BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-232D15
Chromosome2 (Build37)
Map Location 169,539,663 - 169,698,947
singlet/doubletdoublet
Overlap geneTshz2
Upstream geneAtp9a, Sall4, Zfp64, LOC100043909, EG668954
Downstream geneLOC100043737, LOC100043910, Zfp217, Silg111, LOC100043739, Bcas1, LOC228916, Cyp24a1, Pfdn4, 4930470P17Rik, Dok5
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-232D15.bB6Ng01-232D15.g
ACCGA044617GA044618
length8861,076
definitionB6Ng01-232D15.b B6Ng01-232D15.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(169,539,663 - 169,540,546)(169,697,882 - 169,698,947)
sequence
gaattcccaagccgggtagagtgcatacaaacaactctgaaatgttttaa
actcctggaaaaagtagatccttctgcaacccttgaggttttggtgcaca
gctcattagcatttgaacgaatctgtgagactttcaggcaggttgctggg
cggagagctaactagactaatgcagtgggttccagagcctaatggctcca
tttatcaagggagcaggttttaaaataatgcataaaccttcctcacatgg
ccgttttactatgcatttaattctacggcaacatggctctgcatgcggag
cagatgaagttgagtaaggctaaccttccgggaaaagacaaaggttaaaa
aaaaatcaatactcccccccttcccaaataaaagatgatttagaaaacat
ggaaatctctattgatgacagactctgacagataacaaaaatgtgcagct
gatacctcgggatggggacatgagctctcatttgcaccgaatctgcattc
agcattgcaaatgatgctattaggatgctaccgtggactcacgcctgatg
actaataagttaaaggccttcctgatgctttgagctttaagggcagtgaa
aactcccatgtctagtctttattccatgttcatggtctccttcttttcct
agtctctgctgacgcggggagaccttctgcccactccggagagccactag
agtttagtctttggaaaacccacagtgatctgaaaaaacagatcctgaca
tcgccattctgactttgcctattgggaaggtcaccgaaggctagtgacat
gaagtattcagccaggtgctaaaggaggatgttgggccatgcaagcaaca
cagtatagatttgagggttggggtgggtggggttgg
gaattctttcatgccatcatgcttgatgctgagaggggaccttccacccc
ttcctttctatgttgcatgcagtcttcaccgcgaccagcccaccaacaca
gaattcctccccacagcacccgcttggaaacctagctacacgcctatcgt
tgagcgtgcgtacggttgactgtgaggggagagcatcagcttcaggctct
caggacctgctctccctcttgcatcaattctcaagaagacagttagcaga
gactcgagcatcttcactgtgtgggcactcagcatcccggatgcttgttt
cctgacttaaaacggtcctgatgtttaggttctgtggggcaccaacctac
acataagaccgttggtgtaaagtctttaatgtgtggcacatcatttggtc
ttcacaatagctctatctgccttttagtttccttttagtacggatgatga
aacagaatctaggggatgctaatagcatcctccgggttacaaggctgggc
aggagattgagtctgtacctgctggattctaggttctatgttggggtcct
tcctgtatctccctctctggacctaatccatccctcctggttgttttctc
cccacgatctttctgttgccgatacagtttgtatgtgcacctgtgtggtt
gcaggcacaagcgtatgtgcctatggcgggtgggcaatggcaacgttagg
catcgtcttctgtttctctctatctttatgaagttattttctggcggttg
atatctctagatgacctgtagctccaggggccaggtgtgtccccaaacac
actctcagcacccctagcctggagtcatcttttctctcaggggccatgta
gtaaagtctgaagactttcttgtttcccctcccccgcagcatagtccata
cagccatagttttgaactgtggcaatgaagacatctgaagctttggaatt
gaagggcgaggaaaggaagtgatctttggtgcctgtaattctgttgggaa
ttggggcagaagcagaaaaatctgtcttgtttgtgcaagaaaagcttgaa
aaggaacatgtgaggcaccttctctt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_169539663_169540546
seq2: B6Ng01-232D15.b_43_928

seq1  GAATTCCCAAGCCGGGTAGAGTGCATACAAACAACTCTGAAATGTTTTAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCCAAGCCGGGTAGAGTGCATACAAACAACTCTGAAATGTTTTAA  50

seq1  ACTCCTGGAAAAAGTAGATCCTTCTGCAACCCTTGAGGTTTTGGTGCACA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCCTGGAAAAAGTAGATCCTTCTGCAACCCTTGAGGTTTTGGTGCACA  100

seq1  GCTCATTAGCATTTGAACGAATCTGTGAGACTTTCAGGCAGGTTGCTGGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCATTAGCATTTGAACGAATCTGTGAGACTTTCAGGCAGGTTGCTGGG  150

