BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-163F01
Chromosome2 (Build37)
Map Location 151,301,092 - 151,447,697
singlet/doubletdoublet
Overlap gene4921509C19Rik, Nsfl1c, Fkbp1a, Sdcbp2, Snph
Upstream geneOTTMUSG00000015743, LOC545472, Cst7, 2310001A20Rik, Acss1, Vsx1, Entpd6, LOC100043605, Pygb, Abhd12, Gins1, LOC668925, 4930519N13Rik, LOC668926, Nanp, LOC433486, LOC381390, 4930442J19Rik, LOC100043839, LOC100043840
Downstream geneLOC668929, BC052486, 5430405G05Rik, Psmf1, Rspo4, Angpt4, 5430432M24Rik, 2310046K01Rik, Scrt2, Srxn1, Tcf15, LOC100043843, Csnk2a1, Tbc1d20, Rbck1, Trib3, LOC628060, Nrsn2, Sox12, Zcchc3, 6820408C15Rik, EG629114, LOC668930, 9230107O10Rik, 9230002F21Rik, EG654457, OTTMUSG00000015852, Defb29, 4930525K10Rik, Defb19, OTTMUSG00000015859, Defb36
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-163F01.bB6Ng01-163F01.g
ACCDH955935DH955936
length1,0361,172
definitionDH955935|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-163F01, 5' end.DH955936|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-163F01, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(151,446,662 - 151,447,697)(151,301,092 - 151,302,269)
sequence
gaattctgttacagtcgtgagctaattgaaggctttgaagtggcacggtt
atcaaatcccagccaagaagagctgtgatggagctcgggaaaggaaccca
gatggggcggttggggcatgtgtttctgttagatgtgggaaggatgcatc
atggctgctccggtgggtttcctggggcaagagtatccccagtggcctgg
cgtgagtgtggcacacaagatgacaaacagccgcggcatctctagcagat
gagctattcggccaccagagttttctggttacctcagagaccatgtggca
gcttctccctcagagtgagtgtatgtgtgtgctgtgtacgcagagcttcc
taagactcgtgcctgccactcttcctcctccttacaccctctcctctctc
ccacttctggctctagtgaagtacagtttagtaagcagctagctgcacat
atttaaatatactgttaggtcattttggtaaaccactcttacaattaaga
taagatctcctcctcttccctagaagtttcctcttgcttctttgtaactt
gttactctctagttttatcccctctgcctgggcaacaatgtacctgcttc
ccatcactggtgcttttagacatttctacaaatgtaactctaaagtgaac
cttttggagggtgtggctttgttcattcagtaaaattattttgagtcaca
ttgcatatatgaatatatgatatctctgggctactggggaggtggatcag
tgggcaaagtgcttgcttggaaattgtaagaagctgaagtgagaccccta
gaacccatgaaaatccagatgatgttgtacacatttgtaatttccagtat
aggggggaggcaggcagagacaggtggattccaaatactctctgaccagc
aagcatagccaaaatagccagttccagatccagttagagggccccatctt
aaaagtaaggtagataatggtatgggaaagacaggaacatcgacctttgg
tatctataagtgcaccacgttgagtacattcacaga
gaattcaacagcccttgaaaggaccaaacttcctgatcaagatggattca
tccagtcatgccagggctgcaacaaccaccaacgattgacaacgacgcat
agaaatggaagagcaagaatcacatgctcagctgaagaatggaattgtca
tttaaaaagaagaacatggagctgaaaatcactgtagtgtttgacaagcc
agtccagagatgctggctctcaagtgctgaagcatagttagggcaaggtg
cctgtagtaaaagggattcattaggaacgtaaagaagaaagaagggactg
gggtacaggttcttagattaggtgaatattcttaaagtgcattatgtgca
tattcagaaatgttttatggaactgtcctactttatgcttaatatttatt
aacaaaagctttaaaaagtaaataaacagcaatgaaaatgagtaggtaga
aaaacacaaattgaagataattaatgatgataatttaaacgatgtaaaaa
aataaaatctaaaatcaaagagaaactaaaaaaaaaacaaaaacaaaaac
aaacaaaaaaaaaacaaaaaaaacaaaaaaaactaaatccagtacctgtc
aacctcaagcagtaaagtgagaaaagggctcaccgtgtcaaagtccaagc
aggttcaccaatatccgagtccaaaccttctccagaatccgagtccaaaa
ccgttgccagaatccgagtccaaaacgttaccagtatccaagtccaaaat
tatcaccacagtccacgtctcccaaaccaccaccaaaccactctccacac
caaaccagcctcgggcagtacattatatgggcaggtgtctgtcatttctc
acagtggttctttgtgaggtcagagcaaaacatggaccaatgagggatgg
ccacactcctggtccagaagactgtattagctactctgcagtcactgcta
ccaagtgcccaagcagaagcaacagatggttcattttggctcacactttg
agggaacagggaaagcatgatgtagagtgtaacatgtggctgttcacata
gtactgctgtcaccccaatgtcaatgccagtcagaaaaactcttcttaga
gctagaggcccacctcttacgctagattcagcttccttccaaggtaatta
ccagctagaacatgagtcctga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_151446662_151447697
seq2: B6Ng01-163F01.b_43_1078 (reverse)

seq1  TCTGTGAATGTACTCAAACGTGGTGCACTTGTAGATAACAAAGGTCGATG  50
      ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||
seq2  TCTGTGAATGTACTC-AACGTGGTGCACTTATAGATACCAAAGGTCGATG  49

seq1  TTCCATGTCTTT-CCATACCATTATCTACCTTACTTTTAAGATGGGGCCC  99
      |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCC-TGTCTTTCCCATACCATTATCTACCTTACTTTTAAGATGGGGCCC  98

seq1  TCTAACTGGATCTGGAACTGGCTATTTTGGCTATGCTTGCTGGTCAGAGA  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAACTGGATCTGGAACTGGCTATTTTGGCTATGCTTGCTGGTCAGAGA  148

seq1  GTATTTGGAATCCACCTGTCTCTGCCTGCCTCCCCCCTATACTGG-AATT  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  GTATTTGGAATCCACCTGTCTCTGCCTGCCTCCCCCCTATACTGGAAATT  198

seq1  ACAAATGTGTACAACATCATCTGGATTTTCATGGGTTCTAGGGGTCTCAC  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAATGTGTACAACATCATCTGGATTTTCATGGGTTCTAGGGGTCTCAC  248

seq1  TTCAGCTTCTTACAATTTCCAAGCAAGCACTTTGCCCACTGATCCACCTC  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGCTTCTTACAATTTCCAAGCAAGCACTTTGCCCACTGATCCACCTC  298

seq1  CCCAGTAGCCCAGAGATATCATATATTCATATATGCAATGTGACTCAAAA  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGTAGCCCAGAGATATCATATATTCATATATGCAATGTGACTCAAAA  348

seq1  TAATTTTACTGAATGAACAAAGCCACACCCTCCAAAAGGTTCACTTTAGA  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTTTACTGAATGAACAAAGCCACACCCTCCAAAAGGTTCACTTTAGA  398

seq1  GTTACATTTGTAGAAATGTCTAAAAGCACCAGTGATGGGAAGCAGGTACA  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTACATTTGTAGAAATGTCTAAAAGCACCAGTGATGGGAAGCAGGTACA  448

seq1  TTGTTGCCCAGGCAGAGGGGATAAAACTAGAGAGTAACAAGTTACAAAGA  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTGCCCAGGCAGAGGGGATAAAACTAGAGAGTAACAAGTTACAAAGA  498

seq1  AGCAAGAGGAAACTTCTAGGGAAGAGGAGGAGATCTTATCTTAATTGTAA  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAAGAGGAAACTTCTAGGGAAGAGGAGGAGATCTTATCTTAATTGTAA  548

seq1  GAGTGGTTTACCAAAATGACCTAACAGTATATTTAAATATGTGCAGCTAG  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTGGTTTACCAAAATGACCTAACAGTATATTTAAATATGTGCAGCTAG  598

