BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-144A24
Chromosome2 (Build37)
Map Location 102,764,028 - 102,936,747
singlet/doubletdoublet
Overlap genePdhx, Apip
Upstream geneLdlrad3, LOC674202, Trim44, Fjx1, E430002G05Rik, Slc1a2, Cd44
Downstream geneEhf, Elf5, Cat, Abtb2, Nat10, Caprin1, LOC433458, LOC100042961, LOC100042965, Lmo2, Fbxo3, Cd59b, Cd59a
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-144A24.bB6Ng01-144A24.g
ACCDH941836DH941837
length843997
definitionDH941836|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-144A24, 5' end.DH941837|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-144A24, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(102,935,905 - 102,936,747)(102,764,028 - 102,765,028)
sequence
gaattcacattgtagagtacaaaagaaaatcaccagagaaatcagttata
gcatattagctggttataagcactttatagaaaatcagagcagggaagga
tagcaaggtggtagctcacatttataattccagcactagggaggttgagg
caggaagactgtgagtttgaggctggcctgggctagtacatccaagacca
gcatagactacagagtaagatggtatttaaaataattaaatagaaaacaa
acaaaagcaaaaataaagtaggaagtagagctctatgtgaaggatatggt
atggttctgaatatggaggccaggtgatatttaatgacatgattgagtct
ttattgagaatattcccatacagaatgagaaaggtatcaggtacatatgt
ggaagcaaagtacaaaaaggagggaagaaaaaaatataagtgccttgaaa
atgcaaaggctcaaggtttccagcaattggagtagagtatgtgagaaggc
tcaccaaatgagcaatgattctcaacctgtaggccatgatttcttgtggt
ggggacgggggtcattgaactaccctttcacaggggttgcatacccgata
tttacattaagagtcataatagtagcaaaattagagttatcaagtagtga
caaaattattgttggagattgttataacatgaggaactgtattaaaagtt
cacagcattcggcaggttgctctatgagaatggaatcattgtccaaagac
gggctttagagccgagaccctagctgatcttcataacaggatgatgggag
cttgtgttgattattgatagacatttggggtgaggggtgggga
gaattccatgactattgagtatgtttactttggtgagtgtcaacccccca
ctgcacaatagagagcatctgggagccatgagaaactcgaaatccttgaa
ctttgttcttggagcatctggttcagttgggtgatgaggaaactacatct
tggctaattaaaaggaaatgctagaggctggagagatgggtcagaactta
agaacatccgttgctctttcagaggacgtaggttcagtagttcttctggc
cattgtgagctcaaggcatgtgtgtgctacaaagacatactttgaggcaa
aacatctttatgcatcatcataatcatcatcatcatcaacaacatcatca
taataaaacattaaaaaaaactggactccacagctgatttctgcagtgga
ctgccaaggttaagggccatttgtctcaagcagggctcattgaactcaga
gcacatgagagcatttgaggggctcattgtgccagccttttggtcttgtc
cctacatgctctgtgcagctataacacgccttaagaatttcttcattccc
acttaagtgccatgctgttgattcgggagccaaaattttctaaatctttg
tatccattacaatgacaaaaaaccaattacagcataagtcacaataattc
agtggataactgggctaaagataaatatataaagggatatataccgaata
aggtacaaattcaattccagtttacttagctgggctgtctagccaagaca
ttctagaagaacaggaagaagggacaataggcaagaaaaaatgtattact
ttgagctgacatgtggaagtaaatatttactgagcaatttgtatagacat
agcaccatacagccagtctctgtttttacttccagctaaaggggaagttc
tcaaagaaaatgagaattgcagatgcctgatactctgaccagtaaactta
gtgacatggaaatgatggaaagttttagaaaaatataaatagctagc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_102935905_102936747
seq2: B6Ng01-144A24.b_39_881 (reverse)

seq1  TCCCCACCCCTCACCCCAAATGTCTATCAATAATCAACACAAGCTCCCAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCCACCCCTCACCCCAAATGTCTATCAATAATCAACACAAGCTCCCAT  50

