BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-181P02
Chromosome2 (Build37)
Map Location 35,888,537 - 36,043,703
singlet/doubletdoublet
Overlap geneNdufa8, 1700010A17Rik, Lhx6, Rbm18, LOC100042236, Mrrf
Upstream geneHc, AI182371, Rab14, Gsn, Stom, LOC654354, 4930568D16Rik, 4930402F06Rik, Ggta1, LOC666042, LOC100042194, Dab2ip, Ttll11
Downstream geneLOC100040493, Ptgs1, Olfr334-ps1, Olfr335, Olfr336-ps1, Olfr337-ps1, Olfr338, LOC675440, Olfr339, Olfr340, Olfr341, Olfr342, Olfr343-ps1, Olfr344, Olfr345, Olfr346, Olfr347, Olfr348, Olfr50, Rpl18p, Olfr3, Olfr349-ps1, Olfr350, Olfr351, Olfr352, Olfr353, Olfr354, Olfr355, Olfr356, Olfr357, Olfr358, Olfr359-ps1, Olfr360, Olfr361, Olfr362, Olfr364-ps1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-181P02.bB6Ng01-181P02.g
ACCGA007969GA007970
length1,052737
definitionB6Ng01-181P02.b B6Ng01-181P02.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(36,042,659 - 36,043,703)(35,888,537 - 35,889,267)
sequence
gaattcaatagacacaaaaatgcaaattaaaacatgatacaccttcagct
gtcattgctaacaaaacttgatgttgtggtttctaattacaatattcaaa
cccagcaagctaccgtgaatggataagctcccatatcacagggagaaatt
caaatagatgcaaatgcttataccatctaatcctcaaatgtctcaactgg
gatattatcaagcaaacatgatctgaacataacattcttcttttattata
attaatattttatgtatgggtgctttggctatgtgtatgtgtgtgttatt
atgaatgtgaccagtgcctgagaagaccagaagagcatgcaagtaagatc
cctagaactggagttatagtgaaccacaatggagatgctgggaatcaaaa
ctgggttctctagaacagccagtacttcaaactattcagccagctctcta
gtcccaagttgttgtaatttatatgagtgtctgcatgtatcagtaccatg
tgtgtgcctgatgccttgtgacttccctgaaactagagttatagatggtc
atgaactaccatgtgggtactgggagccgaatctgggaagaataacaggt
gtttttcatcaatgagccaacttcctgacccttagcttctaaatgcttaa
gttctaggtgtaaagatgtttatattgtcctttttaaaaccttaacattt
ctatgagtctgcataagtttatgtgcactacactaagtgtaggtgctgag
gaggcataaagtgcttgtcagatcacttggaattgatgtgggtgattgag
aactgaacctgggtcctctgtaagagcagtaaacactcttactgtggaac
caactctccacttccccagcccctggcttaattttgaatagttaaaaaaa
aaaaaaatcagagcttggcgtggtagcacatgcctttaaatcccagcact
cgggaggcaagaggcaggctgattttctgagtttcgaagtcagcctggtc
tacagaggtgtagttcaggacagtcagggctactacagcttttggttttt
tt
gaattccagagctcttgcttctcagttatcatgctatccactgtgtcacg
ggaacaatggggcaggatgtaggaagacgatgcttcctggggaagacagc
actagtgtctgccttgagagatggctcagggttcaagaggcagaggagga
ggaaggatggtttcctggcgagatagcagccagatagacttaaacgctag
aaagcatctaggcatccatcggcacaggccggtgatcccagttacctgag
aagctgagacaggaagatcaccaagttcaacaccagcctgagcaagttag
tcgagataatgtctcaaacatggaaggtaaaactgggactggagatgtaa
cttagctggagggcttaactagcatgcaggaagccctgggtttaactccc
agcacgggaggaaaaaaaaaaagtggaaatcagtctgggattggccttct
acagagtgcagggttcattgtaagattaagataaacgtggggaaatgagg
taggctaaaaccagattatggagtgtcaggatgctagcaagggctcaggc
gttccctggcaggcatttgggagccactgaagattttgagcagcagaggc
acacacagcaattttgggagatgggactagaccacagttaggaaacagtt
gttaataatccaggcaagggataacgcgtgcagctctatgttgagggcag
agagatagagaggaagcatcaatgtgagatgtgcaac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_36042659_36043703
seq2: B6Ng01-181P02.b_47_1098 (reverse)