seq1  CTGCTTACTAAACTGTACTTCACTAGAGCCAGAAGTGGGAGAGAGGAGAG  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTTACTAAACTGTACTTCACTAGAGCCAGAAGTGGGAGAGAGGAGAG  648

seq1  GGTGTAAGGAGGAGGAAGAGTGGCAGGCACGAGTCTTAGGAAGCTCTGCG  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGTAAGGAGGAGGAAGAGTGGCAGGCACGAGTCTTAGGAAGCTCTGCG  698

seq1  TACACAGCACACACATACACTCACTCTGAGGGAGAAGCTGCCACATGGTC  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACAGCACACACATACACTCACTCTGAGGGAGAAGCTGCCACATGGTC  748

seq1  TCTGAGGTAACCAGAAAACTCTGGTGGCCGAATAGCTCATCTGCTAGAGA  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGAGGTAACCAGAAAACTCTGGTGGCCGAATAGCTCATCTGCTAGAGA  798

seq1  TGCCGCGGCTGTTTGTCATCTTGTGTGCCACACTCACGCCAGGCCACTGG  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCGCGGCTGTTTGTCATCTTGTGTGCCACACTCACGCCAGGCCACTGG  848

seq1  GGATACTCTTGCCCCAGGAAACCCACCGGAGCAGCCATGATGCATCCTTC  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATACTCTTGCCCCAGGAAACCCACCGGAGCAGCCATGATGCATCCTTC  898

seq1  CCACATCTAACAGAAACACATGCCCCAACCGCCCCATCTGGGTTCCTTTC  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACATCTAACAGAAACACATGCCCCAACCGCCCCATCTGGGTTCCTTTC  948

seq1  CCGAGCTCCATCACAGCTCTTCTTGGCTGGGATTTGATAACCGTGCCACT  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGAGCTCCATCACAGCTCTTCTTGGCTGGGATTTGATAACCGTGCCACT  998

seq1  TCAAAGCCTTCAATTAGCTCACGACTGTAACAGAATTC  1036
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAAGCCTTCAATTAGCTCACGACTGTAACAGAATTC  1036

seq1: chr2_151301092_151302269
seq2: B6Ng01-163F01.g_66_1237

seq1  GAATTCAACAGCCCTTGAAAGGACCAAACTTCCTGATCAAGATGGATTCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAACAGCCCTTGAAAGGACCAAACTTCCTGATCAAGATGGATTCA  50

seq1  TCCAGTCATGCCAGGGCTGCAACAACCACCAACGATTGACAACGACGCAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGTCATGCCAGGGCTGCAACAACCACCAACGATTGACAACGACGCAT  100

seq1  AGAAATGGAAGAGCAAGAATCACATGCTCAGCTGAAGAATGGAATTGTCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAATGGAAGAGCAAGAATCACATGCTCAGCTGAAGAATGGAATTGTCA  150

seq1  TTTAAAAAGAAGAACATGGAGCTGAAAATCACTGTAGTGTTTGACAAGCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAAAAGAAGAACATGGAGCTGAAAATCACTGTAGTGTTTGACAAGCC  200

seq1  AGTCCAGAGATGCTGGCTCTCAAGTGCTGAAGCATAGTTAGGGCAAGGTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCCAGAGATGCTGGCTCTCAAGTGCTGAAGCATAGTTAGGGCAAGGTG  250

seq1  CCTGTAGTAAAAGGGATTCATTAGGAACGTAAAGAAGAAAGAAGGGACTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTAGTAAAAGGGATTCATTAGGAACGTAAAGAAGAAAGAAGGGACTG  300

seq1  GGGTACAGGTTCTTAGATTAGGTGAATATTCTTAAAGTGCATTATGTGCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTACAGGTTCTTAGATTAGGTGAATATTCTTAAAGTGCATTATGTGCA  350

