BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-146P22
Chromosome2 (Build37)
Map Location 118,127,252 - 118,280,723
singlet/doubletdoublet
Overlap geneGpr176, 1700054M17Rik, Eif2ak4
Upstream geneRasgrp1, Thbs1, Fsip1
Downstream geneSrp14, LOC668859, Bmf, LOC640461, Bub1b, Pak6, Gm1337, Plcb2, LOC100043272, A430105I19Rik, Disp2, D2Ertd750e, Ivd, Bahd1, Chst14, LOC677379, Ccdc32, Rpusd2, Casc5, Rad51, 1200015F23Rik, Gchfr, Dnajc17, OTTMUSG00000015762, LOC545640, Zfyve19, Ppp1r14d, Spint1, Rhov, Vps18, LOC100043609, Dll4, Chac1, Inoc1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-146P22.bB6Ng01-146P22.g
ACCDH943995DH943996
length1,0141,067
definitionDH943995|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-146P22, 5' end.DH943996|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-146P22, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(118,279,716 - 118,280,723)(118,127,252 - 118,128,302)
sequence
gaattctttcctgtatgaaagtttcagaagaaaaaaacaaaacctcccac
ccacctttgtctgatttcattcccacatctaccaaatgcagggtgcacaa
tacaccttaccgttttaaattcagtatgttatttcttgccacatatcttg
caaaagggacctgaaagaagaaagttttaaagacccacatcatgaggtgc
aaagtactacattcttttcgattttaaaacagctctgctgggctagaacc
cacacatcactttaaggtcaggcacccacttaatagtgaggtcagaacca
actgcccagccagcacaccctatgatgtcagcacaatgatgaaatagctg
ccgatgcatttctttaaaaagtataccctagccattaagcagcacgtgac
cgtaccctgagagcacgcacactggggtgctcgtgtgtgcttcagctgca
gtaggctctactgcagactctgctcactgcatttctgagggctgcgaaac
attcttcttccttttttgttgaaaacatggtcatattttatcatgctcat
ttgaaatatgcataggttattggtttattgtgatttttaagatgtagttt
atggattagagagatggcttagagggtagtaagacttgtcatgcatgctg
gctagttttcagtggacacaggttcagccattttcttgattgatgtttga
ttcaggagaggcctagcctatcgtggataatgttctccttcctgggctgg
tctctggtgtgccagccgggcaaagctgtttcctggctttccatatgcac
atttctacacaattctttttcgttctctcacatacactttagtacatttt
taaaaattctcatttataataacagtcaaaatgagtgagtgctttctctt
atgggtgaattaagttcctgagttccatatcggtctccttagaggaaatt
atttaatttttattgtatgggtattttttgtctgcatgcatatgcaatat
ccgctagatatcat
gaattcattcagtgtgggaccacaaaagaattgcttcctcagagggttgc
attgaattactcttccttcacaaaaaggatttaaaagaaattctttaaac
cattctcccacatacagccctgataactctttgagtgtgaatcacctaaa
ctttagagtccttaacccaagtttaccagtcctgcttcttcccattcagt
ccaattagtgaaatcaggaaaggcagtcactgggctggtgaaatgggatt
tgtgcttactgaaaggcacacaggcatcagcaaggcgcaaaactgaggtg
cactggaagctagaggggcatggggtgagtgatgcttgtgggctcagtga
gctggtggtgtgacggggagcttgtgacagtaaggcctatgacagtgaga
gcctgtgacagtgagagcttgtgacagtgagagcctgtgacagtgaagcc
tgtgacagtgagagcctgtgacagtgtgagcctgaaacagtgagagcctg
tgacagtgagagcctgtgacagtgagagcctgtgacagtgaagcctgtga
cagtgagagctgtgacagtgagagcctgtgacagtgagagcctgtgacag
agagagctgtgacagtgagagcctgtgacagtgagagcctgtgacagtga
gagcctgtgacagtgaagcctgtgacagtgagagcctgtgacagtgagag
cctgtgacactgaagcctgtgacagtgaagcctgaaacagtgagagcctg
tgacagtgagagcctgtgacagtgtgagcctgtgacagtgtgagccttgt
gacagtgtgagcctgatacagtgagagcctgtgacagtgagagcctgtga
cagtgagagccctgtgacagtgaagcctggtacaagtgagagctgtgaca
ggtgagagcctgtgacagtgtgagccttgtgacagtgtgagccctgtgac
agtgtggagcctgtgaacagtgagagccttgtgacagtgaaatcctgtga
cagtgagagctgtgtgacagtgagtacctgttgtacacagtgagagcctg
tgacagtgagagtctgt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_118279716_118280723
seq2: B6Ng01-146P22.b_51_1064 (reverse)

seq1  ATGATAGTTCTAGGGGATA-TGCATATGCATGCAGAC-AAAAATAACCAT  48
      ||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||
seq2  ATGATA--TCTAGCGGATATTGCATATGCATGCAGACAAAAAATACCCAT  48

