BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-150L02
Chromosome2 (Build37)
Map Location 145,163,319 - 145,274,255
singlet/doubletdoublet
Overlap geneSlc24a3
Upstream genePpia-ps2_1789.1, LOC635097, Csrp2bp, LOC100043552, 6330439K17Rik, Polr3f, Rbbp9, Sec23b, Gm561, Dtd1, 1700010M22Rik
Downstream geneLOC627312, OTTMUSG00000015643, LOC433482, LOC100043810, Rin2, Nat5, Crnkl1, 4930529M08Rik, LOC100043563, Insm1, A230067G21Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-150L02.bB6Ng01-150L02.g
ACCDH946709DH946710
length1,1721,144
definitionDH946709|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-150L02, 5' end.DH946710|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-150L02, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(145,273,070 - 145,274,255)(145,163,319 - 145,164,469)
sequence
gaattcatgcagggctagagaacagagagaaaagcagctcagtacagatg
accttttcagtacagctgatctaggacagtgccactaaccctgacttcag
agttctaggtctatgaacttgcataagaacaaaatgaaacaaactaaaag
acttcaagtttatgagcctctaactagaatttagcattcccttcaaacaa
gatgcgacaaactatggtaatgctagtatgacctcagccccagctgccaa
tgcaaattttcatctagagttgtcccttggtgtccatgagagattgaatc
tgggatctcaaggacaccatatgggcatagtcaagtctcttctggaaaat
ggcatggtatttgcatatcatgactcatagcttttcctataatgtaaatg
gtatgcaaggagtcatcatgctatattgtttttcaatgtatttcaatgta
tttcaatggtagttggttgatctgtggtacaggatacatggatgtggagg
gtgtgtttcactctattgaggcagctctgacacattgctttggtgctatg
gtagtttgtaggacatcacttgtgaccttaagtttaaatatggaactgag
tatggtggcacactcttttaatcatctcagaggattcagcagttctcttg
agtttgaggttagcctgatctacatagtgagttctaggtcagcgagtgcc
acataagggaacactcatttaaacaatacaaactaaaacaaacaataaca
aaacaaagcaaaagttaaacgaggaagcacggagctaatattacaaactt
gttttctaatattctaatattctcactcaatgtgactgggttttatttgt
aatcctacatactttgtcacatgcagtgaaaagggcttttctgaccaggg
caagcaagcttcacctcatacgctgatgaaaggggctgctccaagctgct
attcactgcctcatttcctcctcccactcctactggctgggacactagta
cctcatctgctctggagcgctgcactttttctgacctgactacatttgca
tgagactgtgtaatcaggaagcgcagaccctctgcctgcttcatccagcc
ttgggcagacacaccagctaatgaagtcgctcccttgagacttgggaagt
acttcggtttcctagtgggcag
gaattcattccaatatgatgtcataatctgaggcttgtaagcccttcatg
tgacctcagaaagacagtctggctaattcaagagggggtggtaagtgtcc
ctagtgactctcctgggatctcccttagtttgactttgtaactaattaga
actaataaccactgaagtcatgcatctttgattgggcttctcccccctcc
aggcctgagtacgacatatttgcttggagaagttctaccccaacaaagcc
tttagatatgaacaggaggggatgtttccatggtatattgtcactgttca
cctagcatgtaatcctaggctgtcttgattaactgacatgagggaggctc
agcccctttcacaagtccctgagcttcctaggtcaggctccaaatgtgtt
ttatttttatatcccacaatatcttcgggctatagtgaacatattagtca
gggttctcctgaggagcagaatcaatagaatatatacaactataaggatt
tattagactgtctcatatgattaaaggctgaaccatcttacagtggctga
cttaagcagtagagtctagtaagccagtggctactcagtgtaagaagctg
ggagtctcaaaacaaagtagaccaaagatgtagcctcagttaaaggttga
agacctaggatctccttgaagagttgctggtccaaatcatgagcctgaga
tatctggaatttgaagtacataggtaacacaaaccagcacaattcaaact
tgctctgaaaggcactgaacacacccaagcttccctccctgctgctgttc
tgtcccacctggacctactaggtccaggtctactggatagacccatggtg
gagctctcacactcagtttactgacacatactcaaaccttctttgaaagg
actttccctaaacacaccccaaagcatgttctagatgactttggatccct
tttagtgttgacagccaacacagactatcacaatgagctcttagtgacta
aaagattgaaggattgtttgtgactcacatgtctccagactcatcatgag
ttcagacctgttaactgagatgttaaagaactccctagctgacaagattg
ctttgcattctgcaattccaccattcagttctttatgtggcata
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_145273070_145274255
seq2: B6Ng01-150L02.b_49_1220 (reverse)

