MoG+ -Mouse Genome database with high added value-

BAC Information

BAC name
Region	Chromosome -
Gene	search by nearby gene name.
Format	rows / page	Page	1

BAC

Clone Name	B6Ng01-164J05
Chromosome	2 (Build37)
Map Location	178,528,751 - 178,529,716
singlet/doublet	singlet
Overlap gene	none
Upstream gene	LOC329575, LOC433515, LOC665205, OTTMUSG00000016327, LOC100039263, LOC626848, 2810021G02Rik, Phactr3, Sycp2, Ppp1r3d, 9030418K01Rik, Cdh26
Downstream gene	LOC100039368, LOC665264, LOC100043168, LOC100039413, Cdh4
Link	Open Mouse BAC browser

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BAC End Information

BAC end	BAC-end 1	BAC-end 2
end name	B6Ng01-164J05.b	B6Ng01-164J05.g
ACC	DH956863	DH956864
length	1,085	1,137
definition	DH956863\|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-164J05, 5' end.	DH956864\|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-164J05, 3' end.
singlet/doublet	singlet	---
BLAST hit	unique	no hit data
sequence	gaattctcagctgaggaataccgactggctgagaagcacctgaaaaaatg ttcatcatccttaatcatcaggaaaatgcaaatcaaaacaaccctgagat tccacctcataccagttagaatggctaagatcaaaaattcaggtgacagc agatgctggtgaggatgtggagaaagaggaacactcctccattgttggtg ggactgcaagcttgtacaaccactctggaaatcagtctggcagttcctca gaaaaatggacatagtactaccagaggatcctgcaatacctctcctgggc atatatccagaagatgttccaaccggtaagaaggacacatgctccactat gttcatagcagccttatttataatagccagaagttggaaagaacccagat gcccctcaacagaggaatggatacagaaaatgaggtacatttacacaata gagtactactcagctattaaaaagaatgaatttatgaaattcctaggcaa atggatggacctggagggcatcatcctgagtgagataacccaatcacaaa agaacttgcacaatatgtagccactgataagtggatattagataagtgga tttagaatacccaagaacaccgttcttacactgaatgcttttatttttaa agatttattttatgtatgtgtgtgtgtgcgtgtgtaaatgtgggaagcca gaaggtgtcagattggccagagctggagtgccaggtgggcgaaccccatg tcctttgtcaaagccacaagcatactcacacaaccacctagccatctctc tagctctgggttgaattctttacagcatagcttatttcttaggaatcagg cagcagattccacagagtgcactcacctccttttttatctctctactcag aaccatgctcccttttttcctgtatccattgagtcgtggagatgttcaaa tacttcccatcacaaggctgaaacagcatagcaaaagcctaagtcagaga gtctgcccttttaaaagccccatgggcggttctgctctccctctaacttt ctgtggctctgtgctgtccaagagtgggcaagcgc	gaattcaaatctttttatttcctacgacttgtgaaatatttagacaaatg ttttgatcccctctgcccagtcaggtgaaactttcctttgcacagaggcc ccactgcattcccagaccttggtggcctgggggtggtctgaacccatccc cattccttcacttggttttcagcgattctgatacaacgagctgattgcag gaggctgtgaggtggtgctccagctggggaggaaagggtgttcagcacct gcatcagaatagcaagtgagctagcttcctgcctcaccgtgctccctctt ctgctcttgtgagcagccctcagtcctcagcaaccatgaagttttgcttt gtgctttccaccagttgcagtgctgccccttgctatgtgactctgacctt atttctaacacaccagagcctattgctgttaagtgtgggcaaagaacctg gctgcaacctggctgtctctatcaaggaaaaatctgaattttgattgaat taaaaagtcatagaccgggttgtttggcagaagaatttaaagcagcagca tcgtggtgtcatttagccagtggcatggtcgttgctcactgaatgaggtt ttagtgagaattcaaaacagaaggatgcagaaaatgtgcaattgattgaa gaaaggagaggcagagggggaggataaagctgcagacatggctcacaaga cacgatgaaagagaaagccctgtactttgcagtaggacaaatagaaagtt gttcggagggcaagaccccatccatggaagattccagtttgtaaaacaac aaatttgtttgaaagcagagagcctgaaccaaggctgcctctaggacagt gttctcagcctgggggcagcaacccctttcgggggtccatgaccctttac agggtcacatatcctgcatatcagatattacattatattcctaacagtag caaaattacagtatgaagtagcaaccaaaataaaatgggtgtcaccacac aggagcttgatttaaaggtcgcaaattaggaagctgggaactcctgcttc tatggtcattagcttcactcgacctcctctaggggaagaccatcgtcagg gtccgctaggccggcattcagaagacccaactcagct
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Alignment Information