seq1  CGGAGAGCTAACTAGACTAATGCAGTGGGTTCCAGAGCCTAATGGCTCCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGAGAGCTAACTAGACTAATGCAGTGGGTTCCAGAGCCTAATGGCTCCA  200

seq1  TTTATCAAGGGAGCAGGTTTTAAAATAATGCATAAACCTTCCTCACATGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATCAAGGGAGCAGGTTTTAAAATAATGCATAAACCTTCCTCACATGG  250

seq1  CCGTTTTACTATGCATTTAATTCTACGGCAACATGGCTCTGCATGCGGAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGTTTTACTATGCATTTAATTCTACGGCAACATGGCTCTGCATGCGGAG  300

seq1  CAGATGAAGTTGAGTAAGGCTAACCTTCCGGGAAAAGACAAAGGTTAAAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATGAAGTTGAGTAAGGCTAACCTTCCGGGAAAAGACAAAGGTTAAAA  350

seq1  AAAAATCAATACTCCCCCCCTTCCCAAATAAAAGATGATTTAGAAAACAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAATCAATACTCCCCCCCTTCCCAAATAAAAGATGATTTAGAAAACAT  400

seq1  GGAAATCTCTATTGATGACAGACTCTGACAGATAACAAAAATGTGCAGCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAATCTCTATTGATGACAGACTCTGACAGATAACAAAAATGTGCAGCT  450

seq1  GATACCTCGGGATGGGGACATGAGCTCTCATTTGCACCGAATCTGCATTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATACCTCGGGATGGGGACATGAGCTCTCATTTGCACCGAATCTGCATTC  500

seq1  AGCATTGCAAATGATGCTATTAGGATGCTACCGTGGACTCACGCCTGATG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATTGCAAATGATGCTATTAGGATGCTACCGTGGACTCACGCCTGATG  550

seq1  ACTAATAAGTTAAAGGCCTTCCTGATGCTTTGAGCTTTAAGGGCAGTGAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAATAAGTTAAAGGCCTTCCTGATGCTTTGAGCTTTAAGGGCAGTGAA  600

seq1  AACTCCCATGTCTAGTCTTTATTCCATGTTCATGGTCTCCTTCTTTTCCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTCCCATGTCTAGTCTTTATTCCATGTTCATGGTCTCCTTCTTTTCCT  650

seq1  AGTCTCTGCTGACGCGGGGAGACCTTCTGCCCACTCCGGAGAGCCACTAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTCTGCTGACGCGGGGAGACCTTCTGCCCACTCCGGAGAGCCACTAG  700

seq1  AGTTTAGTCTTTGGAAAACCCACAGTGATCTGAAAAAACAGATCCTGACA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTAGTCTTTGGAAAACCCACAGTGATCTGAAAAAACAGATCCTGACA  750

seq1  TCGCCATTCTGACTTTGCCTATTGGGAAGGTCACCGAAGGCTAGTGACAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGCCATTCTGACTTTGCCTATTGGGAAGGTCACCGAAGGCTAGTGACAT  800

seq1  GAAGTATTCAGCCAGGTGCTAAAGGAGGATGTTGGGCCATGCAAGCAACA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTATTCAGCCAGGTGCTAAAGGAGGATGTTGGGCCATGCAAGCAACA  850

seq1  CAGTATAGATTTGAGGGTTGGGGTGG--TGGGTTGG  884
      ||||||||||||||||||||||||||   |||||||
seq2  CAGTATAGATTTGAGGGTTGGGGTGGGTGGGGTTGG  886

seq1: chr2_169697882_169698947
seq2: B6Ng01-232D15.g_68_1143 (reverse)

seq1  AAGAGA--GTGCC-CACATGTTCC-TCTCAGGCTTGTCTTGCACAA--CA  44
      ||||||  ||||| |||||||||| | ||| |||| ||||||||||   |
seq2  AAGAGAAGGTGCCTCACATGTTCCTTTTCAAGCTTTTCTTGCACAAACAA  50

seq1  GACAGAATTCTCTGC-TCTGCCCCAAATCCCACCAGCAACTACAGGCACC  93
      |||||| || ||||| |||||||||| ||||| ||| || ||||||||||
seq2  GACAGATTTTTCTGCTTCTGCCCCAATTCCCAACAG-AATTACAGGCACC  99

seq1  AAGGATCAC-TCCCTTCCTCGCCC-TCAA-TCCAAAGCTTCAGATGGTCT  140
      || |||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||
seq2  AAAGATCACTTCCTTTCCTCGCCCTTCAATTCCAAAGCTTCAGAT-GTCT  148

