BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-221P08
Chromosome2 (Build37)
Map Location 135,518,119 - 135,657,490
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100043788, Plcb4
Upstream geneLOC627897, LOC433478, Plcb1, LOC100043487, LOC100043786
Downstream gene6330527O06Rik, Pak7, LOC668910, LOC100043492, BC034902, Ankrd5, Snap25, LOC668911
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-221P08.bB6Ng01-221P08.g
ACCGA037109GA037110
length761778
definitionB6Ng01-221P08.b B6Ng01-221P08.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(135,656,735 - 135,657,490)(135,518,119 - 135,518,890)
sequence
gaattcaatcaaatgggtaagaggctccgatgagaagcaaggtagaagca
acatttcagctttctgccttacagagcatctcacacggcagggaaagggg
aagtgcaccttcaaagcaccaaggcagatagataatgcagaagatgcatg
agccaccctcacatgaaaaacgacaacagtggcagacaactgttctagaa
caattttaccccagagatcctaagtgccatcttaaagatctaacagccag
gaccaaatgccattaaaggtacctgactggcatgacttaaagtgagttac
ttggaagatgggtctgggagaggagttggtgtacttgctggaaggggact
aaggtcatcaccagatcaccgtgagagtctcaacatgacacatagtatgt
ctgctcctggtaggtattgaaaggcaaagggaatggtgatccaggaccta
tagctacgctgcttcatggctccatctgaccctgttaagctagagcaact
tggtgtaaccacgcgttacttgacttatgagtttccgactacacgctatt
gaaaccgcatgtaagaagcctcgggctggcagtagaacaatctcttcagc
atcttttgaacttacgtgctaattaataaagtgactgtttaagtaaactc
ttgtcacgacgcctaaaacgtttaactttttctctaaaaagttaaaaagt
acctgatttaaaaagttttttttctgcattggcataacagcacagagaaa
cgttctgtcag

gaattcagctctgtgattctcagttccctccttcacgttctttctggatc
agtaccatagggcagagcaggacaggactgattgcccagggttcctactg
accttagtggtgtccttgatggggagtctgccatgctttctagtcatact
tcaggcccctcgctcccttgcccagggcaatgaaagtgtacaaggctctg
actcagtccttcccttgagtctttctgaagagcgagtgtgtatgggagac
ggggtggtttgaggctgcagtctgagggctcccattgacctcagccaagc
ctcacatctggtttagcttctttagctcctgggcctccctgccaattagg
catccagtccttgatcttccatctgcctatagcttcagcactgctgtgtg
tgagggaagcacttcctggggatttccaccttgctcagctgcttgtggct
ggcagctcctccaacccccagctgctgcttgcttccccgtggaaatctca
cctggcttgctggcttcctttacagctaccgattcttgcaagaacaggcg
tgactgtgcgttctgctggctgcttcctgtcagtgagtacactgatgata
ggtttcccatctgctatctcgctgggaagtcccctccttttcctttaaat
catgttaggatgcagcgttgggtcttgggcatgttgtctttagagaggtg
ccgagttttgattttttttggactcagttggcttttgaaatagaccttat
tcagcttgtacacagcctttccttcagt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_135656735_135657490
seq2: B6Ng01-221P08.b_47_807 (reverse)

seq1  CTGACAGAACGTTTCTCTGTGCTGTTGTGCCACTGCAG--AAAATACTTT  48
      |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||| |||||
seq2  CTGACAGAACGTTTCTCTGTGCTGTTATGCCAATGCAGAAAAAAAACTTT  50

seq1  TTAAATCAGGTACTTTTTAAC-TTTTAGAG-AAAAGTTAAACGTTTT-GG  95
      ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||
seq2  TTAAATCAGGTACTTTTTAACTTTTTAGAGAAAAAGTTAAACGTTTTAGG  100

seq1  CGTCGTGACAAGAGTTTACTTAAACAGTCACTTTATTAATTAGCACGTAA  145
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTCGTGACAAGAGTTTACTTAAACAGTCACTTTATTAATTAGCACGTAA  150

seq1  GTTCAAAAGATGCTGAAGAGATTGTTCTACTGCCAGCCCGAGGCTTCTTA  195
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCAAAAGATGCTGAAGAGATTGTTCTACTGCCAGCCCGAGGCTTCTTA  200

seq1  CATGCGGTTTCAATAGCGTGTAGTCGGAAACTCATAAGTCAAGTAACGCG  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCGGTTTCAATAGCGTGTAGTCGGAAACTCATAAGTCAAGTAACGCG  250

seq1  TGGTTACACCAAGTTGCTCTAGCTTAACAGGGTCAGATGGAGCCATGAAG  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTTACACCAAGTTGCTCTAGCTTAACAGGGTCAGATGGAGCCATGAAG  300

seq1  CAGCGTAGCTATAGGTCCTGGATCACCATTCCCTTTGCCTTTCAATACCT  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCGTAGCTATAGGTCCTGGATCACCATTCCCTTTGCCTTTCAATACCT  350

seq1  ACCAGGAGCAGACATACTATGTGTCATGTTGAGACTCTCACGGTGATCTG  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAGGAGCAGACATACTATGTGTCATGTTGAGACTCTCACGGTGATCTG  400

seq1  GTGATGACCTTAGTCCCCTTCCAGCAAGTACACCAACTCCTCTCCCAGAC  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGATGACCTTAGTCCCCTTCCAGCAAGTACACCAACTCCTCTCCCAGAC  450

seq1  CCATCTTCCAAGTAACTCACTTTAAGTCATGCCAGTCAGGTACCTTTAAT  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATCTTCCAAGTAACTCACTTTAAGTCATGCCAGTCAGGTACCTTTAAT  500

seq1  GGCATTTGGTCCTGGCTGTTAGATCTTTAAGATGGCACTTAGGATCTCTG  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCATTTGGTCCTGGCTGTTAGATCTTTAAGATGGCACTTAGGATCTCTG  550

seq1  GGGTAAAATTGTTCTAGAACAGTTGTCTGCCACTGTTGTCGTTTTTCATG  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTAAAATTGTTCTAGAACAGTTGTCTGCCACTGTTGTCGTTTTTCATG  600

seq1  TGAGGGTGGCTCATGCATCTTCTGCATTATCTATCTGCCTTGGTGCTTTG  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGGTGGCTCATGCATCTTCTGCATTATCTATCTGCCTTGGTGCTTTG  650

seq1  AAGGTGCACTTCCCCTTTCCCTGCCGTGTGAGATGCTCTGTAAGGCAGAA  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGTGCACTTCCCCTTTCCCTGCCGTGTGAGATGCTCTGTAAGGCAGAA  700

seq1  AGCTGAAATGTTGCTTCTACCTTGCTTCTCATCGGAGCCTCTTACCCATT  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGAAATGTTGCTTCTACCTTGCTTCTCATCGGAGCCTCTTACCCATT  750

seq1  TGATTGAATTC  756
      |||||||||||
seq2  TGATTGAATTC  761


seq1: chr2_135518119_135518890
seq2: B6Ng01-221P08.g_70_846

seq1  GAATTCAGCTCTGTGATTCTCAGTTCCCTCCTTCACGTTCTTTCTGGATC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGCTCTGTGATTCTCAGTTCCCTCCTTCACGTTCTTTCTGGATC  50

seq1  AGTACCATAGGGCAGAGCAGGACAGGACTGATTGCCCAGGGTTCCTACTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTACCATAGGGCAGAGCAGGACAGGACTGATTGCCCAGGGTTCCTACTG  100

seq1  ACCTTAGTGGTGTCCTTGATGGGGAGTCTGCCATGCTTTCTAGTCATACT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTTAGTGGTGTCCTTGATGGGGAGTCTGCCATGCTTTCTAGTCATACT  150

seq1  TCAGGCCCCTCGCTCCCTTGCCCAGGGCAATGAAAGTGTACAAGGCTCTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGGCCCCTCGCTCCCTTGCCCAGGGCAATGAAAGTGTACAAGGCTCTG  200

seq1  ACTCAGTCCTTCCCTTGAGTCTTTCTGAAGAGCGAGTGTGTATGGGAGAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCAGTCCTTCCCTTGAGTCTTTCTGAAGAGCGAGTGTGTATGGGAGAC  250

seq1  GGGGTGGTTTGAGGCTGCAGTCTGAGGGCTCCCATTGACCTCAGCCAAGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGTGGTTTGAGGCTGCAGTCTGAGGGCTCCCATTGACCTCAGCCAAGC  300

seq1  CTCACATCTGGTTTAGCTTCTTTAGCTCCTGGGCCTCCCTGCCAATTAGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACATCTGGTTTAGCTTCTTTAGCTCCTGGGCCTCCCTGCCAATTAGG  350

seq1  CATCCAGTCCTTGATCTTCCATCTGCCTATAGCTTCAGCACTGCTGTGTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCCAGTCCTTGATCTTCCATCTGCCTATAGCTTCAGCACTGCTGTGTG  400

seq1  TGAGGGAAGCACTTCCTGGGGATTTCCACCTTGCTCAGCTGCTTGTGGCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGGAAGCACTTCCTGGGGATTTCCACCTTGCTCAGCTGCTTGTGGCT  450

seq1  GGCAGCTCCTCCAACCCCCAGCTGCTGCTTGCTTCCCCGTGGAAATCTCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGCTCCTCCAACCCCCAGCTGCTGCTTGCTTCCCCGTGGAAATCTCA  500

seq1  CCTGGCTTGCTGGCTTCCTTTACAGCTACCGATTCTTGCAAGAACAGGCG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGCTTGCTGGCTTCCTTTACAGCTACCGATTCTTGCAAGAACAGGCG  550

seq1  TGACTGTGCGTTCTGCTGGCTGCTTCCTGTCAGTGAGTACACTGATGATA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACTGTGCGTTCTGCTGGCTGCTTCCTGTCAGTGAGTACACTGATGATA  600

seq1  GGTTTCCCATCTGCTATCTCGCTGGGAAGTCCCCTCC-TTTCCTTTAAAT  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  GGTTTCCCATCTGCTATCTCGCTGGGAAGTCCCCTCCTTTTCCTTTAAAT  650

seq1  CATGTTAGGATGCAGCGTTGGGTCTTGGGCATGTTGTCTTTAGAGAGGTG  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTTAGGATGCAGCGTTGGGTCTTGGGCATGTTGTCTTTAGAGAGGTG  700

seq1  CCGAG-TTTGA-TTTTTTTGGACTCAGTTTGGCTTTGAAATAGACCTTAT  747
      ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||
seq2  CCGAGTTTTGATTTTTTTTGGACTCAGTTGGCTTTTGAAATAGACCTTAT  750

seq1  ACAGC-TGTACACAGCC-TTCCTTCAG  772
       |||| ||||||||||| |||||||||
seq2  TCAGCTTGTACACAGCCTTTCCTTCAG  777


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |