BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-240B02
Chromosome2 (Build37)
Map Location 68,906,682 - 68,907,851
singlet/doubletsinglet
Overlap geneLass6
Upstream geneLOC227995, B3galt1, Stk39, LOC100039683, Gm1323, 4933409G03Rik, 4932414N04Rik, LOC667443
Downstream geneNostrin, Spc25, G6pc2, Abcb11, Dhrs9, Lrp2, Bbs5, Kbtbd10, Fastkd1, Ppig, 4930578N16Rik, Phospho2, LOC433432, Klhl23, Ssb, Mettl5, 4930550G17Rik, Zfp650, Myo3b
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-240B02.b
ACCGA050331
length1,162
definitionB6Ng01-240B02.b
singlet/doubletsinglet---
BLAST hituniqueno hit data
sequence
gaattcaacaagtacctcttctcccacaactctagccaaagtgcatgcca
gagctttccacaggaatcaaccatggcttaaggtctagggttgatttcta
cacatagactgcagcataaatgtccacttctatgcatacactggatacaa
tcaaattataatagaatttcagaggacttcccgccgattacataatttct
cccattaaaaacacgctgaattaagttcagtctgaatcatacaatagtta
taaccatgagctatcttctgacttatgaccactttagtttcataaccttc
aggggatcagaatttttgatgagcttttacattcagttcaaactttaact
taccgaccgcctctatgaaagataactgtgtgcatctgtacctctgattg
caataacagattatgactgaggattcttcacatgaggaaacatgacacag
cagggggaagaaaaagggtggctccaagagccaattctatgcaaactctg
tacttgtttgggttaattttgaccagttataaaatttcttggcataaagt
aaaaagacttatttatgcacataacattaactctccaagtagcaaattct
ttgcatacctttggtataaaatttacaattcatatgcccctatcactctt
aaaaaccagtaggataatatgtatactggtaacaaaaataaaactgcttt
attgtactgtgagactaaactgggttataagcagttttcagatagatcaa
tgtgactcttagaaaatctattaaaacagtgatttttctgttaaacaatc
aaccattcaaatgtggactggtcaaagcttccagtttcctattagccaat
gatgctaacaaagctcactttggacacacatttgcatggtaatctaaagt
ctcagatttgccaatttaacccactaagcgacagctgatagtttcaaagc
accatccattacaccacgggacagctggtctggggacttgcaagttctgg
attttgtcttcctcagatgaaaaggaaaaggtttacctctagcagagcat
cggctgagtcgtgagaacgaaggaccaggggttcctactcggccatgttg
ttgacatatgaaagttattaagaaattgttgcaaggtggtgccagactat
gcgaagtcctca
quality valuesOpen.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_68906682_68907851
seq2: B6Ng01-240B02.b_43_1204 (reverse)

seq1  TGAGGACTTCGGCATTATGTTCCTGCACCACCTTGCAACAATTTTCTTAA  50
      |||||||||||     ||  ||  ||||||||||||||||| ||||||||
seq2  TGAGGACTTCG----CATAGTCTGGCACCACCTTGCAACAA-TTTCTTAA  45

seq1  TAACCTTTTCATATGTCAACAACATGGCCCGAGTAGGAA-CCCTGGTCCT  99
      ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||
seq2  TAAC--TTTCATATGTCAACAACATGG-CCGAGTAGGAACCCCTGGTCCT  92

seq1  CTGTCTTCACGACTCAGCCGATGCTCTGCTAGAGGTAAACCTTTT-CTTT  148
        ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  TCGTTCTCACGACTCAGCCGATGCTCTGCTAGAGGTAAACCTTTTCCTTT  142

seq1  TCATCTTGAGGAAGACAAAATCCAGAACTTGCAAAGTCCCCAGACCAGCT  198
      ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  TCATC-TGAGGAAGACAAAATCCAGAACTTGC-AAGTCCCCAGACCAGCT  190

seq1  GTCCCGTGGTGTAATGGATGGTGCTTTGAAACTATCAGCTGTCGCTTAGT  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCCGTGGTGTAATGGATGGTGCTTTGAAACTATCAGCTGTCGCTTAGT  240

seq1  GGGTTAAATTGGCAAATCTGAGACTTTAGATTACCATGCAAATGTGTGTC  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTTAAATTGGCAAATCTGAGACTTTAGATTACCATGCAAATGTGTGTC  290

seq1  CAAAGTGAGCTTTGTTAGCATCATTGGCTAATAGGAAACTGGAAGCTTTG  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGTGAGCTTTGTTAGCATCATTGGCTAATAGGAAACTGGAAGCTTTG  340

seq1  ACCAGTCCACATTTGAATGGTTGATTGTTTAACAGAAAAATCACTGTTTT  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAGTCCACATTTGAATGGTTGATTGTTTAACAGAAAAATCACTGTTTT  390

seq1  AATAGATTTTCTAAGAGTCACATTGATCTATCTGAAAACTGCTTATAACC  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAGATTTTCTAAGAGTCACATTGATCTATCTGAAAACTGCTTATAACC  440

seq1  CAGTTTAGTCTCACAGTACAATAAAGCAGTTTTATTTTTGTTACCAGTAT  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTTTAGTCTCACAGTACAATAAAGCAGTTTTATTTTTGTTACCAGTAT  490

seq1  ACATATTATCCTACTGGTTTTTAAGAGTGATAGGGGCATATGAATTGTAA  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATATTATCCTACTGGTTTTTAAGAGTGATAGGGGCATATGAATTGTAA  540

seq1  ATTTTATACCAAAGGTATGCAAAGAATTTGCTACTTGGAGAGTTAATGTT  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTATACCAAAGGTATGCAAAGAATTTGCTACTTGGAGAGTTAATGTT  590

seq1  ATGTGCATAAATAAGTCTTTTTACTTTATGCCAAGAAATTTTATAACTGG  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGCATAAATAAGTCTTTTTACTTTATGCCAAGAAATTTTATAACTGG  640

seq1  TCAAAATTAACCCAAACAAGTACAGAGTTTGCATAGAATTGGCTCTTGGA  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAAATTAACCCAAACAAGTACAGAGTTTGCATAGAATTGGCTCTTGGA  690

seq1  GCCACCCTTTTTCTTCCCCCTGCTGTGTCATGTTTCCTCATGTGAAGAAT  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCACCCTTTTTCTTCCCCCTGCTGTGTCATGTTTCCTCATGTGAAGAAT  740

seq1  CCTCAGTCATAATCTGTTATTGCAATCAGAGGTACAGATGCACACAGTTA  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCAGTCATAATCTGTTATTGCAATCAGAGGTACAGATGCACACAGTTA  790

seq1  TCTTTCATAGAGGCGGTCGGTAAGTTAAAGTTTGAACTGAATGTAAAAGC  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTCATAGAGGCGGTCGGTAAGTTAAAGTTTGAACTGAATGTAAAAGC  840

seq1  TCATCAAAAATTCTGATCCCCTGAAGGTTATGAAACTAAAGTGGTCATAA  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCAAAAATTCTGATCCCCTGAAGGTTATGAAACTAAAGTGGTCATAA  890

seq1  GTCAGAAGATAGCTCATGGTTATAACTATTGTATGATTCAGACTGAACTT  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAGAAGATAGCTCATGGTTATAACTATTGTATGATTCAGACTGAACTT  940

seq1  AATTCAGCGTGTTTTTAATGGGAGAAATTATGTAATCGGCGGGAAGTCCT  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTCAGCGTGTTTTTAATGGGAGAAATTATGTAATCGGCGGGAAGTCCT  990

seq1  CTGAAATTCTATTATAATTTGATTGTATCCAGTGTATGCATAGAAGTGGA  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAAATTCTATTATAATTTGATTGTATCCAGTGTATGCATAGAAGTGGA  1040

seq1  CATTTATGCTGCAGTCTATGTGTAGAAATCAACCCTAGACCTTAAGCCAT  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTATGCTGCAGTCTATGTGTAGAAATCAACCCTAGACCTTAAGCCAT  1090

seq1  GGTTGATTCCTGTGGAAAGCTCTGGCATGCACTTTGGCTAGAGTTGTGGG  1148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTGATTCCTGTGGAAAGCTCTGGCATGCACTTTGGCTAGAGTTGTGGG  1140

seq1  AGAAGAGGTACTTGTTGAATTC  1170
      ||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGAGGTACTTGTTGAATTC  1162