BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-167D02
Chromosome2 (Build37)
Map Location 167,764,108 - 167,902,429
singlet/doubletdoublet
Overlap genePtpn1, 2310033K02Rik
Upstream geneCse1l, Stau1, LOC383774, Ddx27, AI481105, 1500012F01Rik, LOC668950, Kcnb1, Ptgis, LOC668951, B4galt5, Slc9a8, Spata2, Zfp313, Snai1, Ube2v1, AI840826, Cebpb, LOC100043728
Downstream genePard6b, Adnp, Dpm1, Mocs3, LOC100043908, Kcng1, LOC668952, Nfatc2, Atp9a, Sall4, Zfp64, LOC100043909
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-167D02.bB6Ng01-167D02.g
ACCDH958755DH958756
length1,088901
definitionDH958755|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-167D02, 5' end.DH958756|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-167D02, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(167,764,108 - 167,765,208)(167,901,528 - 167,902,429)
sequence
gaattccgtcctgggtcttgtacactgcctgatgttgccctgtgcttgtt
agaactgccactctgtatcttggtccatcccagagcccacatgccctgtg
gtcactgactgtggcacccacctggcataaagtaagtattctctcaagtg
tggtgtggacatggctgcccagagatttagtggctgtggtcccctgtacc
aagctagtgatggggtcaggaagatttgcacagagagcccaacagtaggg
ttcctgccatgggaagccctgtatttgagccgtgggccaaagaagtaact
tgccttcatgtggcttcccagagaaactgctgagtatgctgagactcgtt
gcatctgcccacctcacagaagtctgaggtgtgacagtgttccctctgtg
tgacaggctcagtagacagcggagtggcaccacagctttctctccaggcc
tagtgagctcctctactcaagtcactcttgacatgattaatttttggaaa
taagatatgtttctctgtcagtcaacaaccttaccaatccttgtatttct
tgaactccagttagtaaaggcaagcattgttcacctttagctagactgtt
tgagcgtcatgagaggagtgtaaccttctgctctcactgcctttagtgtc
tggcagtggattacaggctcagctagagctccatggcgctcatcttcctg
cctcatttcttcactcccctgtctctccgttcctcttgtaaaatgatcct
gagctgacttaagttcacctccagtaataaaagttcttaatgttcttgaa
gtagcccttgtaaactgcaggggtctgcacaggtcatatggttaggctca
aaatttggtaggtctgccagtgtggctagcagcttaaagagttgggtagg
tttgtttgtttgtttgtttttcccctcaagggacatcaaggttcttataa
gagggcttcctgagtgagtgacgtggaaagctgccacagttaggcacccc
tcctgagacagtgtgcttgggtggtttctgtaaaacgaggacgacttctg
gagagttccaaagcgggtaattgatggggggggggggg
gaattctgtcacatgctcttttctggttaatggcttataacgcgttgctg
gtttggtggggagtaagggcccattatttgccttttaaaggctcactacc
cctttagttaagaaaactatgttttcgggaggcatctgggccaggctccc
accttcgccttgcccttgctctgttcataccctgggtttgtgttatgacc
ttaatctgctctgggacccagtttctctgtctgtaagcttggacccagga
taaggttgtcttactaccccagctcaacgttctctggctcctaagggatc
tccgagagcgatgggtatctcaatgttaccagggtggactgggatgggag
gactagcctttccatcacgctccatgaccagactgcactcattggccaag
actctcttcccaggaggagtcggtaaaggtgatggttgttttagcgctta
tatgaaacctagcaggcacccatggattaactgatttaatcttaaaatct
tccatggcaggggagagtatggtttcaggaggcagttgtcggaagacctg
gcttgatttctaggctgacaagttcactgaagttcctgctctgctcctca
ctggttgggtagtgttgacctgttctctcaagcactcaacactcctttct
atgaaatgggaatatagtggtggccatggcaattgagatgtcgtttcttt
caggtgaggaatgacacaagactgctttgcaaactaccacgttggtggca
gccctgcatgaatcttaaggcttattcattaatggtgcctaccaacagct
ctgagcaagccgcctagagatggagagggggtgtggcgaaactccttgta
cttgttttcaaggggtctacagagtgtgtgtgtaagtgagtgtggtgtgt
g
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_167764108_167765208
seq2: B6Ng01-167D02.b_45_1132

seq1  GAATTCCGTCCTGGGTCTTGTACACTGCCTGATGTTGCCCTGTGCTTGTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCGTCCTGGGTCTTGTACACTGCCTGATGTTGCCCTGTGCTTGTT  50

seq1  AGAACTGCCACTCTGTATCTTGGTCCATCCCAGAGCCCACATGCCCTGTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAACTGCCACTCTGTATCTTGGTCCATCCCAGAGCCCACATGCCCTGTG  100