seq1  TATTCAGAAATGTTTTATGGAACTGTCCTACTTTATGCTTAATATTTATT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTCAGAAATGTTTTATGGAACTGTCCTACTTTATGCTTAATATTTATT  400

seq1  AACAAAAGCTTTAAAAAGTAAATAAACAGCAATGAAAATGAGTAGGTAGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAAAGCTTTAAAAAGTAAATAAACAGCAATGAAAATGAGTAGGTAGA  450

seq1  AAAACACAAATTGAAGATAATTAATGATGATAATTTAAACGATGTAAAAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACACAAATTGAAGATAATTAATGATGATAATTTAAACGATGTAAAAA  500

seq1  AATAAAATCTAAAATCAAAGAGAAACTAAAAAAAAAACAAAAACAAAAAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAAATCTAAAATCAAAGAGAAACTAAAAAAAAAACAAAAACAAAAAC  550

seq1  AAACAAAAAAAAAACAAAAAAAACAAAAAAAACTAAATCCAGTACCTGTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAAAAAAAAAACAAAAAAAACAAAAAAAACTAAATCCAGTACCTGTC  600

seq1  AACCTCAAGCAGTAAAGTGAGAAAAGGGCTCACCGTGTCAAAGTCCAAGC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCTCAAGCAGTAAAGTGAGAAAAGGGCTCACCGTGTCAAAGTCCAAGC  650

seq1  AGGTTCACCAATATCCGAGTCCAAACCTTCTCCAGAATCCGAGTCCAAAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTTCACCAATATCCGAGTCCAAACCTTCTCCAGAATCCGAGTCCAAAA  700

seq1  CCGTTGCCAGAATCCGAGTCCAAAACGTTACCAGTATCCAAGTCCAAAAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGTTGCCAGAATCCGAGTCCAAAACGTTACCAGTATCCAAGTCCAAAAT  750

seq1  TATCACCACAGTCCACGTCTCCCAAACCACCACCAAACCACTCTCCACAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCACCACAGTCCACGTCTCCCAAACCACCACCAAACCACTCTCCACAC  800

seq1  CAAACCAGCCTCGGGCAGTACATTATATGGGCAGGTGTCTGTCATTTCTC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACCAGCCTCGGGCAGTACATTATATGGGCAGGTGTCTGTCATTTCTC  850

seq1  ACAGTGGTTCTTTGTGAGGTCAGAGCAAAACATGGACCAATGAGGGATGG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGTGGTTCTTTGTGAGGTCAGAGCAAAACATGGACCAATGAGGGATGG  900

seq1  CCACACTCCTGGTCCAGAAGACTGTATTAGCTACTCTGCAGTCACTGCTA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACACTCCTGGTCCAGAAGACTGTATTAGCTACTCTGCAGTCACTGCTA  950

seq1  CCAAGTGCCCAAGCAGAAGCAACAGAATGGTTCATTTTGGCTCACACTTT  1000
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGTGCCCAAGCAGAAGCAACAG-ATGGTTCATTTTGGCTCACACTTT  999

seq1  GAGGGAACAGGGAAAGCATGATGTAGAGTGGTAACATGTGGCTGTTCACA  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  GAGGGAACAGGGAAAGCATGATGTAGAGT-GTAACATGTGGCTGTTCACA  1048

seq1  TAGTACTGCTGGTCACCCC-ATGTCCAATGCCAGGTCAGAAAACTCCTTC  1099
      |||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||   ||||
seq2  TAGTACTGCT-GTCACCCCAATGT-CAATGCCA-GTCAGAAAAACTCTTC  1095

seq1  CTAGAGCTAGA-GCCCACCTTCTAACGCTAGATTCCAGCTTCCCTTCACA  1148
       |||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||| | ||  
seq2  TTAGAGCTAGAGGCCCACC-TCTTACGCTAGATT-CAGCTTCCTTCCAAG  1143

seq1  GT-ATTACCAGCTAGAGACCATGAGTTCTGA  1178
      || ||||||||||  ||| ||||||| ||||
seq2  GTAATTACCAGCT--AGAACATGAGTCCTGA  1172