BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-198H08
Chromosome2 (Build37)
Map Location 76,371,816 - 76,472,386
singlet/doubletdoublet
Overlap geneOsbpl6, Prkra
Upstream geneLOC100040324, LOC667828, Hnrpa3, Nfe2l2, E030042O20Rik, LOC623453, Agps, Ttc30b, Ttc30a2, Ttc30a1, Pde11a, Cyct, Drbp1
Downstream geneDfnb59, Fkbp7, Plekha3, Ttn, 2610301F02Rik, Sestd1, LOC623706, LOC667906, Zfp533
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-198H08.bB6Ng01-198H08.g
ACCGA020052GA020053
length973589
definitionB6Ng01-198H08.b B6Ng01-198H08.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(76,471,419 - 76,472,386)(76,371,816 - 76,372,402)
sequence
gaattcagctttcatacgtgtaaagcctgtatacatcaattttttgaaaa
gtctagtaggaaaaatatgaaggaatggaaaaatattcagtgtattcatg
ccaactaagatattctgtctgttttaagttggtggaagctacactgtttg
gtaactagctgctgttggtgagagtgtgataagcaagcactttggtcggt
gggtatgtaaattagttcagaaatcaacctgcaagcatttgctgcactga
ggtatgtaggagggggcaaggtgcatatgtatggaggtcaaagggtgtca
cttctctcctctttccatatgggtcccagggatcagactcaggaattaga
tttggcatcaaagagccctaacctgctgagccatctctctggctcaagtt
gtaacatttattaaaataaaagcatttctgttggcagtgtctctcctaga
catacataatactggaaataaaaaacaaagctgggtcctccggaaaagca
gccagtgtttttcaccccgacccatctctccatcccccgagcatctgtgt
tcacttaccctggtactgatgttggaactggcccatttcggagctgacgt
ttccctcctctctgccttttagacgaacgtggttggacattccctaggat
gcacttggcactccttgaggaattcccctggtgagaagatcaacctcctg
aaaaggagcctcctcagtctcccgaacacagactacatccagctgcttag
tgagattgccagcgagcaaggctttaacataacgtatttggatataggta
tgctttctcgtgtgccctgacatgtttcttctcaggacctcatgcatctc
atgctgaccttgcctttacctcccaagggctgggtgggattatgggagca
aaacaccaccatgttccacctctgtgggatgtttcatttaatttcagttt
tataacacctgtttagtgtgtgt
gaattcattgcttaccatagatgcttttcaattctgtctttctttttctt
tatttacttatttccagtaagtatataagggcgctctctctctctctctc
tctctctctcgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtggctttaaaacagt
attgggaatatcataactgtcattaaactgtcagcttttatatgattatg
ttataagccttagcaccataaatttaaacctaaagttaaatgaagatgga
agaataggaggaagggttgcaggccctgaaggggatgggaactccacagg
aagaccaacagagtcaactaacccggacccttgggctctcagagtctgaa
cccccaaccaaagaacatacacaggctagacctagtcctccctgcatata
tgtagcagatgtgcagctcggccttcatgtgggtcccaaacatctggaac
aggggctatcttaaaagctgttccctgtacatgggatatgttctactagc
tgggctgccttgtctggcctcagtgggagaggaagtgcctagcctcacag
agactttgaagtgccagggttgggtggggtgtgggtggt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_76471419_76472386
seq2: B6Ng01-198H08.b_47_1019 (reverse)

seq1  ACACACACTAAACAGGTG-TAT-AAACTG-AATTAAATG-AACAT-CCAC  45
      |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||| ||||
seq2  ACACACACTAAACAGGTGTTATAAAACTGAAATTAAATGAAACATCCCAC  50

seq1  AGAGGTGGAACATGGTGGTGTTTTGCTCCCATAATCCCACCCAGCCCTTG  95
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGTGGAACATGGTGGTGTTTTGCTCCCATAATCCCACCCAGCCCTTG  100

seq1  GGAGGTAAAGGCAAGGTCAGCATGAGATGCATGAGGTCCTGAGAAGAAAC  145
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGGTAAAGGCAAGGTCAGCATGAGATGCATGAGGTCCTGAGAAGAAAC  150

seq1  ATGTCAGGGCACACGAGAAAGCATACCTATATCCAAATACGTTATGTTAA  195
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTCAGGGCACACGAGAAAGCATACCTATATCCAAATACGTTATGTTAA  200

seq1  AGCCTTGCTCGCTGGCAATCTCACTAAGCAGCTGGATGTAGTCTGTGTTC  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTTGCTCGCTGGCAATCTCACTAAGCAGCTGGATGTAGTCTGTGTTC  250

seq1  GGGAGACTGAGGAGGCTCCTTTTCAGGAGGTTGATCTTCTCACCAGGGGA  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAGACTGAGGAGGCTCCTTTTCAGGAGGTTGATCTTCTCACCAGGGGA  300

seq1  ATTCCTCAAGGAGTGCCAAGTGCATCCTAGGGAATGTCCAACCACGTTCG  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCCTCAAGGAGTGCCAAGTGCATCCTAGGGAATGTCCAACCACGTTCG  350

seq1  TCTAAAAGGCAGAGAGGAGGGAAACGTCAGCTCCGAAATGGGCCAGTTCC  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAAAAGGCAGAGAGGAGGGAAACGTCAGCTCCGAAATGGGCCAGTTCC  400

