BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-240A23
Chromosome2 (Build37)
Map Location 133,207,610 - 133,292,968
singlet/doubletdoublet
Overlap geneA430048G15Rik
Upstream geneProkr2, 1700026D11Rik, Prei4, LOC100043781, LOC383801, LOC668906, Chgb, 3300001M20Rik, Mcm8, Crls1, B430119L13Rik, 5830467P10Rik, LOC668908, LOC100043785
Downstream geneBmp2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-240A23.bB6Ng01-240A23.g
ACCGA050325GA050326
length1,1431,106
definitionB6Ng01-240A23.b B6Ng01-240A23.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(133,291,830 - 133,292,968)(133,207,610 - 133,208,721)
sequence
gaattcaactattggtcatgcatagacaatcctgcttccatacatacaat
cttacagcatcagagctgtaagaaaaacaaacaaacaaataacttggttt
aacttaatcaaggtcttttactttaaaagcaaaaatactaagatatagag
accacagatggctttcctggaggttttattaatttagctctttaaaaaga
gtgttcaaaccaggcttagtggccacatcctggaaacccagaatgggaga
ggtaaaggcaagagaatcgggaatcaaaggtcattctaagttaccctgca
ggttggaagcttgcctaagctatttggaactgtgtctcaataaacaaaca
aacaaacaaacaaataaaaataccattcagatgaaccaacgtacttaaga
gaagaaactgggaagtaggatactgcttaagcagaggctaaggtcagccg
tgcttctggccgcccattctgcacaagcagaaaacactctccacactgca
aaaggcgcctctgcgtcaggttagaccaaaatgtcattccgcccacgccc
attgaagaagaatttcttgtgtctaatgagtgtctactgtgtctcttgtg
tgatggtttaaaaaccaaggtaatgagaatttttaaaaaatgaatagaac
caaatgggttagtaaaagctgtcccgtctacaatggagggagcaactgca
agaaaggggaggagatatgtggttgccatggactcaacccttgtgtggcc
tctatatttaaacactgaaattataacccttaatgtgatagtatcaggga
ctggaatttggagaaggaaattaagccctgaaaagagagcagtctggaat
gggtcagcactctgagagagctcctattggtccaccttgtaaatgtatgt
agaaacacagagcacagacaataaccaaaaccagttcatctggagcccct
agaaggcgtgatcactgtcactgccctgctgtctggggtcggttcactga
cgatgacagaagacatgttgggtaggattatgaccctagctgcaaggagg
gtatacgagccctgtaacccccacatgcagaatgtggcaacagtttggtt
taatgcactctgttccctgacagccttttctcacacaaaggaa
gaattctcatttaggaaaacatggtgcatgtaaggagtcaaagcaaatgg
aacactgggtctgatgacccaactcaccttaaactgcaagaagtcgagtc
aactcccacatcccaggtggaggaaacaggagccctgataaggaaggaaa
cagaagcccagataaggctccttgaatttctggtctgtgtctgactggtg
tgaagtaaggaatttcgggatccctggtattagaatcaaccccccccccc
ttttctgtaaccacgctggcaggattctgaaatggggagagtgagtgcac
caagggtatggagaaatttttctagggtgtctgaagctgtccaggtgtgg
gtgggtggcgtcacattcaaatttacaaacctttcatggtgcctaatggc
ttgtaagatcaagttcagatttgctcacctagataaaggagtttcatcat
ttgccctctgctgacttctccaagtctgagaacatgctgacttcttggta
tatccttgaagaggcccttgacagcactcactcatcctggataatgttgc
tccaagccttttttcctttgcctggtgaacattcacagcatcttctccat
ggttgtcttgtgtcctgtgtcactgtccttgtttgtccttcagctttgtc
ccttctttgttccttgcttgagaataaagatcaagtcttatctgtcttaa
gaacccagcatgggccatcaaaaggtcatcgtgcacagacagtgagtgac
aagaggagtgaagtagaaacttctagtttctttggaaagttatatcaagt
gaagttttgctggggcacacaggtgagatgataagcaaacacatgaaaga
atgtcttcctgaagcagacacaggggaaaggttgttttgatatagcaaac
atgaaaggatctgtgatgaaggagtataaaaatgaccacacagagtgaga
gatgagcactgagcattggtttggtttgctccacctcactattcttcgct
aaagacacacaacagtattggtttgcctttacatagcattgcctagtact
tactgctatgaacagaacacatgaaaaagcacctcttggtaagcatattt
atgggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_133291830_133292968
seq2: B6Ng01-240A23.b_43_1185 (reverse)

