BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-192M14
Chromosome2 (Build37)
Map Location 7,022,162 - 7,236,462
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream gene5430407P10Rik, LOC634939, Echdc3, 1700014B07Rik, Usp6nl, LOC100040387, Cugbp2, LOC100040659
Downstream geneLOC100040648, LOC672230
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-192M14.bB6Ng01-192M14.g
ACCGA015932GA015933
length1,0411,132
definitionB6Ng01-192M14.b B6Ng01-192M14.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(7,235,426 - 7,236,462)(7,022,162 - 7,023,281)
sequence
gaattcctcccaagttcttagcagtgctaaatataattaaattcaaatcc
cctttcaccacctgcactaagcctggctgacctgtgtcattgttgatttg
agggcttcagtggttccttgaggtgtcatggttgtagcaaaaataaagtg
ggaattttcagccagagagtttttaagtcttccattcaccagtcacatgg
ctgtgggcaagttattacattatatgggtttcattcgctcatcagttaag
tccccctttatgttcaaaagattacagagagcagttggcagagtttttta
tattggcacacgtatcatcctacgaatgtttgcaatgaagtcttaaaccc
atttaagtacacttcatgagaattccaaagtggcatggagactggtggcc
taagaagagcagagcatcatctgccttactcctagtcccctggtcttggt
taccctccacttttttcccatgcagcaatggcctctaaaaccttaagcat
catctttattaagaagctctaggaatagaaaaagtttgctacgatagtta
ttgaatggaaattaataccaattagtgacactttagaggtgtctggtggc
tccttgggtttctatagcatacgccacaaagcctacttggcagttttaaa
cttgcttgccaaccgactacacagggctaaaaagaaaatctttaattgga
gggttcagtgtcacaaaatcctcaatctgatttatatctgttttgactct
gcacagatttctttcaaattcaggtcaacttcccaagaataactctcatt
tcagagtagtccgtggacaactccaaaagggaattttattctgaattcat
tctagaatcctgggttggagagatggcccagtcattaaacatttgctgtg
caaatgtgaaaacaacgagttttgaacattaaaacccacacaaaaaatcc
aggtgtggtgagataatcttatagtcacaaaggcaaaaaaggaagagaca
ggaggtcactggcttcagcagttgtagccaagcatgagctt

gaattcacccatcttgaatctacttgtgctatcggaagtcattcttcttt
aaaaatagatttattttatttttaattatgtatatgaaagtgtacctctg
tgtgtggaagtaagaaaaagactttaacttcctggtgttggagttacagg
tggtcacaagctacctgggtgctagaatccaactctggttctcttaaaag
cagcaagaactcttaacctctgaaccagctgcatgaggcaggcttttgtc
ttgttttttgtagaatttaaacaggaaacaaagccatagacctgtcaagt
aggaatgatgtgtgatcccaatgccttataagcaaagagctctgagaaaa
aggagacatagtcctggcaggaagcatcaaatggttttttagttccttag
ggttgaatgtatgattacagagaggtacgagaaatcagtttcgaaacaga
ggcaggcggaaccagatcatggaggactacaagatcatgtttggcacttt
gagggctagggccgataactaaccactgaggaatgtaagcagggagaaaa
caaagtttagcatgttagaaataattgtcctagttgtaagatgagacacg
gacagcaaagaagtgggtctggggtaagaaaacaagttaaagagtgtgcc
actgtcacctgtaaggggtgagggaagatcttgatgcagttgtgtcggga
agagaggaaaggcagttgagcaaaaacgacttgggaaggtagaaagatcc
tgaataatgcagagtgagcgagagaggcaggtgtgagatctaggttccta
gcttgatcaacatactatatacggtacacttcttaagtcaggagcacagg
ctgagaggccagctttggagtgatgcttatggactcagtctggcagttgc
tgaatttgtagtacccaagagaacatctttgtaaaggtggcagatgggac
agccatatacacagagccttaggatggagacctgggatgaacctgcagga
tgagcatcattagcattatcaatagcaatatggaagtactattagtgtag
agttaattttgccctggtctttgctggcatgtgaggttaaaaggaaatga
aagtttaaaacattttaccttgcagaacactt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_7235426_7236462
seq2: B6Ng01-192M14.b_45_1085 (reverse)

seq1  AAGCTCATTGCTTGGCTAC-ACTGCTG-AGCCAGTGACCTCCTGTCTCTT  48
      ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTCA-TGCTTGGCTACAACTGCTGAAGCCAGTGACCTCCTGTCTCTT  49

seq1  CCTTTTTTGCC-TTGTGACTATAAGATTATCTCACCACACCTGGA-TTTT  96
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  CCTTTTTTGCCTTTGTGACTATAAGATTATCTCACCACACCTGGATTTTT  99

seq1  TGTGTGGGTTTTAATGTTCAAAACTCG-TGTTTTCACATTTGCACAGCAA  145
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGGGTTTTAATGTTCAAAACTCGTTGTTTTCACATTTGCACAGCAA  149

