BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-214O16
Chromosome2 (Build37)
Map Location 155,590,050 - 155,717,703
singlet/doubletdoublet
Overlap geneMmp24, Itgb4bp, 5530400B04Rik, 2410003P15Rik
Upstream geneLOC435692, Raly, Eif2s2, a, Ahcy, Itch, LOC100043877, LOC668931, Dynlrb1, Map1lc3a, Cdc91l1, Trp53inp2, Ncoa6, LOC668938, Ggtl3, Acss2, Gss, Myh7b, Trpc4ap, Edem2, Procr
Downstream geneGdf5, Cep250, Ergic3, Fer1l4, Spag4, Cpne1, Rbm12, Nfs1, 2010100O12Rik, Rbm39, Phf20, Scand1, LOC632394, LOC628707, LOC669792, 2900097C17Rik, LOC668941, Epb4.1l1, 0610011L14Rik, Dlgap4, Myl9, LOC433546, Tgif2, LOC100043677, 1110008F13Rik, Sla2, LOC100043880
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-214O16.bB6Ng01-214O16.g
ACCGA032035GA032036
length1,143811
definitionB6Ng01-214O16.b B6Ng01-214O16.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(155,590,050 - 155,591,209)(155,716,893 - 155,717,703)
sequence
gaattcaaatgacagaggacatttttggagagtgaacgtctctacaattt
tattgcgtggctacatgtttctaacgctcttctcagtatcctactgtgtt
ccccaaacagaaacctcactgggtatgaattaaccagctgtctccccgca
tcacaaggacgcaatctctccaggtgccgcgggccgagatatatttttca
gtataattttgggactggcttcaacagtgttagctgctccttccctcacc
ttccacgggacctgaagtctcatctggtggcattcattccatatactctg
gttaccccttctctatggggacggtccagctcctgctccactggggatga
tgtgaaaatacagttcagcacttcagtcaggatgtcaggttaactgtaat
catgggcgggtggtgagcaggcctctgaggggccaggacccagcaagggg
aaggcgtggtgggaggagaccagagtgtcgcagacaggacgctggacact
gccacagaagcgggcgatgttcagggaacagggaggaacttgtgacatga
acacactgggttgacctcacagcttggctccaggctggctctgggcatgg
gccagtctctttctcagctttaattttccactcttccagatcggtgcagt
ccctagtcacagcaggctcagtcctcaaacccacgccctcctaactgacg
ctaccgacactgtcttgtgcagcatgacagcctctttaaagctatgtatc
tcgattgattcaggggaaagagcattagactcccccccccccccccactc
ccacagaagtagagagacccagaaggttccttgatttgtctgaaagtcac
cttttgaggactgcggcctggaccccttccattccttatgttttgctgcc
ccctactggacacccaatgcaaacacagttctatagtggcttctgtttat
ttatgtaaaagtatcattgatacctatagtgtgctagagacattcagaca
tgtctgacccatggaaaagatgaatccacacaatgattactaatacaggt
atattgatcttctgtgagtacgagatctaagggtaacaaaatagggtgtg
gcttagtcagaagtcaagatcctggctagtgatccataggaaa
gaattccattacctcactgttgctgttgatgaattagcctcctatgacac
ttaagcatcaaaacactgcatcttttcaggtgagaggctgacaagaacaa
attaatttatttaaaaagtactattgaaccttacccagtgcatttctgct
gtgcagtgtgctctctatcccgtgcccagccttttcacggcctgtttcat
tatcatctccaagtctcattcatatcttaggtactgtctgggttcagagg
ttaaaagttagaatgaaattgccaatagatccatttgaggtcgatagtga
acctctggttggaaagctgcaggctctgggtctggagagatggccctgaa
gttaacagcagatacagcttagtcagaggatctgagtttggtccccagca
ttcaacttgggctgctcataccttcctctaactcagctccagggaaccca
gtgcctttgatctccaagggcattaagttcatatgcacatacccagacac
acacacacttaaaaataaatcttaaattaaaaaaagctggatgttcacca
gacatttattcttttatgaacagattttgaagttgtccattctattactt
aaatctttacattctttcctgctggacagtttttactttaagtaaatctt
tcgctttggcccaacctctggttttgattttaatatttgaatagataaat
ttagggcccttctcctgttttctccaagttagatattctttggtctcttt
ctctcattcatgtacatatatatatatatgtatgtatgtatgtatgtata
tatatatataa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_155590050_155591209
seq2: B6Ng01-214O16.b_51_1193

seq1  GAATTCAAATGACAGAGGACATTTTTGGAGAGTGAACGTCTCTACAATTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAATGACAGAGGACATTTTTGGAGAGTGAACGTCTCTACAATTT  50