seq1  CATCCTGTTATGAAGATCAGCTAGGGTCTCGGCTCTAAAGCCCGTCTTTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCCTGTTATGAAGATCAGCTAGGGTCTCGGCTCTAAAGCCCGTCTTTG  100

seq1  GACAATGATTCCATTCTCATAGAGCAACCTGCCGAATGCTGTGAACTTTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAATGATTCCATTCTCATAGAGCAACCTGCCGAATGCTGTGAACTTTT  150

seq1  AATACAGTTCCTCATGTTATAACAATCTCCAACAATAATTTTGTCACTAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATACAGTTCCTCATGTTATAACAATCTCCAACAATAATTTTGTCACTAC  200

seq1  TTGATAACTCTAATTTTGCTACTATTATGACTCTTAATGTAAATATCGGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGATAACTCTAATTTTGCTACTATTATGACTCTTAATGTAAATATCGGG  250

seq1  TATGCAACCCCTGTGAAAGGGTAGTTCAATGACCCCCGTCCCCACCACAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCAACCCCTGTGAAAGGGTAGTTCAATGACCCCCGTCCCCACCACAA  300

seq1  GAAATCATGGCCTACAGGTTGAGAATCATTGCTCATTTGGTGAGCCTTCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATCATGGCCTACAGGTTGAGAATCATTGCTCATTTGGTGAGCCTTCT  350

seq1  CACATACTCTACTCCAATTGCTGGAAACCTTGAGCCTTTGCATTTTCAAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATACTCTACTCCAATTGCTGGAAACCTTGAGCCTTTGCATTTTCAAG  400

seq1  GCACTTATATTTTTTTCTTCCCTCCTTTTTGTACTTTGCTTCCACATATG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACTTATATTTTTTTCTTCCCTCCTTTTTGTACTTTGCTTCCACATATG  450

seq1  TACCTGATACCTTTCTCATTCTGTATGGGAATATTCTCAATAAAGACTCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCTGATACCTTTCTCATTCTGTATGGGAATATTCTCAATAAAGACTCA  500

seq1  ATCATGTCATTAAATATCACCTGGCCTCCATATTCAGAACCATACCATAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATGTCATTAAATATCACCTGGCCTCCATATTCAGAACCATACCATAT  550

seq1  CCTTCACATAGAGCTCTACTTCCTACTTTATTTTTGCTTTTGTTTGTTTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCACATAGAGCTCTACTTCCTACTTTATTTTTGCTTTTGTTTGTTTT  600

seq1  CTATTTAATTATTTTAAATACCATCTTACTCTGTAGTCTATGCTGGTCTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATTTAATTATTTTAAATACCATCTTACTCTGTAGTCTATGCTGGTCTT  650

seq1  GGATGTACTAGCCCAGGCCAGCCTCAAACTCACAGTCTTCCTGCCTCAAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGTACTAGCCCAGGCCAGCCTCAAACTCACAGTCTTCCTGCCTCAAC  700

seq1  CTCCCTAGTGCTGGAATTATAAATGTGAGCTACCACCTTGCTATCCTTCC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCTAGTGCTGGAATTATAAATGTGAGCTACCACCTTGCTATCCTTCC  750

seq1  CTGCTCTGATTTTCTATAAAGTGCTTATAACCAGCTAATATGCTATAACT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTCTGATTTTCTATAAAGTGCTTATAACCAGCTAATATGCTATAACT  800

seq1  GATTTCTCTGGTGATTTTCTTTTGTACTCTACAATGTGAATTC  843
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTCTCTGGTGATTTTCTTTTGTACTCTACAATGTGAATTC  843

seq1: chr2_102764028_102765028
seq2: B6Ng01-144A24.g_68_1064

seq1  GAATTCCATGACTATTGAGTATGTTTACTTTGGTGAGTGTCAACCCCCCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCATGACTATTGAGTATGTTTACTTTGGTGAGTGTCAACCCCCCA  50

seq1  CTGCACAATAGAGAGCATCTGGGAGCCATGAGAAACTCGAAATCCTTGAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCACAATAGAGAGCATCTGGGAGCCATGAGAAACTCGAAATCCTTGAA  100

seq1  CTTTGTTCTTGGAGCATCTGGTTCAGTTGGGTGATGAGGAAACTACATCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGTTCTTGGAGCATCTGGTTCAGTTGGGTGATGAGGAAACTACATCT  150

seq1  TGGCTAATTAAAAGGAAATGCTAGAGGCTGGAGAGATGGGTCAGAACTTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTAATTAAAAGGAAATGCTAGAGGCTGGAGAGATGGGTCAGAACTTA  200

seq1  AGAACATCCGTTGCTCTTTCAGAGGACGTAGGTTCAGTAGTTCTTCTGGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAACATCCGTTGCTCTTTCAGAGGACGTAGGTTCAGTAGTTCTTCTGGC  250

seq1  CATTGTGAGCTCAAGGCATGTGTGTGCTACAAAGACATACTTTGAGGCAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGTGAGCTCAAGGCATGTGTGTGCTACAAAGACATACTTTGAGGCAA  300

seq1  AACATCTTTATGCATCATCATAATCATCATCATCATCAACAACATCATCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATCTTTATGCATCATCATAATCATCATCATCATCAACAACATCATCA  350

seq1  TAATAAAACATTAAAAAAAACTGGACTCCACAGCTGATTTCTGCAGTGGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATAAAACATTAAAAAAAACTGGACTCCACAGCTGATTTCTGCAGTGGA  400

seq1  CTGCCAAGGTTAAGGGCCATTTGTCTCAAGCAGGGCTCATTGAACTCAGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCAAGGTTAAGGGCCATTTGTCTCAAGCAGGGCTCATTGAACTCAGA  450

seq1  GCACATGAGAGCATTTGAGGGGCTCATTGTGCCAGCCTTTTGGTCTTGTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACATGAGAGCATTTGAGGGGCTCATTGTGCCAGCCTTTTGGTCTTGTC  500

seq1  CCTACATGCTCTGTGCAGCTATAACACGCCTTAAGAATTTCTTCATTCCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTACATGCTCTGTGCAGCTATAACACGCCTTAAGAATTTCTTCATTCCC  550

seq1  ACTTAAGTGCCATGCTGTTGATTCGGGAGCCAAAATTTTCTAAATCTTTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTAAGTGCCATGCTGTTGATTCGGGAGCCAAAATTTTCTAAATCTTTG  600

seq1  TATCCATTACAATGACAAAAAACCAATTACAGCATAAGTCACAATAATTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCCATTACAATGACAAAAAACCAATTACAGCATAAGTCACAATAATTC  650

seq1  AGTGGATAACTGGGCTAAAGATAAATATATAAAGGGATATATACCGAATA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGATAACTGGGCTAAAGATAAATATATAAAGGGATATATACCGAATA  700

seq1  AGGTACAAATTCAATTCCAGTTTACTTAGCTGGGCTGTCTAGCCAAGACA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTACAAATTCAATTCCAGTTTACTTAGCTGGGCTGTCTAGCCAAGACA  750

seq1  TTCTAGAAGAACAGGAAGAAGGGACAATAGGCAAGAAAAAATGTATTACT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTAGAAGAACAGGAAGAAGGGACAATAGGCAAGAAAAAATGTATTACT  800

seq1  TTGAGCTGACATGTGGAAGTAAATATTTACTGAGCAATTTGTATAGACAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGCTGACATGTGGAAGTAAATATTTACTGAGCAATTTGTATAGACAT  850

seq1  AGCACCATACAGCCAGTCTCTGTTTTTACTTCCAGCT-AAGGGGAAGTTC  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  AGCACCATACAGCCAGTCTCTGTTTTTACTTCCAGCTAAAGGGGAAGTTC  900

seq1  CCAAAGAAAATGAGAATTGCAGATGCCTGATACTCTGACCAGTAAAACTT  949
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  TCAAAGAAAATGAGAATTGCAGATGCCTGATACTCTGACCAGT-AAACTT  949

seq1  AGTGACATGGAAATGATGGGAAAGTTTTAGAAAAAATAATAAATAAGCTA  999
      ||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||| |||||
seq2  AGTGACATGGAAATGAT-GGAAAGTTTTAGAAAAA--TATAAAT-AGCTA  995

seq1  GC  1001
      ||
seq2  GC  997