BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-167J18
Chromosome2 (Build37)
Map Location 159,648,191 - 159,749,386
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100043689
Upstream geneDhx35, LOC100043891
Downstream geneGm826, Mafb, LOC100043892, Top1, Plcg1, Zhx3, Lpin3, Emilin3
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-167J18.bB6Ng01-167J18.g
ACCDH959056DH959057
length9091,144
definitionDH959056|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-167J18, 5' end.DH959057|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-167J18, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(159,648,191 - 159,649,099)(159,748,232 - 159,749,386)
sequence
gaattctactgaaaatataaacacatattaaagccactggagaaaattaa
gatgaagagacaaagcacacataattataacagttgtaaggttaaaaact
gtcattttcttagttgaccacagattcaaaaacatattttaaaaatactt
ttagaaaataaaatttccattaagtatgagaacataagactcattagatt
atacctccttaaatattaactttatccaaaataatcaaagattattgggg
ttggagatatggcttcttggttgagagcacttgctgtcctcttataaaac
ccagattctgttcccagcagccgtgcagaagctcagaaccatgtgtaact
ccagttataatagatctgatgccctattctggcctccctgggcaccaggc
attcacattgtgcatacatttttattctgggaaaacactcatacacatag
gggggaaaagtattgaaaatgggcataaatgagacaagcaaatgtaagtc
cctcacaacagaaagaagctggaaatgaagctgacccctaaaaatgttta
gaaattaacatgagcatttctataggagctgggcttactcgctgaagcat
gagaaatgcttagtggccacaccactaacaaaaataacacttcttccttg
agtaaccactaactgatcagtctctcagggaggggtgatgccatgtgatc
tcctccctctttaacaatagaatgttgatgcagtcttctgcaggtcttgt
gtagatagctacagaagctgtgaattcagaaagacaatggctatgtgtgt
tcagagtctggctttggtgggagaagaagtgcctaaccttcagaggcttg
aggctccagggggtagggagacctggcaggaggtgctgggcaaggggggg
gaggggagg
gaattcatgatcactctgctataacattattggaaagtagtgagactgga
agatgcagccttattggaggaagctggtcatgtagagggatgtgtgctgg
aagttgtatcccatccaaggactcttccttctctctgtttcttggttggc
aggaggtgggcagcctcttctgctttttacctctaccaccttggtgttct
gctcactgcatcttcacactgatggagccagctagccagcaactaaaacc
agtgaaagcgtcagccaaaatacacccttcatcttttaagttactcttct
ctggtgttttgtcataacgatagaaacctaaagttttctactttaaggtc
ttccttcatatatgctgggctctctacctgctgtcagagaaagcttgcct
gggcttctgtccctgctgtctaagagtatatgatgtctgctgagaatgtc
tccatctccaaaattgaattcctggatagaggacatgacctttaaactct
gcaggtaacaagatatcgaaatgaaaatttcacatagcagtagcctggaa
agctaaggttttatgttttattcagtattccaaaaagagttgcagattgt
ttcatatgttaagcttctgaaacaacagtggcgaacagaagatgatacag
gcacagttcttttgtcagatttcagtacaagggttgacagcctttaaaat
acaactctttgttttatgtgcatgttgttttgcctgcatgtatgtctgtg
caccacaagtttccctaatacccactgaaggtagaagagaacatcctatc
ctctagaattggagttacagactgttgtgagctgccatgtggatgctggg
aattgaacctgggtcctctggaagatcatcaatactcccatctgctgagc
catgccttcagccccagagcacctattaggtaaagtgctgcgcacaaaca
gcagaggctttacagactgtgtcacactcatcacagttacccaactctgc
ggtcccactacaaatagcacagatataatgcaatgatgtgcattatgttt
tcataaacatttgcttcaaggcatggtgctggccctggtttttggctata
atttgtcatccctgcttttgggaagctagaaagagaacacctaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_159648191_159649099
seq2: B6Ng01-167J18.b_47_955

seq1  GAATTCTACTGAAAATATAAACACATATTAAAGCCACTGGAGAAAATTAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTACTGAAAATATAAACACATATTAAAGCCACTGGAGAAAATTAA  50

seq1  GATGAAGAGACAAAGCACACATAATTATAACAGTTGTAAGGTTAAAAACT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGAAGAGACAAAGCACACATAATTATAACAGTTGTAAGGTTAAAAACT  100

seq1  GTCATTTTCTTAGTTGACCACAGATTCAAAAACATATTTTAAAAATACTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCATTTTCTTAGTTGACCACAGATTCAAAAACATATTTTAAAAATACTT  150

