BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-247L08
Chromosome2 (Build37)
Map Location 93,712,488 - 93,882,164
singlet/doubletdoublet
Overlap geneGm1335, LOC620695, Alkbh3, Hsd17b12
Upstream geneSyt13, LOC100042784, Trp53i11, C230071H18Rik, Tspan18, LOC100042789, LOC639658, Cd82, Alx4, Ext2, 2610203E10Rik, Gm1967
Downstream geneE530001K10Rik, Ttc17, Itpa-ps1, Api5, LOC100043259
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-247L08.bB6Ng01-247L08.g
ACCGA055973GA055974
length6351,181
definitionB6Ng01-247L08.b B6Ng01-247L08.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(93,881,533 - 93,882,164)(93,712,488 - 93,713,650)
sequence
gaattcagaccccacaaggcatcagtgctcttgctacttatttatgttga
ggctagagcaaactgtggaatgtcctctgtgttctctgccctgtgaagtg
cccatgactcattttaacgcctctttcctcgaagctagtttccttagatt
ctctgcctgataggaatctaatatggctagaaaccaccccacatcacctc
ttcaggactgtctcacactgccgccaagctccttctgtccctgagctctg
gacaaaaggctcaggttccagtgcatcttccctgagtccctatctcaggc
cttagacacttggattttccttcttcccggagcctcacatgcctctgtct
gctgctgggcctgctcaccaagtggtttttttgtttgtttcttttcttga
gaaagtgtattatagtatagaccaggctggccttgaacttacaaagcacc
tgcctctgcctcctgcctgctgggtaaaagccatacaccagcactcccag
gttgcaatgtgtttcctgagcaaagctgtttgctacctctgtgttgctaa
tgtttctccccctgccccctatcttttcaactactgaagaccgatgggga
ggagtaaaaggaacttgtgctttcatccttcaaag
gaattctgaacccgatttgcaaacaacaacatctggccccgttagagagc
agcaggagcaaattagccttgctcagtcataagcacatacgcacagtatg
tgtctcagtcacaagcagcccgtgggccacatgcactctggaatggactg
aaggcgtgagaggatgctattacctagggagctagacaaaagcctgcggg
aacctagggagtatgcagctctgtggagtagtcttacaggcagaacagca
gcaaatgaaaaggccctgggggtagcaatggctccagggctgctatttat
gaaaaatggatttccgaattagcaaacaaagctaggactttggtttctat
tctaaatgtggggagggaaaaaaaaaaaaaaaaacaaagcccagattttt
ctggacctgtctgtcatgggttgctcgctgcagttgagccaggggcaggc
agccaatggccatgcgagttatacctgtgcttggagccacttagagattg
tctttgctgtgaggttatcaccctggtttctgtgagcccagtgtagcagt
ctcagccagggccctgctaaccaatgccacgcctcatccacgtttaatgc
cccaagccctggtaggacctctgctagagaaataggggatgggtctcagt
ggcctctcaccccaccctaacctttatcttcatggtgttagagaagccat
gcttcccacagacatcccagaaggctgagaatcatattctaaggcacact
cagtgggtccacaggggagcctctgagtgctccctgcccctcctccctcc
tctgagtgctccctgcccctcctctctcctttgagtgctccctgcccctc
ctccctcctctgagtgctcctgccccttcctccctccttttgagtgctcc
ctgccccttcctccctcctttgagtgctccatgcccctcctcccttcttc
tgctctctccctgccccttctctgtgtttctctggggttccttccttcca
tctcattaggctgcagaagaagtggttctgatagcaggcctcctctctcc
tccctcaggtcttagtttgacctggtatccgatttcctctttcaatatgg
attagactcttctgggcccagagactggttctgcagagagctgtgtgcta
agactctccctggggacctctttccaattgt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_93881533_93882164
seq2: B6Ng01-247L08.b_48_682 (reverse)

seq1  CTTTGAAGGATGTATGCACAAGTTCCTTTTGCTCCTCCCCATCGGTCTTC  50
      |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  CTTTGAAGGATGAAAGCACAAGTTCCTTTTACTCCTCCCCATCGGTCTTC  50

seq1  AGTTGTTG-AAAGATAGGGGGCAGGGGGAG-AACATTAGCAACACCGAGG  98
      ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||
seq2  AGTAGTTGAAAAGATAGGGGGCAGGGGGAGAAACATTAGCAACACAGAGG  100