seq1  GTCACTGACTGTGGCACCCACCTGGCATAAAGTAAGTATTCTCTCAAGTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCACTGACTGTGGCACCCACCTGGCATAAAGTAAGTATTCTCTCAAGTG  150

seq1  TGGTGTGGACATGGCTGCCCAGAGATTTAGTGGCTGTGGTCCCCTGTACC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTGTGGACATGGCTGCCCAGAGATTTAGTGGCTGTGGTCCCCTGTACC  200

seq1  AAGCTAGTGATGGGGTCAGGAAGATTTGCACAGAGAGCCCAACAGTAGGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTAGTGATGGGGTCAGGAAGATTTGCACAGAGAGCCCAACAGTAGGG  250

seq1  TTCCTGCCATGGGAAGCCCTGTATTTGAGCCGTGGGCCAAAGAAGTAACT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTGCCATGGGAAGCCCTGTATTTGAGCCGTGGGCCAAAGAAGTAACT  300

seq1  TGCCTTCATGTGGCTTCCCAGAGAAACTGCTGAGTATGCTGAGACTCGTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTTCATGTGGCTTCCCAGAGAAACTGCTGAGTATGCTGAGACTCGTT  350

seq1  GCATCTGCCCACCTCACAGAAGTCTGAGGTGTGACAGTGTTCCCTCTGTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATCTGCCCACCTCACAGAAGTCTGAGGTGTGACAGTGTTCCCTCTGTG  400

seq1  TGACAGGCTCAGTAGACAGCGGAGTGGCACCACAGCTTTCTCTCCAGGCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACAGGCTCAGTAGACAGCGGAGTGGCACCACAGCTTTCTCTCCAGGCC  450

seq1  TAGTGAGCTCCTCTACTCAAGTCACTCTTGACATGATTAATTTTTGGAAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTGAGCTCCTCTACTCAAGTCACTCTTGACATGATTAATTTTTGGAAA  500

seq1  TAAGATATGTTTCTCTGTCAGTCAACAACCTTACCAATCCTTGTATTTCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGATATGTTTCTCTGTCAGTCAACAACCTTACCAATCCTTGTATTTCT  550

seq1  TGAACTCCAGTTAGTAAAGGCAAGCATTGTTCACCTTTAGCTAGACTGTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAACTCCAGTTAGTAAAGGCAAGCATTGTTCACCTTTAGCTAGACTGTT  600

seq1  TGAGCGTCATGAGAGGAGTGTAACCTTCTGCTCTCACTGCCTTTAGTGTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCGTCATGAGAGGAGTGTAACCTTCTGCTCTCACTGCCTTTAGTGTC  650

seq1  TGGCAGTGGATTACAGGCTCAGCTAGAGCTCCATGGCGCTCATCTTCCTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCAGTGGATTACAGGCTCAGCTAGAGCTCCATGGCGCTCATCTTCCTG  700

seq1  CCTCATTTCTTCACTCCCCTGTCTCTCCGTTCCTCTTGTAAAATGATCCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCATTTCTTCACTCCCCTGTCTCTCCGTTCCTCTTGTAAAATGATCCT  750

seq1  GAGCTGACTTAAGTTCACCTCCAGTAATAAAAGTTCTTAATGTTCTTGAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTGACTTAAGTTCACCTCCAGTAATAAAAGTTCTTAATGTTCTTGAA  800

seq1  GTAGCCCTTGTAAACTGCAGGGGTCTGCACAGGTCATATGGTTAGGCTCA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGCCCTTGTAAACTGCAGGGGTCTGCACAGGTCATATGGTTAGGCTCA  850

seq1  AAATTTGGTAGGTCTGCCAGTGTGGCTAGCAGCTTAAAGAGTTGGGTAGG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTTGGTAGGTCTGCCAGTGTGGCTAGCAGCTTAAAGAGTTGGGTAGG  900

seq1  TTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTCCCCTCAAGGGACATTCAAGGTTCTTATA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  TTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTCCCCTCAAGGGACA-TCAAGGTTCTTATA  949

seq1  AGAGGGCTTCCTGGAGTGAGTGACGTGGGAAAGCTTGCCACAGTTAGGCA  1000
      |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||
seq2  AGAGGGCTTCCT-GAGTGAGTGACGT-GGAAAGC-TGCCACAGTTAGGCA  996

seq1  CCCCTCCTTGAGACAGTGGTGCTTGGGTGGTTTTCCTGTAAAAACAGAGG  1050
      ||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||   ||||
seq2  CCCCTCC-TGAGACAGT-GTGCTTGGGTGGTTT--CTGTAAAA--CGAGG  1040