seq1  TTAGAAAATAAAATTTCCATTAAGTATGAGAACATAAGACTCATTAGATT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGAAAATAAAATTTCCATTAAGTATGAGAACATAAGACTCATTAGATT  200

seq1  ATACCTCCTTAAATATTAACTTTATCCAAAATAATCAAAGATTATTGGGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACCTCCTTAAATATTAACTTTATCCAAAATAATCAAAGATTATTGGGG  250

seq1  TTGGAGATATGGCTTCTTGGTTGAGAGCACTTGCTGTCCTCTTATAAAAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGAGATATGGCTTCTTGGTTGAGAGCACTTGCTGTCCTCTTATAAAAC  300

seq1  CCAGATTCTGTTCCCAGCAGCCGTGCAGAAGCTCAGAACCATGTGTAACT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGATTCTGTTCCCAGCAGCCGTGCAGAAGCTCAGAACCATGTGTAACT  350

seq1  CCAGTTATAATAGATCTGATGCCCTATTCTGGCCTCCCTGGGCACCAGGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGTTATAATAGATCTGATGCCCTATTCTGGCCTCCCTGGGCACCAGGC  400

seq1  ATTCACATTGTGCATACATTTTTATTCTGGGAAAACACTCATACACATAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCACATTGTGCATACATTTTTATTCTGGGAAAACACTCATACACATAG  450

seq1  GGGGGAAAAGTATTGAAAATGGGCATAAATGAGACAAGCAAATGTAAGTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGGAAAAGTATTGAAAATGGGCATAAATGAGACAAGCAAATGTAAGTC  500

seq1  CCTCACAACAGAAAGAAGCTGGAAATGAAGCTGACCCCTAAAAATGTTTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCACAACAGAAAGAAGCTGGAAATGAAGCTGACCCCTAAAAATGTTTA  550

seq1  GAAATTAACATGAGCATTTCTATAGGAGCTGGGCTTACTCGCTGAAGCAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATTAACATGAGCATTTCTATAGGAGCTGGGCTTACTCGCTGAAGCAT  600

seq1  GAGAAATGCTTAGTGGCCACACCACTAACAAAAATAACACTTCTTCCTTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAAATGCTTAGTGGCCACACCACTAACAAAAATAACACTTCTTCCTTG  650

seq1  AGTAACCACTAACTGATCAGTCTCTCAGGGAGGGGTGATGCCATGTGATC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAACCACTAACTGATCAGTCTCTCAGGGAGGGGTGATGCCATGTGATC  700

seq1  TCCTCCCTCTTTAACAATAGAATGTTGATGCAGTCTTCTGCAGGTCTTGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCCCTCTTTAACAATAGAATGTTGATGCAGTCTTCTGCAGGTCTTGT  750

seq1  GTAGATAGCTACAGAAGCTGTGAATTCAGAAAGACAATGGCTATGTGTGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGATAGCTACAGAAGCTGTGAATTCAGAAAGACAATGGCTATGTGTGT  800

seq1  TCAGAGTCTGGCTTTGGTGGGAGAAGAAGTGCCTAACCTTCAGAGGCTTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGAGTCTGGCTTTGGTGGGAGAAGAAGTGCCTAACCTTCAGAGGCTTG  850

seq1  AGGCTCCAGGGGGTAGGGAGACCTGGCAGGAGGTGCTGGGCAAGGGGGGG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTCCAGGGGGTAGGGAGACCTGGCAGGAGGTGCTGGGCAAGGGGGGG  900

seq1  GAGGGGAGG  909
      |||||||||
seq2  GAGGGGAGG  909

seq1: chr2_159748232_159749386
seq2: B6Ng01-167J18.g_66_1209 (reverse)

seq1  TTAGTTGTTCTCTTTCTAGCTTCCC-AAAGCAGGGATTGACAAATTATAG  49
      |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||
seq2  TTAGGTGTTCTCTTTCTAGCTTCCCAAAAGCAGGGA-TGACAAATTATAG  49

seq1  CCCAAAGACCAAGGGCAAGCACTATGCCTTGGAAGCAAATGTTTATTGAA  99
       ||||| ||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||
seq2  -CCAAAAACC-AGGGCCAGCACCATGCCTT-GAAGCAAATGTTTA-TGAA  95

seq1  AAACAATAATGCACATCAATTTGCATATTATCTGTGGCTATTTTGTAGTG  149
      ||   |||||||||||||  ||||||  ||||||| |||| |||||||||
seq2  AA--CATAATGCACATCA--TTGCATTATATCTGT-GCTA-TTTGTAGTG  139

seq1  TGACCGCAGAGTTGGGTAACTGTGATGAGTGTGACACAGTCTGTAAAGCC  199
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACCGCAGAGTTGGGTAACTGTGATGAGTGTGACACAGTCTGTAAAGCC  189

