BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-193M07
Chromosome2 (Build37)
Map Location 132,995,539 - 132,996,689
singlet/doubletsinglet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100043470, EG329521, 5730494N06Rik, Pcna, Cds2, Prokr2, 1700026D11Rik, Prei4, LOC100043781, LOC383801, LOC668906, Chgb, 3300001M20Rik, Mcm8, Crls1, B430119L13Rik, 5830467P10Rik, LOC668908
Downstream geneLOC100043785, A430048G15Rik, Bmp2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-193M07.g
ACCGA016645
length1,143
definitionB6Ng01-193M07.g
singlet/doublet---singlet
BLAST hitno hit dataunique
sequence
gaattcaatgttttataatgtggtccaagaagctactggggacagccaat
tattagtctcaccaatgccaatttatatatttctatctctatctatctat
ctatctatctatctatctatctatctatctatctatctataagaacagaa
agcaatctggctactttgtggcattgctattgctccatgtctagtggttt
gcgaaatgactgctctctttatatatcttaattctgatgacctagcattg
cttcaactcttagcatgagcctgtttgcaaaacccccttttttccttgta
acaattatagtggctttgtaccaacaggcatcttgatgggaatgtcttaa
gtgcttcttgaatggagccttgagtaatgtccttgtgtgaatgcaggata
aacttcaggaatatggggagacttgggaaattagcagtaccactccatat
tggcagtagaaaaatataaaacttatttctgggccatgcacttgtgccaa
cagtagatgagagaaacagaaagatgatcagaagcctctaaggatgccca
gctctgaaatgacttgaaggcctgtccagagataattatgctcaaaacat
taattcttcattactgaaaattgtgaatatatggatgataatttactagt
ctacaataagaaacacagcggaagctgaatgtgatggtgcatgcctttaa
ttccagcactcaggaggcagaagcagacagatctttgagtttgtggccag
cctgtacagccagagctacccagagaaaccctgtccttagtaaacaaaca
aacaaacaaataaacaaaatacagctgtcccacgggatgatagcttactg
agaccatcaggattacctgtcactaagctttactcactgtattaaaccac
tctactgtaactggctgggtgacaaatttgaaggttattgcagggaacag
gagatcccaaacaattggagctagataagaaaaaaatattcatttacagc
attctgtccagtatgctgtcagtacaggcagctttggtgacagcatatag
aacagtctgttgtttcccattcatcactctattccaggagtgactggata
tggggacataatccatcagctccatgcctagaccttccttagc
quality valuesOpen.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_132995539_132996689
seq2: B6Ng01-193M07.g_67_1209

seq1  GAATTCAATGTTTTATAATGTGGTCCAAGAAGCTACTGGGGACAGCCAAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAATGTTTTATAATGTGGTCCAAGAAGCTACTGGGGACAGCCAAT  50

seq1  TATTAGTCTCACCAATGCCAATTTATATATTTCTATCTCTATCTATCTAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTAGTCTCACCAATGCCAATTTATATATTTCTATCTCTATCTATCTAT  100

seq1  CTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATAAGAACAGAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATAAGAACAGAA  150

seq1  AGCAATCTGGCTACTTTGTGGCATTGCTATTGCTCCATGTCTAGTGGTTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAATCTGGCTACTTTGTGGCATTGCTATTGCTCCATGTCTAGTGGTTT  200

seq1  GCGAAATGACTGCTCTCTTTATATATCTTAATTCTGATGACCTAGCATTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCGAAATGACTGCTCTCTTTATATATCTTAATTCTGATGACCTAGCATTG  250

seq1  CTTCAACTCTTAGCATGAGCCTGTTTGCAAAACCCCCTTTTTTCCTTGTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCAACTCTTAGCATGAGCCTGTTTGCAAAACCCCCTTTTTTCCTTGTA  300

seq1  ACAATTATAGTGGCTTTGTACCAACAGGCATCTTGATGGGAATGTCTTAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATTATAGTGGCTTTGTACCAACAGGCATCTTGATGGGAATGTCTTAA  350

