BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-152F06
Chromosome2 (Build37)
Map Location 41,673,402 - 41,790,453
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLrp1b
Upstream geneLOC100042629
Downstream geneLOC625094
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-152F06.bB6Ng01-152F06.g
ACCDH947929DH947930
length9801,113
definitionDH947929|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-152F06, 5' end.DH947930|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-152F06, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(41,789,470 - 41,790,453)(41,673,402 - 41,674,514)
sequence
gaattcaataagtttaacacagtaactttgttattattttggttctctgt
tctaaatattttttgattttattatgaaatttatttactatttccatgtt
ttagcctactgggcaaagcacaaactccattatagagatgatattccatt
tctttcagcttcatcctccagcatttgttttcgtactaacattatttcag
ctaaaacacaattctttgatcatactcatttacacagtgggcatttgaat
tttgtttgtcagtgttcagtatttaaagcaatttacactgagatatttct
atctatcacaagaatagatattaatgctgggaagctctattaaggataat
gacttaatgatgtttgagtgaactaaactatcatttctcacattgcttat
ttctatcttgctgtaacattgtatttattcattcgctagagagatattta
tcaaagttatatgtgtgtgactgtgtgttgggtgtatgagacttagaagt
aacatgtgattacacgtaagctccagggatcctcatttaaggagaaaata
ttcacaaaatattttggggctggagggatggttaaaggatctctatttgg
ttagtatcactcacatttggtggctcaaccttcttgtaatcctatgtctc
aagatgctaagaagctctttagtcctctgtgtttagaaacccagacaaag
acaggaacataagcatttatttaaaagtcaaaaatagttaggtaagctga
aggggatggcaatcacagaggaggaccaacagtatcagttaatctggaac
cctgggatatggcagagactaagtcatcaaccagagagcatacatggcct
ggtctgtggcccaggaacatttgtagcagaggaataccttgtctggcctc
agcagagagatatacctaattctgtagagacttgatgcccagggaagagg
agagggatatgatctgggggtgggtaggtg
gaattccactggttcaatagccactgtgcagagctcagtaagatactgaa
caagcagcctcatacagctaatccttctaattcacttgacttttgccagg
caaaagtcttatcttcagcctaacatgtttatttgataacagtggctcag
caagaatatgaattattatttagagataaagtaatgctagcaaattgaat
ttatgaataaatgcttttcaattttctttttgatcatgaacaaagaattc
atgttaggagtattttcaccatgtagaaggcagatgaatttcatcatgga
agggtacacaggactttcactatgtagcaagcaagtgacttttcccatgt
agcaataagataatttcaaatttcatcaaagagagagcaaaggtatctaa
ataggtgtgtctgcaagcaaatgcaaaccatcatatttcaaatgaagtgc
aacagaagaacttctgaaaaaatatgtacatagactgaagaataccaaca
cttctgaggtaaaagatatatatatatatatatatatatatatataattc
aaaaattgacaaatataaaagtacaaaaaacctttggtttgggcttattt
tttttagagagataaaagatagtagctacttttcaatactcacattttga
acatgaagaaattaagcatatagatactaagtaacagtgtagagactaca
gaagtgttaatattagcaaggcactcaatgtttaaaagacagacaataca
ttcaggtatttaaatgacagaacggtggctttgtgatgcaaggagctttg
ttctattcttttcactaatgatcttagattttgactgggttatgaatggg
ttcatgatagatgcacatacatgattttcttaatccattgtaatatgtgt
atgagattcaagtatttgttaataatgttataatattttgttttattctg
gagagatggtgcagcagttacaggtacttgctactcttaatgagtaacca
catttggctagcagctccctcccacatcagacagtattcaatttcattat
actcatttctaagggatctaatatattcttctgcaatccgcagaattcat
catgcaggtgatg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_41789470_41790453
seq2: B6Ng01-152F06.b_46_1025 (reverse)

seq1  CACCTACCCACCCCCAGATCATATCCCTCTCCTCCTTCCCTGGGCATCAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  CACCTACCCACCCCCAGATCATATCCCTCTCCT-CTTCCCTGGGCATCAA  49

seq1  GTCTCTACAGAATTAGGTATATTCTCTCTTGCTGAGGCCAGACAAGGTAT  100
      ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||
seq2  GTCTCTACAGAATTAGGTATA-TCTCTC-TGCTGAGGCCAGACAAGGTAT  97

seq1  TCCTCTGCTACAAATGTTCCTGGGGCCACAGACCAGGCCATGTATGCTCT  150
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCTGCTACAAATGTTCCT-GGGCCACAGACCAGGCCATGTATGCTCT  146

