BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-146E04
Chromosome2 (Build37)
Map Location 73,236,563 - 73,364,587
singlet/doubletdoublet
Overlap geneWipf1
Upstream geneB230120H23Rik, Cdca7, LOC383712, LOC635960, LOC100039928, 6430710C18Rik, Sp3, Hspe1-ps5, Gtpbp9, LOC620110, Sp9, 1700023B02Rik, Scrn3, Gpr155
Downstream geneChrna1, Chn1, Atf2, Atp5g3, LOC667729, LOC100040172, Lnp
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-146E04.bB6Ng01-146E04.g
ACCDH943450DH943451
length1,1581,117
definitionDH943450|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-146E04, 5' end.DH943451|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-146E04, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(73,363,400 - 73,364,587)(73,236,563 - 73,237,707)
sequence
gaattcacatttgagagcccacaggtgatgccagtgtgctgaatatagtt
agtttccatgtggttactgcatggaccacgaagtctccttaatcttgtga
ctggtacaagtactctatcttacaaggtctttttttctttacccctaaag
tgagatcaacaatctctacaagaggattgctatgagggtcatatgtggtc
acatgcacagtatacttagcaggttgtatttaatggtgctgttggtgttt
gtgggccattatcattaacattattataatcagtgtggacgcaacaaaat
agcctacatataggagccgcttttagtataaattaacatatagtctctgg
gatgcccatgatctatcacatgtttgacatttaccatgtagctccaagga
gaagactcttgatgtctgggatctgcagtgtctgtccacccagaagagcc
tacactgctgaggtttttaggggcagattaaggacagggaatgcagagac
agcatgcatcactttcttagccccttggcaccaggaaatattggttatca
tgaccctccatccatgggagtggagtttaacaagtatattagctgcttct
ctcagtccaagcagctttgatctcaggtgtgtagcccaaagcccagtagc
tagaacaccatttcttcttgtggccggacagctcgtgggaccgcagcatt
acagcctgctgttagtcacagatatttactgagaacacaaaagcaataaa
ctttgctactcagtgaaagaacacaggtgagggtaacgagatgtaactat
ctacagcttttgtattgtagtcttgattgctatgactcacataaaaatgt
ctctgttacattttaatgtttacgataaatgaatttttctctttgagcaa
gccatttctttagtataattcatgttgccttttggtttgccctatctctc
agttatactagtgtgcattttgctttcttttggcagtgctgaggttgaac
ccagtgatcagacatgctaagcagactttttcactgagccaaattatata
tttaaaaattttaaaattatataattattttgttgttttcggataagctg
aactcaagtcaactgactctgctgcctgagttggactaagcatgtaccac
ccccagcc
gaattctctaagtaacagcaaaaatgaatccagaaacccaagctatgtgc
ccgtatgccatttctcaaaggcaagagagtatcccatttggtggctcgaa
aaagtgagaaaacctctttctcagacacaccaggtgatcttaggacctga
atcaggccacataccttccctgaatcaaggtgtgcgcctgagaaatacca
tgtagcagctggctgagactgggttgaatggcaggcgccgagcagagagt
atgaaaagctgaaggctcagtcagagatgactccaggatctggcaatgca
tccccttcctgcccatgtgagagaagtaggtatcagattgaaagcctgga
aggaggcagggaacttggagacccatgaagcatgctgcctgtccacggct
acttcacaagccctaacaatacatgtttactgagttacctcacttgtgta
gcctgaggtccaattctagcctacccctattcttataaagtttaagtaat
aaacaaccaggctcattcataagagtatcctctatggctgctttcatggt
acaacgaaagacttgaaaaggtacgtacgtggtctataaaatattttaca
gctggtgtggtagtacctacctataatcctactactccactgaggcagaa
gaattgccatagctgagagctagcctaggctatatagggacttctagggc
taggactagagtgaaaccctatctcaaaagagcagaacaaatcaaaaccc
ttcaactttctgaccctttcagaaaatggttgctggaccgtgcttcatgc
ctttaatcccagcactcaggaagcaggggtaggcggattctgtaaattca
aggccagacagttccacagtaagactctgtctcaataacaaacaaacaaa
ccaacaacaaacttggatttgaagcctctatcatctatctcactttgctg
acctcaattatgacttttaccgcttaaagtcatgtataagccattcagat
gagttaatcaattccttctactttctcttagctatctggaatgcactctt
ccaggctatgtgttctcaagctgtcgcacgagacttccttggtcactacg
ggtctttcttctgcatt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_73363400_73364587
seq2: B6Ng01-146E04.b_46_1203 (reverse)

