BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-223K14
Chromosome2 (Build37)
Map Location 60,662,900 - 60,816,417
singlet/doubletdoublet
Overlap geneRbms1, ENSMUSG00000075325
Upstream geneTanc1, Wdsub1, Baz2b, LOC667103, LOC667106, Ldha-ps, LOC100039092, March7, Cd302, LOC625861, Ly75, LOC100039176, Pla2r1, Itgb6
Downstream geneTank, Psmd14, Tbr1, LOC100039274
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-223K14.bB6Ng01-223K14.g
ACCGA038337GA038338
length1,1671,137
definitionB6Ng01-223K14.b B6Ng01-223K14.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(60,662,900 - 60,664,066)(60,815,278 - 60,816,417)
sequence
gaattctctattgctgtcatgaaacaccaggtccaaaatcaggttggaga
gaaaccagtttatttggcttacacttgtacagcagtgtgtgtggactcca
tctctgaaggaagtcgggacaaggactcaaaaggacaggaacctgatgca
gaggccatgaaaaggtgctgtttactagcttgcccagtctgcttccttat
agaaccaggaccaccaacccaggcatggccccacccacaatgggctctgc
ctttctccaatcaataattaagcaaataccgtaagctgatattttctaat
tggagaaaattttctcaattgaggttctcccctttcagataactctcgct
tgtgtcaacatgacctaaaactagactgcactgcatgcctctatcttata
ttcaaacacataagcttgtatgtatgccaatgtgtacatatacatgtgac
acaggcatataaccacatgaatgtgagtatgcctatgcatgtacatagtc
tcgagaggcagaggcatgcaaatttctgagttcaaggccagcctggtcta
tagagtgaattccaggacagccagggctacacagagaaaccctgtctcaa
aacaaacaaacaaacaaacaaacaaacaaaaaacaaacaacaaaaaaaga
aagccagattaattagaagcatgtatttcttgatgataatggaagatagc
tcagctaataattacttgggattactgttttgtacaggggctttaataat
aacaataataataacagccccaaacaaaaaaccccaaacatgcatttgag
tacatttaagtacacacacacacacacacacacacacacaccaccaccaa
ccaccaccaccaccaccaaacaaaccaaaaaaaaaaaaaaaaaaagaaac
cctgaaattagtcaaggcttctagttctgtagaaacagagtggccttttt
cttttcttcttgctttggaccagaagccagaagtaaattcctgctgggag
ttctgagaaacttgtaactggcatgctgggtgtggtggagtacttgtgtc
ctgtgagtaggaagggaatcttgagccaagcagaagagtgtcctcattca
cgtatttagcagcttcactggagaaggcccacagtgctagcatgtgacac
tggcttgacctggctct
gaattcatgaattagttgttcttcatgttcttcttgttcttcatggtaga
tagttctagaaagtcactgcacacagattagtgagaactgagccctggct
cctaaggcattaatgcatccctcaggctcagccttcccttaataaattaa
ttcacattcttgttttctgtattatttgaagacactatattttacatgtt
atttctttgaaactaattagatgcagcatttctttatgataatagattag
tcaagaggagattaacattttcctgacccagccaaatgtgactgtaaatt
tctttggtggttagctccacaacttattgtcccttgaaggaacaaattcc
gtcactttacccaacttcatcattcactagagccacttgagtccctctta
ccatggtctcttgggaacactggggaatttcctctttatttttccaaaaa
tgtaatagtattgatccattagcactgcactcgctgctgaccctgtacaa
tgcatgcttagataaagcttgtagcgtgtggattttctgcataccataca
atgcagttttcttgctgctaggatctcaaaacagcatgttagcagtacac
ttggggtcattttgaatagtaatgttgccaattaaataaacaaacatgaa
aaacaaaggaaaatataagaaagatttttaaaaggcaataaatgggctgc
aaaaagagcggcatgcgcagtatgaagtaagccacagaccgtcctttgtt
tgactgaaagcattagtgatggggaagggagctcttcagtgctcttcagg
agtgtgcaattgatgcatcggtatcacaagtgttgattttgaacctacag
agaagctttgagtatatcaaataatagtgaagatgtgagaagtcaatact
aaactatcagcgtttactcgccaagttcttagacacggggttttcagtaa
atggtatgtaataaattaatagtagtcaaaacaagtgttcaatctgctaa
ggtcttaaatgacaattcctagattgtgacgtgaagaatacaaagaacat
tttcaggaatcctactgattgtttttttcaaaagaagtcttatttatttt
atgggaatgtttgccctgttccaatggcatgtgcctg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_60662900_60664066
seq2: B6Ng01-223K14.b_42_1208