seq1  TAGCAAACAGCTTTGCTCAGG-AACACATTGCAACCTGGGAGTGCTGGTG  147
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCAAACAGCTTTGCTCAGGAAACACATTGCAACCTGGGAGTGCTGGTG  150

seq1  TATGGCTTTTACCCAGCAGGCAGGAGGCAGAGGCAGGTGCTTTGTAAGTT  197
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGCTTTTACCCAGCAGGCAGGAGGCAGAGGCAGGTGCTTTGTAAGTT  200

seq1  CAAGGCCAGCCTGGTCTATACTATAATACACTTTCTCAAGAAAAGAAACA  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGGCCAGCCTGGTCTATACTATAATACACTTTCTCAAGAAAAGAAACA  250

seq1  AACAAAAAAACCACTTGGTGAGCAGGCCCAGCAGCAGACAGAGGCATGTG  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAAAAAACCACTTGGTGAGCAGGCCCAGCAGCAGACAGAGGCATGTG  300

seq1  AGGCTCCGGGAAGAAGGAAAATCCAAGTGTCTAAGGCCTGAGATAGGGAC  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTCCGGGAAGAAGGAAAATCCAAGTGTCTAAGGCCTGAGATAGGGAC  350

seq1  TCAGGGAAGATGCACTGGAACCTGAGCCTTTTGTCCAGAGCTCAGGGACA  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGGGAAGATGCACTGGAACCTGAGCCTTTTGTCCAGAGCTCAGGGACA  400

seq1  GAAGGAGCTTGGCGGCAGTGTGAGACAGTCCTGAAGAGGTGATGTGGGGT  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGAGCTTGGCGGCAGTGTGAGACAGTCCTGAAGAGGTGATGTGGGGT  450

seq1  GGTTTCTAGCCATATTAGATTCCTATCAGGCAGAGAATCTAAGGAAACTA  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTCTAGCCATATTAGATTCCTATCAGGCAGAGAATCTAAGGAAACTA  500

seq1  GCTTCGAGGAAAGAGGCGTTAAAATGAGTCATGGGCACTTCACAGGGCAG  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCGAGGAAAGAGGCGTTAAAATGAGTCATGGGCACTTCACAGGGCAG  550

seq1  AGAACACAGAGGACATTCCACAGTTTGCTCTAGCCTCAACATAAATAAGT  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAACACAGAGGACATTCCACAGTTTGCTCTAGCCTCAACATAAATAAGT  600

seq1  AGCAAGAGCACTGATGCCTTGTGGGGTCTGAATTC  632
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAAGAGCACTGATGCCTTGTGGGGTCTGAATTC  635

seq1: chr2_93712488_93713650
seq2: B6Ng01-247L08.g_64_1244

seq1  GAATTCTGAACCCGATTTGCAAACAACAACATCTGGCCCCGTTAGAGAGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGAACCCGATTTGCAAACAACAACATCTGGCCCCGTTAGAGAGC  50

seq1  AGCAGGAGCAAATTAGCCTTGCTCAGTCATAAGCACATACGCACAGTATG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGGAGCAAATTAGCCTTGCTCAGTCATAAGCACATACGCACAGTATG  100

seq1  TGTCTCAGTCACAAGCAGCCCGTGGGCCACATGCACTCTGGAATGGACTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTCAGTCACAAGCAGCCCGTGGGCCACATGCACTCTGGAATGGACTG  150

seq1  AAGGCGTGAGAGGATGCTATTACCTAGGGAGCTAGACAAAAGCCTGCGGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCGTGAGAGGATGCTATTACCTAGGGAGCTAGACAAAAGCCTGCGGG  200

seq1  AACCTAGGGAGTATGCAGCTCTGTGGAGTAGTCTTACAGGCAGAACAGCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCTAGGGAGTATGCAGCTCTGTGGAGTAGTCTTACAGGCAGAACAGCA  250

seq1  GCAAATGAAAAGGCCCTGGGGGTAGCAATGGCTCCAGGGCTGCTATTTAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAATGAAAAGGCCCTGGGGGTAGCAATGGCTCCAGGGCTGCTATTTAT  300

seq1  GAAAAATGGATTTCCGAATTAGCAAACAAAGCTAGGACTTTGGTTTCTAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAAATGGATTTCCGAATTAGCAAACAAAGCTAGGACTTTGGTTTCTAT  350

seq1  TCTAAATGTGGGGAGGGAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAGCCCAGATTTTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAAATGTGGGGAGGGAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAGCCCAGATTTTT  400

seq1  CTGGACCTGTCTGTCATGGGTTGCTCGCTGCAGTTGAGCCAGGGGCAGGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGACCTGTCTGTCATGGGTTGCTCGCTGCAGTTGAGCCAGGGGCAGGC  450

seq1  AGCCAATGGCCATGCGAGTTATACCTGTGCTTGGAGCCACTTAGAGATTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCAATGGCCATGCGAGTTATACCTGTGCTTGGAGCCACTTAGAGATTG  500

seq1  TCTTTGCTGTGAGGTTATCACCCTGGTTTCTGTGAGCCCAGTGTAGCAGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTGCTGTGAGGTTATCACCCTGGTTTCTGTGAGCCCAGTGTAGCAGT  550

seq1  CTCAGCCAGGGCCCTGCTAACCAATGCCACGCCTCATCCACGTTTAATGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGCCAGGGCCCTGCTAACCAATGCCACGCCTCATCCACGTTTAATGC  600

seq1  CCCAAGCCCTGGTAGGACCTCTGCTAGAGAAATAGGGGATGGGTCTCAGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAAGCCCTGGTAGGACCTCTGCTAGAGAAATAGGGGATGGGTCTCAGT  650

seq1  GGCCTCTCACCCCACCCTAACCTTTATCTTCATGGTGTTAGAGAAGCCAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCTCTCACCCCACCCTAACCTTTATCTTCATGGTGTTAGAGAAGCCAT  700

seq1  GCTTCCCACAGACATCCCAGAAGGCTGAGAATCATATTCTAAGGCACACT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCCCACAGACATCCCAGAAGGCTGAGAATCATATTCTAAGGCACACT  750

seq1  CAGTGGGTCCACAGGGGAGCCTCTGAGTGCTCCCTGCCCCTCCTCCCTCC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGGGTCCACAGGGGAGCCTCTGAGTGCTCCCTGCCCCTCCTCCCTCC  800

seq1  TCTGAGTGCTCCCTGCCCCTCCTCTCTCCTTTGAGTGCTCCCTGCCCCTC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGAGTGCTCCCTGCCCCTCCTCTCTCCTTTGAGTGCTCCCTGCCCCTC  850

seq1  CTCCCTCCTCTGAGTGCTCCCTGCCCC-TCCTCCCTCC-TTTGAGTGCTC  898
      |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||
seq2  CTCCCTCCTCTGAGTGCT-CCTGCCCCTTCCTCCCTCCTTTTGAGTGCTC  899

seq1  CCTGCCCC-TCCTCCCTCCTTTGAGTGCTCCATGCCCCTCCTCCCTTC-T  946
      |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  CCTGCCCCTTCCTCCCTCCTTTGAGTGCTCCATGCCCCTCCTCCCTTCTT  949

seq1  CTGCTCTCTCCCCTGCCCC-TCTCTGTGTTTTCTCTGGGGTT-CTTCC-T  993
      ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |
seq2  CTGCTCTCT-CCCTGCCCCTTCTCTGTG-TTTCTCTGGGGTTCCTTCCTT  997

seq1  CCATCTCATTAGGCTGCAGA--GAGTGGTTCTGATAGCAGGCC-CCTCTC  1040
      ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||
seq2  CCATCTCATTAGGCTGCAGAAGAAGTGGTTCTGATAGCAGGCCTCCTCTC  1047

seq1  T-CTCCCTCAGGTCTTAGTCTGACCTGGTATCCGA-TTCCTCTTCAAATA  1088
      | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||
seq2  TCCTCCCTCAGGTCTTAGTTTGACCTGGTATCCGATTTCCTCTTTCAATA  1097

seq1  TGAATAAGACTCTTCTGG--CCAGAG-CT-GTTCTGCAGGAGAGC--TGT  1132
      || || ||||||||||||  |||||| || |||||||| ||||||  |||
seq2  TGGATTAGACTCTTCTGGGCCCAGAGACTGGTTCTGCA-GAGAGCTGTGT  1146

seq1  GCTAGGTCT-TCCCTGGG---CTCTTTCCATTTGT  1163
      |||| | || ||||||||   ||||||||| ||||
seq2  GCTAAGACTCTCCCTGGGGACCTCTTTCCAATTGT  1181