seq1  TATTGCGTGGCTACATGTTTCTAACGCTCTTCTCAGTATCCTACTGTGTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTGCGTGGCTACATGTTTCTAACGCTCTTCTCAGTATCCTACTGTGTT  100

seq1  CCCCAAACAGAAACCTCACTGGGTATGAATTAACCAGCTGTCTCCCCGCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCAAACAGAAACCTCACTGGGTATGAATTAACCAGCTGTCTCCCCGCA  150

seq1  TCACAAGGACGCAATCTCTCCAGGTGCCGCGGGCCGAGATATATTTTTCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACAAGGACGCAATCTCTCCAGGTGCCGCGGGCCGAGATATATTTTTCA  200

seq1  GTATAATTTTGGGACTGGCTTCAACAGTGTTAGCTGCTCCTTCCCTCACC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATAATTTTGGGACTGGCTTCAACAGTGTTAGCTGCTCCTTCCCTCACC  250

seq1  TTCCACGGGACCTGAAGTCTCATCTGGTGGCATTCATTCCATATACTCTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCACGGGACCTGAAGTCTCATCTGGTGGCATTCATTCCATATACTCTG  300

seq1  GTTACCCCTTCTCTATGGGGACGGTCCAGCTCCTGCTCCACTGGGGATGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTACCCCTTCTCTATGGGGACGGTCCAGCTCCTGCTCCACTGGGGATGA  350

seq1  TGTGAAAATACAGTTCAGCACTTCAGTCAGGATGTCAGGTTAACTGTAAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAAAATACAGTTCAGCACTTCAGTCAGGATGTCAGGTTAACTGTAAT  400

seq1  CATGGGCGGGTGGTGAGCAGGCCTCTGAGGGGCCAGGACCCAGCAAGGGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGGCGGGTGGTGAGCAGGCCTCTGAGGGGCCAGGACCCAGCAAGGGG  450

seq1  AAGGCGTGGTGGGAGGAGACCAGAGTGTCGCAGACAGGACGCTGGACACT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCGTGGTGGGAGGAGACCAGAGTGTCGCAGACAGGACGCTGGACACT  500

seq1  GCCACAGAAGCGGGCGATGTTCAGGGAACAGGGAGGAACTTGTGACATGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCACAGAAGCGGGCGATGTTCAGGGAACAGGGAGGAACTTGTGACATGA  550

seq1  ACACACTGGGTTGACCTCACAGCTTGGCTCCAGGCTGGCTCTGGGCATGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACTGGGTTGACCTCACAGCTTGGCTCCAGGCTGGCTCTGGGCATGG  600

seq1  GCCAGTCTCTTTCTCAGCTTTAATTTTCCACTCTTCCAGATCGGTGCAGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAGTCTCTTTCTCAGCTTTAATTTTCCACTCTTCCAGATCGGTGCAGT  650

seq1  CCCTAGTCACAGCAGGCTCAGTCCTCAAACCCACGCCCTCCTAACTGACG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTAGTCACAGCAGGCTCAGTCCTCAAACCCACGCCCTCCTAACTGACG  700

seq1  CTACCGACACTGTCTTGTGCAGCATGACAGCCTCTTTAAAGCTATGTATC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACCGACACTGTCTTGTGCAGCATGACAGCCTCTTTAAAGCTATGTATC  750

seq1  TCGATTGATTCAGGGGAAAGAGCATTAGACT-CCCCCCCCCCCCCCACTC  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  TCGATTGATTCAGGGGAAAGAGCATTAGACTCCCCCCCCCCCCCCCACTC  800

seq1  CCACAGAAGTAGAGAGACCCAGAAGGTTCCTTGATTTGTCTGAAAGTCAC  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACAGAAGTAGAGAGACCCAGAAGGTTCCTTGATTTGTCTGAAAGTCAC  850

seq1  CTTTTGAGGACTGCGGCCTGGACCCCTTCCATTCCTTATGTTTTGCTGCC  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTGAGGACTGCGGCCTGGACCCCTTCCATTCCTTATGTTTTGCTGCC  900

seq1  CCCTACTGGACACCCAATTGCAAACAACAGTTCTATAGTGGGCTTCTGTT  949
      ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||
seq2  CCCTACTGGACACCCAA-TGCAAAC-ACAGTTCTATAGT-GGCTTCTGTT  947

seq1  TATTTATGTAAAAAGTATTCATTGATAACCTATAGTGTGCTAGAGACATT  999
      ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTATGT-AAAAGTA-TCATTGAT-ACCTATAGTGTGCTAGAGACATT  994

seq1  CAGACATGGTCTGAACCCATGGAAAAGATGAAACCACACAAATGATTACT  1049
      ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||
seq2  CAGACAT-GTCTG-ACCCATGGAAAAGATGAATCCACAC-AATGATTACT  1041

