BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-210N20
Chromosome2 (Build37)
Map Location 119,073,458 - 119,200,933
singlet/doubletdoublet
Overlap geneSpint1, Rhov, Vps18, LOC100043609, Dll4, Chac1, Inoc1
Upstream geneFsip1, Gpr176, 1700054M17Rik, Eif2ak4, Srp14, LOC668859, Bmf, LOC640461, Bub1b, Pak6, Gm1337, Plcb2, LOC100043272, A430105I19Rik, Disp2, D2Ertd750e, Ivd, Bahd1, Chst14, LOC677379, Ccdc32, Rpusd2, Casc5, Rad51, 1200015F23Rik, Gchfr, Dnajc17, OTTMUSG00000015762, LOC545640, Zfyve19, Ppp1r14d
Downstream geneLOC100043612, Exdl1, 1500003O03Rik, LOC100043307, Oip5, Nusap1, Ndufaf1, LOC625328, LOC100043622, Rtf1, Itpka, Ltk, Rpap1, Tyro3, 6330405D24Rik, LOC625403, Mga, Mapkbp1, Pla2g4b, Spnb5, Ehd4, Pla2g4e, LOC100043635, Pla2g4d, Pla2g4f, Vps39, Tmem87a
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-210N20.bB6Ng01-210N20.g
ACCGA029089GA029090
length975976
definitionB6Ng01-210N20.b B6Ng01-210N20.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(119,199,966 - 119,200,933)(119,073,458 - 119,074,424)
sequence
gaattctggtacagatacaagatagactgggccaccttgtgtcccttggc
cagacttgaagagtagtggcttctgtgaaatgaagaaggaagcagcagcc
aggccgtggtggcacatacctttaatcccagcactcaggaggcaagacag
tcagatccttgtgagttcaggaccagcctggtctacagaatgaattccag
gatagtcatctctatgaaaagatgatactatctcaacaaacaaacaaaaa
gcaactgaattcaggtgttttccagaagacaagacagcattagtgcctgg
tgagctacagctctcattgtgcaaccaggccttccatgtcagacatgtgc
cctctccagagcctgaagagtatgtcttccactctggatggggtaatata
ggtgggacttagtgtttgttgttctctctcaacaatgtagacatcttacc
aaaaggcaattaacaggaaaaataggcaacatcagagatgttggcaagga
gcaacagacagaggggttcccacccctttcctccagcccagacttagcct
aatacttcagactccaaggctgacagctggtgctgagggtcattgtggtt
ctctccatccctacaggaatctccgcaagcagtcctctgcagacatccat
tgtccgacctgctggccttgcagactttggaccttcaagcgcctcttctc
ccttaagttcccctctgaacaaaggaaataatattcctgggactcctaaa
agcctccacatgaccagcagcctagcctcagactccttgatccggaaaca
gggcaaaggcaccaacccctctggaggacggtaaccatggtaaccatctc
tgccctctagctcctttcaaccaaaccaggggctacagtcctgagccata
ggtgggtctttggatcggcttgcctagtgttggcattcttgccatcctat
ttgggaagagttgtaaggaccagtt
gaattcatcctgttgaaaagtgactccagtttgtcctctggcctccctgt
gcacatgccatgcacataagtaaacaatgtacccaggcgtatctttaaaa
tagagtctaagtagtagttctcttggagctgaagattgctatccctttgt
ctgtcttgcctttagtgaggcgacatctgccctcagcctggcgtaggggg
tacttagctatcgtcctgcggggcctgatgggtggcagcagggtggctct
ttgggctcacttgccccttcgtatgctcccttaccacagggtactgtgca
gagctgccagacactgggttttgcaaggagaacatcccacgctggtatta
caacccattcagtgaacgctgtgcccgattcacctatggtggttgctatg
ggaacaagaacaactttgaggaggaacagcagtgtcttgagtcctgccgt
ggcatctccagtgagcagagtggcagtagcggggtgaaggggaagatttg
gctaggcctgggctggtccctcctctataagtgacttgatagccatggag
agggtggcagggggctgtggtactggaacaggtgagtctaaggacttacc
tagtgccgactggtttctctatgtcactttgcagagaaggatgtgtttgg
tcttcggagggaaggctccattcccactgtaggtaagcctagtctgtcct
gtcaccagtgtggatatgtaggtgtcagttcaggaacgggcagcatgtga
ttgcttgtgaatgcccagcctttgctgagaggaccctgagattacccaga
gttgcactttgagtagtgaggcctgacataggttaaggagaggaactgtg
aattgcttgccaattgtcaggtatcagagcccctctgggctttcaagaaa
gcagcttattcttgaagggtctgagatgagtgttcatctgcttctacaca
tgacatcccggtcttttgtccattcc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_119199966_119200933
seq2: B6Ng01-210N20.b_45_1019 (reverse)

