BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-213L14
Chromosome2 (Build37)
Map Location 174,175,789 - 174,337,603
singlet/doubletdoublet
Overlap geneTh1l, Ctsz, Rpl30-ps5, Tubb1, Atp5e, Slmo2
Upstream gene1700021F07Rik, 1700030G11Rik, LOC100043911, Rab22a, 1700010B08Rik, Vapb, LOC620189, LOC664880, LOC100043912, LOC664901, Stx16, Npepl1, Nespas, Gnas
Downstream geneLOC664967, LOC100043757, Edn3, LOC545487, LOC100043760, LOC100043761, LOC620790, LOC665001, LOC100043762, LOC100043763, LOC100043764, LOC100043914, LOC100043915, LOC668009
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-213L14.bB6Ng01-213L14.g
ACCGA031166GA031167
length1,210553
definitionB6Ng01-213L14.b B6Ng01-213L14.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(174,175,789 - 174,177,009)(174,337,045 - 174,337,603)
sequence
gaattcacccccataaattctcacaatcccttaaaactatccaaaaagta
tacaacccaagatgaaggcttgctgtgcaaagctagaagacactcccctc
aaacctttaaagtcttctgttgatgatttctgttaacataataaatatcc
aatccagtgacttgctatgcaaatagctagatgataggcctaccagttcc
cacatctatcaaaattatccaataaatacataatctaagatgcaaacagc
taggagacacacccacaacatcccacaattcctcacactgtctgctaagc
acacactacaagatgatggcttgctaaggaaatagccagatcagtctaca
aatttctgtaatccccccaaactagacaataaatacataatctaagatgg
aggctttctatacaaatacccagaagacccttaaatcccatagtcttaca
aagacctccattaattagcacagtaaacatccaacctaatgatttactat
gcagattgccaaatatgcccataaaatttatgatcctccactgacatgcc
ctattaacataatattcaatccaatgacttgccatacaaataaatgagac
aggcccacaaattcccacaatcactaaaaactatccaataaatatacaat
ctaagatggagatttgctatgcaaataattgccagccccaaattcctgaa
attctccaaagactcccaattaacattataaacattgagcacaaggctta
gatgcaaatagccagagcagcccacacatagcacaatacctcacagaccc
ccaaataaattcagaaacaaaactcattctcttgcattcacctgaaaata
taaaactatataaacagctaccaggaaagctaatgttgacccctcagatt
ctgtcccaaggtggcttccggtagtcctctccttcctagaaattctagag
cctcccctggacatacgcataggatggcctttgcatgcaccaaataggct
tcagtgtggaaacacactttcccatgcacaagggcagttatgtcaagtga
tgttcaataccgatcagtaggtgattgttggcctacagctgccattttat
cagagtatgaagccttagagaaacccttatgagacatgttctacgaatgg
ataattcgtctgcttgaccatgcctaccctgtgcctattgaagatgctgg
aagacggaaa
cacccccaactccaaacaaaagccaggcatggaggtgcgcgcctgtgttc
ccagcaatgggaaggcagagtctggtaggtccccggggtttgctgccgtg
accatgccaccccaaattcagtaagagtccctgtctcaaaaatgtaaggc
gagagcaactgaagaagcaggaaggccaaggccacttgctctgaggagag
gtctaagtgtgaaaataaaaccagatggggaagatatgcttcccccaggg
cagggttgtagtctctcaaccacacagacctgacagcattgggacccagg
cttgtctgttataggtgtgtccactggcctgagtcttttctgttcaaagg
gctggagatggcttctgagcagaaaacggcctcctcccagctggccaagc
tgggctagtaagacccatatttcttaagatttatttatttattcttattt
atatgagtacactgttgatgtcttcagtcacacaccagaagaatgtgtga
ctgcattgtaccccattacagatggttgtgagccatcatgtggtttctgg
gaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_174175789_174177009
seq2: B6Ng01-213L14.b_46_1255

seq1  GAATTCACCCCCATAAATTCTCACAATCCCTTAAAACTATCCAAAAAGTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACCCCCATAAATTCTCACAATCCCTTAAAACTATCCAAAAAGTA  50

