BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-195F14
Chromosome2 (Build37)
Map Location 166,582,187 - 166,693,837
singlet/doubletdoublet
Overlap geneTrp53rk, Arfgef2
Upstream geneEya2, Prkcbp1, LOC546780, Ncoa3, Sulf2, LOC670775, Ppia-ps2_2197.1, BC067047
Downstream geneLOC670802, Cse1l, Stau1, LOC383774, Ddx27, AI481105, 1500012F01Rik, LOC668950, Kcnb1, Ptgis, LOC668951, B4galt5, Slc9a8, Spata2, Zfp313, Snai1, Ube2v1, AI840826, Cebpb
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-195F14.bB6Ng01-195F14.g
ACCGA017797GA017798
length972762
definitionB6Ng01-195F14.b B6Ng01-195F14.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(166,692,871 - 166,693,837)(166,582,187 - 166,582,946)
sequence
gaattctgatgctcaactgtgtgagcatggcttcaccacgggtcatagga
ggggaccatagggctccaccaagcatcagcagggtgtccagccactacat
ttaaaacagagtagcaatactatgtgcaggttggctgtgcatggtggtgt
atgcccttagtcccaacacttgggagagaaaggcaggaggatcttctgtg
agtttgaagtcaccctgatctacataatgagatccaggacaggcagagat
acatagagaaactgcctcaaagaccttaaaaaaagaaagagatggaaaga
agaagcagggaggggtcatgcatccgggctggcctagaatctgccccaca
gccactgatggccgattacaggatatagcaccatgtcctacttatgcagt
actggggattgaactcaggacttgtgaatggtaggcaactctatcaactg
agctatagtcccagccatggatatgagttagtatagtatttattttattt
ttatttattttatgtatgtgagtatactgttgttcttttcagacacatca
gaagagggcattggattccattacagatggttgtgaactaccatgtggtt
gctgggaattgaactcaggacctctgaagagcagtcaatgctcttaacca
tttagccatctctccagcccaccactggacttttaattcatcctacttga
ctcctatccaaatataagcacaacattgttcctttcaaagtgtccatgat
tttcacagggaaaaatgaatagatgtcaaacccccgaaatggggccaact
cttcccattacatcctttgtgaacttaagcacctgcttctctttcagctg
cagctaacgttggtcttttagatgctggcagtcacttattgaagtgatct
cctatgactgccatatccgagaccactgcagtcgggatcttgttcatgtt
gtaatatgatatattccacaat
gaattcaacagctgggtatgtacagtggttcacttctgtcttcccagagc
ttggaaggtataaagaaggtgacgttagtattctgctgtgcttgggacac
aacacatgcagcagccctccccttccacagacacccagctgagtggcagt
ctctgagtccccagcataataggctttcctgagccaggacctctcacctg
ggaagtgacttacatcaaagaggtattggtaaccacacaagcagctccta
cccgctactcccatcccacccccgcctcctgcccaggaatcagagagcct
ggcttcattttgtgctgtgattccctcacacacaccccaaaaggtacgag
aacagaccccatttctgccaaagcctccaattctgctctttagagtctgc
tgtgctgtctctggtgctggggcctgacaactccggagccccaccatccg
attgtctttctgtcagtttgtccacagtgttaacacttcttctaatgaac
tcctttctcctcaataatccatcttggaagaaaaatgagacggctaggca
gacagactccatctctcttcaggattgtagcatttagtggggctagagga
cttgcatatatgtatccataggagctaccaggaagttacagctacttttt
tgtggtttgactgggaacagagtgagttgttttatgacaccaccggggac
acattgttttcttcagatgatatagaccagtgaggcaggagtggaggagg
ggtgggattaag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_166692871_166693837
seq2: B6Ng01-195F14.b_43_1014 (reverse)

seq1  ATTGTGGAA-ATATCATACTACAACATGAACAGGAT-CCGGCTGCAGTGG  48
      ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||
seq2  ATTGTGGAATATATCATATTACAACATGAACAAGATCCCGACTGCAGTGG  50