seq1  ATGTTTAATGACTGGGCCATCTCTCCAACCCAGGATTCTAGAATGAATTC  195
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTTAATGACTGGGCCATCTCTCCAACCCAGGATTCTAGAATGAATTC  199

seq1  AGAATAAAATTCCCTTTTGGAGTTGTCCACGGACTACTCTGAAATGAGAG  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATAAAATTCCCTTTTGGAGTTGTCCACGGACTACTCTGAAATGAGAG  249

seq1  TTATTCTTGGGAAGTTGACCTGAATTTGAAAGAAATCTGTGCAGAGTCAA  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTCTTGGGAAGTTGACCTGAATTTGAAAGAAATCTGTGCAGAGTCAA  299

seq1  AACAGATATAAATCAGATTGAGGATTTTGTGACACTGAACCCTCCAATTA  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGATATAAATCAGATTGAGGATTTTGTGACACTGAACCCTCCAATTA  349

seq1  AAGATTTTCTTTTTAGCCCTGTGTAGTCGGTTGGCAAGCAAGTTTAAAAC  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATTTTCTTTTTAGCCCTGTGTAGTCGGTTGGCAAGCAAGTTTAAAAC  399

seq1  TGCCAAGTAGGCTTTGTGGCGTATGCTATAGAAACCCAAGGAGCCACCAG  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCAAGTAGGCTTTGTGGCGTATGCTATAGAAACCCAAGGAGCCACCAG  449

seq1  ACACCTCTAAAGTGTCACTAATTGGTATTAATTTCCATTCAATAACTATC  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACCTCTAAAGTGTCACTAATTGGTATTAATTTCCATTCAATAACTATC  499

seq1  GTAGCAAACTTTTTCTATTCCTAGAGCTTCTTAATAAAGATGATGCTTAA  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGCAAACTTTTTCTATTCCTAGAGCTTCTTAATAAAGATGATGCTTAA  549

seq1  GGTTTTAGAGGCCATTGCTGCATGGGAAAAAAGTGGAGGGTAACCAAGAC  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTTAGAGGCCATTGCTGCATGGGAAAAAAGTGGAGGGTAACCAAGAC  599

seq1  CAGGGGACTAGGAGTAAGGCAGATGATGCTCTGCTCTTCTTAGGCCACCA  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGGGACTAGGAGTAAGGCAGATGATGCTCTGCTCTTCTTAGGCCACCA  649

seq1  GTCTCCATGCCACTTTGGAATTCTCATGAAGTGTACTTAAATGGGTTTAA  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTCCATGCCACTTTGGAATTCTCATGAAGTGTACTTAAATGGGTTTAA  699

seq1  GACTTCATTGCAAACATTCGTAGGATGATACGTGTGCCAATATAAAAAAC  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTTCATTGCAAACATTCGTAGGATGATACGTGTGCCAATATAAAAAAC  749

seq1  TCTGCCAACTGCTCTCTGTAATCTTTTGAACATAAAGGGGGACTTAACTG  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCCAACTGCTCTCTGTAATCTTTTGAACATAAAGGGGGACTTAACTG  799

seq1  ATGAGCGAATGAAACCCATATAATGTAATAACTTGCCCACAGCCATGTGA  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGCGAATGAAACCCATATAATGTAATAACTTGCCCACAGCCATGTGA  849

seq1  CTGGTGAATGGAAGACTTAAAAACTCTCTGGCTGAAAATTCCCACTTTAT  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTGAATGGAAGACTTAAAAACTCTCTGGCTGAAAATTCCCACTTTAT  899

seq1  TTTTGCTACAACCATGACACCTCAAGGAACCACTGAAGCCCTCAAATCAA  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGCTACAACCATGACACCTCAAGGAACCACTGAAGCCCTCAAATCAA  949

seq1  CAATGACACAGGTCAGCCAGGCTTAGTGCAGGTGGTGAAAGGGGATTTGA  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATGACACAGGTCAGCCAGGCTTAGTGCAGGTGGTGAAAGGGGATTTGA  999

seq1  ATTTAATTATATTTAGCACTGCTAAGAACTTGGGAGGAATTC  1037
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTAATTATATTTAGCACTGCTAAGAACTTGGGAGGAATTC  1041


seq1: chr2_7022162_7023281
seq2: B6Ng01-192M14.g_68_1199

seq1  GAATTCACCCATCTTGAATCTACTTGTGCTATCGGAAGTCATTCTTCTTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACCCATCTTGAATCTACTTGTGCTATCGGAAGTCATTCTTCTTT  50

seq1  AAAAATAGATTTATTTTATTTTTAATTATGTATATGAAAGTGTACCTCTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAATAGATTTATTTTATTTTTAATTATGTATATGAAAGTGTACCTCTG  100

seq1  TGTGTGGAAGTAAGAAAAAGACTTTAACTTCCTGGTGTTGGAGTTACAGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGGAAGTAAGAAAAAGACTTTAACTTCCTGGTGTTGGAGTTACAGG  150

