BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-154J21
Chromosome2 (Build37)
Map Location 76,614,993 - 76,752,533
singlet/doubletdoublet
Overlap geneTtn
Upstream geneLOC623453, Agps, Ttc30b, Ttc30a2, Ttc30a1, Pde11a, Cyct, Drbp1, Osbpl6, Prkra, Dfnb59, Fkbp7, Plekha3
Downstream gene2610301F02Rik, Sestd1, LOC623706, LOC667906, Zfp533, BC003993
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-154J21.bB6Ng01-154J21.g
ACCDH949615DH949616
length1,1331,041
definitionDH949615|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-154J21, 5' end.DH949616|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-154J21, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(76,614,993 - 76,616,131)(76,751,491 - 76,752,533)
sequence
gaattcttttagctcaatggctggtgggcctagattattgacaacaagaa
caaatgttaacataaggagtaaaacgcactaaagaacagacagtgaaatt
cactgtggtttgaggcctgtttgggttgactgtagttacatttcattgtc
caagctgatagaaaacctgggtctctctttagcacagttatactcaacag
ttacatgtagctatcctttattggatctgtgcacagatacctatctgctc
ttgtctctcctttaatcatgctttaacatacatgcagaaattctgacaaa
gggcagcaaggagggaatgtcatggcagtttatgcctgtcacttcagtca
tgtttttctttactaattctttactaagagttatgaagtcatttcaatgc
tcattttttttataagaaatagaattgctggtagaagccaaatacttttc
tattttctataaatgtattataagtgtgcaaaggggattggcacattcat
aagaccaaaaaaatataccatgtatttttgtaacaataatttgaagaggc
ttatttatgtatgcatgttatcttccaaaactaaaatgggtattctcaat
agagggaaagtctcatttgaaaagctacattggccttagtaggtgctaag
taaattccttgctttcagctcctttcaatttctttcatttctaacagatg
agagagcttgtcttgtgggaaagtagaaggaggatactggatgcttcttg
tttatagtaaaagcaatatgggagggtatttgctaattctgtccataatg
gggtaataagttattgactaatgtgtccatgcctatatgtagtccatggg
ggtcctctgataggtgttctgtctctattagatacaagaaggtaacccta
gaggaggaaattctcggttaaatacgtacatgtctggtctttgacaatca
caggaccaacagtggctgaagcttgctgaccccggcctcgttgacgcttt
gactctgaattcatattcccctccctctatgaggtcttccacggtgaact
cagttcttcccattcacgcctattgcactgcctccagcttctttcttttc
ccggtaggttccaagccaaaactccaacaatat
gaattccaggtggtggatggccctcccaggttcatcaaaggcatttcaga
ttgccacgcacccttagggacagcggcatatttccagtgtttagtccgtg
gttcaccgagacccaccgtttcttggtacaaagatgggaaactggtccaa
ggatcacggttcagtgctgaggaaagtggcatagggttccacaatttgtt
cataacaggcttagttaaaggtgacgagggggaatacagctgtgtagcta
caaacaactcgggaatggctaggagctcagctatcctcaccctctcttaa
cgtgggatggctcagggcctctgccactcccagagtctatggattagtaa
ccttccaagtgtagccactgtatttggatcatgatactgacgacccctgg
agatggtctttctgtgtagaaatctcatcttactcatgcatgtaaatatt
ctgtgatctaaatcctgaaaccatcacctgtgtcagttgcaccatgtatc
atccagcatgattaaacaccttcttggatacccacttgtttgtgtttgtg
tttgtgcttctctgtcacttctcctccgcagagtggctcagcattctctt
tcagcgggtacactatagatgcaaggtagaagggtgatcatgttggataa
ccgtgtggataaactggtaagagaaaactccctccagccctaggtcactt
ttgaattagaagcctcttagcattcagacaaacctatgctgatttagtta
gatataggagggtaaaatgagtaataaactcagtgttgcccaaatgatag
ccaacttcatagtctgtttatgttgcagtcttgataattgggcatgcata
aaggttttggtctttccacatttgggaatattttaatttctcatttggga
catcaagtgaagtgcagtataatttgtcattgacctggggtattattcat
ctgaatataaatttttaactgcatgccaatgtagaatctctaaattagac
aaaaggtaggacccttttatattgagacgtatgatagtttt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_76614993_76616131
seq2: B6Ng01-154J21.b_45_1177

seq1  GAATTCTTTTAGCTCAATGGCTGGTGGGCCTAGATTATTGACAACAAGAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTTAGCTCAATGGCTGGTGGGCCTAGATTATTGACAACAAGAA  50

seq1  CAAATGTTAACATAAGGAGTAAAACGCACTAAAGAACAGACAGTGAAATT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATGTTAACATAAGGAGTAAAACGCACTAAAGAACAGACAGTGAAATT  100