BAC End 1	BAC End 2
seq1: chr2_178528751_178529716 seq2: B6Ng01-164J05.b_165_1123 seq1 ATGGCTAAGATCAAAAATTCAGGTGACAGCAGATGCTGGTGAGGATGTGG 50 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ATGGCTAAGATCAAAAATTCAGGTGACAGCAGATGCTGGTGAGGATGTGG 50 seq1 AGAAAGAGGAACACTCCTCCATTGTTGGTGGGACTGCAAGCTTGTACAAC 100 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AGAAAGAGGAACACTCCTCCATTGTTGGTGGGACTGCAAGCTTGTACAAC 100 seq1 CACTCTGGAAATCAGTCTGGCAGTTCCTCAGAAAAATGGACATAGTACTA 150 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CACTCTGGAAATCAGTCTGGCAGTTCCTCAGAAAAATGGACATAGTACTA 150 seq1 CCAGAGGATCCTGCAATACCTCTCCTGGGCATATATCCAGAAGATGTTCC 200 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CCAGAGGATCCTGCAATACCTCTCCTGGGCATATATCCAGAAGATGTTCC 200 seq1 AACCGGTAAGAAGGACACATGCTCCACTATGTTCATAGCAGCCTTATTTA 250 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AACCGGTAAGAAGGACACATGCTCCACTATGTTCATAGCAGCCTTATTTA 250 seq1 TAATAGCCAGAAGTTGGAAAGAACCCAGATGCCCCTCAACAGAGGAATGG 300 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TAATAGCCAGAAGTTGGAAAGAACCCAGATGCCCCTCAACAGAGGAATGG 300 seq1 ATACAGAAAATGAGGTACATTTACACAATAGAGTACTACTCAGCTATTAA 350 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ATACAGAAAATGAGGTACATTTACACAATAGAGTACTACTCAGCTATTAA 350 seq1 AAAGAATGAATTTATGAAATTCCTAGGCAAATGGATGGACCTGGAGGGCA 400 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AAAGAATGAATTTATGAAATTCCTAGGCAAATGGATGGACCTGGAGGGCA 400 seq1 TCATCCTGAGTGAGATAACCCAATCACAAAAGAACTTGCACAATATGTAG 450 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TCATCCTGAGTGAGATAACCCAATCACAAAAGAACTTGCACAATATGTAG 450 seq1 CCACTGATAAGTGGATATTAGATAAGTGGATTTAGAATACCCAAGAACAC 500 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CCACTGATAAGTGGATATTAGATAAGTGGATTTAGAATACCCAAGAACAC 500 seq1 CGTTCTTACACTGAATGCTTTTATTTTTAAAGATTTATTTTATGTATGTG 550 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CGTTCTTACACTGAATGCTTTTATTTTTAAAGATTTATTTTATGTATGTG 550 seq1 TGTGTGTGCGTGTGTAAATGTGGGAAGCCAGAAGGTGTCAGATTGGCCAG 600 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TGTGTGTGCGTGTGTAAATGTGGGAAGCCAGAAGGTGTCAGATTGGCCAG 600 seq1 AGCTGGAGTGCCAGGTGGGCGAACCCCATGTCCTTTGTCAAAGCCACAAG 650 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AGCTGGAGTGCCAGGTGGGCGAACCCCATGTCCTTTGTCAAAGCCACAAG 650 seq1 CATACTCACACAACCACCTAGCCATCTCTCTAGCTCTGGGTTGAATTCTT 700 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CATACTCACACAACCACCTAGCCATCTCTCTAGCTCTGGGTTGAATTCTT 700 seq1 TACAGCATAGCTTATTTCTTAGGAATCAGGCAGCAGATTCCACAGAGTGC 750 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TACAGCATAGCTTATTTCTTAGGAATCAGGCAGCAGATTCCACAGAGTGC 750 seq1 ACTCACCTCCTTTTTTATCTCTCTACTCAGAACCATGCTCCCTTTTTTCC 800 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ACTCACCTCCTTTTTTATCTCTCTACTCAGAACCATGCTCCCTTTTTTCC 800 seq1 TGTATCCATTGAGTCGTGGAGATGTTCAAATAC-TCCCATCACAA-GCTG 848 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| seq2 TGTATCCATTGAGTCGTGGAGATGTTCAAATACTTCCCATCACAAGGCTG 850 seq1 AAAACAGCATAGCAAAAAGCCTAAGTCAGAGAGCCTGCCCTTTTAAAAGC 898 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 -AAACAGCATAGC-AAAAGCCTAAGTCAGAGAGTCTGCCCTTTTAAAAGC 898 seq1 CCCATGGGCGGGTCTCTGCTCTCCCTCTTATACCTTCCTGTGGCTCTGGT 948 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| seq2 CCCATGGGCGG--TTCTGCTCTCCCTC---TAACTTTCTGTGGCTCT-GT 942 seq1 GCCGTGCCCAGAGTGGGC 966 \|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GCTGT-CCAAGAGTGGGC 959