seq1  GAATTCTCTATTGCTGTCATGAAACACCAGGTCCAAAATCAGGTTGGAGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTATTGCTGTCATGAAACACCAGGTCCAAAATCAGGTTGGAGA  50

seq1  GAAACCAGTTTATTTGGCTTACACTTGTACAGCAGTGTGTGTGGACTCCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAACCAGTTTATTTGGCTTACACTTGTACAGCAGTGTGTGTGGACTCCA  100

seq1  TCTCTGAAGGAAGTCGGGACAAGGACTCAAAAGGACAGGAACCTGATGCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTGAAGGAAGTCGGGACAAGGACTCAAAAGGACAGGAACCTGATGCA  150

seq1  GAGGCCATGAAAAGGTGCTGTTTACTAGCTTGCCCAGTCTGCTTCCTTAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGCCATGAAAAGGTGCTGTTTACTAGCTTGCCCAGTCTGCTTCCTTAT  200

seq1  AGAACCAGGACCACCAACCCAGGCATGGCCCCACCCACAATGGGCTCTGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAACCAGGACCACCAACCCAGGCATGGCCCCACCCACAATGGGCTCTGC  250

seq1  CTTTCTCCAATCAATAATTAAGCAAATACCGTAAGCTGATATTTTCTAAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCTCCAATCAATAATTAAGCAAATACCGTAAGCTGATATTTTCTAAT  300

seq1  TGGAGAAAATTTTCTCAATTGAGGTTCTCCCCTTTCAGATAACTCTCGCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGAAAATTTTCTCAATTGAGGTTCTCCCCTTTCAGATAACTCTCGCT  350

seq1  TGTGTCAACATGACCTAAAACTAGACTGCACTGCATGCCTCTATCTTATA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTCAACATGACCTAAAACTAGACTGCACTGCATGCCTCTATCTTATA  400

seq1  TTCAAACACATAAGCTTGTATGTATGCCAATGTGTACATATACATGTGAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAAACACATAAGCTTGTATGTATGCCAATGTGTACATATACATGTGAC  450

seq1  ACAGGCATATAACCACATGAATGTGAGTATGCCTATGCATGTACATAGTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGCATATAACCACATGAATGTGAGTATGCCTATGCATGTACATAGTC  500

seq1  TCGAGAGGCAGAGGCATGCAAATTTCTGAGTTCAAGGCCAGCCTGGTCTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGAGAGGCAGAGGCATGCAAATTTCTGAGTTCAAGGCCAGCCTGGTCTA  550

seq1  TAGAGTGAATTCCAGGACAGCCAGGGCTACACAGAGAAACCCTGTCTCAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGTGAATTCCAGGACAGCCAGGGCTACACAGAGAAACCCTGTCTCAA  600

seq1  AACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAAAAACAAACAACAAAAAAAGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAAAAACAAACAACAAAAAAAGA  650

seq1  AAGCCAGATTAATTAGAAGCATGTATTTCTTGATGATAATGGAAGATAGC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCCAGATTAATTAGAAGCATGTATTTCTTGATGATAATGGAAGATAGC  700

seq1  TCAGCTAATAATTACTTGGGATTACTGTTTTGTACAGGGGCTTTAATAAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCTAATAATTACTTGGGATTACTGTTTTGTACAGGGGCTTTAATAAT  750