seq1  GGCTGGGTGGTGGTACATGCCTTTAGTCCCAGAACTCAGGCAGCAGAGTC  50
      ||||||| ||||||||||||  |||||||   ||||||||||||||||||
seq2  GGCTGGG-GGTGGTACATGC--TTAGTCC---AACTCAGGCAGCAGAGTC  44

seq1  AGGTTGACCTCTGAGTTCAAGGCCTATCCCGAAAAACAAACAAAAAATAA  100
      | ||||||   ||||||||  || |||||   ||||||   | |||||||
seq2  A-GTTGAC--TTGAGTTCA--GCTTATCC--GAAAACA---ACAAAATAA  84

seq1  ATAAATAATAATTTTTAAAATTTTTTTAAATTAATATAATTTGGCTCAGT  150
       || ||||    ||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||
seq2  TTATATAA----TTTTAAAA--TTTTTAAAT--ATATAATTTGGCTCAGT  126

seq1  GATAGAGTCTTGCTTAGCATGTCTGAATCACTGGGTTCAAACCTCAGCAC  200
      || | |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||
seq2  GAAAAAGTC-TGCTTAGCATGTCTG-ATCACTGGGTTC-AACCTCAGCAC  173

seq1  TGCCAAAAAGAAAAGCAAAATGCACACTAGTATAACTGAGAGATAGGGCA  250
      ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  TGCCAAAA--GAAAGCAAAATGCACACTAGTATAACTGAGAGATAGGGC-  220

seq1  AAACCAAAAGGCAACATGAATTATACTAAAGAAATGGCTTGCTCAAAGAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACCAAAAGGCAACATGAATTATACTAAAGAAATGGCTTGCTCAAAGAG  270

seq1  AAAAATTCATTTATCGTAAACATTAAAATGTAACAGAGACATTTTTATGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAATTCATTTATCGTAAACATTAAAATGTAACAGAGACATTTTTATGT  320

seq1  GAGTCATAGCAATCAAGACTACAATACAAAAGCTGTAGATAGTTACATCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTCATAGCAATCAAGACTACAATACAAAAGCTGTAGATAGTTACATCT  370

seq1  CGTTACCCTCACCTGTGTTCTTTCACTGAGTAGCAAAGTTTATTGCTTTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTTACCCTCACCTGTGTTCTTTCACTGAGTAGCAAAGTTTATTGCTTTT  420

seq1  GTGTTCTCAGTAAATATCTGTGACTAACAGCAGGCTGTAATGCTGCGGTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTCTCAGTAAATATCTGTGACTAACAGCAGGCTGTAATGCTGCGGTC  470

seq1  CCACGAGCTGTCCGGCCACAAGAAGAAATGGTGTTCTAGCTACTGGGCTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACGAGCTGTCCGGCCACAAGAAGAAATGGTGTTCTAGCTACTGGGCTT  520

seq1  TGGGCTACACACCTGAGATCAAAGCTGCTTGGACTGAGAGAAGCAGCTAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGCTACACACCTGAGATCAAAGCTGCTTGGACTGAGAGAAGCAGCTAA  570

seq1  TATACTTGTTAAACTCCACTCCCATGGATGGAGGGTCATGATAACCAATA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATACTTGTTAAACTCCACTCCCATGGATGGAGGGTCATGATAACCAATA  620

seq1  TTTCCTGGTGCCAAGGGGCTAAGAAAGTGATGCATGCTGTCTCTGCATTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCTGGTGCCAAGGGGCTAAGAAAGTGATGCATGCTGTCTCTGCATTC  670

