BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-187G07
Chromosome2 (Build37)
Map Location 134,361,796 - 134,458,801
singlet/doubletdoublet
Overlap geneHao1, Txndc13
Upstream geneBmp2
Downstream geneLOC627897, LOC433478, Plcb1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-187G07.bB6Ng01-187G07.g
ACCGA011985GA011986
length1,0731,163
definitionB6Ng01-187G07.b B6Ng01-187G07.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(134,457,744 - 134,458,801)(134,361,796 - 134,362,957)
sequence
gaattccatataactgggaggagtgaatggatattccacccctcattctg
tgaggaaacataagtaaggcagcaagcccagctagggtagtaagtattat
gtgaatacagatttattttataaaaatgatgaaaacagattgtcagtgct
tcagtgtatcaaatttcaagtgacccaagagatagaaaattcaaacagat
gatttacatagatgcttgatttttgttggtatcgttcagcaagagaggta
ggtagaaataagtgttagaagaatgtatgttattttctcctgatatgttc
tttctctacactaagtacaggtagccttctaaatataattgatttacaag
ttacatttataggatagagagctgttttgcagccattgtgagtcgagttt
gctgcattttgttgtttgtataatgtctctatcaggccatgattgtgatg
agtgaaaatctttccctctgtgagaacactacctactttcctcatctgag
ttatcttcaggaactaccagggttcctcaaagaagtttcttagtaactat
ttgctgagcgaaggagacctttattctgtttacctttacatatagataat
gacatcatatgtgctttatgtttagtaaagagttacagaaacaatgaaaa
taagtatgatttcatgtacaatacttggaaattgtataaatacacataaa
ttatgtaaaataattaggatatttaaacctttaaaaatattcattaatgg
gaatggaatagtacaagtatctttacattatttttattttccattttatg
agctagggcatcactgtagttttagactaagaatgaaacttgatatatag
cctaggcattcctcagatttgaagtgctgggattaccagcctcactgggc
ctggtttacattttaaacttgtttgtttgtttgcttgttttttctgagac
agggattctctatgtaataaaccctggcttgtcctggggcctcaaaccca
cagagattacctgcctctgcctcccaagtgctggaaattaaggctgtcta
ccatgcctggacataccttaatt
gaattcataaaaagaaacacaccaaaaaagcttctggtggtgtgctgtgc
ttgctgtggcttcttgtcacttccacagactcagactgattggcagagtg
atgtcagctgagacagatgcacgtgctggaggacaggtgatgtttagagg
gaggactaaaaaaggactcaaccaattgttacatggggtgggagactgag
ctaggcttgcttatagagctaactgtgcacagtgcttgttggtcttgagt
ctttgctgaccttcacttcgctgagaggcatggctgaatgctgaggtcac
atgactgtgatgggttaggcgcagtaatttctacagcaatatggaaaagg
aaaaccaagagctctgtcaaattctccatattttatcgtagacacttctt
aacatcatcttaaggtaaagtgcccctagtcagcaatgtttcctttttca
tatgcatatatttatgaattttaattgacaagtgacaattgtgtgtataa
tgatgatacaatgtgatcttttgacttatgaactcatagtaaaaaataat
caattatgctagtgacatatgcaactaattttgtgatgagaatatcaaaa
atctcttcttcaaggctgggtatatagctcagtagagacttgaatagtat
gtataataaggctttgagttcaacccatagcactaaaaataagttttaaa
atccaattctttcagcaaaatttgaaatatataatatatcagtattcaga
gtggtttcatgcagccccatagcttcccaatggctcttcctctagtctac
cctagactttgattaactccttcctttccccattctcagcctggactctg
gcttctcagttctatcatagcatcctagactctgactgacatccctcctt
tccccaccctcatcccccaaaccacagcttctagtttctagcactttact
ctacaattctacaatatttcattgtgcatgcatccataccacattttctt
tattgttcatccattaatggggatctaggtgctttcatattgggtattta
gaataatgctgactgaccatgagattgcactaataatattttagcatgct
atttatagcctttaaatattccaacgtgggatgacctgggtcacattttg
aaccttatttctc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_134457744_134458801
seq2: B6Ng01-187G07.b_48_1109 (reverse)

seq1  GTCCAGGCATGGTAGAACAAGCCTTTAATTCCAGCACTTGGGAGGCAGAG  50
      ||||||||||||||||   |||||| | ||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCAGGCATGGTAGA--CAGCCTTAATTTCCAGCACTTGGGAGGCAGAG  48

seq1  GCAGGTAATCTCTGTGGGTTTGAGGCCCCAGGAC-AGCCAGGGTTTATTA  99
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  GCAGGTAATCTCTGTGGGTTTGAGGCCCCAGGACAAGCCAGGGTTTATTA  98

seq1  CATAGAGAATCCCTGTCTCAGAAAAAAACAAGCAAACAAACAAACAAGTT  149
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAGAGAATCCCTGTCTCAG-AAAAAACAAGCAAACAAACAAACAAGTT  147