seq1  AAAAAAACC-AAAGCTGT-GTAGCCCTGGCTGTCCTGGAACT-CA-CTCT  46
      ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||| || ||||
seq2  AAAAAAACCAAAAGCTGTAGTAGCCCTGACTGTCCT-GAACTACACCTCT  49

seq1  GTAGACCAGGCTGGCCTCG-AACTCAG-AAATCCGCCTGCCTC-TGCCTC  93
      ||||||||||||| | ||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||
seq2  GTAGACCAGGCTGACTTCGAAACTCAGAAAATCAGCCTGCCTCTTGCCTC  99

seq1  CCGAGTGCTGGGA-TTAAAGGCATGTGCTACCACGCCCAGCTCTGATTTT  142
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  CCGAGTGCTGGGATTTAAAGGCATGTGCTACCACGCCAAGCTCTGATTTT  149

seq1  TTTTTTTTTTAACTATTCAAAATTAAGCCAGGGGCTGGGGAAGTGGAGAG  192
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTTTTTAACTATTCAAAATTAAGCCAGGGGCTGGGGAAGTGGAGAG  199

seq1  TTGGTTCCACAGTTAAGAGTGTTTACTGCTCTTACAGAGGACCCAGGTTC  242
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGTTCCACAG-TAAGAGTGTTTACTGCTCTTACAGAGGACCCAGGTTC  248

seq1  AGTTCTC-ATCACCCACATCAATTCCAAGTGATCTGACAAGCACTTTATG  291
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTCTCAATCACCCACATCAATTCCAAGTGATCTGACAAGCACTTTATG  298

seq1  CCTCCTCAGCACCTACACTTAGTGTAGTGCACATAAACTTATGCAGACTC  341
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCTCAGCACCTACACTTAGTGTAGTGCACATAAACTTATGCAGACTC  348

seq1  ATAGAAATGTTAAGGTTTTAAAAAGGACAATATAAACATCTTTACACCTA  391
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGAAATGTTAAGGTTTTAAAAAGGACAATATAAACATCTTTACACCTA  398

seq1  GAACTTAAGCATTTAGAAGCTAAGGGTCAGGAAGTTGGCTCATTGATGAA  441
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACTTAAGCATTTAGAAGCTAAGGGTCAGGAAGTTGGCTCATTGATGAA  448

seq1  AAACACCTGTTATTCTTCCCAGATTCGGCTCCCAGTACCCACATGGTAGT  491
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACACCTGTTATTCTTCCCAGATTCGGCTCCCAGTACCCACATGGTAGT  498

seq1  TCATGACCATCTATAACTCTAGTTTCAGGGAAGTCACAAGGCATCAGGCA  541
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGACCATCTATAACTCTAGTTTCAGGGAAGTCACAAGGCATCAGGCA  548

seq1  CACACATGGTACTGATACATGCAGACACTCATATAAATTACAACAACTTG  591
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACATGGTACTGATACATGCAGACACTCATATAAATTACAACAACTTG  598

seq1  GGACTAGAGAGCTGGCTGAATAGTTTGAAGTACTGGCTGTTCTAGAGAAC  641
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACTAGAGAGCTGGCTGAATAGTTTGAAGTACTGGCTGTTCTAGAGAAC  648

seq1  CCAGTTTTGATTCCCAGCATCTCCATTGTGGTTCACTATAACTCCAGTTC  691
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGTTTTGATTCCCAGCATCTCCATTGTGGTTCACTATAACTCCAGTTC  698

seq1  TAGGGATCTTACTTGCATGCTCTTCTGGTCTTCTCAGGCACTGGTCACAT  741
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGGATCTTACTTGCATGCTCTTCTGGTCTTCTCAGGCACTGGTCACAT  748

seq1  TCATAATAACACACACATACACATAGCCAAAGCACCCATACATAAAATAT  791
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATAATAACACACACATACACATAGCCAAAGCACCCATACATAAAATAT  798

seq1  TAATTATAATAAAAGAAGAATGTTATGTTCAGATCATGTTTGCTTGATAA  841
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTATAATAAAAGAAGAATGTTATGTTCAGATCATGTTTGCTTGATAA  848

seq1  TATCCCAGTTGAGACATTTGAGGATTAGATGGTATAAGCATTTGCATCTA  891
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCCCAGTTGAGACATTTGAGGATTAGATGGTATAAGCATTTGCATCTA  898

