BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-230E12
Chromosome2 (Build37)
Map Location 158,863,874 - 158,993,426
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream gene2610304G08Rik, Tgm2, D630003M21Rik, Bpi, Lbp, 9430008C03Rik, A930034L06Rik, B230339M05Rik, LOC628935, BC054059, LOC545481, Slc32a1, Actr5, Ppp1r16b, 2310007D09Rik, Dhx35, LOC100043891
Downstream geneLOC100043689
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-230E12.bB6Ng01-230E12.g
ACCGA043185GA043186
length4401,150
definitionB6Ng01-230E12.b B6Ng01-230E12.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(158,863,874 - 158,864,312)(158,992,269 - 158,993,426)
sequence
ggaattccaggcaatgaagagaccccgtctcaaaactctaggtggacact
ggatatggtagtgcatgcatttaatctcaacactaggaagacagaaatag
gcacgtctctgagtatgaggctgctctggcctacatagtgaattttacca
ttcaggggtatatggggggggggtcactggctactcttccaggggatcct
ggttcgattcccagcacccacatggcagctcgctattacctgtaagtcca
ggagatcccatgctctcttctgtcctcatgcactgatatttatgcaggtg
aagcgctcataaacataaaagaaaattaaaaaaaaaaaagaaaaagaatt
gcttctaccagactgacctgttcgcatgtctgtgaggtattgtgggaggt
cctattttttttttgggtggtgccagccatgggcaagtgg
gaattctctatctcctgtgtctatagctgaggtgatgcctagaacacagg
acatgtgactaatatttgctgaatgaagaaacagcctagcaagggtggga
agaagtgatggggaaaatttgcctcatgtcattcacggtgcttattcctt
gaccccacccccacccccgggccaaaggccttcttgtaggaatatatcct
cagttaatatggacttgtttgttctgcttggcatcacatattaaatgcag
gcaattaaaagtgactgtgtgctgcagttagggaggctggctagccctta
aaagcacaggctgttcctgtgaagcaagagttcagttcccagcacccaca
ctgagtggctcaagaccaacctgcaaatccagagccaaaatatctgaaac
catcctctggcctcagcaggcacctgcactcacatgtacacactacacat
ggccacacacacacaaacacacagttaaagtaattcttaaaaaaataagc
ttgaaagatgtctcacctgttgggggcactggctgctcttccagaggacc
cgggttcaattctcagcacccacgtggtagctcacaaatgtctgcaactc
caagatccgacagcttcatgcagacatacatgtagtcaaaccaccaatgc
acataaaataaaaacaaacaattaaaaaataaataaactcttccatttgt
caaaaaatagcaatgtgtctcttttgttaatacttaggtcatagatgtcc
ataataaggagtgtgtttcaacctgactcccaagaagtcggcctgagaca
gatactcacacacaactctgctgttggcttgcctttaaaagacaattcct
ggttctcaatcatgagacatcattctccatcataaccccactccacttaa
tattccacatagccctaatagccaaggattcaattgcaatagaaatgtat
atggtggtcaagaagttgacagcatgctcttagcggaggaaagctagatc
gtgcatttcatttgagaacttggtacccaagccaagatcacaaagcgaag
atgagatgcttaatctcagctgaggtgttgccttgcagaacaactgtgag
catgcacaagcctgatttttttatccagacctgtagaactaacatatata

quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_158863874_158864312
seq2: B6Ng01-230E12.b_44_483

seq1  GGAATTCCAGGCAATGAAGAGACCCCGTCTCAAAACTCTAGGTGGACACT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAATTCCAGGCAATGAAGAGACCCCGTCTCAAAACTCTAGGTGGACACT  50

seq1  GGATATGGTAGTGCATGCATTTAATCTCAACACTAGGAAGACAGAAATAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATATGGTAGTGCATGCATTTAATCTCAACACTAGGAAGACAGAAATAG  100

seq1  GCACGTCTCTGAGTATGAGGCTGCTCTGGCCTACATAGTGAATTTTACCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACGTCTCTGAGTATGAGGCTGCTCTGGCCTACATAGTGAATTTTACCA  150

seq1  TTCAGGGGTATATGGGGGGGGGGTCACTGGCTACTCTTCCAGGGGATCCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGGGGTATATGGGGGGGGGGTCACTGGCTACTCTTCCAGGGGATCCT  200

seq1  GGTTCGATTCCCAGCACCCACATGGCAGCTCGCTATTACCTGTAAGTCCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTCGATTCCCAGCACCCACATGGCAGCTCGCTATTACCTGTAAGTCCA  250

seq1  GGAGATCCCATGCTCTCTTCTGTCCTCATGCACTGATATTTATGCAGGTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGATCCCATGCTCTCTTCTGTCCTCATGCACTGATATTTATGCAGGTG  300

seq1  AAGCGCTCATAAACATAAAAGAAAATTAAAAAAAAAAAAGAAAAAGAATT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCGCTCATAAACATAAAAGAAAATTAAAAAAAAAAAAGAAAAAGAATT  350

seq1  GCTTCTACCAGACTGACCTGTTCGCATGTCTGTGAGGTATTGTGGGAGGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCTACCAGACTGACCTGTTCGCATGTCTGTGAGGTATTGTGGGAGGT  400

seq1  CCTA-GACCACTGTGGGTGGTGCCAGCCATGGGCAAGTGG  439
      ||||       | |||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTATTTTTTTTTTGGGTGGTGCCAGCCATGGGCAAGTGG  440

seq1: chr2_158992269_158993426
seq2: B6Ng01-230E12.g_66_1215 (reverse)

seq1  TATATATGTTATTTCTACAGTCTTGGATATAAAAATCAGGGCTTTGTGCA  50
      ||||||||||| ||||||||   |||||| ||||||||||   |||||||
seq2  TATATATGTTAGTTCTACAGGTCTGGATAAAAAAATCAGG--CTTGTGCA  48

seq1  TGCTTCACAAGTGTTCTTCCAAGGCAACACCTTCAGCCTTGAGATTTAGC  100
      ||| |||||  ||||| | |||||||||||| |||||  ||||||| |||
seq2  TGC-TCACAGTTGTTC-TGCAAGGCAACACC-TCAGC--TGAGATTAAGC  93

seq1  ATCTCATCCTTCGGCTTTGTGATCTTGGCTTGGGTACCAAGTTCTCAAAT  150
      ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTCAT-CTTC-GCTTTGTGATCTTGGCTTGGGTACCAAGTTCTCAAAT  141

seq1  GAAATGCACGATCTAGCTTTCCTCCGCTAAG-GCATGCTGTCAACTTCTT  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  GAAATGCACGATCTAGCTTTCCTCCGCTAAGAGCATGCTGTCAACTTCTT  191

seq1  GACCACCATATACATTTCTATTGCAATTGAATCCTTGGCTATTAGGGCTA  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCACCATATACATTTCTATTGCAATTGAATCCTTGGCTATTAGGGCTA  241

seq1  TGTGGAATATTAAGTGGAGTGGGGTTATGATGGAGAATGATGTCTCATGA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGAATATTAAGTGGAGTGGGGTTATGATGGAGAATGATGTCTCATGA  291

seq1  TTGAGAACCAGGAATTGTCTTTTAAAGGCAAGCCAACAGCAGAGTTGTGT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGAACCAGGAATTGTCTTTTAAAGGCAAGCCAACAGCAGAGTTGTGT  341

seq1  GTGAGTATCTGTCTCAGGCCGACTTCTTGGGAGTCAGGTTGAAACACACT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAGTATCTGTCTCAGGCCGACTTCTTGGGAGTCAGGTTGAAACACACT  391

seq1  CCTTATTATGGACATCTATGACCTAAGTATTAACAAAAGAGACACATTGC  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTATTATGGACATCTATGACCTAAGTATTAACAAAAGAGACACATTGC  441

seq1  TATTTTTTGACAAATGGAAGAGTTTATTTATTTTTTAATTGTTTGTTTTT  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTTTTGACAAATGGAAGAGTTTATTTATTTTTTAATTGTTTGTTTTT  491

seq1  ATTTTATGTGCATTGGTGGTTTGACTACATGTATGTCTGCATGAAGCTGT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTATGTGCATTGGTGGTTTGACTACATGTATGTCTGCATGAAGCTGT  541

seq1  CGGATCTTGGAGTTGCAGACATTTGTGAGCTACCACGTGGGTGCTGAGAA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGATCTTGGAGTTGCAGACATTTGTGAGCTACCACGTGGGTGCTGAGAA  591

seq1  TTGAACCCGGGTCCTCTGGAAGAGCAGCCAGTGCCCCCAACAGGTGAGAC  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAACCCGGGTCCTCTGGAAGAGCAGCCAGTGCCCCCAACAGGTGAGAC  641

seq1  ATCTTTCAAGCTTATTTTTTTAAGAATTACTTTAACTGTGTGTTTGTGTG  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTTCAAGCTTATTTTTTTAAGAATTACTTTAACTGTGTGTTTGTGTG  691

seq1  TGTGTGGCCATGTGTAGTGTGTACATGTGAGTGCAGGTGCCTGCTGAGGC  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGGCCATGTGTAGTGTGTACATGTGAGTGCAGGTGCCTGCTGAGGC  741

seq1  CAGAGGATGGTTTCAGATATTTTGGCTCTGGATTTGCAGGTTGGTCTTGA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGGATGGTTTCAGATATTTTGGCTCTGGATTTGCAGGTTGGTCTTGA  791

seq1  GCCACTCAGTGTGGGTGCTGGGAACTGAACTCTTGCTTCACAGGAACAGC  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCACTCAGTGTGGGTGCTGGGAACTGAACTCTTGCTTCACAGGAACAGC  841

seq1  CTGTGCTTTTAAGGGCTAGCCAGCCTCCCTAACTGCAGCACACAGTCACT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGCTTTTAAGGGCTAGCCAGCCTCCCTAACTGCAGCACACAGTCACT  891

seq1  TTTAATTGCCTGCATTTAATATGTGATGCCAAGCAGAACAAACAAGTCCA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAATTGCCTGCATTTAATATGTGATGCCAAGCAGAACAAACAAGTCCA  941

seq1  TATTAACTGAGGATATATTCCTACAAGAAGGCCTTTGGCCCGGGGGTGGG  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTAACTGAGGATATATTCCTACAAGAAGGCCTTTGGCCCGGGGGTGGG  991

seq1  GGTGGGGTCAAGGAATAAGCACCGTGAATGACATGAGGCAAATTTTCCCC  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGGGGTCAAGGAATAAGCACCGTGAATGACATGAGGCAAATTTTCCCC  1041

seq1  ATCACTTCTTCCCACCCTTGCTAGGCTGTTTCTTCATTCAGCAAATATTA  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCACTTCTTCCCACCCTTGCTAGGCTGTTTCTTCATTCAGCAAATATTA  1091

seq1  GTCACATGTCCTGTGTTCTAGGCATCACCTCAGCTATAGACACAGGAGAT  1149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCACATGTCCTGTGTTCTAGGCATCACCTCAGCTATAGACACAGGAGAT  1141

seq1  AGAGAATTC  1158
      |||||||||
seq2  AGAGAATTC  1150