BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-231M10
Chromosome2 (Build37)
Map Location 36,738,863 - 36,876,616
singlet/doubletdoublet
Overlap geneOlfr353, Olfr354, Olfr355, Olfr356, Olfr357, Olfr358, Olfr359-ps1
Upstream geneTtll11, Ndufa8, 1700010A17Rik, Lhx6, Rbm18, LOC100042236, Mrrf, LOC100040493, Ptgs1, Olfr334-ps1, Olfr335, Olfr336-ps1, Olfr337-ps1, Olfr338, LOC675440, Olfr339, Olfr340, Olfr341, Olfr342, Olfr343-ps1, Olfr344, Olfr345, Olfr346, Olfr347, Olfr348, Olfr50, Rpl18p, Olfr3, Olfr349-ps1, Olfr350, Olfr351, Olfr352
Downstream geneOlfr360, Olfr361, Olfr362, Olfr364-ps1, Olfr365, Olfr366, Olfr367, Olfr368, Pdcl, Rc3h2, Zbtb6, Zbtb26, Rabgap1, Gpr21, 6430510M02Rik, Strbp, LOC639491, Dennd1a
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-231M10.bB6Ng01-231M10.g
ACCGA044281GA044282
length1,1721,170
definitionB6Ng01-231M10.b B6Ng01-231M10.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(36,875,439 - 36,876,616)(36,738,863 - 36,740,041)
sequence
gaattccatgacagccagggatacatagtgagaccttgtttaatcccaca
tcccaaattctctcagtttttcatcacagaatcagtgaaaacatgtacat
gaagcagcatttttataaaatgtaggggtagtaagaatgaaaagtctaaa
taaaaaaaactagaaaaaaacaaagaaaatgaaagggagtcacacaggcc
atcacactatgagcttctcatttaaggtgagaaataatatgttttcatcc
accaggtgcacagatataaaatgaaaatattcttgacttgcaaagactgg
aatgcctgatgcacctaattttattatttggtaacttattcaatacacac
agaaaagttgatgaaaatcaggaacttaaaaaatctatcaaaactttgaa
aaggaagaaagataggtgacacactgaagaggaagaggttttatattttg
tagtaaatggccacacaaacacgtgtatattagcacagtattcagagaca
tggaagttttgagctgaaatatgtaactgaaactacaagaaagtaagcaa
gtttaaggcaatgactatcctttttattacacatggtagtatagttatac
cctattattattttgtgtggtttgcatgcatgtaagtagatgtttgtgtg
agtggatgtaggattatatcaatcacttccaccctcatcctgggaaagtt
tagtttacttaaaagaacaccattactaaaagaacaaaagtacttttatc
agtgcttaaggataagaataaaacgtcactccaatgactaactctcttaa
ggtgaagaatctcagatgtgcttgtgccttggcattgttctcttttccaa
ctctgatccttcctctttacaggtgatgtaaaccataacttagggccact
aaaaacaagacagaagtgactgaatttgtgttgttgggattgtccagtag
gccagagatgcagccagttatttttggagttatcctacctgacagcagtt
ttgggcaataccctactagtgctgttgttgctcagaccccagcttcagac
ccccatgtacttccttctcagccagcctttcttgaatgcatatgttctac
acattcactgtttcctcagatgctgtaccacacactctcttgcggttcga
acattctatgactgttgcatga
gaattcattcatttcctctttaagggtctttaccaccctcataagattga
atttaaggtcaactccttgtggtccaactgtgtcagcatatcaagggctt
tctatagtaggaaagccgggctatattggtactatattgccctagatctt
cttgattgtgttctgatcctggcctttagccatctggttgtttctggtgt
tggctggatattctgcataccaacacaacctcttgggaatgcaggcagag
aaggaacctaacaataaatttcatgaaacaacccatggatcacttttact
gtctgtttcccagatggaactggatgttgctggggtcctgaagacctcct
agggaaggaagctatgagcctggtgatggagacttggagacagagtgcag
tccaactctgtggctgtggcccaggtgaacctaactggcaggcaatagtt
ggggaatggtcaaaaatgggtgttcctgggaccccacagtcctgggtttt
cctggggctcagcaagcctctttgggagaggtcttggagcttggggaaat
ggcagcatgcagctcacttctgatggcagtgccccaggcctgacaggcag
gctatttgtggatggaactagaaaatatcatcctgagtaaggtaacccaa
tcacaaaagaacacatatggtatacactcactgataagtggatattagcc
cagagggtcagaatttccaagatacaattcacagaccaaatgaatgtctt
ttcatcagagatgttaacatataaattacacacacaacttgtgactaaga
acttcagtgtacaagaaattgttcataatgagaaaaaaaagattacttct
ttgaaaattaaaactcacttgactctctaatataaaataaatgtccattt
acttaattaataccaaaggatacaaaactatgccaatggcatcaggagtt
agaatataggatactactagaataatagcagtcaataaaacccagtttat
atagtacttaacatttattcttccttgaaagaatattatacaggtatgat
ttaaaatctatggtcttgcactatgactttgcaatatgattcaagcatgg
gattcttattctggacatcacaaacctgaatcgggtgatgcactgtgggt
gcagtaagacactcctctgg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_36875439_36876616
seq2: B6Ng01-231M10.b_49_1220 (reverse)

