BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-218C06
Chromosome2 (Build37)
Map Location 169,013,880 - 169,015,043
singlet/doubletsinglet
Overlap genenone
Upstream geneAdnp, Dpm1, Mocs3, LOC100043908, Kcng1, LOC668952, Nfatc2, Atp9a, Sall4, Zfp64, LOC100043909
Downstream geneEG668954, Tshz2, LOC100043737, LOC100043910, Zfp217
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-218C06.bB6Ng01-218C06.g
ACCGA034349GA034350
length1,163500
definitionB6Ng01-218C06.b B6Ng01-218C06.g
singlet/doubletsinglet---
BLAST hituniqueno hit data
sequence
gaattctgtttatggatggccgtccccatcctctgagctcctgtgaatag
ggcaggcacttagtattcatgcacctttattctagtgcatccttaccatc
gtgcatccttgttgtattgcactgtcactatgcgtgcagccttactgtag
tgcactgtcactatgcatgcagccttactgtagtgcactctcactatgcg
tgcatccttgctgtagtgcatccttaccatcgtgcatccttgctgtggta
cactgtcactatgcgtgcatccttgctgtagtctctgtcactatgcgtgc
atccttgctgtagtgcaccgtcactatgcgtgcagccttactctaggtac
ccatttcattcctttctcctcacaagtcaaatctagtctttttcagcaca
ttcctttctcacttggttggaaacttccctgccattttctccactctcaa
gcccccccttcttctgtctgttcatctccttgtctgtcatctctctctgt
ctctctctgaagcagaaaggccacagaatttcatgaacatccctcaaaga
ggtttgccttgtactcactgtttgcagcctgtgacctctgttctgtgtga
ccgtctgaaggtcaagccatagcccttaagttctatgcttggcaaagcat
ttggccctgcctcggttggctcatgaatacacagcatacaatagtggcca
caaatggacctgcattaaaaactccttgatcgaacttgctcacactactt
acaaactcatactgatggacacacagcactgtcctttcatctttcttgtc
tgtaaaacatggatataactattttttatgtggacacttggaagcacagt
aggaacaaagtgtttaggagctagagaggaacctgtcaataaaaagcaga
ggacagccccctgtttaggagcctcacaaaatacaacgtgggactagaca
atgagatctgatactttcctctgacacattagtgtcttagtcagcctaat
gccgctccccgtgactaataattgagaaaatcaacttcagagagagacat
ggactggtgcgatggctcactgtttgcaaagatgagactggagttcaagt
cctcaccatcacgtaaagaagcaaggcatgttctggtgctgtagccccaa
tgcttgggagaga
cgaggaatctgatgaccctttttggcttttgtgggcgcccccccccagcc
acatgcacatatacatacacatataagtaaaaatgaatgatacaatttgc
aaaacacatgcaactcaagtagaacgaagaccaaagtggagacactttgc
cccttttttagaattgggaaccaaacacccatggaaggaattacagagac
aaagtttggagctgagacaaaaggatggaccatctagagactgccacacc
cagggatccatcccataatcagtctctaaactctgacaccattgcatacg
ccaggaagattttgctgaaaggaccctgatatagctctctcttgtgaggc
tatgccggtgcctggcaaacacagaagtggatgctcacagtcagctattg
gatggatcacagggcccccaatggaggagctagagaaagtacccaaggag
ttaaaggggtctgcaatcctataggtagaacaacaatatgaactaaccag

quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_169013880_169015043
seq2: B6Ng01-218C06.b_47_1209

seq1  GAATTCTGTTTATGGATGGCCGTCCCCATCCTCTGAGCTCCTGTGAATAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGTTTATGGATGGCCGTCCCCATCCTCTGAGCTCCTGTGAATAG  50

seq1  GGCAGGCACTTAGTATTCATGCACCTTTATTCTAGTGCATCCTTACCATC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGGCACTTAGTATTCATGCACCTTTATTCTAGTGCATCCTTACCATC  100

seq1  GTGCATCCTTGTTGTATTGCACTGTCACTATGCGTGCAGCCTTACTGTAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCATCCTTGTTGTATTGCACTGTCACTATGCGTGCAGCCTTACTGTAG  150

seq1  TGCACTGTCACTATGCATGCAGCCTTACTGTAGTGCACTCTCACTATGCG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCACTGTCACTATGCATGCAGCCTTACTGTAGTGCACTCTCACTATGCG  200

seq1  TGCATCCTTGCTGTAGTGCATCCTTACCATCGTGCATCCTTGCTGTGGTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATCCTTGCTGTAGTGCATCCTTACCATCGTGCATCCTTGCTGTGGTA  250