seq1  AC-ATAAAA--TAAATAATTTCCTCTAA-GAGACCGATATGGAACTCAGG  94
      || ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  ACAATAAAAATTAAATAATTTCCTCTAAGGAGACCGATATGGAACTCAGG  98

seq1  AACTTAATTCA-CCATAAGAGAAAGCACTCACTCATTTTGACTGTTATTA  143
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTAATTCACCCATAAGAGAAAGCACTCACTCATTTTGACTGTTATTA  148

seq1  TAAATGAGAATTTTTAAAAATGTACTAAAGTGTATGTGAGAGAACGAAAA  193
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATGAGAATTTTTAAAAATGTACTAAAGTGTATGTGAGAGAACGAAAA  198

seq1  AGAATTGTGTAGAAATGTGCATATGG-AAGCCAGGAAACAGCTTTGCCCG  242
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATTGTGTAGAAATGTGCATATGGAAAGCCAGGAAACAGCTTTGCCCG  248

seq1  GCTGGCACACCAGAGACCAGCCCAGGAAGGAGAACATTATCCACGATAGG  292
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGCACACCAGAGACCAGCCCAGGAAGGAGAACATTATCCACGATAGG  298

seq1  CTAGGCCTCTCCTGAATCAAACATCAATCAAGAAAATGGCTGAACCTGTG  342
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGGCCTCTCCTGAATCAAACATCAATCAAGAAAATGGCTGAACCTGTG  348

seq1  TCCACTGAAAACTAGCCAGCATGCATGACAAGTCTTACTACCCTCTAAGC  392
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCACTGAAAACTAGCCAGCATGCATGACAAGTCTTACTACCCTCTAAGC  398

seq1  CATCTCTCTAATCCATAAACTACATCTTAAAAATCACAATAAACCAATAA  442
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTCTCTAATCCATAAACTACATCTTAAAAATCACAATAAACCAATAA  448

seq1  CCTATGCATATTTCAAATGAGCATGATAAAATATGACCATGTTTTCAACA  492
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTATGCATATTTCAAATGAGCATGATAAAATATGACCATGTTTTCAACA  498

seq1  AAAAAGGAAGAAGAATGTTTCGCAGCCCTCAGAAATGCAGTGAGCAGAGT  542
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAGGAAGAAGAATGTTTCGCAGCCCTCAGAAATGCAGTGAGCAGAGT  548

seq1  CTGCAGTAGAGCCTACTGCAGCTGAAGCACACACGAGCACCCCAGTGTGC  592
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCAGTAGAGCCTACTGCAGCTGAAGCACACACGAGCACCCCAGTGTGC  598

seq1  GTGCTCTCAGGGTACGGTCACGTGCTGCTTAATGGCTAGGGTATACTTTT  642
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCTCTCAGGGTACGGTCACGTGCTGCTTAATGGCTAGGGTATACTTTT  648

seq1  TAAAGAAATGCATCGGCAGCTATTTCATCATTGTGCTGACATCATAGGGT  692
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGAAATGCATCGGCAGCTATTTCATCATTGTGCTGACATCATAGGGT  698

seq1  GTGCTGGCTGGGCAGTTGGTTCTGACCTCACTATTAAGTGGGTGCCTGAC  742
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCTGGCTGGGCAGTTGGTTCTGACCTCACTATTAAGTGGGTGCCTGAC  748

seq1  CTTAAAGTGATGTGTGGGTTCTAGCCCAGCAGAGCTGTTTTAAAATCGAA  792
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAAAGTGATGTGTGGGTTCTAGCCCAGCAGAGCTGTTTTAAAATCGAA  798

seq1  AAGAATGTAGTACTTTGCACCTCATGATGTGGGTCTTTAAAACTTTCTTC  842
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAATGTAGTACTTTGCACCTCATGATGTGGGTCTTTAAAACTTTCTTC  848

seq1  TTTCAGGTCCCTTTTGCAAGATATGTGGCAAGAAATAACATACTGAATTT  892
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCAGGTCCCTTTTGCAAGATATGTGGCAAGAAATAACATACTGAATTT  898

seq1  AAAACGGTAAGGTGTATTGTGCACCCTGCATTTGGTAGATGTGGGAATGA  942
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACGGTAAGGTGTATTGTGCACCCTGCATTTGGTAGATGTGGGAATGA  948

seq1  AATCAGACAAAGGTGGGTGGGAGGTTTTGTTTTTTTCTTCTGAAACTTTC  992
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCAGACAAAGGTGGGTGGGAGGTTTTGTTTTTTTCTTCTGAAACTTTC  998

seq1  ATACAGGAAAGAATTC  1008
      ||||||||||||||||
seq2  ATACAGGAAAGAATTC  1014

seq1: chr2_118127252_118128302
seq2: B6Ng01-146P22.g_69_1135

seq1  GAATTCATTCAGTGTGGGACCACAAAAGAATTGCTTCCTCAGAGGGTTGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTCAGTGTGGGACCACAAAAGAATTGCTTCCTCAGAGGGTTGC  50

seq1  ATTGAATTACTCTTCCTTCACAAAAAGGATTTAAAAGAAATTCTTTAAAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGAATTACTCTTCCTTCACAAAAAGGATTTAAAAGAAATTCTTTAAAC  100

seq1  CATTCTCCCACATACAGCCCTGATAACTCTTTGAGTGTGAATCACCTAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTCTCCCACATACAGCCCTGATAACTCTTTGAGTGTGAATCACCTAAA  150

seq1  CTTTAGAGTCCTTAACCCAAGTTTACCAGTCCTGCTTCTTCCCATTCAGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTAGAGTCCTTAACCCAAGTTTACCAGTCCTGCTTCTTCCCATTCAGT  200

seq1  CCAATTAGTGAAATCAGGAAAGGCAGTCACTGGGCTGGTGAAATGGGATT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAATTAGTGAAATCAGGAAAGGCAGTCACTGGGCTGGTGAAATGGGATT  250

seq1  TGTGCTTACTGAAAGGCACACAGGCATCAGCAAGGCGCAAAACTGAGGTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGCTTACTGAAAGGCACACAGGCATCAGCAAGGCGCAAAACTGAGGTG  300

seq1  CACTGGAAGCTAGAGGGGCATGGGGTGAGTGATGCTTGTGGGCTCAGTGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGGAAGCTAGAGGGGCATGGGGTGAGTGATGCTTGTGGGCTCAGTGA  350

seq1  GCTGGTGGTGTGACGGGGAGCTTGTGACAGTAAGGCCTATGACAGTGAGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGTGGTGTGACGGGGAGCTTGTGACAGTAAGGCCTATGACAGTGAGA  400

seq1  GCCTGTGACAGTGAGAGCTTGTGACAGTGAGAGCCTGTGACAGTGAAGCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGTGACAGTGAGAGCTTGTGACAGTGAGAGCCTGTGACAGTGAAGCC  450

seq1  TGTGACAGTGAGAGCCTGTGACAGTGTGAGCCTGAAACAGTGAGAGCCTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGACAGTGAGAGCCTGTGACAGTGTGAGCCTGAAACAGTGAGAGCCTG  500

seq1  TGACAGTGAGAGCCTGTGACAGTGAGAGCCTGTGACAGTGAAGCCTGTGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACAGTGAGAGCCTGTGACAGTGAGAGCCTGTGACAGTGAAGCCTGTGA  550

seq1  CAGTGAGAGCTGTGACAGTGAGAGCCTGTGACAGTGAGAGCCTGTGACAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGAGAGCTGTGACAGTGAGAGCCTGTGACAGTGAGAGCCTGTGACAG  600

seq1  AGAGAGCTGTGACAGTGAGAGCCTGTGACAGTGAGAGCCTGTGACAGTGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAGCTGTGACAGTGAGAGCCTGTGACAGTGAGAGCCTGTGACAGTGA  650

seq1  GAGCCTGTGACAGTGAAGCCTGTGACAGTGAGAGCCTGTGACAGTGAGAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCCTGTGACAGTGAAGCCTGTGACAGTGAGAGCCTGTGACAGTGAGAG  700

seq1  CCTGTGACACTGAAGCCTGTGACAGTGAAGCCTGAAACAGTGAGAGCCTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTGACACTGAAGCCTGTGACAGTGAAGCCTGAAACAGTGAGAGCCTG  750

seq1  TGACAGTGAGAGCCTGTGACAGTGTGAGCCTGTGACAGTGTGAGCC-TGT  799
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  TGACAGTGAGAGCCTGTGACAGTGTGAGCCTGTGACAGTGTGAGCCTTGT  800

seq1  GACAGTGTGAGCCTGAAACAGTGAGAGCCTGTGACAGTGAGAGCCTGTGA  849
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGTGTGAGCCTGATACAGTGAGAGCCTGTGACAGTGAGAGCCTGTGA  850

seq1  CAGTGAGAG-CCTGTGACAGTGAAGCCTGTGAC-AGTGAGAGCTGTGACA  897
      ||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||
seq2  CAGTGAGAGCCCTGTGACAGTGAAGCCTGGTACAAGTGAGAGCTGTGACA  900

seq1  -GTGAGAGCCTGTGACAGTGTGAGCC-TGTGACAGTGTGAG-CCTGTGAC  944
       ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||
seq2  GGTGAGAGCCTGTGACAGTGTGAGCCTTGTGACAGTGTGAGCCCTGTGAC  950

seq1  AGTGT-GAGCCTGTG-ACAGTGAGAGCC-TGTGACAGTG-AAGCCTGTGA  990
      ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||
seq2  AGTGTGGAGCCTGTGAACAGTGAGAGCCTTGTGACAGTGAAATCCTGTGA  1000

seq1  CAGTGAGAGC--TGTGACAGTGAGAACCTGT----GACAGTGAGAGCCTG  1034
      ||||||||||  |||||||||||| ||||||     ||||||||||||||
seq2  CAGTGAGAGCTGTGTGACAGTGAGTACCTGTTGTACACAGTGAGAGCCTG  1050

seq1  TGACAGTGAGAGCCTGT  1051
      |||||||||||| ||||
seq2  TGACAGTGAGAGTCTGT  1067