seq1  AACCGAC-TCTGGAGAGTTCACAAAAGCGGGGAATTGATGGGGGGGGGGG  1099
      |  |||| |||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||
seq2  A--CGACTTCTGGAGAGTT--CCAAAGCGGGTAATTGATGGGGGGGGGGG  1086

seq1  GG  1101
      ||
seq2  GG  1088

seq1: chr2_167901528_167902429
seq2: B6Ng01-167D02.g_66_966 (reverse)

seq1  CACACACACACACTCACTTACACACACACTCTGTAGACCCCTTGAAAACA  50
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACAC-CACACTCACTTACACACACACTCTGTAGACCCCTTGAAAACA  49

seq1  AGTACAAGGAGTTTCGCCACACCCCCTCTCCATCTCTAGGCGGCTTGCTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTACAAGGAGTTTCGCCACACCCCCTCTCCATCTCTAGGCGGCTTGCTC  99

seq1  AGAGCTGTTGGTAGGCACCATTAATGAATAAGCCTTAAGATTCATGCAGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCTGTTGGTAGGCACCATTAATGAATAAGCCTTAAGATTCATGCAGG  149

seq1  GCTGCCACCAACGTGGTAGTTTGCAAAGCAGTCTTGTGTCATTCCTCACC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGCCACCAACGTGGTAGTTTGCAAAGCAGTCTTGTGTCATTCCTCACC  199

seq1  TGAAAGAAACGACATCTCAATTGCCATGGCCACCACTATATTCCCATTTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAAGAAACGACATCTCAATTGCCATGGCCACCACTATATTCCCATTTC  249

seq1  ATAGAAAGGAGTGTTGAGTGCTTGAGAGAACAGGTCAACACTACCCAACC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGAAAGGAGTGTTGAGTGCTTGAGAGAACAGGTCAACACTACCCAACC  299

seq1  AGTGAGGAGCAGAGCAGGAACTTCAGTGAACTTGTCAGCCTAGAAATCAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGAGGAGCAGAGCAGGAACTTCAGTGAACTTGTCAGCCTAGAAATCAA  349

seq1  GCCAGGTCTTCCGACAACTGCCTCCTGAAACCATACTCTCCCCTGCCATG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAGGTCTTCCGACAACTGCCTCCTGAAACCATACTCTCCCCTGCCATG  399

seq1  GAAGATTTTAAGATTAAATCAGTTAATCCATGGGTGCCTGCTAGGTTTCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGATTTTAAGATTAAATCAGTTAATCCATGGGTGCCTGCTAGGTTTCA  449

seq1  TATAAGCGCTAAAACAACCATCACCTTTACCGACTCCTCCTGGGAAGAGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAAGCGCTAAAACAACCATCACCTTTACCGACTCCTCCTGGGAAGAGA  499

seq1  GTCTTGGCCAATGAGTGCAGTCTGGTCATGGAGCGTGATGGAAAGGCTAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTGGCCAATGAGTGCAGTCTGGTCATGGAGCGTGATGGAAAGGCTAG  549

seq1  TCCTCCCATCCCAGTCCACCCTGGTAACATTGAGATACCCATCGCTCTCG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCCCATCCCAGTCCACCCTGGTAACATTGAGATACCCATCGCTCTCG  599

seq1  GAGATCCCTTAGGAGCCAGAGAACGTTGAGCTGGGGTAGTAAGACAACCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATCCCTTAGGAGCCAGAGAACGTTGAGCTGGGGTAGTAAGACAACCT  649

seq1  TATCCTGGGTCCAAGCTTACAGACAGAGAAACTGGGTCCCAGAGCAGATT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCCTGGGTCCAAGCTTACAGACAGAGAAACTGGGTCCCAGAGCAGATT  699

seq1  AAGGTCATAACACAAACCCAGGGTATGAACAGAGCAAGGGCAAGGCGAAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGTCATAACACAAACCCAGGGTATGAACAGAGCAAGGGCAAGGCGAAG  749

seq1  GTGGGAGCCTGGCCCAGATGCCTCCCGAAAACATAGTTTTCTTAACTAAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGGAGCCTGGCCCAGATGCCTCCCGAAAACATAGTTTTCTTAACTAAA  799

seq1  GGGGTAGTGAGCCTTTAAAAGGCAAATAATGGGCCCTTACTCCCCACCAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGTAGTGAGCCTTTAAAAGGCAAATAATGGGCCCTTACTCCCCACCAA  849

seq1  ACCAGCAACGCGTTATAAGCCATTAACCAGAAAAGAGCATGTGACAGAAT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAGCAACGCGTTATAAGCCATTAACCAGAAAAGAGCATGTGACAGAAT  899

seq1  TC  902
      ||
seq2  TC  901