seq1  CCTGTCCTTAATCTGCCCCTAAAAACCTCAGCAGTGTAGGCTCTTCTGGG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTCCTTAATCTGCCCCTAAAAACCTCAGCAGTGTAGGCTCTTCTGGG  720

seq1  TGGACAGACACTGCAGATCCCAGACATCAAGAGTCTTCTCCTTGGAGCTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGACAGACACTGCAGATCCCAGACATCAAGAGTCTTCTCCTTGGAGCTA  770

seq1  CATGGTAAATGTCAAACATGTGATAGATCATGGGCATCCCAGAGACTATA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGTAAATGTCAAACATGTGATAGATCATGGGCATCCCAGAGACTATA  820

seq1  TGTTAATTTATACTAAAAGCGGCTCCTATATGTAGGCTATTTTGTTGCGT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTAATTTATACTAAAAGCGGCTCCTATATGTAGGCTATTTTGTTGCGT  870

seq1  CCACACTGATTATAATAATGTTAATGATAATGGCCCACAAACACCAACAG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACACTGATTATAATAATGTTAATGATAATGGCCCACAAACACCAACAG  920

seq1  CACCATTAAATACAACCTGCTAAGTATACTGTGCATGTGACCACATATGA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCATTAAATACAACCTGCTAAGTATACTGTGCATGTGACCACATATGA  970

seq1  CCCTCATAGCAATCCTCTTGTAGAGATTGTTGATCTCACTTTAGGGGTAA  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCATAGCAATCCTCTTGTAGAGATTGTTGATCTCACTTTAGGGGTAA  1020

seq1  AGAAAAAAAGACCTTGTAAGATAGAGTACTTGTACCAGTCACAAGATTAA  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAAAAAGACCTTGTAAGATAGAGTACTTGTACCAGTCACAAGATTAA  1070

seq1  GGAGACTTCGTGGTCCATGCAGTAACCACATGGAAACTAACTATATTCAG  1150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGACTTCGTGGTCCATGCAGTAACCACATGGAAACTAACTATATTCAG  1120

seq1  CACACTGGCATCACCTGTGGGCTCTCAAATGTGAATTC  1188
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACTGGCATCACCTGTGGGCTCTCAAATGTGAATTC  1158

seq1: chr2_73236563_73237707
seq2: B6Ng01-146E04.g_67_1183

seq1  GAATTCTCTAAGTAACAGCAAAAATGAATCCAGAAACCCAAGCTATGTGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTAAGTAACAGCAAAAATGAATCCAGAAACCCAAGCTATGTGC  50

seq1  CCGTATGCCATTTCTCAAAGGCAAGAGAGTATCCCATTTGGTGGCTCGAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGTATGCCATTTCTCAAAGGCAAGAGAGTATCCCATTTGGTGGCTCGAA  100

seq1  AAAGTGAGAAAACCTCTTTCTCAGACACACCAGGTGATCTTAGGACCTGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTGAGAAAACCTCTTTCTCAGACACACCAGGTGATCTTAGGACCTGA  150

seq1  ATCAGGCCACATACCTTCCCTGAATCAAGGTGTGCGCCTGAGAAATACCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAGGCCACATACCTTCCCTGAATCAAGGTGTGCGCCTGAGAAATACCA  200

seq1  TGTAGCAGCTGGCTGAGACTGGGTTGAATGGCAGGCGCCGAGCAGAGAGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAGCAGCTGGCTGAGACTGGGTTGAATGGCAGGCGCCGAGCAGAGAGT  250

seq1  ATGAAAAGCTGAAGGCTCAGTCAGAGATGACTCCAGGATCTGGCAATGCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAAAAGCTGAAGGCTCAGTCAGAGATGACTCCAGGATCTGGCAATGCA  300

seq1  TCCCCTTCCTGCCCATGTGAGAGAAGTAGGTATCAGATTGAAAGCCTGGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCCTTCCTGCCCATGTGAGAGAAGTAGGTATCAGATTGAAAGCCTGGA  350