seq1  TTCC-TTGT-TGAGAAAA-GCTGTCAGGGAACAGAGTGCATTAAACCAAA  47
      |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  TTCCTTTGTGTGAGAAAAGGCTGTCAGGGAACAGAGTGCATTAAACC-AA  49

seq1  ACTGTTGCCACA-TCTGCATGT-GGGGTTACAGGGCTCCGTATACCCTCC  95
      |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||
seq2  ACTGTTGCCACATTCTGCATGTGGGGGTTACAGGGCT-CGTATACCCTCC  98

seq1  CTGCAGCTAGGGTCATAATCCTA-CCAACATGTCTTCTGTCATCGTCAGT  144
       |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCAGCTAGGGTCATAATCCTACCCAACATGTCTTCTGTCATCGTCAGT  148

seq1  GAACCGACCCCAGACAGCAGGGCAGTGACAGTGATCACGCCTTCTAGGGG  194
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACCGACCCCAGACAGCAGGGCAGTGACAGTGATCACGCCTTCTAGGGG  198

seq1  CTCCAGATGAACTGGTTTTGGTTATTGTCTGTGCTCTGTGTTTCTACATA  244
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCAGATGAACTGGTTTTGGTTATTGTCTGTGCTCTGTGTTTCTACATA  248

seq1  CATTTACAAGGTGGACCAATAGGAGCTCTCTCAGAGTGCTGACCCATTCC  294
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTACAAGGTGGACCAATAGGAGCTCTCTCAGAGTGCTGACCCATTCC  298

seq1  AGACTGCTCTCTTTTCAGGGCTTAATTTCCTTCTCCAAATTCCAGTCCCT  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTGCTCTCTTTTCAGGGCTTAATTTCCTTCTCCAAATTCCAGTCCCT  348

seq1  GATACTATCACATTAAGGGTTATAATTTCAGTGTTTAAATATAGAGGCCA  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATACTATCACATTAAGGGTTATAATTTCAGTGTTTAAATATAGAGGCCA  398

seq1  CACAAGGGTTGAGTCCATGGCAACCACATATCTCCTCCCCTTTCTTGCAG  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAAGGGTTGAGTCCATGGCAACCACATATCTCCTCCCCTTTCTTGCAG  448

seq1  TTGCTCCCTCCATTGTAGACGGGACAGCTTTTACTAACCCATTTGGTTCT  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTCCCTCCATTGTAGACGGGACAGCTTTTACTAACCCATTTGGTTCT  498

seq1  ATTCATTTTTTAAAAATTCTCATTACCTTGGTTTTTAAACCATCACACAA  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCATTTTTTAAAAATTCTCATTACCTTGGTTTTTAAACCATCACACAA  548

seq1  GAGACACAGTAGACACTCATTAGACACAAGAAATTCTTCTTCAATGGGCG  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGACACAGTAGACACTCATTAGACACAAGAAATTCTTCTTCAATGGGCG  598

seq1  TGGGCGGAATGACATTTTGGTCTAACCTGACGCAGAGGCGCCTTTTGCAG  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGCGGAATGACATTTTGGTCTAACCTGACGCAGAGGCGCCTTTTGCAG  648

seq1  TGTGGAGAGTGTTTTCTGCTTGTGCAGAATGGGCGGCCAGAAGCACGGCT  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGAGAGTGTTTTCTGCTTGTGCAGAATGGGCGGCCAGAAGCACGGCT  698