seq1  TTTGAATTTCTCCCTGTGATATGGGAGCTTATCCATTCACGGTAGCTTGC  941
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGAATTTCTCCCTGTGATATGGGAGCTTATCCATTCACGGTAGCTTGC  948

seq1  TGGGTTTGAATATTGTAATTAGAAACCACAACATCAAGTTTTGTTAGCAA  991
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGTTTGAATATTGTAATTAGAAACCACAACATCAAGTTTTGTTAGCAA  998

seq1  TGACAGCTGAAGGTGTATCATGTTTTAATTTGCATTTTTGTGTCTATTGA  1041
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACAGCTGAAGGTGTATCATGTTTTAATTTGCATTTTTGTGTCTATTGA  1048

seq1  ATTC  1045
      ||||
seq2  ATTC  1052

seq1: chr2_35888537_35889267
seq2: B6Ng01-181P02.g_70_806

seq1  GAATTCCAGAGCTCTTGC-CCTCAGTTATCATGCTATCCACTGTGTCACG  49
      ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGAGCTCTTGCTTCTCAGTTATCATGCTATCCACTGTGTCACG  50

seq1  GGAACAATGGGGCAGGATGTAGGAAGACGATGCTTCCTGGGGAAGACAGC  99
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAACAATGGGGCAGGATGTAGGAAGACGATGCTTCCTGGGGAAGACAGC  100

seq1  ACTAGTGTCTGCCTTGAGAGATGGCTCAGGGTTCAAGAGGCAGAGGAGGA  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAGTGTCTGCCTTGAGAGATGGCTCAGGGTTCAAGAGGCAGAGGAGGA  150

seq1  GGAAGGATGGTTTCCTGGCGAGATAGCAGCCAGATAGACTTAAACGCTAG  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGGATGGTTTCCTGGCGAGATAGCAGCCAGATAGACTTAAACGCTAG  200

seq1  AAAGCATCTAGGCATCCATCGGCACAGGCCGGTGATCCCAGTTACCTGAG  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCATCTAGGCATCCATCGGCACAGGCCGGTGATCCCAGTTACCTGAG  250

seq1  AAGCTGAGACAGGAAGATCACCAAGTTCAACACCAGCCTGAGCAAGTTAG  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTGAGACAGGAAGATCACCAAGTTCAACACCAGCCTGAGCAAGTTAG  300

seq1  TCGAGATAATGTCTCAAACATGGAAGGTAAAACTGGGACTGGAGATGTAA  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGAGATAATGTCTCAAACATGGAAGGTAAAACTGGGACTGGAGATGTAA  350

seq1  CTTAGCTGGAGGGCTTAACTAGCATGCAGGAAGCCCTGGGTTTAACTCCC  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAGCTGGAGGGCTTAACTAGCATGCAGGAAGCCCTGGGTTTAACTCCC  400

seq1  AGCACGGGAGGAAAAAAAAAAAGTGGAAATCAGTCTGGGATTGGCCTTCT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCACGGGAGGAAAAAAAAAAAGTGGAAATCAGTCTGGGATTGGCCTTCT  450

seq1  ACAGAGTGCAGGGTTCATTGTAAGATTAAGATAAACGTGGGGAAATGAGG  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGAGTGCAGGGTTCATTGTAAGATTAAGATAAACGTGGGGAAATGAGG  500

seq1  TAGGCTAAAACCAGATTATGGAGTGTCAGGATGCTAGCAAGGGCTCAGGC  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGCTAAAACCAGATTATGGAGTGTCAGGATGCTAGCAAGGGCTCAGGC  550

seq1  GTTCCCTGGCAGGCATTTGGGAGCCACTGAAGATTTTGAGCAGCAGAGGC  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCCCTGGCAGGCATTTGGGAGCCACTGAAGATTTTGAGCAGCAGAGGC  600

seq1  ACACACAGCAA-TTTGGGAGAT-GGACTAGACCACAGTTAGGAAACAGTT  647
      ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACAGCAATTTTGGGAGATGGGACTAGACCACAGTTAGGAAACAGTT  650

seq1  G-TAATAATCCAGGCAAGGGA-AACACG-GCAGC-CTAGGTTGAGGGCAG  693
      | ||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||| |||||||||||
seq2  GTTAATAATCCAGGCAAGGGATAACGCGTGCAGCTCTATGTTGAGGGCAG  700

seq1  AGAGATAGAGAGGAAGCAGTCAATGTGAGATGTGCAAC  731
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  AGAGATAGAGAGGAAGCA-TCAATGTGAGATGTGCAAC  737