seq1  TACAACCCAAGATGAAGGCTTGCTGTGCAAAGCTAGAAGACACTCCCCTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAACCCAAGATGAAGGCTTGCTGTGCAAAGCTAGAAGACACTCCCCTC  100

seq1  AAACCTTTAAAGTCTTCTGTTGATGATTTCTGTTAACATAATAAATATCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACCTTTAAAGTCTTCTGTTGATGATTTCTGTTAACATAATAAATATCC  150

seq1  AATCCAGTGACTTGCTATGCAAATAGCTAGATGATAGGCCTACCAGTTCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCCAGTGACTTGCTATGCAAATAGCTAGATGATAGGCCTACCAGTTCC  200

seq1  CACATCTATCAAAATTATCCAATAAATACATAATCTAAGATGCAAACAGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATCTATCAAAATTATCCAATAAATACATAATCTAAGATGCAAACAGC  250

seq1  TAGGAGACACACCCACAACATCCCACAATTCCTCACACTGTCTGCTAAGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGAGACACACCCACAACATCCCACAATTCCTCACACTGTCTGCTAAGC  300

seq1  ACACACTACAAGATGATGGCTTGCTAAGGAAATAGCCAGATCAGTCTACA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACTACAAGATGATGGCTTGCTAAGGAAATAGCCAGATCAGTCTACA  350

seq1  AATTTCTGTAATCCCCCCAAACTAGACAATAAATACATAATCTAAGATGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTCTGTAATCCCCCCAAACTAGACAATAAATACATAATCTAAGATGG  400

seq1  AGGCTTTCTATACAAATACCCAGAAGACCCTTAAATCCCATAGTCTTACA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTTTCTATACAAATACCCAGAAGACCCTTAAATCCCATAGTCTTACA  450

seq1  AAGACCTCCATTAATTAGCACAGTAAACATCCAACCTAATGATTTACTAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGACCTCCATTAATTAGCACAGTAAACATCCAACCTAATGATTTACTAT  500

seq1  GCAGATTGCCAAATATGCCCATAAAATTTATGATCCTCCACTGACATGCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGATTGCCAAATATGCCCATAAAATTTATGATCCTCCACTGACATGCC  550

seq1  CTATTAACATAATATTCAATCCAATGACTTGCCATACAAATAAATGAGAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATTAACATAATATTCAATCCAATGACTTGCCATACAAATAAATGAGAC  600

seq1  AGGCCCACAAATTCCCACAATCACTAAAAACTATCCAATAAATATACAAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCCCACAAATTCCCACAATCACTAAAAACTATCCAATAAATATACAAT  650

seq1  CTAAGATGGAGATTTGCTATGCAAATAATTGCCAGCCCCAAATTCCTGAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAGATGGAGATTTGCTATGCAAATAATTGCCAGCCCCAAATTCCTGAA  700

seq1  ATTCTCCAAAGACTCCCAATTAACATTATAAACATTGAGCACAAGGCTTA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCTCCAAAGACTCCCAATTAACATTATAAACATTGAGCACAAGGCTTA  750

seq1  GATGCAAATAGCCAGAGCAGCCCACACATAGCACAATACCTCACAGACCC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGCAAATAGCCAGAGCAGCCCACACATAGCACAATACCTCACAGACCC  800

seq1  CCAAATAAATTCAGAAACAAAACTCATTCTCTTGCATTCACCTGAAAATA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAATAAATTCAGAAACAAAACTCATTCTCTTGCATTCACCTGAAAATA  850

seq1  TAAAACTATATAAACAGCTACCAGGAAAGCTAAGGTTGACCCCTCAGATT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  TAAAACTATATAAACAGCTACCAGGAAAGCTAATGTTGACCCCTCAGATT  900

seq1  CTGTCCCAAGGTGGCTTCCGGTAGTCCTCTCCTTCCTAGAAATTCTAGAG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCCCAAGGTGGCTTCCGGTAGTCCTCTCCTTCCTAGAAATTCTAGAG  950

seq1  CCTCCCCTGGACAATACGCATAGGATGG-CTTTGCATGCACCAAATAGGC  999
      |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCCCTGGAC-ATACGCATAGGATGGCCTTTGCATGCACCAAATAGGC  999

seq1  TTCAGTGTGGAAACACACTTTCCCATGCCACAGGGCAGTTATGTCAAGTG  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||
seq2  TTCAGTGTGGAAACACACTTTCCCATGCACAAGGGCAGTTATGTCAAGTG  1049

seq1  AATGTCAATACCGATCAGTAGGTGATTGTTTGCCTACAGCTGCCATTTTA  1099
      |   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  ATGTTCAATACCGATCAGTAGGTGATTGTTGGCCTACAGCTGCCATTTTA  1099

seq1  TCCAAGAGTAATGAAGGCTTAGAGAAACCCTAGTGAAGACAGGTTTCTAC  1149
      ||  ||||| |||||| ||||||||||||||  || ||||| | ||||||
seq2  TC--AGAGT-ATGAAGCCTTAGAGAAACCCTTATG-AGACATG-TTCTAC  1144

seq1  CGATGGGTTAAAATTCTGCTGCTTGACCACTGCCCTACCCTGTTGCCTA-  1198
        ||||   | |||||  ||||||||||| || ||||||||| |||||| 
seq2  GAATGG---ATAATTCGTCTGCTTGACCA-TG-CCTACCCTG-TGCCTAT  1188

seq1  TGAAGATGCTGGAAGACAGGAAA  1221
      ||||||||||||||||| |||||
seq2  TGAAGATGCTGGAAGAC-GGAAA  1210

seq1: chr2_174337045_174337603
seq2: B6Ng01-213L14.g_67_625 (reverse)

seq1  TTCCCAGAAACCACATGATGGCTCACAACCATCTGTAATGGGGTACAATG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCAGAAACCACATGATGGCTCACAACCATCTGTAATGGGGTACAATG  50

seq1  CAGTCACACATTCTTCTGGTGTGTGACTGAAGACATCAACAGTGTACTCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCACACATTCTTCTGGTGTGTGACTGAAGACATCAACAGTGTACTCA  100

seq1  TATAAATAAGAATAAATAAATAAATCTTAAGAAATATGGGTCTTACTAGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAAATAAGAATAAATAAATAAATCTTAAGAAATATGGGTCTTACTAGC  150

seq1  CCAGCTTGGCCAGCTGGGAGGAGGCCGTTTTCTGCTCAGAAGCCATCTCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCTTGGCCAGCTGGGAGGAGGCCGTTTTCTGCTCAGAAGCCATCTCC  200

seq1  AGCCCTTTGAACAGAAAAGACTCAGGCCAGTGGACACACCTATAACAGAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCCTTTGAACAGAAAAGACTCAGGCCAGTGGACACACCTATAACAGAC  250

seq1  AAGCCTGGGTCCCAATGCTGTCAGGTCTGTGTGGTTGAGAGACTACAACC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCCTGGGTCCCAATGCTGTCAGGTCTGTGTGGTTGAGAGACTACAACC  300

seq1  CTGCCCTGGGGGAAGCATATCTTCCCCATCTGGTTTTATTTTCACACTTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCCTGGGGGAAGCATATCTTCCCCATCTGGTTTTATTTTCACACTTA  350

seq1  GACCTCTCCTCAGAGCAAGTGGCCTTGGCCTTCCTGCTTCTTCAGTTGCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCTCTCCTCAGAGCAAGTGGCCTTGGCCTTCCTGCTTCTTCAGTTGCT  400

seq1  CTCGCCTTACATTTTTGAGACAGGGACTCTTACTGAATTTGGGGTGGCAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCGCCTTACATTTTTGAGACAGGGACTCTTACTGAATTTGGGGTGGCAT  450

seq1  GGTCACGGCAGCAAACCCCGGGGACCTACCAGACTCTGCCTTCCCATTGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCACGGCAGCAAACCCCGGGGACCTACCAGACTCTGCCTTCCCATTGC  500

seq1  TGGGAACACAGGCGCGCACCTCCATGCCTGGCTTTTGTTTGGAGTTGGGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGAACACAGGCGCGCACCTCCATGCCTGGCTTTTGTTTGGAGTTGGGG  550

seq1  GTGGAATTC  559
      |||||||||
seq2  GTGGAATTC  559