seq1  GACCTTAGCCTCTGCTTAAGCAGTATCCTACTTCCCAGTTTCTTCTCTTA  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCTTAGCCTCTGCTTAAGCAGTATCCTACTTCCCAGTTTCTTCTCTTA  748

seq1  AGTACGTTGGTTCATCTGAATGGTATTTTTATTTGTTTGTTTGTTTGTTT  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTACGTTGGTTCATCTGAATGGTATTTTTATTTGTTTGTTTGTTTGTTT  798

seq1  GTTTATTGAGACACAGTTCCAAATAGCTTAGGCAAGCTTCCAACCTGCAG  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTATTGAGACACAGTTCCAAATAGCTTAGGCAAGCTTCCAACCTGCAG  848

seq1  GGTAACTTAGAATGACCTTTGATTCCCGATTCTCTTGCCTTTACCTCTCC  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAACTTAGAATGACCTTTGATTCCCGATTCTCTTGCCTTTACCTCTCC  898

seq1  CATTCTGGGTTTCCAGGATGTGGCCACTAAGCCTGGTTTGAACACTCTTT  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTCTGGGTTTCCAGGATGTGGCCACTAAGCCTGGTTTGAACACTCTTT  948

seq1  TTAAAGAGCTAAATTAATAAAACCTCCAGGAAAGCCATCTGTGGTCTCTA  994
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAGAGCTAAATTAATAAAACCTCCAGGAAAGCCATCTGTGGTCTCTA  998

seq1  TATCTTAGTATTTTTGCTTTTAAAGTAAAAGACCTTGATTAAGTTAAACC  1044
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTTAGTATTTTTGCTTTTAAAGTAAAAGACCTTGATTAAGTTAAACC  1048

seq1  AAGTTATTTGTTTGTTTGTTTTTCTTACAGCTCTGATGCTGTAAGATTGT  1094
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTATTTGTTTGTTTGTTTTTCTTACAGCTCTGATGCTGTAAGATTGT  1098

seq1  ATGTATGGAAGCAGGATTGTCTATGCATGACCAATAGTTGAATTC  1139
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTATGGAAGCAGGATTGTCTATGCATGACCAATAGTTGAATTC  1143

seq1: chr2_133207610_133208721
seq2: B6Ng01-240A23.g_65_1170

seq1  GAATTCTCATTTAGGAAAACATGGTGCATGTAAGGAGTCAAAGCAAATGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCATTTAGGAAAACATGGTGCATGTAAGGAGTCAAAGCAAATGG  50

seq1  AACACTGGGTCTGATGACCCAACTCACCTTAAACTGCAAGAAGTCGAGTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACTGGGTCTGATGACCCAACTCACCTTAAACTGCAAGAAGTCGAGTC  100

seq1  AACTCCCACATCCCAGGTGGAGGAAACAGGAGCCCTGATAAGGAAGGAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTCCCACATCCCAGGTGGAGGAAACAGGAGCCCTGATAAGGAAGGAAA  150

seq1  CAGAAGCCCAGATAAGGCTCCTTGAATTTCTGGTCTGTGTCTGACTGGTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAAGCCCAGATAAGGCTCCTTGAATTTCTGGTCTGTGTCTGACTGGTG  200

seq1  TGAAGTAAGGAATTTCGGGATCCCTGGTATTAGAATCAACCCCCCCCCCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGTAAGGAATTTCGGGATCCCTGGTATTAGAATCAACCCCCCCCCCC  250

seq1  TTTTCTGTAACCACGCTGGCAGGATTCTGAAATGGGGAGAGTGAGTGCAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCTGTAACCACGCTGGCAGGATTCTGAAATGGGGAGAGTGAGTGCAC  300

seq1  CAAGGGTATGGAGAAATTTTTCTAGGGTGTCTGAAGCTGTCCAGGTGTGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGGGTATGGAGAAATTTTTCTAGGGTGTCTGAAGCTGTCCAGGTGTGG  350

