BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-195P10
Chromosome2 (Build37)
Map Location 171,607,047 - 171,749,161
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneDok5, LOC668955, LOC100043743
Downstream geneLOC100043744, Cbln4, Mc3r, 2010011I20Rik, Aurka, Cstf1, F730031O20Rik, 2410001C21Rik, A330041C17Rik, 1700029J11Rik, LOC629957, Tcfap2c, LOC100043750, Bmp7
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-195P10.bB6Ng01-195P10.g
ACCGA018239GA018240
length716777
definitionB6Ng01-195P10.b B6Ng01-195P10.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(171,607,047 - 171,607,762)(171,748,388 - 171,749,161)
sequence
gaattcactggcaaatagtgtagcctagcctttgtggagagttacaggtc
agtgagagacattgtctcaaaaatcaacgtggacatctcttgagaaacta
cactaaaggttaatctctgacccccatccatgtatatgcacccacacatg
cacaaatgtgcacacacaaacacacagaaaagaaatggaaaggtgttctc
actaatgagtaatcttaaaatatagatagcataagtgtccaagacaaact
tactgtagctattccctctggctacactgctgtgcattcttggtttctat
ggaagtgctacagaggtgagggtacttagaagacatgtgcgctcctgggc
tgctacacatgttgaatagcccaactctactcccctgagagagctctaca
gaaaagagcatttcccatagtaatagggtgctgcagtcagcttgctgatc
tgactgctctgtcccagggccctcttgagcatccttcttcatcagcctcc
cactgccttgaagcctctcatattgaatatcaatactgcagtggattttg
caagcactaacctgatttagagatgaaatggaaacagttccatatcagca
aaaaatgttaaaattacatatacccaggctccacgcaaggaaagggaagt
gaataaaggcttcgaattcccaggagggagctgagagcaaggcaggggga
cagggggtgggaagtt
gaattcatggggctttgaactcagattctcatgcttgcatagcaaacacg
ttacccagcaagccatctctctagcccctgcctttcaagtttccagggct
tgttcacgttcttcaactcctggccccttccagatcaaataatcacaact
ctgaacataagatggtgactttttgttgttgttgtttgttttgttttttg
gttctgctctacctcctcatccaggaccctgtgattacactggatttatc
catgtgacccagggtcatctctcttctcaaggtcacctttatcacaactc
caaacctccttggtgacttttgaagcaggacagacattttagggggactg
gcgaccccggaaggcctgtgtaaatcaacaaaccacggtcaacacaccat
ttcctctatgatttcattttacttgcttgtctgtcgattgcatcaaagac
cttagagtgctaggggcagatccttaaacacaatacactttaaaataaat
taataaggtctaaggagattgctcaatgggaaaaatggttaccacaacag
catggagtcttgagctcagatcccttgaaccgatggtgaatgaagcacgt
gtctgtgatctcagtgcatgtatgggaacacatatctgtaatctcagtgc
gtgtatggtaacatgtgtctgtaatttcagtgtgtgtgtggtagcatgtg
tctataatctcaatgcatgtatgatagcattttttttgttgttttttttg
tttttttgttttgttgttgttgttgtt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_171607047_171607762
seq2: B6Ng01-195P10.b_46_761

seq1  GAATTCACTGGCAAATAGTGTAGCCTAGCCTTTGTGGAGAGTTACAGGTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTGGCAAATAGTGTAGCCTAGCCTTTGTGGAGAGTTACAGGTC  50

seq1  AGTGAGAGACATTGTCTCAAAAATCAACGTGGACATCTCTTGAGAAACTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGAGAGACATTGTCTCAAAAATCAACGTGGACATCTCTTGAGAAACTA  100

seq1  CACTAAAGGTTAATCTCTGACCCCCATCCATGTATATGCACCCACACATG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTAAAGGTTAATCTCTGACCCCCATCCATGTATATGCACCCACACATG  150

seq1  CACAAATGTGCACACACAAACACACAGAAAAGAAATGGAAAGGTGTTCTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAAATGTGCACACACAAACACACAGAAAAGAAATGGAAAGGTGTTCTC  200

seq1  ACTAATGAGTAATCTTAAAATATAGATAGCATAAGTGTCCAAGACAAACT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAATGAGTAATCTTAAAATATAGATAGCATAAGTGTCCAAGACAAACT  250

seq1  TACTGTAGCTATTCCCTCTGGCTACACTGCTGTGCATTCTTGGTTTCTAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTGTAGCTATTCCCTCTGGCTACACTGCTGTGCATTCTTGGTTTCTAT  300

seq1  GGAAGTGCTACAGAGGTGAGGGTACTTAGAAGACATGTGCGCTCCTGGGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGTGCTACAGAGGTGAGGGTACTTAGAAGACATGTGCGCTCCTGGGC  350

seq1  TGCTACACATGTTGAATAGCCCAACTCTACTCCCCTGAGAGAGCTCTACA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTACACATGTTGAATAGCCCAACTCTACTCCCCTGAGAGAGCTCTACA  400

seq1  GAAAAGAGCATTTCCCATAGTAATAGGGTGCTGCAGTCAGCTTGCTGATC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAAGAGCATTTCCCATAGTAATAGGGTGCTGCAGTCAGCTTGCTGATC  450