seq1  AACTGGTCCTTTCCACTCT--CCAAATAGGAT-GCAAG-ATGCC-ACACT  45
      ||||||||||| | |||||  ||||||||||| ||||| ||||| |||||
seq2  AACTGGTCCTTACAACTCTTCCCAAATAGGATGGCAAGAATGCCAACACT  50

seq1  AGGCAAGCC-ATCCAAAGA-CCACCTATGGCTCAGGACTGTAGCCCCTGG  93
      ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCAAGCCGATCCAAAGACCCACCTATGGCTCAGGACTGTAGCCCCTGG  100

seq1  TTTGGTTGAAGGAAGCTAGAGGGCAGAGATGGTTACCATGGTTACCGTCC  143
      |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGTTGAAAGGAGCTAGAGGGCAGAGATGGTTACCATGGTTACCGTCC  150

seq1  TCCAGAGGGGTTGGTGCCTTTGCCCTGTTTCCGGATCAAGGAGTCTGAGG  193
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGAGGGGTTGGTGCCTTTGCCCTGTTTCCGGATCAAGGAGTCTGAGG  200

seq1  CTAGGCTGCTGGTCATGTGGAGGCTTTTAGGAGTCCCAGGAATATTATTT  243
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGGCTGCTGGTCATGTGGAGGCTTTTAGGAGTCCCAGGAATATTATTT  250

seq1  CCTTTGTTCAGAGGGGAACTTAAGGGAGAAGAGGCGCTTGAAGGTCCAAA  293
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTGTTCAGAGGGGAACTTAAGGGAGAAGAGGCGCTTGAAGGTCCAAA  300

seq1  GTCTGCAAGGCCAGCAGGTCGGACAATGGATGTCTGCAGAGGACTGCTTG  343
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTGCAAGGCCAGCAGGTCGGACAATGGATGTCTGCAGAGGACTGCTTG  350

seq1  CGGAGATTCCTGTAGGGATGGAGAGAACCACAATGACCCTCAGCACCAGC  393
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGAGATTCCTGTAGGGATGGAGAGAACCACAATGACCCTCAGCACCAGC  400

seq1  TGTCAGCCTTGGAGTCTGAAGTATTAGGCTAAGTCTGGGCTGGAGGAAAG  443
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCAGCCTTGGAGTCTGAAGTATTAGGCTAAGTCTGGGCTGGAGGAAAG  450

seq1  GGGTGGGAACCCCTCTGTCTGTTGCTCCTTGCCAACATCTCTGATGTTGC  493
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTGGGAACCCCTCTGTCTGTTGCTCCTTGCCAACATCTCTGATGTTGC  500

seq1  CTATTTTTCCTGTTAATTGCCTTTTGGTAAGATGTCTACATTGTTGAGAG  543
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATTTTTCCTGTTAATTGCCTTTTGGTAAGATGTCTACATTGTTGAGAG  550

seq1  AGAACAACAAACACTAAGTCCCACCTATATTACCCCATCCAGAGTGGAAG  593
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAACAACAAACACTAAGTCCCACCTATATTACCCCATCCAGAGTGGAAG  600

seq1  ACATACTCTTCAGGCTCTGGAGAGGGCACATGTCTGACATGGAAGGCCTG  643
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATACTCTTCAGGCTCTGGAGAGGGCACATGTCTGACATGGAAGGCCTG  650

seq1  GTTGCACAATGAGAGCTGTAGCTCACCAGGCACTAATGCTGTCTTGTCTT  693
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGCACAATGAGAGCTGTAGCTCACCAGGCACTAATGCTGTCTTGTCTT  700

seq1  CTGGAAAACACCTGAATTCAGTTGCTTTTTGTTTGTTTGTTGAGATAGTA  743
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGAAAACACCTGAATTCAGTTGCTTTTTGTTTGTTTGTTGAGATAGTA  750

seq1  TCATCTTTTCATAGAGATGACTATCCTGGAATTCATTCTGTAGACCAGGC  793
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCTTTTCATAGAGATGACTATCCTGGAATTCATTCTGTAGACCAGGC  800

seq1  TGGTCCTGAACTCACAAGGATCTGACTGTCTTGCCTCCTGAGTGCTGGGA  843
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTCCTGAACTCACAAGGATCTGACTGTCTTGCCTCCTGAGTGCTGGGA  850

seq1  TTAAAGGTATGTGCCACCACGGCCTGGCTGCTGCTTCCTTCTTCATTTCA  893
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAGGTATGTGCCACCACGGCCTGGCTGCTGCTTCCTTCTTCATTTCA  900

seq1  CAGAAGCCACTACTCTTCAAGTCTGGCCAAGGGACACAAGGTGGCCCAGT  943
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAAGCCACTACTCTTCAAGTCTGGCCAAGGGACACAAGGTGGCCCAGT  950

seq1  CTATCTTGTATCTGTACCAGAATTC  968
      |||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATCTTGTATCTGTACCAGAATTC  975

