BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-132K22
Chromosome2 (Build37)
Map Location 58,014,989 - 58,135,231
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100042926, Acvr1c
Upstream geneLOC100041900, LOC100042910, Gpd2, LOC271788, Galnt5, A330104H05Rik, LOC667026, Pscdbp
Downstream geneLOC667062, Acvr1, LOC674940, Upp2, BC062650, Pkp4
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-132K22.bB6Ng01-132K22.g
ACCDH933421DH933422
length1,1591,094
definitionDH933421|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-132K22, 5' end.DH933422|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-132K22, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(58,134,069 - 58,135,231)(58,014,989 - 58,016,094)
sequence
gaattccatttccacctccaagggacagagtatgatgtcaccagggggag
gcaggaagtaaaaggagcacgccagctgtggctgtgacaggctcatcagt
caccacgtgtctgctgtgtttccttgtctgaccagcaggtggctcctcag
ctagttcacttccctgtcctttacttgggttccgggattcgtggtacttt
ttcacaattccagagttcttgaccttggaatcacaacagtcaacttattt
tcctggacacactaaagcacttgagactagagaatttctaaggaggtaga
gctggctactgagccagctgagatttcaggacaatgagtgcaagccatct
gctgtctgctgtagacttagtaggcagtgtcaccccagcgaagcacgttc
agaatgagcagccctaacggacatctcttcttttcttaataagggcatct
ctcttactagtcccccatcagggacactcaggcaaggcttgggtgctgct
tttctttggaggagcccaatactttgaaaaaatcccaaagattatatagt
ctggaaaaatgcccaactctgtatgggccagttagactctgtcaggtcct
gtgagtataagccttcttccattaaactttgtttgaacaaggatatactt
ttcttggtcatagtacgtaataacattcttcattctgataaaatatttgt
ggaataccatgtagctgtgggttggcaatcgagccccctgtggtgaggga
aatcccctgcttgttagaagggaactttctatgatgacagattcttgagg
cattgagctgcatttcagttattgagtgctttccttgtggaccttcccaa
tttactccttccaagtactgggctgctgttgatcctgccacaatgtgaaa
ttttaaaacctttacctttgttaaatgtttcaaaaatgatggctgtgtca
atactgtgttattacttttattccaccctattatggtatctgagatattc
tcttgaaactgatgtgtactttgatttatgtttttgtatcaatgtattaa
agtcgtgtttcaattgcacaaagctcaatggtgcaccgttttgaggtaca
tggcctcccgaatgctgaatgatacaatgaaacctgaagcatctttgagt
cttcagcga
gaattctttaaaagcctgtgccacgttttccaaaaatttactttccattg
tttggggcaagtattcttcttatatgaatgaagcattttgtttatttata
gaaatccatctttagtatgaatgaagtaaaccctaatgggcatgggaaga
tttagtagaggcaggtaaacaggatgtgctgagtccagaaaacaggggga
atgataagttcttcaagaaactgtggccaacctgttaaccatcctaaccg
tccatgaaaataccaagaatattgattcctctggtctgacagaggcttcg
agattctaatcctggctctgctttaagaatacagattaatatgtgtttca
cagtgtgaatatgttaatgccctaacttccagtgtagactgctattggat
aaagaggtagtcaaggttagatgaggtcaaagggctgcgccgtgatctaa
gggactgtatatccttctaaaagacatcagagatgtctctttccacgtga
ggacacgagggagcagccgtctgaaggtaggaggatattccagatgaatc
attctgcactttgatcttggacttggaagcctccaggatcctgaaaatac
aaatgtcttgtgtgtacagccaaccagtgaatggtgcgtcctatactatg
ggacttgttacgctttgtctattttccagcagcctgagctgattcacaca
ctctacataggattcatgtatgctcagtctccacgtatataaacatggca
tttagaaggaacagacgtaagcgtctatgtttaacatactatacaaaatc
agctattactgctgagtttggttttaagtagtaagaactcagaagggaac
ccttcaaaggaaacaacctaagttccctatgaacttgcctgtcaactacc
agtgtccacatgtgcagcagagtctctcatcaccctcccagagtgtaaag
ctagaaacgtgcagttcctgtagttactcaaacagatttactcacaagtc
tgttagaagcagttctgtacatttctgcattcttcttgtcaccccaggtc
tgctttcccttctgggccacagctcattgcaagcaggctgactg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_58134069_58135231
seq2: B6Ng01-132K22.b_48_1206 (reverse)