seq1  TAAAATGTAAACCAGGCCCAGTGAGGCTGGTAATCCCAGCACTACAAATC  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  TAAAATGTAAACCAGGCCCAGTGAGGCTGGTAATCCCAGCACTTCAAATC  197

seq1  TGAGGAATGCCTAGGCTATATATCAAGTTTCATTC-TAGTCTAAAACTAC  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  TGAGGAATGCCTAGGCTATATATCAAGTTTCATTCTTAGTCTAAAACTAC  247

seq1  AGTGATGCCCTAGCTCATAAAATGGAAAAT-AAAATAATGTAAAGATACT  297
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  AGTGATGCCCTAGCTCATAAAATGGAAAATAAAAATAATGTAAAGATACT  297

seq1  TGTACTATTCCATT-CCATTAATGAATATTTTTAAAGGTTT-AATATCCT  345
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  TGTACTATTCCATTCCCATTAATGAATATTTTTAAAGGTTTAAATATCCT  347

seq1  AATTATTTTACATAATTT-TGTGTATTTATACAATTTCCAAGTATTGTAC  394
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTATTTTACATAATTTATGTGTATTTATACAATTTCCAAGTATTGTAC  397

seq1  ATG-AATCATACTTATTTTCATTGTTTCTGTAACTCTTTACTAAACATAA  443
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAAATCATACTTATTTTCATTGTTTCTGTAACTCTTTACTAAACATAA  447

seq1  AGCACATATGATGTCATTATCTATATGTAAAGGTAAACAGAATAAAGGTC  493
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCACATATGATGTCATTATCTATATGTAAAGGTAAACAGAATAAAGGTC  497

seq1  TCCTTCGCTCAGCAAATAGTTACTAAGAAACTTCTTTGAGGAACCCTGGT  543
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTCGCTCAGCAAATAGTTACTAAGAAACTTCTTTGAGGAACCCTGGT  547

seq1  AGTTCCTGAAGATAACTCAGATGAGGAAAGTAGGTAGTGTTCTCACAGAG  593
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTCCTGAAGATAACTCAGATGAGGAAAGTAGGTAGTGTTCTCACAGAG  597

seq1  GGAAAGATTTTCACTCATCACAATCATGGCCTGATAGAGACATTATACAA  643
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAAGATTTTCACTCATCACAATCATGGCCTGATAGAGACATTATACAA  647

seq1  ACAACAAAATGCAGCAAACTCGACTCACAATGGCTGCAAAACAGCTCTCT  693
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAACAAAATGCAGCAAACTCGACTCACAATGGCTGCAAAACAGCTCTCT  697

seq1  ATCCTATAAATGTAACTTGTAAATCAATTATATTTAGAAGGCTACCTGTA  743
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTATAAATGTAACTTGTAAATCAATTATATTTAGAAGGCTACCTGTA  747

seq1  CTTAGTGTAGAGAAAGAACATATCAGGAGAAAATAACATACATTCTTCTA  793
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAGTGTAGAGAAAGAACATATCAGGAGAAAATAACATACATTCTTCTA  797

seq1  ACACTTATTTCTACCTACCTCTCTTGCTGAACGATACCAACAAAAATCAA  843
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACTTATTTCTACCTACCTCTCTTGCTGAACGATACCAACAAAAATCAA  847

seq1  GCATCTATGTAAATCATCTGTTTGAATTTTCTATCTCTTGGGTCACTTGA  893
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATCTATGTAAATCATCTGTTTGAATTTTCTATCTCTTGGGTCACTTGA  897

seq1  AATTTGATACACTGAAGCACTGACAATCTGTTTTCATCATTTTTATAAAA  943
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTGATACACTGAAGCACTGACAATCTGTTTTCATCATTTTTATAAAA  947

seq1  TAAATCTGTATTCACATAATACTTACTACCCTAGCTGGGCTTGCTGCCTT  993
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATCTGTATTCACATAATACTTACTACCCTAGCTGGGCTTGCTGCCTT  997

seq1  ACTTATGTTTCCTCACAGAATGAGGGGTGGAATATCCATTCACTCCTCCC  1043
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTATGTTTCCTCACAGAATGAGGGGTGGAATATCCATTCACTCCTCCC  1047

seq1  AGTTATATGGAATTC  1058
      |||||||||||||||
seq2  AGTTATATGGAATTC  1062

seq1: chr2_134361796_134362957
seq2: B6Ng01-187G07.g_63_1225

seq1  GAATTCATAAAAAGAAACACACCAAAAAAGCTTCTGGTGGTGTGCTGTGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATAAAAAGAAACACACCAAAAAAGCTTCTGGTGGTGTGCTGTGC  50

seq1  TTGCTGTGGCTTCTTGTCACTTCCACAGACTCAGACTGATTGGCAGAGTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTGTGGCTTCTTGTCACTTCCACAGACTCAGACTGATTGGCAGAGTG  100

seq1  ATGTCAGCTGAGACAGATGCACGTGCTGGAGGACAGGTGATGTTTAGAGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTCAGCTGAGACAGATGCACGTGCTGGAGGACAGGTGATGTTTAGAGG  150