seq1  TCTCGGATATGGCATGTCATTGGAGATCACTTCAATAAGGTGACTGCCAG  98
      |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  TCTCGGATATGGCA-GTCATAGGAGATCACTTCAATAA-GTGACTGCCAG  98

seq1  CATCT-AAAGACC-ACGTTAGCTGCAGCTGAAAGAG-AGCAGGTGC-TAA  144
      ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||
seq2  CATCTAAAAGACCAACGTTAGCTGCAGCTGAAAGAGAAGCAGGTGCTTAA  148

seq1  GTTCACAAAGGATGTAATGGGAAGAGTTGGCCCCATTTCGGGGGTTTGAC  194
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCACAAAGGATGTAATGGGAAGAGTTGGCCCCATTTCGGGGGTTTGAC  198

seq1  ATCTATTCATTTTTCCCTGTG-AAATCATGGACACTTTGAAAGGAACAAT  243
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTATTCATTTTTCCCTGTGAAAATCATGGACACTTTGAAAGGAACAAT  248

seq1  GTTGTGCTTATATTTGGATAGGAGTCAAGTAGGATGAATTAAAAGTCCAG  293
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGTGCTTATATTTGGATAGGAGTCAAGTAGGATGAATTAAAAGTCCAG  298

seq1  TGGTGGGCTGGAGAGATGGCTAAATGGTTAAGAGCATTGACTGCTCTTCA  343
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTGGGCTGGAGAGATGGCTAAATGGTTAAGAGCATTGACTGCTCTTCA  348

seq1  GAGGTCCTGAGTTCAATTCCCAGCAACCACATGGTAGTTCACAACCATCT  393
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGTCCTGAGTTCAATTCCCAGCAACCACATGGTAGTTCACAACCATCT  398

seq1  GTAATGGAATCCAATGCCCTCTTCTGATGTGTCTGAAAAGAACAACAGTA  443
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAATGGAATCCAATGCCCTCTTCTGATGTGTCTGAAAAGAACAACAGTA  448

seq1  TACTCACATACATAAAATAAATAAAAATAAAATAAATACTATACTAACTC  493
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTCACATACATAAAATAAATAAAAATAAAATAAATACTATACTAACTC  498

seq1  ATATCCATGGCTGGGACTATAGCTCAGTTGATAGAGTTGCCTACCATTCA  543
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATCCATGGCTGGGACTATAGCTCAGTTGATAGAGTTGCCTACCATTCA  548

seq1  CAAGTCCTGAGTTCAATCCCCAGTACTGCATAAGTAGGACATGGTGCTAT  593
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTCCTGAGTTCAATCCCCAGTACTGCATAAGTAGGACATGGTGCTAT  598

seq1  ATCCTGTAATCGGCCATCAGTGGCTGTGGGGCAGATTCTAGGCCAGCCCG  643
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTGTAATCGGCCATCAGTGGCTGTGGGGCAGATTCTAGGCCAGCCCG  648

seq1  GATGCATGACCCCTCCCTGCTTCTTCTTTCCATCTCTTTCTTTTTTTAAG  693
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGCATGACCCCTCCCTGCTTCTTCTTTCCATCTCTTTCTTTTTTTAAG  698

seq1  GTCTTTGAGGCAGTTTCTCTATGTATCTCTGCCTGTCCTGGATCTCATTA  743
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTTGAGGCAGTTTCTCTATGTATCTCTGCCTGTCCTGGATCTCATTA  748

seq1  TGTAGATCAGGGTGACTTCAAACTCACAGAAGATCCTCCTGCCTTTCTCT  793
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAGATCAGGGTGACTTCAAACTCACAGAAGATCCTCCTGCCTTTCTCT  798

seq1  CCCAAGTGTTGGGACTAAGGGCATACACCACCATGCACAGCCAACCTGCA  843
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAAGTGTTGGGACTAAGGGCATACACCACCATGCACAGCCAACCTGCA  848

seq1  CATAGTATTGCTACTCTGTTTTAAATGTAGTGGCTGGACACCCTGCTGAT  893
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAGTATTGCTACTCTGTTTTAAATGTAGTGGCTGGACACCCTGCTGAT  898