seq1  AGGAGGCAGGGAACTTGGAGACCCATGAAGCATGCTGCCTGTCCACGGCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGGCAGGGAACTTGGAGACCCATGAAGCATGCTGCCTGTCCACGGCT  400

seq1  ACTTCACAAGCCCTAACAATACATGTTTACTGAGTTACCTCACTTGTGTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCACAAGCCCTAACAATACATGTTTACTGAGTTACCTCACTTGTGTA  450

seq1  GCCTGAGGTCCAATTCTAGCCTACCCCTATTCTTATAAAGTTTAAGTAAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGAGGTCCAATTCTAGCCTACCCCTATTCTTATAAAGTTTAAGTAAT  500

seq1  AAACAACCAGGCTCATTCATAAGAGTATCCTCTATGGCTGCTTTCATGGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAACCAGGCTCATTCATAAGAGTATCCTCTATGGCTGCTTTCATGGT  550

seq1  ACAACGAAAGACTTGAAAAGGTACGTACGTGGTCTATAAAATATTTTACA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAACGAAAGACTTGAAAAGGTACGTACGTGGTCTATAAAATATTTTACA  600

seq1  GCTGGTGTGGTAGTACCTACCTATAATCCTACTACTCCACTGAGGCAGAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGTGTGGTAGTACCTACCTATAATCCTACTACTCCACTGAGGCAGAA  650

seq1  GAATTGCCATAGCTGAGAGCTAGCCTAGGCTATATAGGGACTTCTAGGGC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTGCCATAGCTGAGAGCTAGCCTAGGCTATATAGGGACTTCTAGGGC  700

seq1  TAGGACTAGAGTGAAACCCTATCTCAAAAGAGCAGAACAAATCAAAACCC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGACTAGAGTGAAACCCTATCTCAAAAGAGCAGAACAAATCAAAACCC  750

seq1  TTCAACTTTCTGACCCTTTCAGAAAATGGTTGCTGGACCGTGCTTCATGC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAACTTTCTGACCCTTTCAGAAAATGGTTGCTGGACCGTGCTTCATGC  800

seq1  CTTTAATCCCAGCACTCAGGAAGCAGGGGTAGGCGGATTCCTGTAAATTC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  CTTTAATCCCAGCACTCAGGAAGCAGGGGTAGGCGGATT-CTGTAAATTC  849

seq1  AAGGCCAGACAGTTCCACAGTAAGACTCTGTCTCAATAAACAAACAAACA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  AAGGCCAGACAGTTCCACAGTAAGACTCTGTCTCAAT-AACAAACAAACA  898

seq1  AACCAACAAACAAACTTGGATTTTGAAGCCCTCTATCATCTATCTTCACT  950
      ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||
seq2  AACCAAC-AACAAACTTGGA-TTTGAAG-CCTCTATCATCTATC-TCACT  944

seq1  TTGCTGACCTCCATTTATTGACTTTTTACCGCTTTATAGTCATGTTATAA  1000
      ||||||||||| |||   |||| ||||||||| ||| ||||||| |||||
seq2  TTGCTGACCTCAATT--ATGAC-TTTTACCGC-TTAAAGTCATG-TATAA  989

seq1  GCCATTCAGATGAGTTTATTCATTTCCTGTCTACTTTTCTCTTTAGCTAA  1050
      |||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||| |||||| |||||| |
seq2  GCCATTCAGATGAG-TTAATCAATTCCT-TCTAC-TTTCTC-TTAGCT-A  1034

seq1  TCTGGAATGCAACTCTTCAAGCCTATGTGTCTTCAAAGGCCTGTCGCACC  1100
      |||||||||| ||||||| || ||||||||  ||||    |||||||| |
seq2  TCTGGAATGC-ACTCTTCCAGGCTATGTGTTCTCAA---GCTGTCGCA-C  1079

seq1  GAGCCTTCCCTGTGTTCACCCTACGGGGTCTTTCTTTCCTGCATT  1145
      ||| ||||| || ||   | |||| |||||||||||  |||||||
seq2  GAGACTTCCTTG-GT---CACTAC-GGGTCTTTCTT--CTGCATT  1117