seq1  TCTGCTGTTTGGTGCGCAGCACTTTACCTAATAGGTGCTCTGGGGCTGAA  249
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCTGTTT-GTGCGCAGCACTTTACCTAATAGGTGCTCTGGGGCTGAA  238

seq1  GGCATGGCTCAGCAGATGGGAGTATTGATGATCTTCCAGAGGACCCAGGT  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCATGGCTCAGCAGATGGGAGTATTGATGATCTTCCAGAGGACCCAGGT  288

seq1  TCAATTCCCAGCATCCACATGGCAGCTCACAACAGTCTGTAACTCCAATT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAATTCCCAGCATCCACATGGCAGCTCACAACAGTCTGTAACTCCAATT  338

seq1  CTAGAGGATAGGATGTTCTCTTCTACCTTCAGTGGGTATTAGGGAAACTT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGAGGATAGGATGTTCTCTTCTACCTTCAGTGGGTATTAGGGAAACTT  388

seq1  GTGGTGCACAGACATACATGCAGGCAAAACAACATGCACATAAAACAAAG  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGTGCACAGACATACATGCAGGCAAAACAACATGCACATAAAACAAAG  438

seq1  AGTTGTATTTTAAAGGCTGTCAACCCTTGTACTGAAATCTGACAAAAGAA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTGTATTTTAAAGGCTGTCAACCCTTGTACTGAAATCTGACAAAAGAA  488

seq1  CTGTGCCTGTATCATCTTCTGTTCGCCACTGTTGTTTCAGAAGCTTAACA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGCCTGTATCATCTTCTGTTCGCCACTGTTGTTTCAGAAGCTTAACA  538

seq1  TATGAAACAATCTGCAACTCTTTTTGGAATACTGAATAAAACATAAAACC  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGAAACAATCTGCAACTCTTTTTGGAATACTGAATAAAACATAAAACC  588

seq1  TTAGCTTTCCAGGCTACTGCTATGTGAAATTTTCATTTCGATATCTTGTT  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGCTTTCCAGGCTACTGCTATGTGAAATTTTCATTTCGATATCTTGTT  638

seq1  ACCTGCAGAGTTTAAAGGTCATGTCCTCTATCCAGGAATTCAATTTTGGA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTGCAGAGTTTAAAGGTCATGTCCTCTATCCAGGAATTCAATTTTGGA  688

seq1  GATGGAGACATTCTCAGCAGACATCATATACTCTTAGACAGCAGGGACAG  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGAGACATTCTCAGCAGACATCATATACTCTTAGACAGCAGGGACAG  738

seq1  AAGCCCAGGCAAGCTTTCTCTGACAGCAGGTAGAGAGCCCAGCATATATG  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCCCAGGCAAGCTTTCTCTGACAGCAGGTAGAGAGCCCAGCATATATG  788

seq1  AAGGAAGACCTTAAAGTAGAAAACTTTAGGTTTCTATCGTTATGACAAAA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGAAGACCTTAAAGTAGAAAACTTTAGGTTTCTATCGTTATGACAAAA  838

seq1  CACCAGAGAAGAGTAACTTAAAAGATGAAGGGTGTATTTTGGCTGACGCT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCAGAGAAGAGTAACTTAAAAGATGAAGGGTGTATTTTGGCTGACGCT  888

seq1  TTCACTGGTTTTAGTTGCTGGCTAGCTGGCTCCATCAGTGTGAAGATGCA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCACTGGTTTTAGTTGCTGGCTAGCTGGCTCCATCAGTGTGAAGATGCA  938

seq1  GTGAGCAGAACACCAAGGTGGTAGAGGTAAAAAGCAGAAGAGGCTGCCCA  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAGCAGAACACCAAGGTGGTAGAGGTAAAAAGCAGAAGAGGCTGCCCA  988

seq1  CCTCCTGCCAACCAAGAAACAGAGAGAAGGAAGAGTCCTTGGATGGGATA  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCTGCCAACCAAGAAACAGAGAGAAGGAAGAGTCCTTGGATGGGATA  1038

seq1  CAACTTCCAGCACACATCCCTCTACATGACCAGCTTCCTCCAATAAGGCT  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACTTCCAGCACACATCCCTCTACATGACCAGCTTCCTCCAATAAGGCT  1088

seq1  GCATCTTCCAGTCTCACTACTTTCCAATAATGTTATAGCAGAGTGATCAT  1149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATCTTCCAGTCTCACTACTTTCCAATAATGTTATAGCAGAGTGATCAT  1138

seq1  GAATTC  1155
      ||||||
seq2  GAATTC  1144