seq1: chr2_180477256_180478292
seq2: B6Ng01-247A22.b_47_1074 (reverse)
seq1 AACACCCAAGCAAGCAAACAAAACTGGTTCCACCCAAGTTTAATTTGATG 50
||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||
seq2 AACACCC-AGC-AGCAAAC-AAACTGG-TCCACCCAAGTTT-ATTTGATG 45
seq1 AACCAATGGGTTTGGTTTTGGTTTGTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTTGTT 100
|||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||
seq2 AACCAATGGGTTTGGTTT--GGTTGTTTTG-TTTTGTTTTTG-TTTTGTT 91
seq1 TTGAGACAGGACCTTACTGTATAATAGCCCTCACTGTTTTGGGAACTCAT 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTGAGACAGGACCTTACTGTATAATAGCCCTCACTGTTTTGGGAACTCAT 141
seq1 TATGTAGGCCAGGATGGTGTTAAACTCATGGAGATCCTCCTGCCTCTGCC 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TATGTAGGCCAGGATGGTGTTAAACTCATGGAGATCCTCCTGCCTCTGCC 191
seq1 TCTCACATGCTGAGGGTTAAAGGCGTGAGCCACCACTGCACAGGTTACCA 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TCTCACATGCTGAGGGTTAAAGGCGTGAGCCACCACTGCACAGGTTACCA 241
seq1 GTGAGTTTAATTGGAGTTATTTACAGGAACATGGGCAACTTACAGGTGGC 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GTGAGTTTAATTGGAGTTATTTACAGGAACATGGGCAACTTACAGGTGGC 291
seq1 TATACCACACAGGAAAAGTCTTCATTCCGAAATCATTGGTGAGGAGGGGG 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TATACCACACAGGAAAAGTCTTCATTCCGAAATCATTGGTGAGGAGGGGG 341
seq1 GTTTGCATGGCTAAACTGCCTCATGACTTCTGCTCTGTGAGGAGTGCTAA 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GTTTGCATGGCTAAACTGCCTCATGACTTCTGCTCTGTGAGGAGTGCTAA 391
seq1 TGTACTCAGTCCTGTGAGGGGCTCGCGCCAGACATCATTTCAGAATGGCC 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGTACTCAGTCCTGTGAGGGGCTCGCGCCAGACATCATTTCAGAATGGCC 441
seq1 ATGCCATGCCCGGAGGAGAGTTTTCCCTTGTATCATCTCCTAAGGCAGGG 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ATGCCATGCCCGGAGGAGAGTTTTCCCTTGTATCATCTCCTAAGGCAGGG 491
seq1 CAGAAGGCTCAGTGAGTGAAATGTTTGCTGAACAGCACGAAGGCCTGGGT 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CAGAAGGCTCAGTGAGTGAAATGTTTGCTGAACAGCACGAAGGCCTGGGT 541
seq1 CTGGCTTCCCAGAACCCACACACCAAAGCCAAGCACAGTGATAGAGTGAT 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTGGCTTCCCAGAACCCACACACCAAAGCCAAGCACAGTGATAGAGTGAT 591
seq1 GTGCGCCATAACCCCACCCAACAAATCTTGGAGCACACTGACCAGCCATT 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GTGCGCCATAACCCCACCCAACAAATCTTGGAGCACACTGACCAGCCATT 641
seq1 CTAGTGTAAATGGTGAACTTCAGATGTAGTGAGAGACCTTGACTCAAAAA 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTAGTGTAAATGGTGAACTTCAGATGTAGTGAGAGACCTTGACTCAAAAA 691
seq1 TGGAGTTACTGTAGAAGAAAACATCTGTGTCCACTTCCAGCCTCTTCATG 750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGGAGTTACTGTAGAAGAAAACATCTGTGTCCACTTCCAGCCTCTTCATG 741
seq1 CACCAGCCTGGGCTAGCAGTGACATAGGTTAGACCCTCTCTGCTGTCCTG 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CACCAGCCTGGGCTAGCAGTGACATAGGTTAGACCCTCTCTGCTGTCCTG 791
seq1 GTGCACGAGCAGTGCTCGCTCACCCATCTGCACAACTCCTGTCAGAAGTG 850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GTGCACGAGCAGTGCTCGCTCACCCATCTGCACAACTCCTGTCAGAAGTG 841
seq1 TGCACAAATCTCCAGAGCAAGATGCCCTGAGCCAGGTGTGCCATGAAGTA 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGCACAAATCTCCAGAGCAAGATGCCCTGAGCCAGGTGTGCCATGAAGTA 891
seq1 ACCTGTGAGCACAAACTTTCTTCTGTGGTCTTCCAATTTTGAATAAAAAT 950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ACCTGTGAGCACAAACTTTCTTCTGTGGTCTTCCAATTTTGAATAAAAAT 941
seq1 ACTCTTTTAAGACTGGTGTGTTAGGGGCTGGAGAGATGACTCAGCAGTTA 1000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ACTCTTTTAAGACTGGTGTGTTAGGGGCTGGAGAGATGACTCAGCAGTTA 991
seq1 AGAGCAGTCTGACTGCTCTTCCAGAGGTCCTGAATTC 1037
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AGAGCAGTCTGACTGCTCTTCCAGAGGTCCTGAATTC 1028
| seq1: chr2_180336419_180336481
seq2: B6Ng01-247A22.g_75_137
seq1 TGTGGATGGTGTCCACAACTGACTGGGCCCTGTGCCATTGCTCCACTTTG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGTGGATGGTGTCCACAACTGACTGGGCCCTGTGCCATTGCTCCACTTTG 50
seq1 GGGGGTGGGGGGA 63
|||||||||||||
seq2 GGGGGTGGGGGGA 63
|