seq1  TCATTGCCACAGTTCAAAACTATGGCTGTATGGGACTATGCTGCGGGGGA  190
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  TCATTGCCACAGTTCAAAACTATGGCTGTAT-GGACTATGCTGCGGGGGA  197

seq1  GGGGAAACAAGAAAGTCTTCAGACTTTACTACATGGCCCCTGAGAG-AAA  239
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  GGGGAAACAAGAAAGTCTTCAGACTTTACTACATGGCCCCTGAGAGAAAA  247

seq1  GATGACTCCAGGCTAGGGGTGCTGAGAGTGTG-TTGGGGACACACCTGGC  288
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  GATGACTCCAGGCTAGGGGTGCTGAGAGTGTGTTTGGGGACACACCTGGC  297

seq1  CCCTGGAGCTACAGGTCATCTAGAGATATCAACCGCCAGAAAATAACTTC  338
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGGAGCTACAGGTCATCTAGAGATATCAACCGCCAGAAAATAACTTC  347

seq1  ATAAAGATAGAGAGAAACAGAAGACGATGCCTAACGTTGCCATTGCCCAC  388
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAGATAGAGAGAAACAGAAGACGATGCCTAACGTTGCCATTGCCCAC  397

seq1  CCGCCATAGGCACATACGCTTGTGCCTGCAACCACACAGGTGCACATACA  438
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGCCATAGGCACATACGCTTGTGCCTGCAACCACACAGGTGCACATACA  447

seq1  AACTGTATCGGCAACAGAAAGATC-TGGGGAGAAAACAACCAGGAGGGAT  487
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTGTATCGGCAACAGAAAGATCGTGGGGAGAAAACAACCAGGAGGGAT  497

seq1  GGATTAGGTCCAGAGAGGGAGATACAGGAAGGACCCCAACATAGAACCTA  537
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATTAGGTCCAGAGAGGGAGATACAGGAAGGACCCCAACATAGAACCTA  547

seq1  GAATCCAGCAGGTACAGACTCAATCTCCTGCCCAGCCTTGTAACCCGGAG  587
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATCCAGCAGGTACAGACTCAATCTCCTGCCCAGCCTTGTAACCCGGAG  597

seq1  GATGCTATTAGCATCCCCTAGATTCTGTTTCATCATCCGTACTAAAAGGA  637
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGCTATTAGCATCCCCTAGATTCTGTTTCATCATCCGTACTAAAAGGA  647

seq1  AACTAAAAGGCAGATAGAGCTATTGTGAAGACCAAATGATGTGCCACACA  687
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTAAAAGGCAGATAGAGCTATTGTGAAGACCAAATGATGTGCCACACA  697

seq1  TTAAAGACTTTACACCAACGGTCTTATGTGTAGGTTGGTGCCCCACAGAA  737
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAGACTTTACACCAACGGTCTTATGTGTAGGTTGGTGCCCCACAGAA  747

seq1  CCTAAACATCAGGACCGTTTTAAGTCAGGAAACAAGCATCCGGGATGCTG  787
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAAACATCAGGACCGTTTTAAGTCAGGAAACAAGCATCCGGGATGCTG  797

seq1  AGTGCCCACACAGTGAAGATGCTCGAGTCTCTGCTAACTGTCTTCTTGAG  837
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGCCCACACAGTGAAGATGCTCGAGTCTCTGCTAACTGTCTTCTTGAG  847

seq1  AATTGATGCAAGAGGGAGAGCAGGTCCTGAGAGCCTGAAGCTGATGCTCT  887
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTGATGCAAGAGGGAGAGCAGGTCCTGAGAGCCTGAAGCTGATGCTCT  897

seq1  CCCCTCACAGTCAACCGTACGCACGCTCAACGATAGGCGTGTAGCTAGGT  937
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCTCACAGTCAACCGTACGCACGCTCAACGATAGGCGTGTAGCTAGGT  947

seq1  TTCCAAGCGGGTGCTGTGGGGAGGAATTCTGTGTTGGTGGGCTGGTCGCG  987
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCAAGCGGGTGCTGTGGGGAGGAATTCTGTGTTGGTGGGCTGGTCGCG  997

seq1  GTGAAGACTGCATGCAACATAGAAAGGAAGGGGTGGAAGGTCCCCTCTCA  1037
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAAGACTGCATGCAACATAGAAAGGAAGGGGTGGAAGGTCCCCTCTCA  1047

seq1  GCATCAAGCATGATGGCATGAAAGAATTC  1066
      |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATCAAGCATGATGGCATGAAAGAATTC  1076