seq1  CACTGTCACTATGCGTGCATCCTTGCTGTAGTCTCTGTCACTATGCGTGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGTCACTATGCGTGCATCCTTGCTGTAGTCTCTGTCACTATGCGTGC  300

seq1  ATCCTTGCTGTAGTGCACCGTCACTATGCGTGCAGCCTTACTCTAGGTAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTTGCTGTAGTGCACCGTCACTATGCGTGCAGCCTTACTCTAGGTAC  350

seq1  CCATTTCATTCCTTTCTCCTCACAAGTCAAATCTAGTCTTTTTCAGCACA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATTTCATTCCTTTCTCCTCACAAGTCAAATCTAGTCTTTTTCAGCACA  400

seq1  TTCCTTTCTCACTTGGTTGGAAACTTCCCTGCCATTTTCTCCACTCTCAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTTTCTCACTTGGTTGGAAACTTCCCTGCCATTTTCTCCACTCTCAA  450

seq1  GCCCCCCCTTCTTCTGTCTGTTCATCTCCTTGTCTGTCATCTCTCTCTGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCCCCCTTCTTCTGTCTGTTCATCTCCTTGTCTGTCATCTCTCTCTGT  500

seq1  CTCTCTCTGAAGCAGAAAGGCCACAGAATTTCATGAACATCCCTCAAAGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCTCTGAAGCAGAAAGGCCACAGAATTTCATGAACATCCCTCAAAGA  550

seq1  GGTTTGCCTTGTACTCACTGTTTGCAGCCTGTGACCTCTGTTCTGTGTGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTGCCTTGTACTCACTGTTTGCAGCCTGTGACCTCTGTTCTGTGTGA  600

seq1  CCGTCTGAAGGTCAAGCCATAGCCCTTAAGTTCTATGCTTGGCAAAGCAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGTCTGAAGGTCAAGCCATAGCCCTTAAGTTCTATGCTTGGCAAAGCAT  650

seq1  TTGGCCCTGCCTCGGTTGGCTCATGAATACACAGCATACAATAGTGGCCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGCCCTGCCTCGGTTGGCTCATGAATACACAGCATACAATAGTGGCCA  700

seq1  CAAATGGACCTGCATTAAAAACTCCTTGATCGAACTTGCTCACACTACTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATGGACCTGCATTAAAAACTCCTTGATCGAACTTGCTCACACTACTT  750

seq1  ACAAACTCATACTGATGGACACACAGCACTGTCCTTTCATCTTTCTTGTC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAACTCATACTGATGGACACACAGCACTGTCCTTTCATCTTTCTTGTC  800

seq1  TGTAAAACATGGATATAACTATTTTTTATGTGGACACTTGGAAGCACAGT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAAAACATGGATATAACTATTTTTTATGTGGACACTTGGAAGCACAGT  850

seq1  AGGAACAAAGTGTTTAGGAGCTAGAGAGGAACCTGTCAATAAAAAGCAGA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAACAAAGTGTTTAGGAGCTAGAGAGGAACCTGTCAATAAAAAGCAGA  900

seq1  GGACAGCCCCCTGTTTAGGAGCCTCACAAAATACAACGTGGGACTAGACA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACAGCCCCCTGTTTAGGAGCCTCACAAAATACAACGTGGGACTAGACA  950

seq1  ATGAGATCTGATACTTTCCTCTGACACATTAGTGTCTTAGTCAGCCTAAT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGATCTGATACTTTCCTCTGACACATTAGTGTCTTAGTCAGCCTAAT  1000

seq1  GCCGCTCACCGTGACTAATAATTGAGAAAATCAACTTCAAGAGAGGAAGA  1050
      ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||
seq2  GCCGCTCCCCGTGACTAATAATTGAGAAAATCAACTTC-AGAGAG--AGA  1047

seq1  CATGGACTGGTGCGATGGCTCACTGTGTGCAAAGATGAGGACCTGAGTTC  1100
      |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||
seq2  CATGGACTGGTGCGATGGCTCACTGTTTGCAAAGATGA-GACTGGAGTTC  1096

seq1  AAGTCCTCACCATCCACGTAAAG-AGC-AGGCATG-TCTGTGCCTGTAGC  1147
      ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||   |||||||
seq2  AAGTCCTCACCAT-CACGTAAAGAAGCAAGGCATGTTCTGGTGCTGTAGC  1145

seq1  CCCAGTGC-TGGGAGAGA  1164
      |||| ||| |||||||||
seq2  CCCAATGCTTGGGAGAGA  1163