BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-216A07
Chromosome2 (Build37)
Map Location 126,274,253 - 126,459,585
singlet/doubletdoublet
Overlap geneSlc27a2, Hdc, Gabpb1
Upstream geneFbn1, Cep152, Shc4, Eid1, 3110001I20Rik, Cops2, Galk2, Fgf7, Dtwd1, Atp8b4
Downstream geneUsp8, LOC100043714, Usp50, Trpm7, 2010106G01Rik, Ap4e1, Blvra, Ncaph, 1700041B20Rik, 1810024B03Rik, LOC100043408, Ascc3l1, Ciao1, Tmem127, ENSMUSG00000074822, Stard7, Dusp2, Astl, Adra2b, A530057A03Rik, Fahd2a, Kcnip3, Prom2, Zfp661, Mrps5, Mal
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-216A07.bB6Ng01-216A07.g
ACCGA032819GA032820
length1,1321,109
definitionB6Ng01-216A07.b B6Ng01-216A07.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(126,274,253 - 126,275,402)(126,458,466 - 126,459,585)
sequence
gaattcagtaataaattttaataatgcctctgttcttccttaaagagact
tcgctttgcaacagaatccattaaagaatggaaacaagccagcaaacaaa
cagttgatcaaaatgctggaagcaagtgactgtgtgccacctgccccaac
tgatagccaccaccttactaagccagcataatcctcaactatattctaaa
catttgtccttatacccacaatcagtgtagctctcatctcccatcaagga
aacgactctttgtaactgataaagaccaatatggaaaccacaaccaatca
aaatgcagagttgtagagcccagtcccaatagatacatctccaatacaac
attcccacctaaggctcaggaaatgagaggctgaagatgggccagaaaga
ttgcaacaaccagagaaacaggaagtcagatgtcagactgtgtctcctaa
aaatgtcatggaagctacaccgtgaagcctcaacaacatactgcctaaat
ggagacaatgccaacatgctaacatggaagggaggaatctcatgggcccc
aaccctagacatggggctataggcaactaagagatcctaagagaaagaga
aagtctttcccaaggaagagtttccctatcgattattcaacactagatag
tcccaaaatgatatacatacaagtaacattatatgcactgattaggttat
atttatatatttggtaaatacatatgtgtgtgcatatacatatatatatg
aatatatgatacacatatatgatatatattacatttaaattaaagaaaac
ttaagggctagtgagatggctcagtgggtaagagcactgactgctcttcc
aaaggtcctgagttcaaatcccagcaaccacgtggtgtctcacaaccact
cataatgagatctgatgccctcttctggtgtatctgagacagctacagtg
tacttaagtatataataaataaaaatcttttaaaaataagaaactaaaat
atttaataaaataataaattttaataaataaatttaattaaaattaaagt
cataagaaagggcataactttgaaaagagaataagtgggtacctgggagg
gattggagagggagaaccaggaagggggagat
gaattcttgaccagcagggctacatcgtgagactgtctgaaagagaaaga
ggtgaggttggaacagatgcaggttgactacgacagtgaacagatcgtcc
ctgcccagtgaatggcatttatcgggggatcgcctaaagcgtaggttgta
actgtgtcctgtttatagcagctagaacaacaacataaaattgagtatta
gaaacttacatattaaagtggtcaagttgttccacaccattgcttttaag
gcagaattagagattcgtatttgaaaataaagggagctgaagtcagccct
taccctgtggttctgttactaatgactcagctataacttagtataataat
tggtgtgtcttgttaataatcttgattattaactagggtttagttttctt
agaaatctttggtgttaaactcctttattttccttcagtgctggaacttg
aacaccaacaaaccatccctggagcagtaccttagtatcacaacatccta
actgattgcaggtgattccctgccctcttctggcctccttgggcactgta
cacttacaacggtgcacagacataaatacagataaaacatccaaatacat
acaataataataacatatcaaaaatgggccaacaagatggttcggcaggt
agagatgcttactgtgcaagcctgtcatcttgcatttgacccccaaatcc
atgtaagggtggaaagaaaaaagctgaccccagaaagctgtcctctgagc
acacacacacacacacacacgcacacacacacacacacacactaaatatt
aaaccagaatattaaaaccaatgtggctttactacaaaataatattcagc
ccataggataacatttatatttaaataaaattgttaggtgtcagcctgtt
gtactgttaatatgtgaagcactatttaaagaaactgtcttccgtgaagt
atatccagtcattgacatcagaaacaaaggtaaaaatgttagcattttca
tttttcagagttttacttgctttgaagtgagatggcaaaagttctctttc
gcattcttttgtttctgaagtcagaagtacaacaggaaagtttttatgtg
tcaccacat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_126274253_126275402
seq2: B6Ng01-216A07.b_46_1177