seq1  GAGGACTAAAAAAGGACTCAACCAATTGTTACATGGGGTGGGAGACTGAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGACTAAAAAAGGACTCAACCAATTGTTACATGGGGTGGGAGACTGAG  200

seq1  CTAGGCTTGCTTATAGAGCTAACTGTGCACAGTGCTTGTTGGTCTTGAGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGGCTTGCTTATAGAGCTAACTGTGCACAGTGCTTGTTGGTCTTGAGT  250

seq1  CTTTGCTGACCTTCACTTCGCTGAGAGGCATGGCTGAATGCTGAGGTCAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGCTGACCTTCACTTCGCTGAGAGGCATGGCTGAATGCTGAGGTCAC  300

seq1  ATGACTGTGATGGGTTAGGCGCAGTAATTTCTACAGCAATATGGAAAAGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGACTGTGATGGGTTAGGCGCAGTAATTTCTACAGCAATATGGAAAAGG  350

seq1  AAAACCAAGAGCTCTGTCAAATTCTCCATATTTTATCGTAGACACTTCTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACCAAGAGCTCTGTCAAATTCTCCATATTTTATCGTAGACACTTCTT  400

seq1  AACATCATCTTAAGGTAAAGTGCCCCTAGTCAGCAATGTTTCCTTTTTCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATCATCTTAAGGTAAAGTGCCCCTAGTCAGCAATGTTTCCTTTTTCA  450

seq1  TATGCATATATTTATGAATTTTAATTGACAAGTGACAATTGTGTGTATAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCATATATTTATGAATTTTAATTGACAAGTGACAATTGTGTGTATAA  500

seq1  TGATGATACAATGTGATCTTTTGACTTATGAACTCATAGTAAAAAATAAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGATACAATGTGATCTTTTGACTTATGAACTCATAGTAAAAAATAAT  550

seq1  CAATTATGCTAGTGACATATGCAACTAATTTTGTGATGAGAATATCAAAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATTATGCTAGTGACATATGCAACTAATTTTGTGATGAGAATATCAAAA  600

seq1  ATCTCTTCTTCAAGGCTGGGTATATAGCTCAGTAGAGACTTGAATAGTAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTCTTCTTCAAGGCTGGGTATATAGCTCAGTAGAGACTTGAATAGTAT  650

seq1  GTATAATAAGGCTTTGAGTTCAACCCATAGCACTAAAAATAAGTTTTAAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATAATAAGGCTTTGAGTTCAACCCATAGCACTAAAAATAAGTTTTAAA  700

seq1  ATCCAATTCTTTCAGCAAAATTTGAAATATATAATATATCAGTATTCAGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCAATTCTTTCAGCAAAATTTGAAATATATAATATATCAGTATTCAGA  750

seq1  GTGGTTTCATGCAGCCCCATAGCTTCCCAATGGCTCTTCCTCTAGTCTAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGTTTCATGCAGCCCCATAGCTTCCCAATGGCTCTTCCTCTAGTCTAC  800

seq1  CCTAGACTTTGATTAACTCCTTCCTTTCCCCATTCTCAGCCTGGACTCTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAGACTTTGATTAACTCCTTCCTTTCCCCATTCTCAGCCTGGACTCTG  850

seq1  GCTTCTCAGTTCTATCATAGCATCCTAGACTCTGACTGACAT-CCTCCTT  899
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  GCTTCTCAGTTCTATCATAGCATCCTAGACTCTGACTGACATCCCTCCTT  900

seq1  TCCCCACCCTCATCCCCC-AACCACAGCTTCTAGTTTCTAGCACTTTACT  948
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCCACCCTCATCCCCCAAACCACAGCTTCTAGTTTCTAGCACTTTACT  950

seq1  CTACAATTCTACAATATTTCATTGTGCATGCATCCATACCACATTTTCTT  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACAATTCTACAATATTTCATTGTGCATGCATCCATACCACATTTTCTT  1000

seq1  TATTTGTTCATCCATTAAT-GGGATCTTAGGTGCTTTCATATTGGTTATT  1047
      || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||
seq2  TA-TTGTTCATCCATTAATGGGGATC-TAGGTGCTTTCATATTGGGTATT  1048

seq1  TGGAATAATGCTGAACTGACCATGAGATTGCAACTAT-ATA-TTTAGCAT  1095
      | ||||||||||| ||||||||||||||||||   || ||| ||||||||
seq2  TAGAATAATGCTG-ACTGACCATGAGATTGCACTAATAATATTTTAGCAT  1097

seq1  GCTAATTTAAATAACC-TTAAATATTTCAAAAGTGGGATGA-CTGGGTCA  1143
      |||| ||   ||| || ||||||| ||| || ||||||||| ||||||||
seq2  GCTATTT---ATAGCCTTTAAATA-TTCCAACGTGGGATGACCTGGGTCA  1143

seq1  CATTTT-AATCTTATTTCTC  1162
      |||||| || ||||||||||
seq2  CATTTTGAACCTTATTTCTC  1163