BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-188P07
Chromosome2 (Build37)
Map Location 19,346,650 - 19,480,792
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100041196, Ptf1a, LOC100041534, 4921504E06Rik
Upstream geneLOC625815, Commd3, Bmi1, EG667477, LOC100041448, BC061194, LOC667493, LOC100041479, Pip5k2a, 4930426L09Rik, LOC667521, Armc3, Msrb2
Downstream geneLOC100041244, Otud1, LOC667564, LOC100041302, LOC433406, LOC654360, LOC667609, Etl4
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-188P07.bB6Ng01-188P07.g
ACCGA013105GA013106
length1,1591,068
definitionB6Ng01-188P07.b B6Ng01-188P07.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(19,479,625 - 19,480,792)(19,346,650 - 19,347,710)
sequence
gaattctcctgttactctctaaagcctgattagtaataataatttggaag
taatcttccatttactagttactactttgtattgtaactttgatcttagg
caacaataaacacaagtctcagagaaccataagggaaaaaaaatcagtga
aattaggttatttgaaggaaactgagtggaatctatggggccaatcagct
ttgagtcttgtaaatgttgccagtttcctgggtcttgtgagctccttccc
tgctctaggaagatatgccttgtgagccttgagcctctttctccttctag
gagggaatgtctcaatctcgaggaaacagctacacaaaactgaaaaagag
aactaattactgtcctctcatgtatggatctcagagtgtgcatgtgcaca
tgtatgtacacctatgtgcatacttgtacataccatgagagcagaaggga
gactgctcagggagagagggagtctagcaagtggaacaagagaaggcaac
aaggagtgaatgtggccgcagtgcacacaggtatgcttgaacagaaacat
cattatgaaaaccactacattctacaatgaatatgtgttaataaaatctc
aataaactaaacaaaaatgtttctgattacagagaacccaagcaatgtat
gaaggctgtcccaggagccttctaccatctaacaaagctgacccatttga
aatggatgtggtgacattctagatgcaagatgctcagttctccagtaatc
aacagatgagaagcaaaggctggcagaggaccgttcaagaaccaagtttc
aagtcccacccctcagggttttagttacaggccatgttagattcttacaa
ctgtttgtgcataggcaggagatgctgaactatattatctaatctgtgtg
tctcaaaatgcacaatgtgagtctagttttaatatttattgattatcaat
gggggtactaaatcagtaaaaccactttctgactgggcaacacgaagctc
aaccttaaaccggagttgactagtgcatgaggccctgagctcagtcccta
gcactcagaagaaatcacacttacaacacccgaccataggaagcatgaca
tttcttacattgctagcatagtggacctaagtatagggtgacgtgacttg
gacattcct
gaattccacccctacacttcctaggatgactttgcagtgataccaacatt
cagatcagatcatatgtgagcagcaaacaaaaggatgcaggcatcctcca
ggaactggaaagagcaagaaaaccatgtctccccccaaagcctccaggag
aagtgctcctctgccaaccctgtgctacacttatagccatttagtctgaa
ggagtggaagactgtccacttgtgttgctttaagtcactgacttctggta
attaggtatggcaaccacagagaactaacaccagcctttcctttcatcat
tggatgatgggcatctatttctgcctctcgagaggtgacgttatgccatc
tccttgatctaggatttcccaccttcagaacttgtgggaaacatgttttt
tttagcttatgaattactcggtttgaagcattatgttgcagcagcaagaa
aagattgaaatagaccctcttctcctgtcaccaaagctagtgatagcata
ttcctctgaccactttcttctcaatcatatttccttctgcctccctattc
tgttctaagaaccctgcaccgtactaccaggaacacccttttcatttcct
tcgctgtatctgactattccaaggctagtcagcccctctaccatccatgg
agatgaaatcgtacagatgaaccacaccaggagcctgccctaggggtcag
agcatggcttagagtgggtatgggagcaggtggcggtaggcatgatcata
ggttgctatgggcagtcactgcctacctgactagagtttccattttcaat
gatgctgggcccttccacaattgccacaagaccacagagaccaaggctga
agagattgctcatgtgccgattttctagctcgtttttgagatttttattg
gagctacatgagacttagcattcaattaatcacaaggtagctaggactct
catcataaggtacaatagaacctcaagatattaaaatattatcattccag
ggaaactttaaggaaaacccagttctaacacagaaaatctcgtttattac
ctaagatttgaatgttta
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_19479625_19480792
seq2: B6Ng01-188P07.b_46_1204 (reverse)