BAC End 1

BAC End 2

seq1: chr2_178528751_178529716
seq2: B6Ng01-164J05.b_165_1123

seq1  ATGGCTAAGATCAAAAATTCAGGTGACAGCAGATGCTGGTGAGGATGTGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGCTAAGATCAAAAATTCAGGTGACAGCAGATGCTGGTGAGGATGTGG  50

seq1  AGAAAGAGGAACACTCCTCCATTGTTGGTGGGACTGCAAGCTTGTACAAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAGAGGAACACTCCTCCATTGTTGGTGGGACTGCAAGCTTGTACAAC  100

seq1  CACTCTGGAAATCAGTCTGGCAGTTCCTCAGAAAAATGGACATAGTACTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTCTGGAAATCAGTCTGGCAGTTCCTCAGAAAAATGGACATAGTACTA  150

seq1  CCAGAGGATCCTGCAATACCTCTCCTGGGCATATATCCAGAAGATGTTCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGAGGATCCTGCAATACCTCTCCTGGGCATATATCCAGAAGATGTTCC  200

seq1  AACCGGTAAGAAGGACACATGCTCCACTATGTTCATAGCAGCCTTATTTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCGGTAAGAAGGACACATGCTCCACTATGTTCATAGCAGCCTTATTTA  250

seq1  TAATAGCCAGAAGTTGGAAAGAACCCAGATGCCCCTCAACAGAGGAATGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATAGCCAGAAGTTGGAAAGAACCCAGATGCCCCTCAACAGAGGAATGG  300

seq1  ATACAGAAAATGAGGTACATTTACACAATAGAGTACTACTCAGCTATTAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACAGAAAATGAGGTACATTTACACAATAGAGTACTACTCAGCTATTAA  350

seq1  AAAGAATGAATTTATGAAATTCCTAGGCAAATGGATGGACCTGGAGGGCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAATGAATTTATGAAATTCCTAGGCAAATGGATGGACCTGGAGGGCA  400

seq1  TCATCCTGAGTGAGATAACCCAATCACAAAAGAACTTGCACAATATGTAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCCTGAGTGAGATAACCCAATCACAAAAGAACTTGCACAATATGTAG  450

seq1  CCACTGATAAGTGGATATTAGATAAGTGGATTTAGAATACCCAAGAACAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTGATAAGTGGATATTAGATAAGTGGATTTAGAATACCCAAGAACAC  500

seq1  CGTTCTTACACTGAATGCTTTTATTTTTAAAGATTTATTTTATGTATGTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTTCTTACACTGAATGCTTTTATTTTTAAAGATTTATTTTATGTATGTG  550

seq1  TGTGTGTGCGTGTGTAAATGTGGGAAGCCAGAAGGTGTCAGATTGGCCAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGTGCGTGTGTAAATGTGGGAAGCCAGAAGGTGTCAGATTGGCCAG  600

seq1  AGCTGGAGTGCCAGGTGGGCGAACCCCATGTCCTTTGTCAAAGCCACAAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGGAGTGCCAGGTGGGCGAACCCCATGTCCTTTGTCAAAGCCACAAG  650

seq1  CATACTCACACAACCACCTAGCCATCTCTCTAGCTCTGGGTTGAATTCTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATACTCACACAACCACCTAGCCATCTCTCTAGCTCTGGGTTGAATTCTT  700

seq1  TACAGCATAGCTTATTTCTTAGGAATCAGGCAGCAGATTCCACAGAGTGC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAGCATAGCTTATTTCTTAGGAATCAGGCAGCAGATTCCACAGAGTGC  750

seq1  ACTCACCTCCTTTTTTATCTCTCTACTCAGAACCATGCTCCCTTTTTTCC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCACCTCCTTTTTTATCTCTCTACTCAGAACCATGCTCCCTTTTTTCC  800

seq1  TGTATCCATTGAGTCGTGGAGATGTTCAAATAC-TCCCATCACAA-GCTG  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||
seq2  TGTATCCATTGAGTCGTGGAGATGTTCAAATACTTCCCATCACAAGGCTG  850

seq1  AAAACAGCATAGCAAAAAGCCTAAGTCAGAGAGCCTGCCCTTTTAAAAGC  898
       |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  -AAACAGCATAGC-AAAAGCCTAAGTCAGAGAGTCTGCCCTTTTAAAAGC  898

seq1  CCCATGGGCGGGTCTCTGCTCTCCCTCTTATACCTTCCTGTGGCTCTGGT  948
      |||||||||||   |||||||||||||   || ||| |||||||||| ||
seq2  CCCATGGGCGG--TTCTGCTCTCCCTC---TAACTTTCTGTGGCTCT-GT  942

seq1  GCCGTGCCCAGAGTGGGC  966
      || || || |||||||||
seq2  GCTGT-CCAAGAGTGGGC  959

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