seq1  TCATGCAACAGTTATAAGAAATGTTTCGAACCGC-AGAGAGTGTGTGTAC  49
      |||||||||||| |||   |||| |||||||||| ||||||||||||   
seq2  TCATGCAACAGTCATA--GAATG-TTCGAACCGCAAGAGAGTGTGTGGTA  47

seq1  CAGCATCTGAGG-AACAGTGATGGTTGTTAGACATATGGCAATCAAGGAA  98
      |||||||||||| ||||||||  | |||   |||||| ||| ||||| ||
seq2  CAGCATCTGAGGAAACAGTGAATG-TGTAGAACATAT-GCATTCAAGAAA  95

seq1  AGCTGGCTGAGAAGGAAGTACATGGGGGTCTGAAGCTTTGGGTCTGAGCA  148
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| 
seq2  GGCTGGCTGAGAAGGAAGTACATGGGGGTCTGAAGC-TGGGGTCTGAGC-  143

seq1  AACAACAAGCACTAGTAGGGTATTGCCCAAAACTGCTGTCAGGTAGGATA  198
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAC-AGCACTAGTAGGGTATTGCCCAAAACTGCTGTCAGGTAGGATA  192

seq1  ACTCCAAAAATAACTGGCTGCATCTCTGGCCTACTGGACAATCCCAACAA  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCCAAAAATAACTGGCTGCATCTCTGGCCTACTGGACAATCCCAACAA  242

seq1  CACAAATTCAGTCACTTCTGTCTTGTTTTTAGTGGCCCTAAGTTATGGTT  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAAATTCAGTCACTTCTGTCTTGTTTTTAGTGGCCCTAAGTTATGGTT  292

seq1  TACATCACCTGTAAAGAGGAAGGATCAGAGTTGGAAAAGAGAACAATGCC  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATCACCTGTAAAGAGGAAGGATCAGAGTTGGAAAAGAGAACAATGCC  342

seq1  AAGGCACAAGCACATCTGAGATTCTTCACCTTAAGAGAGTTAGTCATTGG  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCACAAGCACATCTGAGATTCTTCACCTTAAGAGAGTTAGTCATTGG  392

seq1  AGTGACGTTTTATTCTTATCCTTAAGCACTGATAAAAGTACTTTTGTTCT  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGACGTTTTATTCTTATCCTTAAGCACTGATAAAAGTACTTTTGTTCT  442

seq1  TTTAGTAATGGTGTTCTTTTAAGTAAACTAAACTTTCCCAGGATGAGGGT  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGTAATGGTGTTCTTTTAAGTAAACTAAACTTTCCCAGGATGAGGGT  492

seq1  GGAAGTGATTGATATAATCCTACATCCACTCACACAAACATCTACTTACA  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGTGATTGATATAATCCTACATCCACTCACACAAACATCTACTTACA  542

seq1  TGCATGCAAACCACACAAAATAATAATAGGGTATAACTATACTACCATGT  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATGCAAACCACACAAAATAATAATAGGGTATAACTATACTACCATGT  592