seq1  CACTGTGGTTTGAGGCCTGTTTGGGTTGACTGTAGTTACATTTCATTGTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGTGGTTTGAGGCCTGTTTGGGTTGACTGTAGTTACATTTCATTGTC  150

seq1  CAAGCTGATAGAAAACCTGGGTCTCTCTTTAGCACAGTTATACTCAACAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGCTGATAGAAAACCTGGGTCTCTCTTTAGCACAGTTATACTCAACAG  200

seq1  TTACATGTAGCTATCCTTTATTGGATCTGTGCACAGATACCTATCTGCTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACATGTAGCTATCCTTTATTGGATCTGTGCACAGATACCTATCTGCTC  250

seq1  TTGTCTCTCCTTTAATCATGCTTTAACATACATGCAGAAATTCTGACAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTCTCTCCTTTAATCATGCTTTAACATACATGCAGAAATTCTGACAAA  300

seq1  GGGCAGCAAGGAGGGAATGTCATGGCAGTTTATGCCTGTCACTTCAGTCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCAGCAAGGAGGGAATGTCATGGCAGTTTATGCCTGTCACTTCAGTCA  350

seq1  TGTTTTTCTTTACTAATTCTTTACTAAGAGTTATGAAGTCATTTCAATGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTTTCTTTACTAATTCTTTACTAAGAGTTATGAAGTCATTTCAATGC  400

seq1  TCATTTTTTTTATAAGAAATAGAATTGCTGGTAGAAGCCAAATACTTTTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTTTTTTTATAAGAAATAGAATTGCTGGTAGAAGCCAAATACTTTTC  450

seq1  TATTTTCTATAAATGTATTATAAGTGTGCAAAGGGGATTGGCACATTCAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTTCTATAAATGTATTATAAGTGTGCAAAGGGGATTGGCACATTCAT  500

seq1  AAGACCAAAAAAATATACCATGTATTTTTGTAACAATAATTTGAAGAGGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGACCAAAAAAATATACCATGTATTTTTGTAACAATAATTTGAAGAGGC  550

seq1  TTATTTATGTATGCATGTTATCTTCCAAAACTAAAATGGGTATTCTCAAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTTATGTATGCATGTTATCTTCCAAAACTAAAATGGGTATTCTCAAT  600

seq1  AGAGGGAAAGTCTCATTTGAAAAGCTACATTGGCCTTAGTAGGTGCTAAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGGAAAGTCTCATTTGAAAAGCTACATTGGCCTTAGTAGGTGCTAAG  650

seq1  TAAATTCCTTGCTTTCAGCTCCTTTCAATTTCTTTCATTTCTAACAGATG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATTCCTTGCTTTCAGCTCCTTTCAATTTCTTTCATTTCTAACAGATG  700

seq1  AGAGAGCTTGTCTTGTGGGAAAGTAGAAGGAGGATACTGGATGCTTCTTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAGCTTGTCTTGTGGGAAAGTAGAAGGAGGATACTGGATGCTTCTTG  750

seq1  TTTATAGTAAAAGCAATATGGGAGGGTATTTGCTAATTCTGTCCATAATG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATAGTAAAAGCAATATGGGAGGGTATTTGCTAATTCTGTCCATAATG  800

seq1  GGGTAATAAGTTATTGACTAATGTGTCCATGCCTATATGTAGTCCATGGG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTAATAAGTTATTGACTAATGTGTCCATGCCTATATGTAGTCCATGGG  850

seq1  GGTCCTCTGATAGGTGTTCTGTCTCTATTAGATACAAGAAGGTAACCCTA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCCTCTGATAGGTGTTCTGTCTCTATTAGATACAAGAAGGTAACCCTA  900

seq1  GAGGAGGAAATTCTCGGTTAAATACGTACATGTCTGGTCTTTGACAATCA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGAGGAAATTCTCGGTTAAATACGTACATGTCTGGTCTTTGACAATCA  950

seq1  CAGGACCAACAGTGGCTGAAGGCTTGCTGACCCCGGCCTCGTTGACGGCT  1000
      |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  CAGGACCAACAGTGGCTGAA-GCTTGCTGACCCCGGCCTCGTTGAC-GCT  998

seq1  TTGACTCTGAATTCATATTCCCCTCCCTCTATGAGGTCTTCCACGGTGAA  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGACTCTGAATTCATATTCCCCTCCCTCTATGAGGTCTTCCACGGTGAA  1048

seq1  CTCCAGTTCTTCCACATCACGCCTATTGCACTGCCTCCAGGCTTCTTTCT  1100
      || ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||| 
seq2  CT-CAGTTCTTCCCATTCACGCCTATTGCACTGCCTCCA-GCTTCTTTC-  1095

seq1  TTTTCCCGGTAGGGTCCCAAGCCAAACACT-CAACAATAT  1139
      ||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||
seq2  TTTTCCCGGTA-GGTTCCAAGCCAAA-ACTCCAACAATAT  1133

seq1: chr2_76751491_76752533
seq2: B6Ng01-154J21.g_64_1104 (reverse)

seq1  AAAACTATCATACGTCTCAATTATAAAAGTGTCCTACCTTTTGTCTAATT  50
      |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  AAAACTATCATACGTCTCAA-TATAAAAGGGTCCTACCTTTTGTCTAATT  49

seq1  TAGAGATTCTGACATTGGCATGCAGTTAAAAATTTATATTCAGATGAATA  100
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGATTCT-ACATTGGCATGCAGTTAAAAATTTATATTCAGATGAATA  98

seq1  ATACCCCAGGTCAATGACAAATTATACTGCACTTCACTTGATGTCCCAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACCCCAGGTCAATGACAAATTATACTGCACTTCACTTGATGTCCCAAA  148

seq1  TGAGAAATTAAAATATTTCCAAATGTGGAAAGACCAAAACCTTTATGCAT  200
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGAAATTAAAATATTCCCAAATGTGGAAAGACCAAAACCTTTATGCAT  198

seq1  GCCCAATTATCAAGACTGCAACATAAACAGACTATGAAGTTGGCTATCAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCAATTATCAAGACTGCAACATAAACAGACTATGAAGTTGGCTATCAT  248

seq1  TTGGGCAACACTGAGTTTATTACTCATTTTACCCTCCTATATCTAACTAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGCAACACTGAGTTTATTACTCATTTTACCCTCCTATATCTAACTAA  298

seq1  ATCAGCATAGGTTTGTCTGAATGCTAAGAGGCTTCTAATTCAAAAGTGAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAGCATAGGTTTGTCTGAATGCTAAGAGGCTTCTAATTCAAAAGTGAC  348

seq1  CTAGGGCTGGAGGGAGTTTTCTCTTACCAGTTTATCCACACGGTTATCCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGGGCTGGAGGGAGTTTTCTCTTACCAGTTTATCCACACGGTTATCCA  398

seq1  ACATGATCACCCTTCTACCTTGCATCTATAGTGTACCCGCTGAAAGAGAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGATCACCCTTCTACCTTGCATCTATAGTGTACCCGCTGAAAGAGAA  448

seq1  TGCTGAGCCACTCTGCGGAGGAGAAGTGACAGAGAAGCACAAACACAAAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGAGCCACTCTGCGGAGGAGAAGTGACAGAGAAGCACAAACACAAAC  498

seq1  ACAAACAAGTGGGTATCCAAGAAGGTGTTTAATCATGCTGGATGATACAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAACAAGTGGGTATCCAAGAAGGTGTTTAATCATGCTGGATGATACAT  548

seq1  GGTGCAACTGACACAGGTGATGGTTTCAGGATTTAGATCACAGAATATTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGCAACTGACACAGGTGATGGTTTCAGGATTTAGATCACAGAATATTT  598

seq1  ACATGCATGAGTAAGATGAGATTTCTACACAGAAAGACCATCTCCAGGGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGCATGAGTAAGATGAGATTTCTACACAGAAAGACCATCTCCAGGGG  648

seq1  TCGTCAGTATCATGATCCAAATACAGTGGCTACACTTGGAAGGTTACTAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGTCAGTATCATGATCCAAATACAGTGGCTACACTTGGAAGGTTACTAA  698

seq1  TCCATAGACTCTGGGAGTGGCAGAGGCCCTGAGCCATCCCACGTTAAGAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATAGACTCTGGGAGTGGCAGAGGCCCTGAGCCATCCCACGTTAAGAG  748

seq1  AGGGTGAGGATAGCTGAGCTCCTAGCCATTCCCGAGTTGTTTGTAGCTAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTGAGGATAGCTGAGCTCCTAGCCATTCCCGAGTTGTTTGTAGCTAC  798

seq1  ACAGCTGTATTCCCCCTCGTCACCTTTAACTAAGCCTGTTATGAACAAAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGCTGTATTCCCCCTCGTCACCTTTAACTAAGCCTGTTATGAACAAAT  848

seq1  TGTGGAACCCTATGCCACTTTCCTCAGCACTGAACCGTGATCCTTGGACC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGAACCCTATGCCACTTTCCTCAGCACTGAACCGTGATCCTTGGACC  898

seq1  AGTTTCCCATCTTTGTACCAAGAAACGGTGGGTCTCGGTGAACCACGGAC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTCCCATCTTTGTACCAAGAAACGGTGGGTCTCGGTGAACCACGGAC  948

seq1  TAAACACTGGAAATATGCCGCTGTCCCTAAGGGTGCGTGGCAATCTGAAA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAACACTGGAAATATGCCGCTGTCCCTAAGGGTGCGTGGCAATCTGAAA  998

seq1  TGCCTTTGATGAACCTGGGAGGGCCATCCACCACCTGGAATTC  1043
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTTTGATGAACCTGGGAGGGCCATCCACCACCTGGAATTC  1041