seq1  GAATTCAGTAATAAATTTTAATAATGCCTCTGTTCTTCCTTAAAGAGACT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGTAATAAATTTTAATAATGCCTCTGTTCTTCCTTAAAGAGACT  50

seq1  TCGCTTTGCAACAGAATCCATTAAAGAATGGAAACAAGCCAGCAAACAAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGCTTTGCAACAGAATCCATTAAAGAATGGAAACAAGCCAGCAAACAAA  100

seq1  CAGTTGATCAAAATGCTGGAAGCAAGTGACTGTGTGCCACCTGCCCCAAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTTGATCAAAATGCTGGAAGCAAGTGACTGTGTGCCACCTGCCCCAAC  150

seq1  TGATAGCCACCACCTTACTAAGCCAGCATAATCCTCAACTATATTCTAAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATAGCCACCACCTTACTAAGCCAGCATAATCCTCAACTATATTCTAAA  200

seq1  CATTTGTCCTTATACCCACAATCAGTGTAGCTCTCATCTCCCATCAAGGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTGTCCTTATACCCACAATCAGTGTAGCTCTCATCTCCCATCAAGGA  250

seq1  AACGACTCTTTGTAACTGATAAAGACCAATATGGAAACCACAACCAATCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACGACTCTTTGTAACTGATAAAGACCAATATGGAAACCACAACCAATCA  300

seq1  AAATGCAGAGTTGTAGAGCCCAGTCCCAATAGATACATCTCCAATACAAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGCAGAGTTGTAGAGCCCAGTCCCAATAGATACATCTCCAATACAAC  350

seq1  ATTCCCACCTAAGGCTCAGGAAATGAGAGGCTGAAGATGGGCCAGAAAGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCCCACCTAAGGCTCAGGAAATGAGAGGCTGAAGATGGGCCAGAAAGA  400

seq1  TTGCAACAACCAGAGAAACAGGAAGTCAGATGTCAGACTGTGTCTCCTAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCAACAACCAGAGAAACAGGAAGTCAGATGTCAGACTGTGTCTCCTAA  450

seq1  AAATGTCATGGAAGCTACACCGTGAAGCCTCAACAACATACTGCCTAAAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGTCATGGAAGCTACACCGTGAAGCCTCAACAACATACTGCCTAAAT  500

seq1  GGAGACAATGCCAACATGCTAACATGGAAGGGAGGAATCTCATGGGCCCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGACAATGCCAACATGCTAACATGGAAGGGAGGAATCTCATGGGCCCC  550

seq1  AACCCTAGACATGGGGCTATAGGCAACTAAGAGATCCTAAGAGAAAGAGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCCTAGACATGGGGCTATAGGCAACTAAGAGATCCTAAGAGAAAGAGA  600

seq1  AAGTCTTTCCCAAGGAAGAGTTTCCCTATCGATTATTCAACACTAGATAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTCTTTCCCAAGGAAGAGTTTCCCTATCGATTATTCAACACTAGATAG  650

