BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-158E11
Chromosome2 (Build37)
Map Location 118,497,569 - 118,615,622
singlet/doubletdoublet
Overlap genePak6, Gm1337, Plcb2, LOC100043272, A430105I19Rik, Disp2
Upstream geneThbs1, Fsip1, Gpr176, 1700054M17Rik, Eif2ak4, Srp14, LOC668859, Bmf, LOC640461, Bub1b
Downstream geneD2Ertd750e, Ivd, Bahd1, Chst14, LOC677379, Ccdc32, Rpusd2, Casc5, Rad51, 1200015F23Rik, Gchfr, Dnajc17, OTTMUSG00000015762, LOC545640, Zfyve19, Ppp1r14d, Spint1, Rhov, Vps18, LOC100043609, Dll4, Chac1, Inoc1, LOC100043612, Exdl1, 1500003O03Rik, LOC100043307, Oip5, Nusap1, Ndufaf1, LOC625328, LOC100043622, Rtf1, Itpka, Ltk, Rpap1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-158E11.bB6Ng01-158E11.g
ACCDH952275DH952276
length1,064894
definitionDH952275|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-158E11, 5' end.DH952276|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-158E11, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(118,614,553 - 118,615,622)(118,497,569 - 118,498,458)
sequence
gaattcatagaccacgttgcttccggtacacttggcaggaacttgggcac
aaaacgggggtttgtcctggctagaccccacacaagcaggcaccaggaca
ccacgatggtagaaggtggcacagaaccgtagcagggccaatgtgcggtc
tgtatcggcttgggtagtgtcttggcaggaggagcggttagacagcacgg
ccagatagttgcccaaggaccagctggggcagcactcattggctgctgat
cgctggcacagagccccaaaactgatgtgagagcggatctgtagggcaca
caggagtgggggagtgaagctcagagggaaatccaggggcccaggttacc
ttaaccctgtcttgagctctctcacctcttgtcatgctgaagggcagaga
gcaagtattttgactacccaaaggaaatactttgtctcaaagctgtcttt
gcacctcacctagcttctagtaactctatcttggctttatcaaaggcaag
cctggggaggtttccccagacctttcccagaggctaccagaagggctcct
gcagcccctccctgccagctttgcaacttcctaagtcaggaatgggaata
gatgtgacaagccacatatagggcaaggtcaagagaccagggagctggaa
gcaagcagtagaagacattccagggtcagggtcgtggagaacccccagcc
cttctttccctgggttactgaaggcctcttaaggccagaacttcctcttg
ccaccgtgtgcctcctttcctttttaaccccgctgtccccatcacaacag
ctggtgtggggcaaagctcccacctgggagtcagatgccccactctgcca
ttaaccacatgtctagttgacagcgacactgatactatacacttatcaag
tcattcctagtgccagaattatgtcagattcttccaaattcaatctcatt
tcacagtcactttccctataaagggcatactatgtccctatttctattta
cagggctgagatgtagctcagtaatagagcatgtactagtcattcaggta
tctagtttgatccc
gaattcatcatgtctctaaagcaagtgtccttactgtagagatagcttgg
ctccccaggccttcccaggaaggcttagatcatagtccatgtccctggga
agggtgccatggtctgcaaagaggccaatgttcctgaatggcttatctca
ggttaccaggtcccttgggaaggtctggctaattgaaatgaactcccacc
ggcagtttttgtttggagagcagtctagaaaaggttagaatttggggaaa
aggagaaagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagaga
gagagagagagagactgttatgtgtgaggccagaatgcctgagttcttgt
cctatcagcaaatgaatggaaggtcccatcaagtgggcacccttagactt
ttccccaacaataactggatgctaggctgagctgggttcttttctaggcc
atagagtggtatacctgtcgaattggttgagtagttgaccttctagaaga
atctgggattctgctctgtgttgtaccacaatgggcttgactgatcttta
tggaaggtgtgtgtatccactgtgtgtgtacactgtgagtgtgtgtgtgt
ggtctttcttactctttcatccattgtgttcactcagtttggaggtgctg
gtcccaaggacctctgcaccccaatgcttagaccttatcacttcaccctc
ccaaggggaagggagcaaagtttcccccactatccacatcaagaaatcaa
agctgaggtcatgggaacacccagacagggcagggaattggtggtttcta
cagctaagctctgtcttgactcttcttgcgggaggaccaaagggtctgat
aaagttagctttcaactctggttctcgggcccttagagccaggc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_118614553_118615622
seq2: B6Ng01-158E11.b_45_1108 (reverse)

seq1  GGGATCAAACTTAGATACTTGAATGGACTAAGTACATGCTCTATTACTGA  50
      |||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||
seq2  GGGATCAAAC-TAGATACCTGAAT-GACT-AGTACATGCTCTATTACTGA  47

