BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-220A10
Chromosome2 (Build37)
Map Location 156,449,804 - 156,600,122
singlet/doubletdoublet
Overlap geneDlgap4
Upstream geneMyh7b, Trpc4ap, Edem2, Procr, Mmp24, Itgb4bp, 5530400B04Rik, 2410003P15Rik, Gdf5, Cep250, Ergic3, Fer1l4, Spag4, Cpne1, Rbm12, Nfs1, 2010100O12Rik, Rbm39, Phf20, Scand1, LOC632394, LOC628707, LOC669792, 2900097C17Rik, LOC668941, Epb4.1l1, 0610011L14Rik
Downstream geneMyl9, LOC433546, Tgif2, LOC100043677, 1110008F13Rik, Sla2, LOC100043880, Ndrg3, LOC668943, Dsn1, 9830001H06Rik, Gm1332, Samhd1, Rbl1, LOC100043882, 4922505G16Rik, Rpn2, Ghrh, LOC100043678, Manbal, Src, Blcap, Nnat, Ctnnbl1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-220A10.bB6Ng01-220A10.g
ACCGA035691GA035692
length1,113811
definitionB6Ng01-220A10.b B6Ng01-220A10.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(156,449,804 - 156,450,915)(156,599,313 - 156,600,122)
sequence
gaattccagcaccaagagagatggtgaaaatgagccagggtcagaccaca
agattcctgacaaaatgcagcactcagtggagcggggtacagtgtacggt
ctctgtaagggcttcaggaagtaaaagtgaattcctggaaccgccagggt
cctaggaagcctaagaaccagaatgcctgtacctcacccacccccgcccc
caggcctctctggggccctactggagtccttctctccttggaaccctctt
tttttggctggcctggtttctacatggcccacattccgggtggcagcctt
gggcgggagggtaggctgtgagcctttgcttggagggtctctgtccggtc
cagccctgaccttgggccccgggggcacttccctctgccaggagatgcag
ctgtaagtggtgggcaggtggtccatctctctgggcacccagatctgatc
tgtcagaagtcccctactccatctgggcaccctgctttggggagcagatg
tatttaggccactgtacagattctgtgtcaactgtgcttgtcactgggga
ggcagggctgtgagcagccacacctggtacagtatcccggcccctcctga
gctgttagcgaggctgttgactgctcgctcggggtgtgtgtgtgtgtgtg
gaaccacaagtgatagcaatgtgaggtggactgggagggggtcctctgct
aagggggcatctccttctttctccctgtcccctgaggcatcatcaccctg
acccatcctatttaggtcacacacaaatccaactacttgcttcccgccag
cacgccacctctgagctcctggggccgatgtcccttctcagaactcaagc
acttctcttgcttgtgaaggttcatggctactgtagacccagtgctagaa
gacctgaagtgagggcatccaagctgatcatatcttgggttaggagaagg
cttggcagacttctaacccagcacacctgttgaaatacaggactacctac
aaggggcactgggatggtggcgatgacctgagccattattctaaaggcat
attctgtggctgtatcctggcagttagctggatgagtcacaccaggagac
attaggcctcctg
gaattcaattcttttaaaaattctatttattcgtgatgagagttggtgtg
gaagtcagtggactgttgcaggcctgcctggccacatacgaacagcaagt
gccattaccaaggagcctctctcacgccccagctcaggatttcagtgggg
cagctggagagagtgctgccattttcttagttgggcagcgtgggcgtagg
cggagcagatttgggagagatccattttgtcttggatttattcatttttg
gaaactttcttttgagataatttcaagcatactaaggttctaagactcgt
atagaaaactgacttccttgagagtctccagttgacctttggctcctcac
tcttccctgtgggaatatgcacattgcccaacacttgatagtgaataaga
ttttagtatatcctaaaaggaggactcttttacatattgatagtatatta
tcaaaatcataagatttaacattgatttaggcttttaatttatgacctat
attccaattgtgccagatgtctcagtaatatcctgtatggaaatttgttc
tggtccaggttgtgtgtgatgggtgaggtgcaggtgccatgggcatcatt
ctatggagcttgaagatgatgtcatgtagctggagggtgatgtcatggag
ctggagaatgttgccatggagctggaagatgttgtcatggagctggttgt
ggtggattgaatatgcttgctcagggagtagcactattaggaggtgtggt
cttgttggagtaggtgtggccttgttagaggaagtgtgtcactgtggggg
gtgggttttga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_156449804_156450915
seq2: B6Ng01-220A10.b_48_1160

seq1  GAATTCCAGCACCAAGAGAGATGGTGAAAATGAGCCAGGGTCAGACCACA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGCACCAAGAGAGATGGTGAAAATGAGCCAGGGTCAGACCACA  50

seq1  AGATTCCTGACAAAATGCAGCACTCAGTGGAGCGGGGTACAGTGTACGGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATTCCTGACAAAATGCAGCACTCAGTGGAGCGGGGTACAGTGTACGGT  100

seq1  CTCTGTAAGGGCTTCAGGAAGTAAAAGTGAATTCCTGGAACCGCCAGGGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGTAAGGGCTTCAGGAAGTAAAAGTGAATTCCTGGAACCGCCAGGGT  150

seq1  CCTAGGAAGCCTAAGAACCAGAATGCCTGTACCTCACCCACCCCCGCCCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAGGAAGCCTAAGAACCAGAATGCCTGTACCTCACCCACCCCCGCCCC  200

seq1  CAGGCCTCTCTGGGGCCCTACTGGAGTCCTTCTCTCCTTGGAACCCTCTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGCCTCTCTGGGGCCCTACTGGAGTCCTTCTCTCCTTGGAACCCTCTT  250

seq1  TTTTTGGCTGGCCTGGTTTCTACATGGCCCACATTCCGGGTGGCAGCCTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTGGCTGGCCTGGTTTCTACATGGCCCACATTCCGGGTGGCAGCCTT  300

seq1  GGGCGGGAGGGTAGGCTGTGAGCCTTTGCTTGGAGGGTCTCTGTCCGGTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCGGGAGGGTAGGCTGTGAGCCTTTGCTTGGAGGGTCTCTGTCCGGTC  350

seq1  CAGCCCTGACCTTGGGCCCCGGGGGCACTTCCCTCTGCCAGGAGATGCAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCCCTGACCTTGGGCCCCGGGGGCACTTCCCTCTGCCAGGAGATGCAG  400

seq1  CTGTAAGTGGTGGGCAGGTGGTCCATCTCTCTGGGCACCCAGATCTGATC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTAAGTGGTGGGCAGGTGGTCCATCTCTCTGGGCACCCAGATCTGATC  450

seq1  TGTCAGAAGTCCCCTACTCCATCTGGGCACCCTGCTTTGGGGAGCAGATG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCAGAAGTCCCCTACTCCATCTGGGCACCCTGCTTTGGGGAGCAGATG  500

seq1  TATTTAGGCCACTGTACAGATTCTGTGTCAACTGTGCTTGTCACTGGGGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTAGGCCACTGTACAGATTCTGTGTCAACTGTGCTTGTCACTGGGGA  550

seq1  GGCAGGGCTGTGAGCAGCCACACCTGGTACAGTATCCCGGCCCCTCCTGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGGGCTGTGAGCAGCCACACCTGGTACAGTATCCCGGCCCCTCCTGA  600

seq1  GCTGTTAGCGAGGCTGTTGACTGCTCGCTCGGGGTGTGTGTGTGTGTGTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTTAGCGAGGCTGTTGACTGCTCGCTCGGGGTGTGTGTGTGTGTGTG  650

seq1  GAACCACAAGTGATAGCAATGTGAGGTGGACTGGGAGGGGGTCCTCTGCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACCACAAGTGATAGCAATGTGAGGTGGACTGGGAGGGGGTCCTCTGCT  700

seq1  AAGGGGGCATCTCCTTCTTTCTCCCTGTCCCCTGAGGCATCATCACCCTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGGGGCATCTCCTTCTTTCTCCCTGTCCCCTGAGGCATCATCACCCTG  750

seq1  ACCCATCCTATTTAGGTCACACACAAATCCAACTACTTGCTTCCCGCCAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCATCCTATTTAGGTCACACACAAATCCAACTACTTGCTTCCCGCCAG  800

seq1  CACGCCACCTCTGAGCTCCTGGGGCCGATGTCCCTTCTCAGAACTCAAGC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACGCCACCTCTGAGCTCCTGGGGCCGATGTCCCTTCTCAGAACTCAAGC  850

seq1  AC-TCTCTTGCTTGTGAAGGTTCATGGCTACTGTAGACCCAGTGCTAG-A  898
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  ACTTCTCTTGCTTGTGAAGGTTCATGGCTACTGTAGACCCAGTGCTAGAA  900

seq1  GACCTGAAGGTGAAGGCATCCAAGCTGATCATATCTTGGGTTAGGAGAAG  948
      |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCTGAA-GTGAGGGCATCCAAGCTGATCATATCTTGGGTTAGGAGAAG  949

seq1  GC-TGGCAGACTTCTAACCCAGCACACCTGTTGAAATACAGGGACTACCT  997
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  GCTTGGCAGACTTCTAACCCAGCACACCTGTTGAAATACA-GGACTACCT  998

seq1  ACAAGGGGCACTGGGAT-GTGGCGATGACCTGAGCCAATATTCTAAAGCA  1046
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  
seq2  ACAAGGGGCACTGGGATGGTGGCGATGACCTGAGCCATTATTCTAAAGGC  1048

seq1  ATATTCTGT-GCTGAATCCTGGCAGTTAAGCTGAGTGAGTCAACACCAGG  1095
      ||||||||| |||| |||||||||||| |||||  |||||| ||||||||
seq2  ATATTCTGTGGCTGTATCCTGGCAGTT-AGCTGGATGAGTC-ACACCAGG  1096

seq1  AGACATTAGCGCTCCTG  1112
      |||||||||  ||||||
seq2  AGACATTAGGCCTCCTG  1113

seq1: chr2_156599313_156600122
seq2: B6Ng01-220A10.g_66_876 (reverse)

seq1  TCAAAACCCA-CCCCCACAGTGACACACTTCCTCTAACAAGGCCACACCT  49
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAAACCCACCCCCCACAGTGACACACTTCCTCTAACAAGGCCACACCT  50

seq1  ACTCCAACAAGACCACACCTCCTAATAGTGCTACTCCCTGAGCAAGCATA  99
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCCAACAAGACCACACCTCCTAATAGTGCTACTCCCTGAGCAAGCATA  100

seq1  TTCAATCCACCACAACCAGCTCCATGACAACATCTTCCAGCTCCATGGCA  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAATCCACCACAACCAGCTCCATGACAACATCTTCCAGCTCCATGGCA  150

seq1  ACATTCTCCAGCTCCATGACATCACCCTCCAGCTACATGACATCATCTTC  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTCTCCAGCTCCATGACATCACCCTCCAGCTACATGACATCATCTTC  200

seq1  AAGCTCCATAGAATGATGCCCATGGCACCTGCACCTCACCCATCACACAC  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTCCATAGAATGATGCCCATGGCACCTGCACCTCACCCATCACACAC  250

seq1  AACCTGGACCAGAACAAATTTCCATACAGGATATTACTGAGACATCTGGC  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCTGGACCAGAACAAATTTCCATACAGGATATTACTGAGACATCTGGC  300

seq1  ACAATTGGAATATAGGTCATAAATTAAAAGCCTAAATCAATGTTAAATCT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATTGGAATATAGGTCATAAATTAAAAGCCTAAATCAATGTTAAATCT  350

seq1  TATGATTTTGATAATATACTATCAATATGTAAAAGAGTCCTCCTTTTAGG  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGATTTTGATAATATACTATCAATATGTAAAAGAGTCCTCCTTTTAGG  400

seq1  ATATACTAAAATCTTATTCACTATCAAGTGTTGGGCAATGTGCATATTCC  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATACTAAAATCTTATTCACTATCAAGTGTTGGGCAATGTGCATATTCC  450

seq1  CACAGGGAAGAGTGAGGAGCCAAAGGTCAACTGGAGACTCTCAAGGAAGT  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGGGAAGAGTGAGGAGCCAAAGGTCAACTGGAGACTCTCAAGGAAGT  500

seq1  CAGTTTTCTATACGAGTCTTAGAACCTTAGTATGCTTGAAATTATCTCAA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTTTTCTATACGAGTCTTAGAACCTTAGTATGCTTGAAATTATCTCAA  550

seq1  AAGAAAGTTTCCAAAAATGAATAAATCCAAGACAAAATGGATCTCTCCCA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAAGTTTCCAAAAATGAATAAATCCAAGACAAAATGGATCTCTCCCA  600

seq1  AATCTGCTCCGCCTACGCCCACGCTGCCCAACTAAGAAAATGGCAGCACT  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCTGCTCCGCCTACGCCCACGCTGCCCAACTAAGAAAATGGCAGCACT  650

seq1  CTCTCCAGCTGCCCCACTGAAATCCTGAGCTGGGGCGTGAGAGAGGCTCC  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCCAGCTGCCCCACTGAAATCCTGAGCTGGGGCGTGAGAGAGGCTCC  700

seq1  TTGGTAATGGCACTTGCTGTTCGTATGTGGCCAGGCAGGCCTGCAACAGT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGTAATGGCACTTGCTGTTCGTATGTGGCCAGGCAGGCCTGCAACAGT  750

seq1  CCACTGACTTCCACACCAACTCTCATCACGAATAAATAGAATTTTTAAAA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTGACTTCCACACCAACTCTCATCACGAATAAATAGAATTTTTAAAA  800

seq1  GAATTGAATTC  810
      |||||||||||
seq2  GAATTGAATTC  811