seq1  CTGGTTGATGACTTAGTCTCTGCCATATCCCAGGGTTCCAGATTAACTGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTTGATGACTTAGTCTCTGCCATATCCCAGGGTTCCAGATTAACTGA  196

seq1  TACTGTTGGTCCTCCTCTGTGATTGCCATCCCCTTCAGCTTACCTAACTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTGTTGGTCCTCCTCTGTGATTGCCATCCCCTTCAGCTTACCTAACTA  246

seq1  TTTTTGACTTTTAAATAAATGCTTATGTTCCTGTCTTTGTCTGGGTTTCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTGACTTTTAAATAAATGCTTATGTTCCTGTCTTTGTCTGGGTTTCT  296

seq1  AAACACAGAGGACTAAAGAGCTTCTTAGCATCTTGAGACATAGGATTACA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACACAGAGGACTAAAGAGCTTCTTAGCATCTTGAGACATAGGATTACA  346

seq1  AGAAGGTTGAGCCACCAAATGTGAGTGATACTAACCAAATAGAGATCCTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGGTTGAGCCACCAAATGTGAGTGATACTAACCAAATAGAGATCCTT  396

seq1  TAACCATCCCTCCAGCCCCAAAATATTTTGTGAATATTTTCTCCTTAAAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACCATCCCTCCAGCCCCAAAATATTTTGTGAATATTTTCTCCTTAAAT  446

seq1  GAGGATCCCTGGAGCTTACGTGTAATCACATGTTACTTCTAAGTCTCATA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGATCCCTGGAGCTTACGTGTAATCACATGTTACTTCTAAGTCTCATA  496

seq1  CACCCAACACACAGTCACACACATATAACTTTGATAAATATCTCTCTAGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCCAACACACAGTCACACACATATAACTTTGATAAATATCTCTCTAGC  546

seq1  GAATGAATAAATACAATGTTACAGCAAGATAGAAATAAGCAATGTGAGAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGAATAAATACAATGTTACAGCAAGATAGAAATAAGCAATGTGAGAA  596

seq1  ATGATAGTTTAGTTCACTCAAACATCATTAAGTCATTATCCTTAATAGAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGATAGTTTAGTTCACTCAAACATCATTAAGTCATTATCCTTAATAGAG  646

seq1  CTTCCCAGCATTAATATCTATTCTTGTGATAGATAGAAATATCTCAGTGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCCAGCATTAATATCTATTCTTGTGATAGATAGAAATATCTCAGTGT  696

seq1  AAATTGCTTTAAATACTGAACACTGACAAACAAAATTCAAATGCCCACTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTGCTTTAAATACTGAACACTGACAAACAAAATTCAAATGCCCACTG  746

seq1  TGTAAATGAGTATGATCAAAGAATTGTGTTTTAGCTGAAATAATGTTAGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAAATGAGTATGATCAAAGAATTGTGTTTTAGCTGAAATAATGTTAGT  796

seq1  ACGAAAACAAATGCTGGAGGATGAAGCTGAAAGAAATGGAATATCATCTC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGAAAACAAATGCTGGAGGATGAAGCTGAAAGAAATGGAATATCATCTC  846

seq1  TATAATGGAGTTTGTGCTTTGCCCAGTAGGCTAAAACATGGAAATAGTAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAATGGAGTTTGTGCTTTGCCCAGTAGGCTAAAACATGGAAATAGTAA  896

seq1  ATAAATTTCATAATAAAATCAAAAAATATTTAGAACAGAGAACCAAAATA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAATTTCATAATAAAATCAAAAAATATTTAGAACAGAGAACCAAAATA  946

seq1  ATAACAAAGTTACTGTGTTAAACTTATTGAATTC  984
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAACAAAGTTACTGTGTTAAACTTATTGAATTC  980

seq1: chr2_41673402_41674514
seq2: B6Ng01-152F06.g_66_1178

seq1  GAATTCCACTGGTTCAATAGCCACTGTGCAGAGCTCAGTAAGATACTGAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCACTGGTTCAATAGCCACTGTGCAGAGCTCAGTAAGATACTGAA  50

seq1  CAAGCAGCCTCATACAGCTAATCCTTCTAATTCACTTGACTTTTGCCAGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGCAGCCTCATACAGCTAATCCTTCTAATTCACTTGACTTTTGCCAGG  100

seq1  CAAAAGTCTTATCTTCAGCCTAACATGTTTATTTGATAACAGTGGCTCAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAAGTCTTATCTTCAGCCTAACATGTTTATTTGATAACAGTGGCTCAG  150