seq1  GCTACATCCTCAGCCCTGTAAATATGAAATAGGGACAATAGTATGCCCTT  100
      ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||
seq2  GCTACAT-CTCAGCCCTGTAAATA-GAAATAGGGAC-ATAGTATGCCCTT  94

seq1  TATAGGGAAAGTGACTGTGAAATGAGATTGAATTTGGAAGAATCTGACAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAGGGAAAGTGACTGTGAAATGAGATTGAATTTGGAAGAATCTGACAT  144

seq1  AATTCTGGCACTAGGAATGACTTGATAAGTGTATAGTATCAGTGTCGCTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTCTGGCACTAGGAATGACTTGATAAGTGTATAGTATCAGTGTCGCTG  194

seq1  TCAACTAGACATGTGGTTAATGGCAGAGTGGGGCATCTGACTCCCAGGTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAACTAGACATGTGGTTAATGGCAGAGTGGGGCATCTGACTCCCAGGTG  244

seq1  GGAGCTTTGCCCCACACCAGCTGTTGTGATGGGGACAGCGGGGTTAAAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGCTTTGCCCCACACCAGCTGTTGTGATGGGGACAGCGGGGTTAAAAA  294

seq1  GGAAAGGAGGCACACGGTGGCAAGAGGAAGTTCTGGCCTTAAGAGGCCTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAAGGAGGCACACGGTGGCAAGAGGAAGTTCTGGCCTTAAGAGGCCTT  344

seq1  CAGTAACCCAGGGAAAGAAGGGCTGGGGGTTCTCCACGACCCTGACCCTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTAACCCAGGGAAAGAAGGGCTGGGGGTTCTCCACGACCCTGACCCTG  394

seq1  GAATGTCTTCTACTGCTTGCTTCCAGCTCCCTGGTCTCTTGACCTTGCCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGTCTTCTACTGCTTGCTTCCAGCTCCCTGGTCTCTTGACCTTGCCC  444

seq1  TATATGTGGCTTGTCACATCTATTCCCATTCCTGACTTAGGAAGTTGCAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATGTGGCTTGTCACATCTATTCCCATTCCTGACTTAGGAAGTTGCAA  494

seq1  AGCTGGCAGGGAGGGGCTGCAGGAGCCCTTCTGGTAGCCTCTGGGAAAGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGGCAGGGAGGGGCTGCAGGAGCCCTTCTGGTAGCCTCTGGGAAAGG  544

seq1  TCTGGGGAAACCTCCCCAGGCTTGCCTTTGATAAAGCCAAGATAGAGTTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGGGAAACCTCCCCAGGCTTGCCTTTGATAAAGCCAAGATAGAGTTA  594

seq1  CTAGAAGCTAGGTGAGGTGCAAAGACAGCTTTGAGACAAAGTATTTCCTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGAAGCTAGGTGAGGTGCAAAGACAGCTTTGAGACAAAGTATTTCCTT  644

seq1  TGGGTAGTCAAAATACTTGCTCTCTGCCCTTCAGCATGACAAGAGGTGAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGTAGTCAAAATACTTGCTCTCTGCCCTTCAGCATGACAAGAGGTGAG  694

seq1  AGAGCTCAAGACAGGGTTAAGGTAACCTGGGCCCCTGGATTTCCCTCTGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCTCAAGACAGGGTTAAGGTAACCTGGGCCCCTGGATTTCCCTCTGA  744

seq1  GCTTCACTCCCCCACTCCTGTGTGCCCTACAGATCCGCTCTCACATCAGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCACTCCCCCACTCCTGTGTGCCCTACAGATCCGCTCTCACATCAGT  794

seq1  TTTGGGGCTCTGTGCCAGCGATCAGCAGCCAATGAGTGCTGCCCCAGCTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGGGCTCTGTGCCAGCGATCAGCAGCCAATGAGTGCTGCCCCAGCTG  844

seq1  GTCCTTGGGCAACTATCTGGCCGTGCTGTCTAACCGCTCCTCCTGCCAAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCTTGGGCAACTATCTGGCCGTGCTGTCTAACCGCTCCTCCTGCCAAG  894

seq1  ACACTACCCAAGCCGATACAGACCGCACATTGGCCCTGCTACGGTTCTGT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACTACCCAAGCCGATACAGACCGCACATTGGCCCTGCTACGGTTCTGT  944

seq1  GCCACCTTCTACCATCGTGGTGTCCTGGTGCCTGCTTGTGTGGGGTCTAG  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCACCTTCTACCATCGTGGTGTCCTGGTGCCTGCTTGTGTGGGGTCTAG  994

seq1  CCAGGACAAACCCCCGTTTTGTGCCCAAGTTCCTGCCAAGTGTACCGGAA  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGACAAACCCCCGTTTTGTGCCCAAGTTCCTGCCAAGTGTACCGGAA  1044

seq1  GCAACGTGGTCTATGAATTC  1070
      ||||||||||||||||||||
seq2  GCAACGTGGTCTATGAATTC  1064

seq1: chr2_118497569_118498458
seq2: B6Ng01-158E11.g_68_961

seq1  GAATTCATCATGTCTCTAAAGCAAGTGTCCTTACTGTAGAGATAGCTTGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATCATGTCTCTAAAGCAAGTGTCCTTACTGTAGAGATAGCTTGG  50

seq1  CTCCCCAGGCCTTCCCAGGAAGGCTTAGATCATAGTCCATGTCCCTGGGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCCAGGCCTTCCCAGGAAGGCTTAGATCATAGTCCATGTCCCTGGGA  100

seq1  AGGGTGCCATGGTCTGCAAAGAGGCCAATGTTCCTGAATGGCTTATCTCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTGCCATGGTCTGCAAAGAGGCCAATGTTCCTGAATGGCTTATCTCA  150

seq1  GGTTACCAGGTCCCTTGGGAAGGTCTGGCTAATTGAAATGAACTCCCACC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTACCAGGTCCCTTGGGAAGGTCTGGCTAATTGAAATGAACTCCCACC  200

seq1  GGCAGTTTTTGTTTGGAGAGCAGTCTAGAAAAGGTTAGAATTTGGGGAAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGTTTTTGTTTGGAGAGCAGTCTAGAAAAGGTTAGAATTTGGGGAAA  250

seq1  AGGAGAA--AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA  298
      |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA  300

seq1  GAGAGAGAGAGAGACTGTTATGTGTGAGGCCAGAATGCCTGAGTTCTTGT  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGAGAGAGAGACTGTTATGTGTGAGGCCAGAATGCCTGAGTTCTTGT  350

seq1  CCTATCAGCAAATGAATGGAAGGTCCCATCAAGTGGGCACCCTTAGACTT  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTATCAGCAAATGAATGGAAGGTCCCATCAAGTGGGCACCCTTAGACTT  400

seq1  TTCCCCAACAATAACTGGATGCTAGGCTGAGCTGGGTTCTTTTCTAGGCC  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCCAACAATAACTGGATGCTAGGCTGAGCTGGGTTCTTTTCTAGGCC  450

seq1  ATAGAGTGGTATACCTGTCGAATTGGTTGAGTAGTTGACCTTCTAGAAGA  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGAGTGGTATACCTGTCGAATTGGTTGAGTAGTTGACCTTCTAGAAGA  500

seq1  ATCTGGGATTCTGCTCTGTGTTGTACCACAATGGGCTTGACTGATCTTTA  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGGGATTCTGCTCTGTGTTGTACCACAATGGGCTTGACTGATCTTTA  550

seq1  TGGAAGGTGTGTGTATCCACTGTGTGTGTACACTGTGAGTGTGTGTGTGT  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAAGGTGTGTGTATCCACTGTGTGTGTACACTGTGAGTGTGTGTGTGT  600

seq1  GGTC-TTCTTACTCTTTCATCCATTGTGTTCACTCAGTTTGGAGGTGCTG  647
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCTTTCTTACTCTTTCATCCATTGTGTTCACTCAGTTTGGAGGTGCTG  650

seq1  GTCCCAAGGACCTCTGCACCCCAATGCTTAGACCTTATCACTTCACCCTC  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCCAAGGACCTCTGCACCCCAATGCTTAGACCTTATCACTTCACCCTC  700

seq1  CCAA-GGGAAGGGAGCAAAGTTTCCCCCACTATCCACATCAAGAAACCAA  746
      |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  CCAAGGGGAAGGGAGCAAAGTTTCCCCCACTATCCACATCAAGAAATCAA  750

seq1  AGCTGAGGTCATGGGAACACCCAGACAGGGCAAGGGAATTGGTGGTTTCT  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  AGCTGAGGTCATGGGAACACCCAGACAGGGC-AGGGAATTGGTGGTTTCT  799

seq1  ACAGCTAAGCTCTG-CCTGCCTCCTCCTGCAGGAGGACCAAAGGGTCTGA  845
      |||||||||||||| | || ||| || ||| |||||||||||||||||||
seq2  ACAGCTAAGCTCTGTCTTGACTCTTCTTGCGGGAGGACCAAAGGGTCTGA  849

seq1  TAAAGTTAGCTTCCAACTCATGCTCCCGGGCCCTTAGAGCCAGGC  890
      |||||||||||| ||||||  | || |||||||||||||||||||
seq2  TAAAGTTAGCTTTCAACTCTGGTTCTCGGGCCCTTAGAGCCAGGC  894