seq1  TAATTACAGTTATA-TGATC-TCTGTGAAGTACGAGATCT-AGGGT-ACA  1095
        | ||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||
seq2  --AATACAGGTATATTGATCTTCTGTG-AGTACGAGATCTAAGGGTAACA  1088

seq1  AAATAGGGTGTGTGGCCTAGTCCAGAAGTTCAGGGAATCTTGCATAAAGT  1145
      |||||||  ||||||| |||| |||||||  ||   ||| ||  |  |||
seq2  AAATAGG--GTGTGGCTTAGT-CAGAAGTCAAG---ATCCTGGCT--AGT  1130

seq1  GGAATCCATAGGAAA  1160
      |  ||||||||||||
seq2  G--ATCCATAGGAAA  1143

seq1: chr2_155716893_155717703
seq2: B6Ng01-214O16.g_66_876 (reverse)

seq1  TTATATATATATATACATACATACATACATACATATATATATATATGTAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATATATATATATACATACATACATACATACATATATATATATATGTAC  50

seq1  ATGAATGAGAGAAAGAGACCAAAGAATATCTAACTTGGAGAAAACAGGAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAATGAGAGAAAGAGACCAAAGAATATCTAACTTGGAGAAAACAGGAG  100

seq1  AAGGGCCCTAAATTTATCTATTCAAATATTAAAATCAAAACCAGAGGTTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGGCCCTAAATTTATCTATTCAAATATTAAAATCAAAACCAGAGGTTG  150

seq1  GGCCAAAGCGAAAGATTTACTTAAAGTAAAAACTGTCCAGCAGGAAAGAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCAAAGCGAAAGATTTACTTAAAGTAAAAACTGTCCAGCAGGAAAGAA  200

seq1  TGTAAAGATTTAAGTAATAGAATGGACAACTTCAAAATCTGTTCATAAAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAAAGATTTAAGTAATAGAATGGACAACTTCAAAATCTGTTCATAAAA  250

seq1  GAATAAATGTCTGGTGAACATCCAGCTTTTTTTAATTTAAGATTTATTTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATAAATGTCTGGTGAACATCCAGCTTTTTTTAATTTAAGATTTATTTT  300

seq1  TAAGTGTGTGTGTGTCTGGGTATGTGCATATGAACTTAATGCCCTTGGAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGTGTGTGTGTGTCTGGGTATGTGCATATGAACTTAATGCCCTTGGAG  350

seq1  ATCAAAGGCACTGGGTTCCCTGGAGCTGAGTTAGAGGAAGGTATGAGCAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAAAGGCACTGGGTTCCCTGGAGCTGAGTTAGAGGAAGGTATGAGCAG  400

seq1  CCCAAGTTGAATGCTGGGGACCAAACTCAGATCCTCTGACTAAGCTGTAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAAGTTGAATGCTGGGGACCAAACTCAGATCCTCTGACTAAGCTGTAT  450

seq1  CTGCTGTTAACTTCAGGGCCATCTCTCCAGACCCAGAGCCTGCAGCTTTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTGTTAACTTCAGGGCCATCTCTCCAGACCCAGAGCCTGCAGCTTTC  500

seq1  CAACCAGAGGTTCACTATCGACCTCAAATGGATCTATTGGCAATTTCATT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACCAGAGGTTCACTATCGACCTCAAATGGATCTATTGGCAATTTCATT  550

seq1  CTAACTTTTAACCTCTGAACCCAGACAGTACCTAAGATATGAATGAGACT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAACTTTTAACCTCTGAACCCAGACAGTACCTAAGATATGAATGAGACT  600

seq1  TGGAGATGATAATGAAACAGGCCGTGAAAAGGCTGGGCACGGGATAGAGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGATGATAATGAAACAGGCCGTGAAAAGGCTGGGCACGGGATAGAGA  650

seq1  GCACACTGCACAGCAGAAATGCACTGGGTAAGGTTCAATAGTACTTTTTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACACTGCACAGCAGAAATGCACTGGGTAAGGTTCAATAGTACTTTTTA  700

seq1  AATAAATTAATTTGTTCTTGTCAGCCTCTCACCTGAAAAGATGCAGTGTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAATTAATTTGTTCTTGTCAGCCTCTCACCTGAAAAGATGCAGTGTT  750

seq1  TTGATGCTTAAGTGTCATAGGAGGCTAATTCATCAACAGCAACAGTGAGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGATGCTTAAGTGTCATAGGAGGCTAATTCATCAACAGCAACAGTGAGG  800

seq1  TAATGGAATTC  811
      |||||||||||
seq2  TAATGGAATTC  811