seq1  GCTTGGTGGAGCCCTATGGTCCCCTCCTATGACCCGTGGTGAAGCCATGC  943
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGGTGGAGCCCTATGGTCCCCTCCTATGACCCGTGGTGAAGCCATGC  948

seq1  TCACACAGTTGAGCATCAGAATTC  967
      ||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACACAGTTGAGCATCAGAATTC  972

seq1: chr2_166582187_166582946
seq2: B6Ng01-195F14.g_62_823

seq1  GAATTCAACAGCTGGGTATGTACAGTGGTTCACTTCTGTCTTCCCAGAGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAACAGCTGGGTATGTACAGTGGTTCACTTCTGTCTTCCCAGAGC  50

seq1  TTGGAAGGTATAAAGAAGGTGACGTTAGTATTCTGCTGTGCTTGGGACAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGAAGGTATAAAGAAGGTGACGTTAGTATTCTGCTGTGCTTGGGACAC  100

seq1  AACACATGCAGCAGCCCTCCCCTTCCACAGACACCCAGCTGAGTGGCAGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACATGCAGCAGCCCTCCCCTTCCACAGACACCCAGCTGAGTGGCAGT  150

seq1  CTCTGAGTCCCCAGCATAATAGGCTTTCCTGAGCCAGGACCTCTCACCTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGAGTCCCCAGCATAATAGGCTTTCCTGAGCCAGGACCTCTCACCTG  200

seq1  GGAAGTGACTTACATCAAAGAGGTATTGGTAACCACACAAGCAGCTCCTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGTGACTTACATCAAAGAGGTATTGGTAACCACACAAGCAGCTCCTA  250

seq1  CCCGCTACTCCCATCCCACCCCCGCCTCCTGCCCAGGAATCAGAGAGCCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCGCTACTCCCATCCCACCCCCGCCTCCTGCCCAGGAATCAGAGAGCCT  300

seq1  GGCTTCATTTTGTGCTGTGATTCCCTCACACACACCCCAAAAGGTACGAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTCATTTTGTGCTGTGATTCCCTCACACACACCCCAAAAGGTACGAG  350

seq1  AACAGACCCCATTTCTGCCAAAGCCTCCAATTCTGCTCTTTAGAGTCTGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGACCCCATTTCTGCCAAAGCCTCCAATTCTGCTCTTTAGAGTCTGC  400

seq1  TGTGCTGTCTCTGGTGCTGGGGCCTGACAACTCCGGAGCCCCACCATCCG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGCTGTCTCTGGTGCTGGGGCCTGACAACTCCGGAGCCCCACCATCCG  450

seq1  ATTGTCTTTCTGTCAGTTTGTCCACAGTGTTAACACTTCTTCTAATGAAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTCTTTCTGTCAGTTTGTCCACAGTGTTAACACTTCTTCTAATGAAC  500

seq1  TCCTTTCTCCTCAATAATCCATCTTGGAAGAAAAATGAGACGGCTAGGCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTTCTCCTCAATAATCCATCTTGGAAGAAAAATGAGACGGCTAGGCA  550

seq1  GACAGACTCCATCTCTCTTCAGGATTGTAGCATTTAGTGGGGCTAGAGGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGACTCCATCTCTCTTCAGGATTGTAGCATTTAGTGGGGCTAGAGGA  600

seq1  CTTGCATATATGTATCCATAGGAGCTACCAGGAAGTTACAGCTACTTTTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGCATATATGTATCCATAGGAGCTACCAGGAAGTTACAGCTACTTTTT  650

seq1  TGTGGTTTGACTGGGAACAGAGTGAGTTG-TTTATGACACCACCGGGGAC  699
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGTTTGACTGGGAACAGAGTGAGTTGTTTTATGACACCACCGGGGAC  700

seq1  ACATTG-TTTCTTCAGATGATATAGACCAGTGAGGCAGGAGTGGAGGAGG  748
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTGTTTTCTTCAGATGATATAGACCAGTGAGGCAGGAGTGGAGGAGG  750

seq1  GGTGGGATTAAG  760
      ||||||||||||
seq2  GGTGGGATTAAG  762