seq1  AACATCAGTACCAGGGTAAGTGAACACAGATGCTCGGGGGATGGAGAGAT  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATCAGTACCAGGGTAAGTGAACACAGATGCTCGGGGGATGGAGAGAT  450

seq1  GGGTCGGGGTGAAAAACACTGGCTGCTTTTCCGGAGGACCCAGCTTTGTT  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTCGGGGTGAAAAACACTGGCTGCTTTTCCGGAGGACCCAGCTTTGTT  500

seq1  TTTTATTTCCAGTATTATGTATGTCTAGGAGAGACACTGCCAACAGAAAT  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTATTTCCAGTATTATGTATGTCTAGGAGAGACACTGCCAACAGAAAT  550

seq1  GCTTTTATTTTAATAAATGTTACAACTTGAGCCAGAGAGATGGCTCAGCA  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTTATTTTAATAAATGTTACAACTTGAGCCAGAGAGATGGCTCAGCA  600

seq1  GGTTAGGGCTCTTTGATGCCAAATCTAATTCCTGAGTCTGATCCCTGGGA  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTAGGGCTCTTTGATGCCAAATCTAATTCCTGAGTCTGATCCCTGGGA  650

seq1  CCCATATGGAAAGAGGAGAGAAGTGACACCCTTTGACCTCCATACATATG  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCATATGGAAAGAGGAGAGAAGTGACACCCTTTGACCTCCATACATATG  700

seq1  CACCTTGCCCCCTCCTACATACCTCAGTGCAGCAAATGCTTGCAGGTTGA  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCTTGCCCCCTCCTACATACCTCAGTGCAGCAAATGCTTGCAGGTTGA  750

seq1  TTTCTGAACTAATTTACATACCCACCGACCAAAGTGCTTGCTTATCACAC  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTGAACTAATTTACATACCCACCGACCAAAGTGCTTGCTTATCACAC  800

seq1  TCTCACCAACAGCAGCTAGTTACCAAACAGTGTAGCTTCCACCAACTTAA  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCACCAACAGCAGCTAGTTACCAAACAGTGTAGCTTCCACCAACTTAA  850

seq1  AACAGACAGAATATCTTAGTTGGCATGAATACACTGAATATTTTTCCATT  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGACAGAATATCTTAGTTGGCATGAATACACTGAATATTTTTCCATT  900

seq1  CCTTCATATTTTTCCTACTAGACTTTTCAAAAAATTGATGTATACAGGCT  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCATATTTTTCCTACTAGACTTTTCAAAAAATTGATGTATACAGGCT  950

seq1  TTACACGTATGAAAGCTGAATTC  968
      |||||||||||||||||||||||
seq2  TTACACGTATGAAAGCTGAATTC  973

seq1: chr2_76371816_76372402
seq2: B6Ng01-198H08.g_64_651

seq1  GAATTCATTGCTTACCATAGATGCTTTTCAATTCTGTCTTTCTTTTTCTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTGCTTACCATAGATGCTTTTCAATTCTGTCTTTCTTTTTCTT  50

seq1  TATTTACTTATTTCCAGTAAGTATATAAGGGCGCTCTCTCTCTCTCTCTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTACTTATTTCCAGTAAGTATATAAGGGCGCTCTCTCTCTCTCTCTC  100

seq1  TCTCTCTCTCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGCTTTAAAACAGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTCTCTCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGCTTTAAAACAGT  150

seq1  ATTGGGAATATCATAACTGTCATTAAACTGTCAGCTTTTATATGATTATG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGGGAATATCATAACTGTCATTAAACTGTCAGCTTTTATATGATTATG  200

seq1  TTATAAGCCTTAGCACCATAAATTTAAACCTAAAGTTAAATGAAGATGGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATAAGCCTTAGCACCATAAATTTAAACCTAAAGTTAAATGAAGATGGA  250

seq1  AGAATAGGAGGAAGGGTTGCAGGCCCTGAAGGGGATGGGAACTCCACAGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATAGGAGGAAGGGTTGCAGGCCCTGAAGGGGATGGGAACTCCACAGG  300

seq1  AAGACCAACAGAGTCAACTAACCCGGACCCTTGGGCTCTCAGAGTCTGAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGACCAACAGAGTCAACTAACCCGGACCCTTGGGCTCTCAGAGTCTGAA  350

seq1  CCCCCAACCAAAGAACATACACAGGCTAGACCTAGTCCTCCCTGCATATA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCCAACCAAAGAACATACACAGGCTAGACCTAGTCCTCCCTGCATATA  400

seq1  TGTAGCAGATGTGCAGCTCGGCCTTCATGTGGGTCCCAAACATCTGGAAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAGCAGATGTGCAGCTCGGCCTTCATGTGGGTCCCAAACATCTGGAAC  450

seq1  AGGGGCTATCTTAAAAGCTGTTCCCTGTACATGGGATATGTTCTACTAGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGGCTATCTTAAAAGCTGTTCCCTGTACATGGGATATGTTCTACTAGC  500

seq1  TGGGCTGCCTTGTCTGGCCTCAGTGGGAGAGGAAGTGCCTAGCCTCACAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGCTGCCTTGTCTGGCCTCAGTGGGAGAGGAAGTGCCTAGCCTCACAG  550

seq1  AGAC-TTGAAGTGCCAGGGTTGGGTGGGGTGTGGGTGG  587
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTTTGAAGTGCCAGGGTTGGGTGGGGTGTGGGTGG  588