seq1  CTGCCCACTAGAGAAACAGGAAGATACATCACCAAGCTCCAAGGGAGACG  50
      ||||||||||| |||||  |||| ||| || |||||   |||||||| ||
seq2  CTGCCCACTAG-GAAAC-CGAAG-TACTTC-CCAAGTCTCAAGGGAG-CG  45

seq1  ACTTCATTAGCTGGTGTTGTCTGCCAAAGGCTGGATGAGGGCAGGCAGAG  100
      |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||
seq2  ACTTCATTAGCTGGTG-TGTCTGCCCAAGGCTGGATGA-AGCAGGCAGAG  93

seq1  TGTCTGCGGCTTCCTGAATTACACAGTCTCATGGCAAATGTAGGTCAGGT  150
       |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||
seq2  GGTCTGC-GCTTCCTG-ATTACACAGTCTCAT-GCAAATGTA-GTCAGGT  139

seq1  CAGAAAAAAGTGCAGCGCTCCAGAGCAGGATGGAGGTACTAGTGTCCCAA  200
      ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |
seq2  CAG-AAAAAGTGCAGCGCTCCAGAGCA-GAT-GAGGTACTAGTGTCCC-A  185

seq1  GCCAGTAGGAGTGGGAGAGGGAAATGAGGCAGTGAATAGCAGCTTGGAGC  250
      |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAGTAGGAGTGGGAGGAGGAAATGAGGCAGTGAATAGCAGCTTGGAGC  235

seq1  AGCCCC-TTCATCAGCGTATGAGGTGAAGCCTGCTTGCCCTGGTCAGAAA  299
      |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  AGCCCCTTTCATCAGCGTATGAGGTGAAGCTTGCTTGCCCTGGTCAGAAA  285

seq1  AGCCCTTTTCACTGCATGTGACAAAGTATGTAGGATTACAAATAAAAACC  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  AGCCCTTTTCACTGCATGTGACAAAGTATGTAGGATTACAAATAAAACCC  335

seq1  AGTCACATTGAGTGAGAATATTAGAATATTAGAAAACAAGTTTGTAATAT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCACATTGAGTGAGAATATTAGAATATTAGAAAACAAGTTTGTAATAT  385

seq1  TAGCTCCGTGCTTCCTCGTTTAACTTTTGCTTTGTTTTGTTATTGTTTGT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCTCCGTGCTTCCTCGTTTAACTTTTGCTTTGTTTTGTTATTGTTTGT  435

seq1  TTTAGTTTGTATTGTTTAAATGAGTGTTCCCTTATGTGGCACTCGCTGAC  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGTTTGTATTGTTTAAATGAGTGTTCCCTTATGTGGCACTCGCTGAC  485

seq1  CTAGAACTCACTATGTAGATCAGGCTAACCTCAAACTCAAGAGAACTGCT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGAACTCACTATGTAGATCAGGCTAACCTCAAACTCAAGAGAACTGCT  535

seq1  GAATCCTCTGAGATGATTAAAAGAGTGTGCCACCATACTCAGTTCCATAT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATCCTCTGAGATGATTAAAAGAGTGTGCCACCATACTCAGTTCCATAT  585

seq1  TTAAACTTAAGGTCACAAGTGATGTCCTACAAACTACCATAGCACCAAAG  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAACTTAAGGTCACAAGTGATGTCCTACAAACTACCATAGCACCAAAG  635