seq1  GTAATAAAAAGGATAGTCATTGCCTTAAACTTGCTTACTTTCTTGTAGTT  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAATAAAAAGGATAGTCATTGCCTTAAACTTGCTTACTTTCTTGTAGTT  642

seq1  TCAGTTACATATTTCAGCTCAAAACTTCCATGTCTCTGAATACTGTGCTA  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTTACATATTTCAGCTCAAAACTTCCATGTCTCTGAATACTGTGCTA  692

seq1  ATATACACGTGTTTGTGTGGCCATTTACTACAAAATATAAAACCTCTTCC  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATACACGTGTTTGTGTGGCCATTTACTACAAAATATAAAACCTCTTCC  742

seq1  TCTTCAGTGTGTCACCTATCTTTCTTCCTTTTCAAAGTTTTGATAGATTT  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCAGTGTGTCACCTATCTTTCTTCCTTTTCAAAGTTTTGATAGATTT  792

seq1  TTTAAGTTCCTGATTTTCATCAACTTTTCTGTGTGTATTGAATAAGTTAC  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAGTTCCTGATTTTCATCAACTTTTCTGTGTGTATTGAATAAGTTAC  842

seq1  CAAATAATAAAATTAGGTGCATCAGGCATTCCAGTCTTTGCAAGTCAAGA  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATAATAAAATTAGGTGCATCAGGCATTCCAGTCTTTGCAAGTCAAGA  892

seq1  ATATTTTCATTTTATATCTGTGCACCTGGTGGATGAAAACATATTATTTC  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTTTCATTTTATATCTGTGCACCTGGTGGATGAAAACATATTATTTC  942

seq1  TCACCTTAAATGAGAAGCTCATAGTGTGATGGCCTGTGTGACTCCCTTTC  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCTTAAATGAGAAGCTCATAGTGTGATGGCCTGTGTGACTCCCTTTC  992

seq1  ATTTTCTTTGTTTTTTTCTAGTTTTTTTTATTTAGACTTTTCATTCTTAC  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTCTTTGTTTTTTTCTAGTTTTTTTTATTTAGACTTTTCATTCTTAC  1042

seq1  TACCCCTACATTTTATAAAAATGCTGCTTCATGTACATGTTTTCACTGAT  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCCCTACATTTTATAAAAATGCTGCTTCATGTACATGTTTTCACTGAT  1092

seq1  TCTGTGATGAAAAACTGAGAGAATTTGGGATGTGGGATTAAACAAGGTCT  1148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTGATGAAAAACTGAGAGAATTTGGGATGTGGGATTAAACAAGGTCT  1142

seq1  CACTATGTATCCCTGGCTGTCATGGAATTC  1178
      ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTATGTATCCCTGGCTGTCATGGAATTC  1172

seq1: chr2_36738863_36740041
seq2: B6Ng01-231M10.g_67_1236

seq1  GAATTCATTCATTTCCTCTTTAAGGGTCTTTACCACCCTCATAAGATTGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTCATTTCCTCTTTAAGGGTCTTTACCACCCTCATAAGATTGA  50

seq1  ATTTAAGGTCAACTCCTTGTGGTCCAACTGTGTCAGCATATCAAGGGCTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTAAGGTCAACTCCTTGTGGTCCAACTGTGTCAGCATATCAAGGGCTT  100

seq1  TCTATAGTAGGAAAGCCGGGCTATATTGGTACTATATTGCCCTAGATCTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTATAGTAGGAAAGCCGGGCTATATTGGTACTATATTGCCCTAGATCTT  150

seq1  CTTGATTGTGTTCTGATCCTGGCCTTTAGCCATCTGGTTGTTTCTGGTGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGATTGTGTTCTGATCCTGGCCTTTAGCCATCTGGTTGTTTCTGGTGT  200

seq1  TGGCTGGATATTCTGCATACCAACACAACCTCTTGGGAATGCAGGCAGAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTGGATATTCTGCATACCAACACAACCTCTTGGGAATGCAGGCAGAG  250

seq1  AAGGAACCTAACAATAAATTTCATGAAACAACCCATGGATCACTTTTACT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGAACCTAACAATAAATTTCATGAAACAACCCATGGATCACTTTTACT  300

seq1  GTCTGTTTCCCAGATGGAACTGGATGTTGCTGGGGTCCTGAAGACCTCCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTGTTTCCCAGATGGAACTGGATGTTGCTGGGGTCCTGAAGACCTCCT  350