seq1  AGGAATGTTTCAAGTTCTACTGTCACACTATACTAAGTCCCACTATGCTA  50
      ||||||| | |||||   || ||||| ||||||| ||  |||||||||| 
seq2  AGGAATG-TCCAAGT--CAC-GTCACCCTATACTTAGGTCCACTATGCT-  45

seq1  AACAATGTAAGAAATGTCAATGCTTTCCTATTGTCGGGTTGTTGTTAAAG  100
      | |||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||  |||
seq2  AGCAATGTAAGAAATGTC-ATGC-TTCCTATGGTCGGG-TGTTGT--AAG  90

seq1  TTGTGATTTCTTCTGAAGTGCTAGGGACTGAGCTCAGGGCCTCATGCACT  150
       |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  -TGTGATTTCTTCTG-AGTGCTAGGGACTGAGCTCAGGGCCTCATGCACT  138

seq1  AGTCAACT-CGGTTAAGGGTTGAGCTTCGTGGTGCCCAGTCAG-AAGTGG  198
      |||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||
seq2  AGTCAACTCCGGTTTAAGGTTGAGCTTCGTGTTGCCCAGTCAGAAAGTGG  188

seq1  TTTTACTGATTTAGTA-CCCCATTGATAATCAATAAATATTAAAACTAGA  247
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTACTGATTTAGTACCCCCATTGATAATCAATAAATATTAAAACTAGA  238

seq1  CTCACATTGTGCATTTTGAGACACACAGATTAGATAATATAGTTCAGCAT  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACATTGTGCATTTTGAGACACACAGATTAGATAATATAGTTCAGCAT  288

seq1  CTCCTGCCTATGCACAAACAGTTGTAAGAATCTAACATGGCCTGTAACTA  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTGCCTATGCACAAACAGTTGTAAGAATCTAACATGGCCTGTAACTA  338

seq1  AAACCCTGAGGGGTGGGACTTGAAACTTGGTTCTTGAACGGTCCTCTGCC  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACCCTGAGGGGTGGGACTTGAAACTTGGTTCTTGAACGGTCCTCTGCC  388

seq1  AGCCTTTGCTTCTCATCTGTTGATTACTGGAGAACTGAGCATCTTGCATC  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTTTGCTTCTCATCTGTTGATTACTGGAGAACTGAGCATCTTGCATC  438

seq1  TAGAATGTCACCACATCCATTTCAAATGGGTCAGCTTTGTTAGATGGTAG  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAATGTCACCACATCCATTTCAAATGGGTCAGCTTTGTTAGATGGTAG  488

seq1  AAGGCTCCTGGGACAGCCTTCATACATTGCTTGGGTTCTCTGTAATCAGA  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCTCCTGGGACAGCCTTCATACATTGCTTGGGTTCTCTGTAATCAGA  538

seq1  AACATTTTTGTTTAGTTTATTGAGATTTTATTAACACATATTCATTGTAG  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATTTTTGTTTAGTTTATTGAGATTTTATTAACACATATTCATTGTAG  588

seq1  AATGTAGTGGTTTTCATAATGATGTTTCTGTTCAAGCATACCTGTGTGCA  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTAGTGGTTTTCATAATGATGTTTCTGTTCAAGCATACCTGTGTGCA  638

seq1  CTGCGGCCACATTCACTCCTTGTTGCCTTCTCTTGTTCCACTTGCTAGAC  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCGGCCACATTCACTCCTTGTTGCCTTCTCTTGTTCCACTTGCTAGAC  688

seq1  TCCCTCTCTCCCTGAGCAGTCTCCCTTCTGCTCTCATGGTATGTACAAGT  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTCTCTCCCTGAGCAGTCTCCCTTCTGCTCTCATGGTATGTACAAGT  738

seq1  ATGCACATAGGTGTACATACATGTGCACATGCACACTCTGAGATCCATAC  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCACATAGGTGTACATACATGTGCACATGCACACTCTGAGATCCATAC  788

seq1  ATGAGAGGACAGTAATTAGTTCTCTTTTTCAGTTTTGTGTAGCTGTTTCC  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGAGGACAGTAATTAGTTCTCTTTTTCAGTTTTGTGTAGCTGTTTCC  838

seq1  TCGAGATTGAGACATTCCCTCCTAGAAGGAGAAAGAGGCTCAAGGCTCAC  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGAGATTGAGACATTCCCTCCTAGAAGGAGAAAGAGGCTCAAGGCTCAC  888

seq1  AAGGCATATCTTCCTAGAGCAGGGAAGGAGCTCACAAGACCCAGGAAACT  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCATATCTTCCTAGAGCAGGGAAGGAGCTCACAAGACCCAGGAAACT  938

seq1  GGCAACATTTACAAGACTCAAAGCTGATTGGCCCCATAGATTCCACTCAG  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAACATTTACAAGACTCAAAGCTGATTGGCCCCATAGATTCCACTCAG  988

seq1  TTTCCTTCAAATAACCTAATTTCACTGATTTTTTTTCCCTTATGGTTCTC  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCTTCAAATAACCTAATTTCACTGATTTTTTTTCCCTTATGGTTCTC  1038

seq1  TGAGACTTGTGTTTATTGTTGCCTAAGATCAAAGTTACAATACAAAGTAG  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGACTTGTGTTTATTGTTGCCTAAGATCAAAGTTACAATACAAAGTAG  1088

seq1  TAACTAGTAAATGGAAGATTACTTCCAAATTATTATTACTAATCAGGCTT  1147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACTAGTAAATGGAAGATTACTTCCAAATTATTATTACTAATCAGGCTT  1138

seq1  TAGAGAGTAACAGGAGAATTC  1168
      |||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGAGTAACAGGAGAATTC  1159

seq1: chr2_19346650_19347710
seq2: B6Ng01-188P07.g_66_1133

seq1  GAATTCCACCCCTACACTTCCTAGGATGACTTTGCAGTGATACCAACATT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCACCCCTACACTTCCTAGGATGACTTTGCAGTGATACCAACATT  50

seq1  CAGATCAGATCATATGTGAGCAGCAAACAAAAGGATGCAGGCATCCTCCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATCAGATCATATGTGAGCAGCAAACAAAAGGATGCAGGCATCCTCCA  100

seq1  GGAACTGGAAAGAGCAAGAAAACCATGTCTCCCCCCAAAGCCTCCAGGAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAACTGGAAAGAGCAAGAAAACCATGTCTCCCCCCAAAGCCTCCAGGAG  150

seq1  AAGTGCTCCTCTGCCAACCCTGTGCTACACTTATAGCCATTTAGTCTGAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGCTCCTCTGCCAACCCTGTGCTACACTTATAGCCATTTAGTCTGAA  200

seq1  GGAGTGGAAGACTGTCCACTTGTGTTGCTTTAAGTCACTGACTTCTGGTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGTGGAAGACTGTCCACTTGTGTTGCTTTAAGTCACTGACTTCTGGTA  250

seq1  ATTAGGTATGGCAACCACAGAGAACTAACACCAGCCTTTCCTTTCATCAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAGGTATGGCAACCACAGAGAACTAACACCAGCCTTTCCTTTCATCAT  300

seq1  TGGATGATGGGCATCTATTTCTGCCTCTCGAGAGGTGACGTTATGCCATC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGATGATGGGCATCTATTTCTGCCTCTCGAGAGGTGACGTTATGCCATC  350

seq1  TCCTTGATCTAGGATTTCCCACCTTCAGAACTTGTGGGAAACATGTTTTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTGATCTAGGATTTCCCACCTTCAGAACTTGTGGGAAACATGTTTTT  400

seq1  TTTAGCTTATGAATTACTCGGTTTGAAGCATTATGTTGCAGCAGCAAGAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGCTTATGAATTACTCGGTTTGAAGCATTATGTTGCAGCAGCAAGAA  450

seq1  AAGATTGAAATAGACCCTCTTCTCCTGTCACCAAAGCTAGTGATAGCATA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATTGAAATAGACCCTCTTCTCCTGTCACCAAAGCTAGTGATAGCATA  500

seq1  TTCCTCTGACCACTTTCTTCTCAATCATATTTCCTTCTGCCTCCCTATTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTCTGACCACTTTCTTCTCAATCATATTTCCTTCTGCCTCCCTATTC  550

seq1  TGTTCTAAGAACCCTGCACCGTACTACCAGGAACACCCTTTTCATTTCCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTCTAAGAACCCTGCACCGTACTACCAGGAACACCCTTTTCATTTCCT  600

seq1  TCGCTGTATCTGACTATTCCAAGGCTAGTCAGCCCCTCTACCATCCATGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGCTGTATCTGACTATTCCAAGGCTAGTCAGCCCCTCTACCATCCATGG  650

seq1  AGATGAAATCGTACAGATGAACCACACCAGGAGCCTGCCCTAGGGGTCAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGAAATCGTACAGATGAACCACACCAGGAGCCTGCCCTAGGGGTCAG  700

seq1  AGCATGGCTTAGAGTGGGTATGGGAGCAGGTGGCGGTAGGCATGATCATA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATGGCTTAGAGTGGGTATGGGAGCAGGTGGCGGTAGGCATGATCATA  750

seq1  GGTTGCTATGGGCAGTCACTGCCTACCTGACTAGAGTTTCCATTTTCAAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTGCTATGGGCAGTCACTGCCTACCTGACTAGAGTTTCCATTTTCAAT  800

seq1  GATGCTGGG-CCTTCCACAATTGCCACAAGACCACAGAGACCAAGGCTGA  849
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGCTGGGCCCTTCCACAATTGCCACAAGACCACAGAGACCAAGGCTGA  850

seq1  AGAGATTGCTCATGTGCCGATTTTCTAGCTCGTTTTTGAGA-TTTTATTG  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  AGAGATTGCTCATGTGCCGATTTTCTAGCTCGTTTTTGAGATTTTTATTG  900

seq1  GAGCTACATGAGACTTAGCA-TCAATT-ATCACAAAGTAGCTAGGACTCT  946
      |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||
seq2  GAGCTACATGAGACTTAGCATTCAATTAATCACAAGGTAGCTAGGACTCT  950

seq1  CATCATAA-GTAC-ATAGAA-CTCAAGATAATTAAAATATTAATCAATCC  993
      |||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||
seq2  CATCATAAGGTACAATAGAACCTCAAGAT-ATTAAAATATT-ATCATTCC  998

seq1  A-GGAAACTTT-AGGAAAACCCAGTTCTAACACCAGAAAA--TCGTTTAT  1039
      | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| 
seq2  AGGGAAACTTTAAGGAAAACCCAGTTCTAACA-CAGAAAATCTCGTTTA-  1046

seq1  TTACCTAAGATTTTAATGTTTA  1061
      ||||||||||||| ||||||||
seq2  TTACCTAAGATTTGAATGTTTA  1068