seq1  TCCCAAAATGATATACATACAAGTAACATTATATGCACTGATTAGGTTAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCAAAATGATATACATACAAGTAACATTATATGCACTGATTAGGTTAT  700

seq1  ATTTATATATTTGGTAAATACATATGTGTGTGCATATACATATATATATG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTATATATTTGGTAAATACATATGTGTGTGCATATACATATATATATG  750

seq1  AATATATGATACACATATATGATATATATTACATTTAAATTAAAGAAAAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATATGATACACATATATGATATATATTACATTTAAATTAAAGAAAAC  800

seq1  TTAAGGGCTAGTGAGATGGCTCAGTGGGTAAGAGCACTGACTGCTCTTCC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGGGCTAGTGAGATGGCTCAGTGGGTAAGAGCACTGACTGCTCTTCC  850

seq1  AAAGGTCCTGAGTTCAAATCCCAGCAACCACGTGGTGTCTCACAACCACT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGTCCTGAGTTCAAATCCCAGCAACCACGTGGTGTCTCACAACCACT  900

seq1  CATAATGAGATCTGATGCCCTCTTCTGGTGTATCTGAAGACAGCTACAGT  950
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  CATAATGAGATCTGATGCCCTCTTCTGGTGTATCTG-AGACAGCTACAGT  949

seq1  GTACTTAAGTATAATAATAAATAAAAATCTTTTTAAAAAATAAAGAAAAC  1000
      |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||  
seq2  GTACTTAAGTAT-ATAATAAATAAAAATCTTTT--AAAAAT-AAGAAA--  993

seq1  TTAAAATATTTAATAAAATAAATAAAATTTTTAAATAAAATAAAATTTAA  1050
       |||||||||||||||||| ||||||   ||| ||||||   ||||||||
seq2  CTAAAATATTTAATAAAAT-AATAAA---TTTTAATAAA--TAAATTTAA  1037

seq1  TTAAAAATTAAAGTCAATTAAAGAAAAGGGGGCCATAACTTTG-AGAGAG  1099
      || |||||||||||||    ||||||    || |||||||||| | ||||
seq2  TT-AAAATTAAAGTCA---TAAGAAA----GGGCATAACTTTGAAAAGAG  1079

seq1  AATAGGTGGGTACCTGGGAGGGATTG--GAGGGAGAAACAGGAAGGGGGA  1147
      |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||
seq2  AATAAGTGGGTACCTGGGAGGGATTGGAGAGGGAGAACCAGGAAGGGGGA  1129

seq1  GAT  1150
      |||
seq2  GAT  1132

seq1: chr2_126458466_126459585
seq2: B6Ng01-216A07.g_68_1176 (reverse)

seq1  ATGTGGTGACCACATAAAAACCTTTCCTGTTGTACTTCTGACTTCTCAGA  50
      ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||
seq2  ATGTGGTGA-CACATAAAAA-CTTTCCTGTTGTACTTCTGACT--TCAGA  46

seq1  AACACAGGAATGCGGAAAGAGAAACTTTTTTGCCATCTCACTTTTCAAAG  100
      |||| | |||||| |||||||||    ||||||||||||||  |||||||
seq2  AACAAAAGAATGC-GAAAGAGAA---CTTTTGCCATCTCAC--TTCAAAG  90

seq1  CAAGTAAAACTCTGAAAAATGGAAAATGCTAACATTTTTACCTTTGTTTC  150
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTAAAACTCTGAAAAAT-GAAAATGCTAACATTTTTACCTTTGTTTC  139

seq1  TGATGTCAATGACTGGATATACTTCACGGAAGACAGTTTCTTTAAATAGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGTCAATGACTGGATATACTTCACGGAAGACAGTTTCTTTAAATAGT  189

seq1  GCTTCACATATTAACAGTACAACAGGCTGACACCTAACATTTTTATTTAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  GCTTCACATATTAACAGTACAACAGGCTGACACCTAACAATTTTATTTAA  239