seq1  TGGTCACAAGCTACCTGGGTGCTAGAATCCAACTCTGGTTCTCTTAAAAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTCACAAGCTACCTGGGTGCTAGAATCCAACTCTGGTTCTCTTAAAAG  200

seq1  CAGCAAGAACTCTTAACCTCTGAACCAGCTGCATGAGGCAGGCTTTTGTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCAAGAACTCTTAACCTCTGAACCAGCTGCATGAGGCAGGCTTTTGTC  250

seq1  TTGTTTTTTGTAGAATTTAAACAGGAAACAAAGCCATAGACCTGTCAAGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTTTTTGTAGAATTTAAACAGGAAACAAAGCCATAGACCTGTCAAGT  300

seq1  AGGAATGATGTGTGATCCCAATGCCTTATAAGCAAAGAGCTCTGAGAAAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAATGATGTGTGATCCCAATGCCTTATAAGCAAAGAGCTCTGAGAAAA  350

seq1  AGGAGACATAGTCCTGGCAGGAAGCATCAAATGGTTTTTTAGTTCCTTAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGACATAGTCCTGGCAGGAAGCATCAAATGGTTTTTTAGTTCCTTAG  400

seq1  GGTTGAATGTATGATTACAGAGAGGTACGAGAAATCAGTTTCGAAACAGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTGAATGTATGATTACAGAGAGGTACGAGAAATCAGTTTCGAAACAGA  450

seq1  GGCAGGCGGAACCAGATCATGGAGGACTACAAGATCATGTTTGGCACTTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGGCGGAACCAGATCATGGAGGACTACAAGATCATGTTTGGCACTTT  500

seq1  GAGGGCTAGGGCCGATAACTAACCACTGAGGAATGTAAGCAGGGAGAAAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGGCTAGGGCCGATAACTAACCACTGAGGAATGTAAGCAGGGAGAAAA  550

seq1  CAAAGTTTAGCATGTTAGAAATAATTGTCCTAGTTGTAAGATGAGACACG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGTTTAGCATGTTAGAAATAATTGTCCTAGTTGTAAGATGAGACACG  600

seq1  GACAGCAAAGAAGTGGGTCTGGGGTAAGAAAACAAGTTAAAGAGTGTGCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGCAAAGAAGTGGGTCTGGGGTAAGAAAACAAGTTAAAGAGTGTGCC  650

seq1  ACTGTCACCTGTAAGGGGTGAGGGAAGATCTTGATGCAGTTGTGTCGGGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGTCACCTGTAAGGGGTGAGGGAAGATCTTGATGCAGTTGTGTCGGGA  700

seq1  AGAGAGGAAAGGCAGTTGAGCAAAAACGACTTGGGAAGGTAGAAAGATCC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAGGAAAGGCAGTTGAGCAAAAACGACTTGGGAAGGTAGAAAGATCC  750

seq1  TGAATAATGCAGAGTGAGCGAGAGAGGCAGGTGTGAGATCTAGGTTCCTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATAATGCAGAGTGAGCGAGAGAGGCAGGTGTGAGATCTAGGTTCCTA  800

seq1  GCTTGATCAACATACTATATACGGTACACTTCTTAAGTCAGGGAGCACAG  850
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  GCTTGATCAACATACTATATACGGTACACTTCTTAAGTCA-GGAGCACAG  849

seq1  GCTGAGAGGCCAGCTTTGGAGTGATGCTTATGGACTCAGTCTGGCAGTTG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGAGAGGCCAGCTTTGGAGTGATGCTTATGGACTCAGTCTGGCAGTTG  899

seq1  CTGAATTTGTAGTACCC-AGAG-ACATCTTTGTAAAGGTGGCAGATGGGA  948
      ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAATTTGTAGTACCCAAGAGAACATCTTTGTAAAGGTGGCAGATGGGA  949

seq1  CAGCCATATACACAGAG-CTTAGGATGGAGACCTGGGATGAACCTGCAGG  997
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCCATATACACAGAGCCTTAGGATGGAGACCTGGGATGAACCTGCAGG  999

seq1  ATGAGCATCATTAGCA-TATCATTAGC-ATATGGAAGTACTA-TAGTGTA  1044
      |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||||
seq2  ATGAGCATCATTAGCATTATCAATAGCAATATGGAAGTACTATTAGTGTA  1049

seq1  GAAGTAATTT--GCCTGGTCTT--GTTGCATGTGAAG-TAAAAAGAAATG  1089
      ||  ||||||   |||||||||   | |||||||| | ||||| ||||||
seq2  GAGTTAATTTTGCCCTGGTCTTTGCTGGCATGTGAGGTTAAAAGGAAATG  1099

seq1  AAGGTTAAAAACATTTTAC--TGCAGAGCACTT  1120
      || ||| ||||||||||||  |||||| |||||
seq2  AAAGTTTAAAACATTTTACCTTGCAGAACACTT  1132


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |