BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-226P03
Chromosome2 (Build37)
Map Location 134,471,848 - 134,640,902
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC627897, LOC433478, Plcb1
Upstream geneHao1, Txndc13
Downstream geneLOC100043487, LOC100043786, LOC100043788, Plcb4
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-226P03.bB6Ng01-226P03.g
ACCGA040744GA040745
length1,0231,128
definitionB6Ng01-226P03.b B6Ng01-226P03.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(134,471,848 - 134,472,871)(134,639,771 - 134,640,902)
sequence
gaattcttgtgtcattcatgtaaaatagtttgatgcagtacattgtatgt
tatagctttttattttccctatagggtagattcttatagcagtgcttggc
agacagtttctggcatgactctgaaggtcactcaattcctgatattcaga
accatgtgtgtctttctctcttcttgagtgtgagttgggctagtgactca
ctcctaagtcctaaaatgcaacagaagttatgggttagatcttccccaat
aagataacaaaagcccagggacttctatcctgccgacactctttgttctc
gcctactcattttgataccatgtttaggggcaacagagggaggcctcaaa
ccaacatcccacaaggaacagaggcctttgtacaatagcctgctgggaac
tagatctcggggacagcaatgtaaatgaccaaaatgggtatccttcccca
gttcttgggagagggcacagcctgataggtgatccagagcttcaagctga
aggtcaggtgggtcctatatgtaagaaactgagatgttcaatgtaatttt
aagctaccaagattcagaataaattgtaacacacatcattttcttaagtt
tgcaggcactgtttgactaggttggtactgtacccccctggcagaaagga
agatactctaagagactctgtgtgtctctcaatgggactatccaaatatt
gaatcaatgttaccccttccccccagacaaaggggggatttcccaaggaa
tctcaagctggagaagggtagggcatcagcaggaggaccatatcttccta
agagatttcacacagttcttacaatttgtcagactatcttacaggatgca
actgaaccccagaaaattatgggtcagtggtgagaaagtcaacaccttga
tgaggaccacttagaagtgtgtgccctttggccttctatataaactttga
tttcacttcagacaaagacttaagagtagttcactggatctcgttgtccc
tcttcccaatatgggagtgtgtg
gaattctgagataagagtctggtgtggaaagaaatgtgccccaaactctg
aggagacagacatataaaactgaggcgaggttaccagccgcatggcactc
acagagcagaatgaatgggttaattaaatggcaagctattcagagataaa
gcaaaagcttgtagcctggacatttattcataaataataagcatcagagt
cattattttgggaactagggcgtgggtagaaaagcccacagttacataac
atgggcttcaaaactaatatttgaaccacactgtacagtaattggcgagc
ccctatctgttctaatactattctattagttttgcttccctattggcttc
taaatgtattctgtgatctcaaaacaataatgacaacaaactacctcttc
agatgtcagaaattagaagatgaaaatattctatgtgctgggcctcttag
gtgccagcgactcttgaaaacataaccacttctaaggaatattcttgtct
aactccccattaaacctcaaataaatcttatggtttgcagacagttttta
ataattcagtacaggattgtcaactggctttataagaattgagctactga
attcttagtattgtgggcagaaacctaaatgtgggaagtttcttgaaaac
tcaataaaaagtagctttaattttttaacactgttccagttttactctct
gttgctgtgataaacaggatcaaaagcagcttgggtgatggcttgtttgg
ctcatggtttacaatatataaccaggtataacccaggcaggaactcaagg
aagaaatctggaatcagaaactaaagcagagtccacagagaaacactata
cactggcttgatcccaggttcatgttcgactacctttcttataggcctgc
cgacctgccaaggaatggtactgtccacagcagcctgactctcctacatc
aattgtaagtcaatagaatcccatatatgtctacaatgaaggagaccaat
tcctcatctaaggttccctctctccagatgtgacaattgacaacacattt
gcaatcacaaaacattatgactattcagtaatatcagaattactaccggg
agacttgtcattaatagcacagggagaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_134471848_134472871
seq2: B6Ng01-226P03.b_45_1067

seq1  GAATTCTTGTGTCATTCATGTAAAATAGTTTGATGCAGTACATTGTATGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTGTGTCATTCATGTAAAATAGTTTGATGCAGTACATTGTATGT  50

seq1  TATAGCTTTTTATTTTCCCTATAGGGTAGATTCTTATAGCAGTGCTTGGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAGCTTTTTATTTTCCCTATAGGGTAGATTCTTATAGCAGTGCTTGGC  100

seq1  AGACAGTTTCTGGCATGACTCTGAAGGTCACTCAATTCCTGATATTCAGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACAGTTTCTGGCATGACTCTGAAGGTCACTCAATTCCTGATATTCAGA  150