seq1  ATATAAATGTTATCCTATGGGCTGAATATTATTTTGTAGTAAAGCCACAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATAAATGTTATCCTATGGGCTGAATATTATTTTGTAGTAAAGCCACAT  289

seq1  TGGTTTTAATATTCTGGTTTAATATTTAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTTTTAATATTCTGGTTTAATATTTAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGC  339

seq1  GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCTCAGAGGACAGCTTTCTGGGGTCAGCTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCTCAGAGGACAGCTTTCTGGGGTCAGCTT  389

seq1  TTTTCTTTCCACCCTTACATGGATTTGGGGGTCAAATGCAAGATGACAGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCTTTCCACCCTTACATGGATTTGGGGGTCAAATGCAAGATGACAGG  439

seq1  CTTGCACAGTAAGCATCTCTACCTGCCGAACCATCTTGTTGGCCCATTTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGCACAGTAAGCATCTCTACCTGCCGAACCATCTTGTTGGCCCATTTT  489

seq1  TGATATGTTATTATTATTGTATGTATTTGGATGTTTTATCTGTATTTATG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATATGTTATTATTATTGTATGTATTTGGATGTTTTATCTGTATTTATG  539

seq1  TCTGTGCACCGTTGTAAGTGTACAGTGCCCAAGGAGGCCAGAAGAGGGCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTGCACCGTTGTAAGTGTACAGTGCCCAAGGAGGCCAGAAGAGGGCA  589

seq1  GGGAATCACCTGCAATCAGTTAGGATGTTGTGATACTAAGGTACTGCTCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAATCACCTGCAATCAGTTAGGATGTTGTGATACTAAGGTACTGCTCC  639

seq1  AGGGATGGTTTGTTGGTGTTCAAGTTCCAGCACTGAAGGAAAATAAAGGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGATGGTTTGTTGGTGTTCAAGTTCCAGCACTGAAGGAAAATAAAGGA  689

seq1  GTTTAACACCAAAGATTTCTAAGAAAACTAAACCCTAGTTAATAATCAAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTAACACCAAAGATTTCTAAGAAAACTAAACCCTAGTTAATAATCAAG  739

seq1  ATTATTAACAAGACACACCAATTATTATACTAAGTTATAGCTGAGTCATT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATTAACAAGACACACCAATTATTATACTAAGTTATAGCTGAGTCATT  789

seq1  AGTAACAGAACCACAGGGTAAGGGCTGACTTCAGCTCCCTTTATTTTCAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAACAGAACCACAGGGTAAGGGCTGACTTCAGCTCCCTTTATTTTCAA  839

seq1  ATACGAATCTCTAATTCTGCCTTAAAAGCAATGGTGTGGAACAACTTGAC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACGAATCTCTAATTCTGCCTTAAAAGCAATGGTGTGGAACAACTTGAC  889

seq1  CACTTTAATATGTAAGTTTCTAATACTCAATTTTATGTTGTTGTTCTAGC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTTAATATGTAAGTTTCTAATACTCAATTTTATGTTGTTGTTCTAGC  939

seq1  TGCTATAAACAGGACACAGTTACAACCTACGCTTTAGGCGATCCCCCGAT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTATAAACAGGACACAGTTACAACCTACGCTTTAGGCGATCCCCCGAT  989

seq1  AAATGCCATTCACTGGGCAGGGACGATCTGTTCACTGTCGTAGTCAACCT  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGCCATTCACTGGGCAGGGACGATCTGTTCACTGTCGTAGTCAACCT  1039

seq1  GCATCTGTTCCAACCTCACCTCTTTCTCTTTCAGACAGTCTCACGATGTA  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATCTGTTCCAACCTCACCTCTTTCTCTTTCAGACAGTCTCACGATGTA  1089

seq1  GCCCTGCTGGTCAAGAATTC  1120
      ||||||||||||||||||||
seq2  GCCCTGCTGGTCAAGAATTC  1109