seq1  CAATGTGTCAGAGCTGCCTCAATAGAGTGAAACACACCCTCCACATCCAT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATGTGTCAGAGCTGCCTCAATAGAGTGAAACACACCCTCCACATCCAT  685

seq1  GTATCCTGTACCACAGATCAACCAACTACCATTGAAATACATTGAAATAC  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATCCTGTACCACAGATCAACCAACTACCATTGAAATACATTGAAATAC  735

seq1  ATTGAAAAACAATATAGCATGATGACTCCTTGCATACCATTTACATTATA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGAAAAACAATATAGCATGATGACTCCTTGCATACCATTTACATTATA  785

seq1  GGAAAAGCTATGAGTCATGATATGCAAATACCATGCCATTTTCCAGAAGA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAAAGCTATGAGTCATGATATGCAAATACCATGCCATTTTCCAGAAGA  835

seq1  GACTTGACTATGCCCATATGGTGTCCTTGAGATCCCAGATTCAATCTCTC  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTTGACTATGCCCATATGGTGTCCTTGAGATCCCAGATTCAATCTCTC  885

seq1  ATGGACACCAAGGGACAACTCTAGATGAAAATTTGCATTGGCAGCTGGGG  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGACACCAAGGGACAACTCTAGATGAAAATTTGCATTGGCAGCTGGGG  935

seq1  CTGAGGTCATACTAGCATTACCATAGTTTGTCGCATCTTGTTTGAAGGGA  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGGTCATACTAGCATTACCATAGTTTGTCGCATCTTGTTTGAAGGGA  985

seq1  ATGCTAAATTCTAGTTAGAGGCTCATAAACTTGAAGTCTTTTAGTTTGTT  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTAAATTCTAGTTAGAGGCTCATAAACTTGAAGTCTTTTAGTTTGTT  1035

seq1  TCATTTTGTTCTTATGCAAGTTCATAGACCTAGAACTCTGAAGTCAGGGT  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTTTGTTCTTATGCAAGTTCATAGACCTAGAACTCTGAAGTCAGGGT  1085

seq1  TAGTGGCACTGTCCTAGATCAGCTGTACTGAAAAGGTCATCTGTACTGAG  1149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTGGCACTGTCCTAGATCAGCTGTACTGAAAAGGTCATCTGTACTGAG  1135

seq1  CTGCTTTTCTCTCTGTTCTCTAGCCCTGCATGAATTC  1186
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTTTTCTCTCTGTTCTCTAGCCCTGCATGAATTC  1172

seq1: chr2_145163319_145164469
seq2: B6Ng01-150L02.g_67_1210

seq1  GAATTCATTCCAATATGATGTCATAATCTGAGGCTTGTAAGCCCTTCATG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTCCAATATGATGTCATAATCTGAGGCTTGTAAGCCCTTCATG  50

seq1  TGACCTCAGAAAGACAGTCTGGCTAATTCAAGAGGGGGTGGTAAGTGTCC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACCTCAGAAAGACAGTCTGGCTAATTCAAGAGGGGGTGGTAAGTGTCC  100

seq1  CTAGTGACTCTCCTGGGATCTCCCTTAGTTTGACTTTGTAACTAATTAGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGTGACTCTCCTGGGATCTCCCTTAGTTTGACTTTGTAACTAATTAGA  150

seq1  ACTAATAACCACTGAAGTCATGCATCTTTGATTGGGCTTCTCCCCCCTCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAATAACCACTGAAGTCATGCATCTTTGATTGGGCTTCTCCCCCCTCC  200

seq1  AGGCCTGAGTACGACATATTTGCTTGGAGAAGTTCTACCCCAACAAAGCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCCTGAGTACGACATATTTGCTTGGAGAAGTTCTACCCCAACAAAGCC  250

seq1  TTTAGATATGAACAGGAGGGGATGTTTCCATGGTATATTGTCACTGTTCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGATATGAACAGGAGGGGATGTTTCCATGGTATATTGTCACTGTTCA  300

seq1  CCTAGCATGTAATCCTAGGCTGTCTTGATTAACTGACATGAGGGAGGCTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAGCATGTAATCCTAGGCTGTCTTGATTAACTGACATGAGGGAGGCTC  350

seq1  AGCCCCTTTCACAAGTCCCTGAGCTTCCTAGGTCAGGCTCCAAATGTGTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCCCTTTCACAAGTCCCTGAGCTTCCTAGGTCAGGCTCCAAATGTGTT  400

seq1  TTATTTTTATATCCCACAATATCTTCGGGCTATAGTGAACATATTAGTCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTTTTATATCCCACAATATCTTCGGGCTATAGTGAACATATTAGTCA  450

seq1  GGGTTCTCCTGAGGAGCAGAATCAATAGAATATATACAACTATAAGGATT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTTCTCCTGAGGAGCAGAATCAATAGAATATATACAACTATAAGGATT  500

seq1  TATTAGACTGTCTCATATGATTAAAGGCTGAACCATCTTACAGTGGCTGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTAGACTGTCTCATATGATTAAAGGCTGAACCATCTTACAGTGGCTGA  550

seq1  CTTAAGCAGTAGAGTCTAGTAAGCCAGTGGCTACTCAGTGTAAGAAGCTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAAGCAGTAGAGTCTAGTAAGCCAGTGGCTACTCAGTGTAAGAAGCTG  600

seq1  GGAGTCTCAAAACAAAGTAGACCAAAGATGTAGCCTCAGTTAAAGGTTGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGTCTCAAAACAAAGTAGACCAAAGATGTAGCCTCAGTTAAAGGTTGA  650

seq1  AGACCTAGGATCTCCTTGAAGAGTTGCTGGTCCAAATCATGAGCCTGAGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACCTAGGATCTCCTTGAAGAGTTGCTGGTCCAAATCATGAGCCTGAGA  700

seq1  TATCTGGAATTTGAAGTACATAGGTAACACAAACCAGCACAATTCAAACT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTGGAATTTGAAGTACATAGGTAACACAAACCAGCACAATTCAAACT  750

seq1  TGCTCTGAAAGGCACTGAACACACCCAAGCTTCCCTCCCTGCTGCTGTTC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCTGAAAGGCACTGAACACACCCAAGCTTCCCTCCCTGCTGCTGTTC  800

seq1  TGTCCCACCTGGACCTACTAGGTCCAGGTCTACTGGATAGACCCATGGTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCCCACCTGGACCTACTAGGTCCAGGTCTACTGGATAGACCCATGGTG  850

seq1  GAGCTCTCACACTCAGTTTACTGACACATACTCAAACCTTCTTTGAAAGG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTCTCACACTCAGTTTACTGACACATACTCAAACCTTCTTTGAAAGG  900

seq1  ACTTT-CCTAAACACACCCCAAAGCATGTTCTAGATGACTTTGGATCCC-  948
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  ACTTTCCCTAAACACACCCCAAAGCATGTTCTAGATGACTTTGGATCCCT  950

seq1  TTTAGTGTTGACAGCCAACACAGACTATCACAATGAGGCTCCTTAGTGAC  998
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||
seq2  TTTAGTGTTGACAGCCAACACAGACTATCACAATGA-GCT-CTTAGTGAC  998

seq1  TAAAAGATTGAAGGATTGTTGGTGACTCAACATGTCTCCAGACTCATCAT  1048
      |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAGATTGAAGGATTGTTTGTGACTC-ACATGTCTCCAGACTCATCAT  1047

seq1  GAGTCCAGACCTGTTAACTGAAGAATGTTAACAGACTCCCTAGTCTGACA  1098
      |||| ||||||||||||||||   |||||||   ||||||||| ||||||
seq2  GAGTTCAGACCTGTTAACTGA--GATGTTAAAGAACTCCCTAG-CTGACA  1094

seq1  AAGAATTGC-TTGCATTCTTGCATTCCCACCATTCAGTTTTCTTTATGT-  1146
      |   ||||| |||||||| |||| | |||||||||||  |||||||||| 
seq2  A--GATTGCTTTGCATTC-TGCAATTCCACCATTCAG--TTCTTTATGTG  1139

seq1  GCATA  1151
      |||||
seq2  GCATA  1144