seq1  TGACTGCTCTGTCCCAGGGCCCTCTTGAGCATCCTTCTTCATCAGCCTCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACTGCTCTGTCCCAGGGCCCTCTTGAGCATCCTTCTTCATCAGCCTCC  500

seq1  CACTGCCTTGAAGCCTCTCATATTGAATATCAATACTGCAGTGGATTTTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGCCTTGAAGCCTCTCATATTGAATATCAATACTGCAGTGGATTTTG  550

seq1  CAAGCACTAACCTGATTTAGAGATGAAATGGAAACAGTTCCATATCAGCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGCACTAACCTGATTTAGAGATGAAATGGAAACAGTTCCATATCAGCA  600

seq1  AAAAATGTTAAAATTACATATACCCAGGCTCCACGCAAGGAAAGGGAAGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAATGTTAAAATTACATATACCCAGGCTCCACGCAAGGAAAGGGAAGT  650

seq1  GAATAAAGGCTTCGAATTCCCAGGAGGGAGCTGAGAGCAAGGCAGGGGGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATAAAGGCTTCGAATTCCCAGGAGGGAGCTGAGAGCAAGGCAGGGGGA  700

seq1  CAGGGGGTGGGAAGTT  716
      ||||||||||||||||
seq2  CAGGGGGTGGGAAGTT  716

seq1: chr2_171748388_171749161
seq2: B6Ng01-195P10.g_63_839 (reverse)

seq1  AACAACAACAACAACAAAACAAAAAA--CAAAAAAACAAC-AAAAAAATG  47
      ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||
seq2  AACAACAACAACAACAAAACAAAAAAACAAAAAAAACAACAAAAAAAATG  50

seq1  CTATCATACATGCATTGAGATTATAGACACATGCTACCACACACACACTG  97
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATCATACATGCATTGAGATTATAGACACATGCTACCACACACACACTG  100

seq1  AAATTACAGACACATGTTACCATACACGCACTGAGATTACAGATATGTGT  147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTACAGACACATGTTACCATACACGCACTGAGATTACAGATATGTGT  150

seq1  TCCCATACATGCACTGAGATCACAGACACGTGCTTCATTCACCATCGGTT  197
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCATACATGCACTGAGATCACAGACACGTGCTTCATTCACCATCGGTT  200

seq1  CAAGGGATCTGAGCTCAAGACTCCATGCTGTTGTGGTAACCATTTTTCCC  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGGGATCTGAGCTCAAGACTCCATGCTGTTGTGGTAACCATTTTTCCC  250

seq1  ATTGAGCAATCTCCTTAGACCTTATTAATTTATTTTAAAGTGTATTGTGT  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGAGCAATCTCCTTAGACCTTATTAATTTATTTTAAAGTGTATTGTGT  300

seq1  TTAAGGATCTGCCCCTAGCACTCTAAGGTCTTTGATGCAATCGACAGACA  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGGATCTGCCCCTAGCACTCTAAGGTCTTTGATGCAATCGACAGACA  350

seq1  AGCAAGTAAAATGAAATCATAGAGGAAATGGTGTGTTGACCGTGGTTTGT  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAAGTAAAATGAAATCATAGAGGAAATGGTGTGTTGACCGTGGTTTGT  400

seq1  TGATTTACACAGGCCTTCCGGGGTCGCCAGTCCCCCTAAAATGTCTGTCC  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATTTACACAGGCCTTCCGGGGTCGCCAGTCCCCCTAAAATGTCTGTCC  450

seq1  TGCTTCAAAAGTCACCAAGGAGGTTTGGAGTTGTGATAAAGGTGACCTTG  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTCAAAAGTCACCAAGGAGGTTTGGAGTTGTGATAAAGGTGACCTTG  500

seq1  AGAAGAGAGATGACCCTGGGTCACATGGATAAATCCAGTGTAATCACAGG  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGAGAGATGACCCTGGGTCACATGGATAAATCCAGTGTAATCACAGG  550

seq1  GTCCTGGATGAGGAGGTAGAGCAGAACCAAAAAACAAAACAAACAACAAC  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCTGGATGAGGAGGTAGAGCAGAACCAAAAAACAAAACAAACAACAAC  600

seq1  AACAAAAAGTCACCATCTTATGTTCAGAGTTGTGATTATTTGATCTGGAA  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAAAAGTCACCATCTTATGTTCAGAGTTGTGATTATTTGATCTGGAA  650

seq1  GGGGCCAGGAGTTGAAGAACGTGAACAAGCCCTGGAAACTTGAAAGGCAG  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGCCAGGAGTTGAAGAACGTGAACAAGCCCTGGAAACTTGAAAGGCAG  700

seq1  GGGCTAGAGAGATGGCTTGCTGGGTAACGTGTTTGCTATGCAAGCATGAG  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCTAGAGAGATGGCTTGCTGGGTAACGTGTTTGCTATGCAAGCATGAG  750

seq1  AATCTGAGTTCAAAGCCCCATGAATTC  774
      |||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCTGAGTTCAAAGCCCCATGAATTC  777