seq1  GTGCTTCTTGAATGGAGCCTTGAGTAATGTCCTTGTGTGAATGCAGGATA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCTTCTTGAATGGAGCCTTGAGTAATGTCCTTGTGTGAATGCAGGATA  400

seq1  AACTTCAGGAATATGGGGAGACTTGGGAAATTAGCAGTACCACTCCATAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTCAGGAATATGGGGAGACTTGGGAAATTAGCAGTACCACTCCATAT  450

seq1  TGGCAGTAGAAAAATATAAAACTTATTTCTGGGCCATGCACTTGTGCCAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCAGTAGAAAAATATAAAACTTATTTCTGGGCCATGCACTTGTGCCAA  500

seq1  CAGTAGATGAGAGAAACAGAAAGATGATCAGAAGCCTCTAAGGATGCCCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTAGATGAGAGAAACAGAAAGATGATCAGAAGCCTCTAAGGATGCCCA  550

seq1  GCTCTGAAATGACTTGAAGGCCTGTCCAGAGATAATTATGCTCAAAACAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTGAAATGACTTGAAGGCCTGTCCAGAGATAATTATGCTCAAAACAT  600

seq1  TAATTCTTCATTACTGAAAATTGTGAATATATGGATGATAATTTACTAGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTCTTCATTACTGAAAATTGTGAATATATGGATGATAATTTACTAGT  650

seq1  CTACAATAAGAAACACAGCGGAAGCTGAATGTGATGGTGCATGCCTTTAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACAATAAGAAACACAGCGGAAGCTGAATGTGATGGTGCATGCCTTTAA  700

seq1  TTCCAGCACTCAGGAGGCAGAAGCAGACAGATCTTTGAGTTTGTGGCCAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCAGCACTCAGGAGGCAGAAGCAGACAGATCTTTGAGTTTGTGGCCAG  750

seq1  CCTGTACAGCCAGAGCTACCCAGAGAAACCCTGTCCTTAGTAAACAAACA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTACAGCCAGAGCTACCCAGAGAAACCCTGTCCTTAGTAAACAAACA  800

seq1  AACAAACAAATAAACAAAATACAGCTGTCCCACGGGATGATAGCTTACTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAACAAATAAACAAAATACAGCTGTCCCACGGGATGATAGCTTACTG  850

seq1  AGACCATCAGGATTACCTGTCACTAAGCTTTACTCACTGTATTAAACCAC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACCATCAGGATTACCTGTCACTAAGCTTTACTCACTGTATTAAACCAC  900

seq1  TCTACTGTAACTGGCTGGGTGACAAATTTGAAGGTTATTGCAGGGAACA-  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  TCTACTGTAACTGGCTGGGTGACAAATTTGAAGGTTATTGCAGGGAACAG  950

seq1  GAGAT-CCAAACAATTGGAGCTAGATAAGAAAAAAAAATATCATTACAAG  998
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   ||
seq2  GAGATCCCAAACAATTGGAGCTAGATAAGAAAAAAATAT-TCATTTACAG  999

seq1  CA-TCTGTCCAAGGTATGCTGTCAGTACAGGCAGCCTT-GTGACAGGCAT  1046
      || ||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||
seq2  CATTCTGTCCA--GTATGCTGTCAGTACAGGCAGCTTTGGTGACA-GCAT  1046

seq1  ATAGAACAGTCTGTTTGGTTTCACATTCCATCACTTCTATCCCAGGAGTG  1096
      |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||| |||||||||
seq2  ATAGAACAGTCTGTT--GTTTCCCATT-CATCAC-TCTATTCCAGGAGTG  1092

seq1  ACTGAGTATGGGGACTAGAATCACATCAGCTCCAATGGCTAGACCTTCCT  1146
      ||||  ||||||||| | |||| |||||||||| ||| ||||||||||||
seq2  ACTGGATATGGGGAC-ATAATC-CATCAGCTCC-ATGCCTAGACCTTCCT  1139

seq1  CTAGC  1151
       ||||
seq2  -TAGC  1143