seq1  ACCATGTGTGTCTTTCTCTCTTCTTGAGTGTGAGTTGGGCTAGTGACTCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCATGTGTGTCTTTCTCTCTTCTTGAGTGTGAGTTGGGCTAGTGACTCA  200

seq1  CTCCTAAGTCCTAAAATGCAACAGAAGTTATGGGTTAGATCTTCCCCAAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTAAGTCCTAAAATGCAACAGAAGTTATGGGTTAGATCTTCCCCAAT  250

seq1  AAGATAACAAAAGCCCAGGGACTTCTATCCTGCCGACACTCTTTGTTCTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATAACAAAAGCCCAGGGACTTCTATCCTGCCGACACTCTTTGTTCTC  300

seq1  GCCTACTCATTTTGATACCATGTTTAGGGGCAACAGAGGGAGGCCTCAAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTACTCATTTTGATACCATGTTTAGGGGCAACAGAGGGAGGCCTCAAA  350

seq1  CCAACATCCCACAAGGAACAGAGGCCTTTGTACAATAGCCTGCTGGGAAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAACATCCCACAAGGAACAGAGGCCTTTGTACAATAGCCTGCTGGGAAC  400

seq1  TAGATCTCGGGGACAGCAATGTAAATGACCAAAATGGGTATCCTTCCCCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATCTCGGGGACAGCAATGTAAATGACCAAAATGGGTATCCTTCCCCA  450

seq1  GTTCTTGGGAGAGGGCACAGCCTGATAGGTGATCCAGAGCTTCAAGCTGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCTTGGGAGAGGGCACAGCCTGATAGGTGATCCAGAGCTTCAAGCTGA  500

seq1  AGGTCAGGTGGGTCCTATATGTAAGAAACTGAGATGTTCAATGTAATTTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTCAGGTGGGTCCTATATGTAAGAAACTGAGATGTTCAATGTAATTTT  550

seq1  AAGCTACCAAGATTCAGAATAAATTGTAACACACATCATTTTCTTAAGTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTACCAAGATTCAGAATAAATTGTAACACACATCATTTTCTTAAGTT  600

seq1  TGCAGGCACTGTTTGACTAGGTTGGTACTGTACCCCCCTGGCAGAAAGGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAGGCACTGTTTGACTAGGTTGGTACTGTACCCCCCTGGCAGAAAGGA  650

seq1  AGATACTCTAAGAGACTCTGTGTGTCTCTCAATGGGACTATCCAAATATT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATACTCTAAGAGACTCTGTGTGTCTCTCAATGGGACTATCCAAATATT  700

seq1  GAATCAATGTTACCCCTTCCCCCCAGACAAAGGGGGGATTTCCCAAGGAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATCAATGTTACCCCTTCCCCCCAGACAAAGGGGGGATTTCCCAAGGAA  750

seq1  TCTCAAGCTGGAGAAGGGTAGGGCATCAGCAGGAGGACCATATCTTCCTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCAAGCTGGAGAAGGGTAGGGCATCAGCAGGAGGACCATATCTTCCTA  800

seq1  AGAGATTTCACACAGTTCTTACAATTTGTCAGACTATCTTACAGGATGCA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGATTTCACACAGTTCTTACAATTTGTCAGACTATCTTACAGGATGCA  850

seq1  ACTGAACCCCAGAAAATTATGGGTCAGTGGTGAGAAAGTCAACACCTTGA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGAACCCCAGAAAATTATGGGTCAGTGGTGAGAAAGTCAACACCTTGA  900

seq1  TGAGGACCACTTAGAAGTGTGTGCCC-TTGGCCTTCTATATAAACTTTGA  949
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGACCACTTAGAAGTGTGTGCCCTTTGGCCTTCTATATAAACTTTGA  950

seq1  TTTCACTTCAGGACAAAGACTTAAGGAGTAGTTCACTGGATCTCGTTGTC  999
      |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCACTTCA-GACAAAGACTTAA-GAGTAGTTCACTGGATCTCGTTGTC  998

seq1  CCTCTTCCCAATATGGGAGTGTGTG  1024
      |||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTTCCCAATATGGGAGTGTGTG  1023

seq1: chr2_134639771_134640902
seq2: B6Ng01-226P03.g_66_1193 (reverse)

seq1  TTCTCCCTGTGCTA-TAATGAACAGTTCTCCCGGTAGTAA-TCTGATATG  48
      |||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||| |||||||| 
seq2  TTCTCCCTGTGCTATTAATG-ACAAGTCTCCCGGTAGTAATTCTGATAT-  48

seq1  GCCCTG-ATAGTTCATTAATG-TTTGTGATGGCAAATTGTGGTTGTCAAT  96
         ||| |||| ||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||| 
seq2  -TACTGAATAG-TCA-TAATGTTTTGTGATTGCAAA-TGT-GTTGTCAA-  92

seq1  TTGTCACATCTGGAGAGAGGGAACCTTAGATGAGGAATT-GTCTCCTTCA  145
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  TTGTCACATCTGGAGAGAGGGAACCTTAGATGAGGAATTGGTCTCCTTCA  142

seq1  TTGTAGACATATATGGGATTCTTATGACTTACAATTGATGTAGGAGAGTC  195
      ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTAGACATATATGGGATTCTATTGACTTACAATTGATGTAGGAGAGTC  192

seq1  AGGCCTGCTGTGGACAGTACCATTCCTTGGCAGGTCGGCAGGCCTATAAG  245
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGG-CTGCTGTGGACAGTACCATTCCTTGGCAGGTCGGCAGGCCTATAAG  241

seq1  AAAGGTAGTCGAACATGAACCTGGGATCAAGCCAGTGTATAGTGTTTCTC  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGTAGTCGAACATGAACCTGGGATCAAGCCAGTGTATAGTGTTTCTC  291

seq1  TGTGGACTCTGCTTTAGTTTCTGATTCCAGATTTCTTCCTTGAGTTCCTG  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGACTCTGCTTTAGTTTCTGATTCCAGATTTCTTCCTTGAGTTCCTG  341

seq1  CCTGGGTTATACCTGGTTATATATTGTAAACCATGAGCCAAACAAGCCAT  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGGTTATACCTGGTTATATATTGTAAACCATGAGCCAAACAAGCCAT  391

seq1  CACCCAAGCTGCTTTTGATCCTGTTTATCACAGCAACAGAGAGTAAAACT  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCCAAGCTGCTTTTGATCCTGTTTATCACAGCAACAGAGAGTAAAACT  441

seq1  GGAACAGTGTTAAAAAATTAAAGCTACTTTTTATTGAGTTTTCAAGAAAC  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAACAGTGTTAAAAAATTAAAGCTACTTTTTATTGAGTTTTCAAGAAAC  491

seq1  TTCCCACATTTAGGTTTCTGCCCACAATACTAAGAATTCAGTAGCTCAAT  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCACATTTAGGTTTCTGCCCACAATACTAAGAATTCAGTAGCTCAAT  541

seq1  TCTTATAAAGCCAGTTGACAATCCTGTACTGAATTATTAAAAACTGTCTG  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTATAAAGCCAGTTGACAATCCTGTACTGAATTATTAAAAACTGTCTG  591

seq1  CAAACCATAAGATTTATTTGAGGTTTAATGGGGAGTTAGACAAGAATATT  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACCATAAGATTTATTTGAGGTTTAATGGGGAGTTAGACAAGAATATT  641

seq1  CCTTAGAAGTGGTTATGTTTTCAAGAGTCGCTGGCACCTAAGAGGCCCAG  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTAGAAGTGGTTATGTTTTCAAGAGTCGCTGGCACCTAAGAGGCCCAG  691

seq1  CACATAGAATATTTTCATCTTCTAATTTCTGACATCTGAAGAGGTAGTTT  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATAGAATATTTTCATCTTCTAATTTCTGACATCTGAAGAGGTAGTTT  741

seq1  GTTGTCATTATTGTTTTGAGATCACAGAATACATTTAGAAGCCAATAGGG  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGTCATTATTGTTTTGAGATCACAGAATACATTTAGAAGCCAATAGGG  791

seq1  AAGCAAAACTAATAGAATAGTATTAGAACAGATAGGGGCTCGCCAATTAC  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCAAAACTAATAGAATAGTATTAGAACAGATAGGGGCTCGCCAATTAC  841

seq1  TGTACAGTGTGGTTCAAATATTAGTTTTGAAGCCCATGTTATGTAACTGT  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTACAGTGTGGTTCAAATATTAGTTTTGAAGCCCATGTTATGTAACTGT  891

seq1  GGGCTTTTCTACCCACGCCCTAGTTCCCAAAATAATGACTCTGATGCTTA  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCTTTTCTACCCACGCCCTAGTTCCCAAAATAATGACTCTGATGCTTA  941

seq1  TTATTTATGAATAAATGTCCAGGCTACAAGCTTTTGCTTTATCTCTGAAT  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTTATGAATAAATGTCCAGGCTACAAGCTTTTGCTTTATCTCTGAAT  991

seq1  AGCTTGCCATTTAATTAACCCATTCATTCTGCTCTGTGAGTGCCATGCGG  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTGCCATTTAATTAACCCATTCATTCTGCTCTGTGAGTGCCATGCGG  1041

seq1  CTGGTAACCTCGCCTCAGTTTTATATGTCTGTCTCCTCAGAGTTTGGGGC  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTAACCTCGCCTCAGTTTTATATGTCTGTCTCCTCAGAGTTTGGGGC  1091

seq1  ACATTTCTTTCCACACCAGACTCTTATCTCAGAATTC  1132
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTTCTTTCCACACCAGACTCTTATCTCAGAATTC  1128