seq1: chr2_119073458_119074424
seq2: B6Ng01-210N20.g_68_1043

seq1  GAATTCATCCTGTTGAAAAGTGACTCCAGTTTGTCCTCTGGCCTCCCTGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATCCTGTTGAAAAGTGACTCCAGTTTGTCCTCTGGCCTCCCTGT  50

seq1  GCACATGCCATGCACATAAGTAAACAATGTACCCAGGCGTATCTTTAAAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACATGCCATGCACATAAGTAAACAATGTACCCAGGCGTATCTTTAAAA  100

seq1  TAGAGTCTAAGTAGTAGTTCTCTTGGAGCTGAAGATTGCTATCCCTTTGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGTCTAAGTAGTAGTTCTCTTGGAGCTGAAGATTGCTATCCCTTTGT  150

seq1  CTGTCTTGCCTTTAGTGAGGCGACATCTGCCCTCAGCCTGGCGTAGGGGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCTTGCCTTTAGTGAGGCGACATCTGCCCTCAGCCTGGCGTAGGGGG  200

seq1  TACTTAGCTATCGTCCTGCGGGGCCTGATGGGTGGCAGCAGGGTGGCTCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTAGCTATCGTCCTGCGGGGCCTGATGGGTGGCAGCAGGGTGGCTCT  250

seq1  TTGGGCTCACTTGCCCCTTCGTATGCTCCCTTACCACAGGGTACTGTGCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGCTCACTTGCCCCTTCGTATGCTCCCTTACCACAGGGTACTGTGCA  300

seq1  GAGCTGCCAGACACTGGGTTTTGCAAGGAGAACATCCCACGCTGGTATTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTGCCAGACACTGGGTTTTGCAAGGAGAACATCCCACGCTGGTATTA  350

seq1  CAACCCATTCAGTGAACGCTGTGCCCGATTCACCTATGGTGGTTGCTATG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACCCATTCAGTGAACGCTGTGCCCGATTCACCTATGGTGGTTGCTATG  400

seq1  GGAACAAGAACAACTTTGAGGAGGAACAGCAGTGTCTTGAGTCCTGCCGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAACAAGAACAACTTTGAGGAGGAACAGCAGTGTCTTGAGTCCTGCCGT  450

seq1  GGCATCTCCAGTGAGCAGAGTGGCAGTAGCGGGGTGAAGGGGAAGATTTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCATCTCCAGTGAGCAGAGTGGCAGTAGCGGGGTGAAGGGGAAGATTTG  500

seq1  GCTAGGCCTGGGCTGGTCCCTCCTCTATAAGTGACTTGATAGCCATGGAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAGGCCTGGGCTGGTCCCTCCTCTATAAGTGACTTGATAGCCATGGAG  550

seq1  AGGGTGGCAGGGGGCTGTGGTACTGGAACAGGTGAGTCTAAGGACTTACC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTGGCAGGGGGCTGTGGTACTGGAACAGGTGAGTCTAAGGACTTACC  600

seq1  TAGTGCCGACTGGTTTCTCTATGTCACTTTGCAGAGAAGGATGTGTTTGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTGCCGACTGGTTTCTCTATGTCACTTTGCAGAGAAGGATGTGTTTGG  650

seq1  TCTTCGGAGGGAAGGCTCCATTCCCACTGTAGGTAAGCCTAGTCTGTCCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCGGAGGGAAGGCTCCATTCCCACTGTAGGTAAGCCTAGTCTGTCCT  700

seq1  GTCACCAGTGTGGATATGTAGGTGTCAGTTCAGGAACGGGCAGCATGTGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCACCAGTGTGGATATGTAGGTGTCAGTTCAGGAACGGGCAGCATGTGA  750

seq1  TTGCTTGTGAATGCCCAGCC-TTGCTGAGAGGACCCTGAGATTACCCAGA  799
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTTGTGAATGCCCAGCCTTTGCTGAGAGGACCCTGAGATTACCCAGA  800

seq1  G-TGCAC-TTGAGTAGTGAGGCCTGACATAGGTAAAGGAGAGGAACTGTG  847
      | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  GTTGCACTTTGAGTAGTGAGGCCTGACATAGGTTAAGGAGAGGAACTGTG  850

seq1  AATTGCTTGCCAATTGTCAGGTATCAGAGCCCCTCTGGGC-TTCTAG-AA  895
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||
seq2  AATTGCTTGCCAATTGTCAGGTATCAGAGCCCCTCTGGGCTTTCAAGAAA  900

seq1  GCAGC-TATTC-TGAA-GGTCTGAGATGAGTGTTCATCTGCTTCTACACA  942
      ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGCTTATTCTTGAAGGGTCTGAGATGAGTGTTCATCTGCTTCTACACA  950

seq1  TGACATCCCGGTC-TTTGTCCATTCC  967
      ||||||||||||| ||||||||||||
seq2  TGACATCCCGGTCTTTTGTCCATTCC  976