seq1  AGGGAAGGAAGCTATGAGCCTGGTGATGGAGACTTGGAGACAGAGTGCAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGAAGGAAGCTATGAGCCTGGTGATGGAGACTTGGAGACAGAGTGCAG  400

seq1  TCCAACTCTGTGGCTGTGGCCCAGGTGAACCTAACTGGCAGGCAATAGTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAACTCTGTGGCTGTGGCCCAGGTGAACCTAACTGGCAGGCAATAGTT  450

seq1  GGGGAATGGTCAAAAATGGGTGTTCCTGGGACCCCACAGTCCTGGGTTTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGAATGGTCAAAAATGGGTGTTCCTGGGACCCCACAGTCCTGGGTTTT  500

seq1  CCTGGGGCTCAGCAAGCCTCTTTGGGAGAGGTCTTGGAGCTTGGGGAAAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGGGCTCAGCAAGCCTCTTTGGGAGAGGTCTTGGAGCTTGGGGAAAT  550

seq1  GGCAGCATGCAGCTCACTTCTGATGGCAGTGCCCCAGGCCTGACAGGCAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGCATGCAGCTCACTTCTGATGGCAGTGCCCCAGGCCTGACAGGCAG  600

seq1  GCTATTTGTGGATGGAACTAGAAAATATCATCCTGAGTAAGGTAACCCAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTATTTGTGGATGGAACTAGAAAATATCATCCTGAGTAAGGTAACCCAA  650

seq1  TCACAAAAGAACACATATGGTATACACTCACTGATAAGTGGATATTAGCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACAAAAGAACACATATGGTATACACTCACTGATAAGTGGATATTAGCC  700

seq1  CAGAGGGTCAGAATTTCCAAGATACAATTCACAGACCAAATGAATGTCTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGGGTCAGAATTTCCAAGATACAATTCACAGACCAAATGAATGTCTT  750

seq1  TTCATCAGAGATGTTAACATATAAATTACACACACAACTTGTGACTAAGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATCAGAGATGTTAACATATAAATTACACACACAACTTGTGACTAAGA  800

seq1  ACTTCAGTGTACAAGAAATTGTTCATAATGAGAAAAAAAAGATTACTTCT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCAGTGTACAAGAAATTGTTCATAATGAGAAAAAAAAGATTACTTCT  850

seq1  TTGAAAATTAAAACTCACTTGACTCTCTAATATAAAATAAATGTCCATTT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAAAATTAAAACTCACTTGACTCTCTAATATAAAATAAATGTCCATTT  900

seq1  ACTTAATTAATACCAAAGGATACAAAACTATGCCAAATGGCATCAGGAGT  950
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  ACTTAATTAATACCAAAGGATACAAAACTATGCC-AATGGCATCAGGAGT  949

seq1  TAGAATAATAGGATACTACTAGAATAATAGCAGTCAATAAAACCCAGTTT  1000
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAAT-ATAGGATACTACTAGAATAATAGCAGTCAATAAAACCCAGTTT  998

seq1  ATATAGTACTTTAAACATTTATTC-TCCTTGAAAGAATATTATACAGGTA  1049
      |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| 
seq2  ATATAGTACTT--AACATTTATTCTTCCTTGAAAGAATATTATACAGGT-  1045

seq1  ATGATTTTAAAAATCTTATGGTC-TGCACTATGACTTTTGCAATATGATT  1098
      |||||||  |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
seq2  ATGATTT--AAAATC-TATGGTCTTGCACTATGAC-TTTGCAATATGA-T  1090

seq1  TCAAGCAT-GGTTTCTTTAATTCTGGGACATCACAAAACTG-ATAGGGTG  1146
      |||||||| || |||||  ||||| |||||||||||| ||| || |||||
seq2  TCAAGCATGGGATTCTT--ATTCT-GGACATCACAAACCTGAATCGGGTG  1137

seq1  ATGGAAATTTGGGTGGCAGTAAGACA--TCTCTGG  1179
      || | | | ||||| |||||||||||   ||||||
seq2  AT-GCACTGTGGGT-GCAGTAAGACACTCCTCTGG  1170