seq1  AACAATAATAATAACAG-CCCAAACAAAAAA-CCCAAACATGCATTTGAG  798
      ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  AACAATAATAATAACAGCCCCAAACAAAAAACCCCAAACATGCATTTGAG  800

seq1  TACATTTAAGTACACACACACACACACACACACACACACACCACCACCAA  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATTTAAGTACACACACACACACACACACACACACACACCACCACCAA  850

seq1  CCACCACCACCACCACCAAACAAACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA  898
      ||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||
seq2  CCACCACCACCACCACCAAACAAACC-----AAAAAAAAAAAAAAAAAAA  895

seq1  GAAACCCTGAAATTAGTCAAGGC-TCTAGTTCTGTAGAAACAGAGTGGCC  947
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAACCCTGAAATTAGTCAAGGCTTCTAGTTCTGTAGAAACAGAGTGGCC  945

seq1  TTTT--CTTTCTCCTTGCTTTGGACCAG-AGCCAGAAGTAAAT--CTGCT  992
      ||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||
seq2  TTTTTCTTTTCTTCTTGCTTTGGACCAGAAGCCAGAAGTAAATTCCTGCT  995

seq1  GGGAGTTCTGAG-AACTTGTAACTGGCATGCTGGGTGTGGTGAGTTACTT  1041
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||
seq2  GGGAGTTCTGAGAAACTTGTAACTGGCATGCTGGGTGTGGTGGAGTACTT  1045

seq1  GTGGTCCTGTGAGTAGGGAGGGAATCTGAGGCCAAGCAGGAAGAGTGTCC  1091
      || |||||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||||||
seq2  GT-GTCCTGTGAGTAGGAAGGGAATCTTGAGCCAAGCA-GAAGAGTGTCC  1093

seq1  TCATTCACGTA-TTAGCAGCTCCACTGGAGAAGGCACA-GGTGCTAGCAT  1139
      ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||
seq2  TCATTCACGTATTTAGCAGCTTCACTGGAGAAGGCCCACAGTGCTAGCAT  1143

seq1  GTGGCCACTGGCTCTGACCCCTGGCTCT  1167
      || | |||||||| |||  |||||||||
seq2  GT-GACACTGGCT-TGA--CCTGGCTCT  1167

seq1: chr2_60815278_60816417
seq2: B6Ng01-223K14.g_68_1204 (reverse)

seq1  CAGGCACATG-CATATGAACA-GGCAAACATACCCATAAAATAAATAAGA  48
      |||||||||| |||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  CAGGCACATGCCATTGGAACAGGGCAAACATTCCCATAAAATAAATAAGA  50

seq1  CCTCTTTTTGAAAAAAACAATCAGTAGGATT-CTGAAAATG-TCTTTGTA  96
      | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||
seq2  CTTC-TTTTGAAAAAAACAATCAGTAGGATTCCTGAAAATGTTCTTTGTA  99

seq1  TTCTTCACGTCAC-ATCTAGGAATTGTTCATTTTAAAGGACCTTAGCAGA  145
      ||||||||||||| |||||||||||| ||||||   | ||||||||||||
seq2  TTCTTCACGTCACAATCTAGGAATTG-TCATTT---AAGACCTTAGCAGA  145

seq1  TTTGAACACTTGTTTTGACTACTTATTAATTTATTACATAACCATTTACT  195
       ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||
seq2  -TTGAACACTTGTTTTGACTAC-TATTAATTTATTACAT-ACCATTTACT  192

seq1  GAAAACCCCGTGTCTAAGAACTTGGCGAGTAAACGCTGATAGTTTAGTAT  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAACCCCGTGTCTAAGAACTTGGCGAGTAAACGCTGATAGTTTAGTAT  242

seq1  TGACTTCTCACATCTTCACTATTATTTGATATACTCAAAGCTTCTCTGTA  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACTTCTCACATCTTCACTATTATTTGATATACTCAAAGCTTCTCTGTA  292

seq1  GGTTCAAAATCAACACTTGTGATACCGATGCATCAATTGCACACTCCTGA  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTCAAAATCAACACTTGTGATACCGATGCATCAATTGCACACTCCTGA  342

seq1  AGAGCACTGAAGAGCTCCCTTCCCCATCACTAATGCTTTCAGTCAAACAA  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCACTGAAGAGCTCCCTTCCCCATCACTAATGCTTTCAGTCAAACAA  392

seq1  AGGACGGTCTGTGGCTTACTTCATACTGCGCATGCCGCTCTTTTTGCAGC  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGACGGTCTGTGGCTTACTTCATACTGCGCATGCCGCTCTTTTTGCAGC  442

seq1  CCATTTATTGCCTTTTAAAAATCTTTCTTATATTTTCCTTTGTTTTTCAT  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATTTATTGCCTTTTAAAAATCTTTCTTATATTTTCCTTTGTTTTTCAT  492

seq1  GTTTGTTTATTTAATTGGCAACATTACTATTCAAAATGACCCCAAGTGTA  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGTTTATTTAATTGGCAACATTACTATTCAAAATGACCCCAAGTGTA  542

seq1  CTGCTAACATGCTGTTTTGAGATCCTAGCAGCAAGAAAACTGCATTGTAT  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTAACATGCTGTTTTGAGATCCTAGCAGCAAGAAAACTGCATTGTAT  592

seq1  GGTATGCAGAAAATCCACACGCTACAAGCTTTATCTAAGCATGCATTGTA  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTATGCAGAAAATCCACACGCTACAAGCTTTATCTAAGCATGCATTGTA  642

seq1  CAGGGTCAGCAGCGAGTGCAGTGCTAATGGATCAATACTATTACATTTTT  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGGTCAGCAGCGAGTGCAGTGCTAATGGATCAATACTATTACATTTTT  692

seq1  GGAAAAATAAAGAGGAAATTCCCCAGTGTTCCCAAGAGACCATGGTAAGA  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAAAATAAAGAGGAAATTCCCCAGTGTTCCCAAGAGACCATGGTAAGA  742

seq1  GGGACTCAAGTGGCTCTAGTGAATGATGAAGTTGGGTAAAGTGACGGAAT  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGACTCAAGTGGCTCTAGTGAATGATGAAGTTGGGTAAAGTGACGGAAT  792

seq1  TTGTTCCTTCAAGGGACAATAAGTTGTGGAGCTAACCACCAAAGAAATTT  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTCCTTCAAGGGACAATAAGTTGTGGAGCTAACCACCAAAGAAATTT  842

seq1  ACAGTCACATTTGGCTGGGTCAGGAAAATGTTAATCTCCTCTTGACTAAT  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGTCACATTTGGCTGGGTCAGGAAAATGTTAATCTCCTCTTGACTAAT  892

seq1  CTATTATCATAAAGAAATGCTGCATCTAATTAGTTTCAAAGAAATAACAT  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATTATCATAAAGAAATGCTGCATCTAATTAGTTTCAAAGAAATAACAT  942

seq1  GTAAAATATAGTGTCTTCAAATAATACAGAAAACAAGAATGTGAATTAAT  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAAATATAGTGTCTTCAAATAATACAGAAAACAAGAATGTGAATTAAT  992

seq1  TTATTAAGGGAAGGCTGAGCCTGAGGGATGCATTAATGCCTTAGGAGCCA  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTAAGGGAAGGCTGAGCCTGAGGGATGCATTAATGCCTTAGGAGCCA  1042

seq1  GGGCTCAGTTCTCACTAATCTGTGTGCAGTGACTTTCTAGAACTATCTAC  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCTCAGTTCTCACTAATCTGTGTGCAGTGACTTTCTAGAACTATCTAC  1092

seq1  CATGAAGAACAAGAAGAACATGAAGAACAACTAATTCATGAATTC  1140
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGAAGAACAAGAAGAACATGAAGAACAACTAATTCATGAATTC  1137