seq1  TCGCTTGAAGGACTCAAAGATGC-TCAGG-TTCATTGTATCATCAAGCAT  48
      |||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||| 
seq2  TCGC-TGAA-GACTCAAAGATGCTTCAGGTTTCATTGTATCATTCAGCA-  47

seq1  TTCGGGA-GCCATGTACCTTCAAAAACGTGCA-CATTGAGCTTGGTGC-A  95
      ||||||| |||||||||| ||||||  ||||| |||||||||| |||| |
seq2  TTCGGGAGGCCATGTACC-TCAAAACGGTGCACCATTGAGCTTTGTGCAA  96

seq1  GTGAAACACGACTTTAATACATTTTGATAC-AAAACATAAATCAAAGTAA  144
       ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |
seq2  TTGAAACACGACTTTAATACA--TTGATACAAAAACATAAATCAAAGT-A  143

seq1  CACATCAGTTTCAAGAGAATATCTCAGATACCATAATAGGGTGGAATAAA  194
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATCAGTTTCAAGAGAATATCTCAGATACCATAATAGGGTGGAATAAA  193

seq1  AGTAAATAACACAGTATTGACACAGCCATCATTTTTGAAACATTTTAAAC  244
      ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||
seq2  AGT-AATAACACAGTATTGACACAGCCATCATTTTTGAAACATTT--AAC  240

seq1  AAAGGTAAAGGTTTTAAAATTTCACATTGTGGCAGGATCAACAGCAGCCC  294
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGTAAAGGTTTTAAAATTTCACATTGTGGCAGGATCAACAGCAGCCC  290

seq1  AGTACTTGGAAGGAGTAAATTGGGAAGGTCCACAAGGAAAGCACTCAATA  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTACTTGGAAGGAGTAAATTGGGAAGGTCCACAAGGAAAGCACTCAATA  340

seq1  ACTGAAATGCAGCTCAATGCCTCAAGAATCTGTCATCATAGAAAGTTCCC  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGAAATGCAGCTCAATGCCTCAAGAATCTGTCATCATAGAAAGTTCCC  390

seq1  TTCTAACAAGCAGGGGATTTCCCTCACCACAGGGGGCTCGATTGCCAACC  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTAACAAGCAGGGGATTTCCCTCACCACAGGGGGCTCGATTGCCAACC  440

seq1  CACAGCTACATGGTATTCCACAAATATTTTATCAGAATGAAGAATGTTAT  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGCTACATGGTATTCCACAAATATTTTATCAGAATGAAGAATGTTAT  490

seq1  TACGTACTATGACCAAGAAAAGTATATCCTTGTTCAAACAAAGTTTAATG  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACGTACTATGACCAAGAAAAGTATATCCTTGTTCAAACAAAGTTTAATG  540

seq1  GAAGAAGGCTTATACTCACAGGACCTGACAGAGTCTAACTGGCCCATACA  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGAAGGCTTATACTCACAGGACCTGACAGAGTCTAACTGGCCCATACA  590

seq1  GAGTTGGGCATTTTTCCAGACTATATAATCTTTGGGATTTTTTCAAAGTA  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTTGGGCATTTTTCCAGACTATATAATCTTTGGGATTTTTTCAAAGTA  640

seq1  TTGGGCTCCTCCAAAGAAAAGCAGCACCCAAGCCTTGCCTGAGTGTCCCT  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGCTCCTCCAAAGAAAAGCAGCACCCAAGCCTTGCCTGAGTGTCCCT  690

seq1  GATGGGGGACTAGTAAGAGAGATGCCCTTATTAAGAAAAGAAGAGATGTC  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGGGGACTAGTAAGAGAGATGCCCTTATTAAGAAAAGAAGAGATGTC  740

seq1  CGTTAGGGCTGCTCATTCTGAACGTGCTTCGCTGGGGTGACACTGCCTAC  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTTAGGGCTGCTCATTCTGAACGTGCTTCGCTGGGGTGACACTGCCTAC  790

seq1  TAAGTCTACAGCAGACAGCAGATGGCTTGCACTCATTGTCCTGAAATCTC  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGTCTACAGCAGACAGCAGATGGCTTGCACTCATTGTCCTGAAATCTC  840

seq1  AGCTGGCTCAGTAGCCAGCTCTACCTCCTTAGAAATTCTCTAGTCTCAAG  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGGCTCAGTAGCCAGCTCTACCTCCTTAGAAATTCTCTAGTCTCAAG  890

seq1  TGCTTTAGTGTGTCCAGGAAAATAAGTTGACTGTTGTGATTCCAAGGTCA  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTTAGTGTGTCCAGGAAAATAAGTTGACTGTTGTGATTCCAAGGTCA  940

seq1  AGAACTCTGGAATTGTGAAAAAGTACCACGAATCCCGGAACCCAAGTAAA  994
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAACTCTGGAATTGTGAAAAAGTACCACGAATCCCGGAACCCAAGTAAA  990

seq1  GGACAGGGAAGTGAACTAGCTGAGGAGCCACCTGCTGGTCAGACAAGGAA  1044
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACAGGGAAGTGAACTAGCTGAGGAGCCACCTGCTGGTCAGACAAGGAA  1040

seq1  ACACAGCAGACACGTGGTGACTGATGAGCCTGTCACAGCCACAGCTGGCG  1094
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACAGCAGACACGTGGTGACTGATGAGCCTGTCACAGCCACAGCTGGCG  1090

seq1  TGCTCCTTTTACTTCCTGCCTCCCCCTGGTGACATCATACTCTGTCCCTT  1144
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCCTTTTACTTCCTGCCTCCCCCTGGTGACATCATACTCTGTCCCTT  1140

seq1  GGAGGTGGAAATGGAATTC  1163
      |||||||||||||||||||
seq2  GGAGGTGGAAATGGAATTC  1159

seq1: chr2_58014989_58016094
seq2: B6Ng01-132K22.g_67_1160

seq1  GAATTCTTTAAAAGCCTGTGCCACGTTTTCCAAAAATTTACTTTCCATTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTAAAAGCCTGTGCCACGTTTTCCAAAAATTTACTTTCCATTG  50

seq1  TTTGGGGCAAGTATTCTTCTTATATGAATGAAGCATTTTGTTTATTTATA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGGGCAAGTATTCTTCTTATATGAATGAAGCATTTTGTTTATTTATA  100

seq1  GAAATCCATCTTTAGTATGAATGAAGTAAACCCTAATGGGCATGGGAAGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATCCATCTTTAGTATGAATGAAGTAAACCCTAATGGGCATGGGAAGA  150

seq1  TTTAGTAGAGGCAGGTAAACAGGATGTGCTGAGTCCAGAAAACAGGGGGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGTAGAGGCAGGTAAACAGGATGTGCTGAGTCCAGAAAACAGGGGGA  200

seq1  ATGATAAGTTCTTCAAGAAACTGTGGCCAACCTGTTAACCATCCTAACCG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGATAAGTTCTTCAAGAAACTGTGGCCAACCTGTTAACCATCCTAACCG  250

seq1  TCCATGAAAATACCAAGAATATTGATTCCTCTGGTCTGACAGAGGCTTCG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATGAAAATACCAAGAATATTGATTCCTCTGGTCTGACAGAGGCTTCG  300

seq1  AGATTCTAATCCTGGCTCTGCTTTAAGAATACAGATTAATATGTGTTTCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATTCTAATCCTGGCTCTGCTTTAAGAATACAGATTAATATGTGTTTCA  350

seq1  CAGTGTGAATATGTTAATGCCCTAACTTCCAGTGTAGACTGCTATTGGAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGTGAATATGTTAATGCCCTAACTTCCAGTGTAGACTGCTATTGGAT  400

seq1  AAAGAGGTAGTCAAGGTTAGATGAGGTCAAAGGGCTGCGCCGTGATCTAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAGGTAGTCAAGGTTAGATGAGGTCAAAGGGCTGCGCCGTGATCTAA  450

seq1  GGGACTGTATATCCTTCTAAAAGACATCAGAGATGTCTCTTTCCACGTGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGACTGTATATCCTTCTAAAAGACATCAGAGATGTCTCTTTCCACGTGA  500

seq1  GGACACGAGGGAGCAGCCGTCTGAAGGTAGGAGGATATTCCAGATGAATC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACACGAGGGAGCAGCCGTCTGAAGGTAGGAGGATATTCCAGATGAATC  550

seq1  ATTCTGCACTTTGATCTTGGACTTGGAAGCCTCCAGGATCCTGAAAATAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCTGCACTTTGATCTTGGACTTGGAAGCCTCCAGGATCCTGAAAATAC  600

seq1  AAATGTCTTGTGTGTACAGCCAACCAGTGAATGGTGCGTCCTATACTATG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGTCTTGTGTGTACAGCCAACCAGTGAATGGTGCGTCCTATACTATG  650

seq1  GGACTTGTTACGCTTTGTCTATTTTCCAGCAGCCTGAGCTGATTCACACA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACTTGTTACGCTTTGTCTATTTTCCAGCAGCCTGAGCTGATTCACACA  700

seq1  CTCTACATAGGATTCATGTATGCTCAGTCTCCACGTATATAAACATGGCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTACATAGGATTCATGTATGCTCAGTCTCCACGTATATAAACATGGCA  750

seq1  TTTAGAAGGAACAGACGTAAGCGTCTATGTTTAACATACTATACAAAATC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGAAGGAACAGACGTAAGCGTCTATGTTTAACATACTATACAAAATC  800

seq1  AGCTATTACTGCTGAGTTTGGTTTTAAGTAGTAAGAACTCAGAAGGGAAC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTATTACTGCTGAGTTTGGTTTTAAGTAGTAAGAACTCAGAAGGGAAC  850

seq1  CCTTCAAAGGAAACAACCTAAGTTCCCTATGAACTTGCCTGTCAACTACC  900
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  CCTTCAAAGGAAACAACCTAAGTTCCCTATGAACTTGCCTGTCAACTA-C  899

seq1  CAGTGTCCACATGTGCAGCAGAGTCTCTCATCACCCTCCCAGAGTGTAAA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGTCCACATGTGCAGCAGAGTCTCTCATCACCCTCCCAGAGTGTAAA  949

seq1  GCTAGAAAACGTGCAGTCCCTGTAGTTAACTCAAACAGATGTACTCACAA  1000
      ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| |
seq2  GCTAG-AAACGTGCAGTTCCTGTAGTT-ACTCAAACAGATTTACTCAC-A  996

seq1  AGTACTGTTAGAGCCAGTTCTTGTAACATTTCTGCACTCCTCCTTGTCAC  1050
      ||| ||||||||  |||||| ||| ||||||||||| | || ||||||||
seq2  AGT-CTGTTAGAAGCAGTTC-TGT-ACATTTCTGCA-TTCTTCTTGTCAC  1042

seq1  CCCATGTCTGCTTCCCCCTCTGGGCAACCAGGCTCATTGCACAGCAGGCT  1100
      |||| |||||||| ||| ||||||| ||   |||||||||| ||||||||
seq2  CCCAGGTCTGCTTTCCCTTCTGGGCCAC--AGCTCATTGCA-AGCAGGCT  1089

seq1  GGACTG  1106
       |||||
seq2  -GACTG  1094