seq1  GTGGGTGGCGTCACATTCAAATTTACAAACCTTTCATGGTGCCTAATGGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGGTGGCGTCACATTCAAATTTACAAACCTTTCATGGTGCCTAATGGC  400

seq1  TTGTAAGATCAAGTTCAGATTTGCTCACCTAGATAAAGGAGTTTCATCAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTAAGATCAAGTTCAGATTTGCTCACCTAGATAAAGGAGTTTCATCAT  450

seq1  TTGCCCTCTGCTGACTTCTCCAAGTCTGAGAACATGCTGACTTCTTGGTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCCCTCTGCTGACTTCTCCAAGTCTGAGAACATGCTGACTTCTTGGTA  500

seq1  TATCCTTGAAGAGGCCCTTGACAGCACTCACTCATCCTGGATAATGTTGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCCTTGAAGAGGCCCTTGACAGCACTCACTCATCCTGGATAATGTTGC  550

seq1  TCCAAGCCTTTTTTCCTTTGCCTGGTGAACATTCACAGCATCTTCTCCAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAAGCCTTTTTTCCTTTGCCTGGTGAACATTCACAGCATCTTCTCCAT  600

seq1  GGTTGTCTTGTGTCCTGTGTCACTGTCCTTGTTTGTCCTTCAGCTTTGTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTGTCTTGTGTCCTGTGTCACTGTCCTTGTTTGTCCTTCAGCTTTGTC  650

seq1  CCTTCTTTGTTCCTTGCTTGAGAATAAAGATCAAGTCTTATCTGTCTTAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCTTTGTTCCTTGCTTGAGAATAAAGATCAAGTCTTATCTGTCTTAA  700

seq1  GAACCCAGCATGGGCCATCAAAAGGTCATCGTGCACAGACAGTGAGTGAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACCCAGCATGGGCCATCAAAAGGTCATCGTGCACAGACAGTGAGTGAC  750

seq1  AAGAGGAGTGAAGTAGAAACTTCTAGTTTCTTTGGAAAGTTATATCAAGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGGAGTGAAGTAGAAACTTCTAGTTTCTTTGGAAAGTTATATCAAGT  800

seq1  GAAGTTTTGCTGGGGCACACAGGTGAGATGATAAGCAAACACATGAAAGA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTTTTGCTGGGGCACACAGGTGAGATGATAAGCAAACACATGAAAGA  850

seq1  ATGTCTTCCTGAAGCAGACACAGGGGAAAGGTTGTTTTGATATAGCAAAC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTCTTCCTGAAGCAGACACAGGGGAAAGGTTGTTTTGATATAGCAAAC  900

seq1  ATGAAAGGATCTGTGATGAAGGAGTATAAAAATGACCACACAGAGTGAGA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAAAGGATCTGTGATGAAGGAGTATAAAAATGACCACACAGAGTGAGA  950

seq1  GATGAGCACTGAGCATTGGTTTGGTTTGCTCCACCTCACTATTCTTCGCT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGAGCACTGAGCATTGGTTTGGTTTGCTCCACCTCACTATTCTTCGCT  1000

seq1  AAAGACACAC-ACAGTATTGGTTTGCC-TTACATAGCATTTGCCTTAGTA  1048
      |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||
seq2  AAAGACACACAACAGTATTGGTTTGCCTTTACATAGCA-TTGCC-TAGTA  1048

seq1  CTTTACTGCTATGAACAGACACCATGAAAAAGGCAACTCTT-GTAAGGGC  1097
      | |||||||||||||||||   ||||||||| ||| ||||| |||||   
seq2  C-TTACTGCTATGAACAGAACACATGAAAAA-GCACCTCTTGGTAAG---  1093

seq1  AATATTTAATTGGGG  1112
       |||||||  |||||
seq2  CATATTTA--TGGGG  1106