seq1  CAAGAATATGAATTATTATTTAGAGATAAAGTAATGCTAGCAAATTGAAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGAATATGAATTATTATTTAGAGATAAAGTAATGCTAGCAAATTGAAT  200

seq1  TTATGAATAAATGCTTTTCAATTTTCTTTTTGATCATGAACAAAGAATTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATGAATAAATGCTTTTCAATTTTCTTTTTGATCATGAACAAAGAATTC  250

seq1  ATGTTAGGAGTATTTTCACCATGTAGAAGGCAGATGAATTTCATCATGGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTAGGAGTATTTTCACCATGTAGAAGGCAGATGAATTTCATCATGGA  300

seq1  AGGGTACACAGGACTTTCACTATGTAGCAAGCAAGTGACTTTTCCCATGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTACACAGGACTTTCACTATGTAGCAAGCAAGTGACTTTTCCCATGT  350

seq1  AGCAATAAGATAATTTCAAATTTCATCAAAGAGAGAGCAAAGGTATCTAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAATAAGATAATTTCAAATTTCATCAAAGAGAGAGCAAAGGTATCTAA  400

seq1  ATAGGTGTGTCTGCAAGCAAATGCAAACCATCATATTTCAAATGAAGTGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGGTGTGTCTGCAAGCAAATGCAAACCATCATATTTCAAATGAAGTGC  450

seq1  AACAGAAGAACTTCTGAAAAAATATGTACATAGACTGAAGAATACCAACA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGAAGAACTTCTGAAAAAATATGTACATAGACTGAAGAATACCAACA  500

seq1  CTTCTGAGGTAAAAGATATATATATATATATATATATATATATATAATTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTGAGGTAAAAGATATATATATATATATATATATATATATATAATTC  550

seq1  AAAAATTGACAAATATAAAAGTACAAAAAACCTTTGGTTTGGGCTTATTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAATTGACAAATATAAAAGTACAAAAAACCTTTGGTTTGGGCTTATTT  600

seq1  TTTTTAGAGAGATAAAAGATAGTAGCTACTTTTCAATACTCACATTTTGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTAGAGAGATAAAAGATAGTAGCTACTTTTCAATACTCACATTTTGA  650

seq1  ACATGAAGAAATTAAGCATATAGATACTAAGTAACAGTGTAGAGACTACA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGAAGAAATTAAGCATATAGATACTAAGTAACAGTGTAGAGACTACA  700

seq1  GAAGTGTTAATATTAGCAAGGCACTCAATGTTTAAAAGACAGACAATACA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTGTTAATATTAGCAAGGCACTCAATGTTTAAAAGACAGACAATACA  750

seq1  TTCAGGTATTTAAATGACAGAACGGTGGCTTTGTGATGCAAGGAGCTTTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGGTATTTAAATGACAGAACGGTGGCTTTGTGATGCAAGGAGCTTTG  800

seq1  TTCTATTCTTTTCACTAATGATCTTAGATTTTGACTGGGTTATGAATGGG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTATTCTTTTCACTAATGATCTTAGATTTTGACTGGGTTATGAATGGG  850

seq1  TTCATGATAGATGCACATACATGATTTTCTTAATCCATTGTAATATGTGT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATGATAGATGCACATACATGATTTTCTTAATCCATTGTAATATGTGT  900

seq1  ATGAGAATCAAGTATTTGTTAATAATGTTATAATATTT--GTTTATTCTG  948
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||
seq2  ATGAGATTCAAGTATTTGTTAATAATGTTATAATATTTTGTTTTATTCTG  950

seq1  GAGAGATGGTGCAGCAGTTACAGGTACTTGCTACTCTTAATGAGTAACCA  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGATGGTGCAGCAGTTACAGGTACTTGCTACTCTTAATGAGTAACCA  1000

seq1  CATTTGGCTAGCAGCTCCCTCCCACATCAGACAGTATTCAATTTCATATA  1048
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   
seq2  CATTTGGCTAGCAGCTCCCTCCCACATCAGACAGTATTCAATTTCATTAT  1050

seq1  ACTCCATTTCTAAGGGATCTAATATTATCTTCTGTAAATCACGCAG-ATC  1097
      ||| |||||||||||||||||||||  |||||||  |||| ||||| || 
seq2  ACT-CATTTCTAAGGGATCTAATATATTCTTCTG-CAATC-CGCAGAATT  1097

seq1  AATCATGCAGGTGATG  1113
       |||||||||||||||
seq2  CATCATGCAGGTGATG  1113