BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-255O03
Chromosome2 (Build37)
Map Location 166,532,946 - 166,635,815
singlet/doubletdoublet
Overlap geneBC067047, Trp53rk, Arfgef2
Upstream geneEya2, Prkcbp1, LOC546780, Ncoa3, Sulf2, LOC670775, Ppia-ps2_2197.1
Downstream geneLOC670802, Cse1l, Stau1, LOC383774, Ddx27, AI481105, 1500012F01Rik, LOC668950, Kcnb1, Ptgis, LOC668951, B4galt5, Slc9a8, Spata2, Zfp313, Snai1, Ube2v1, AI840826, Cebpb
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-255O03.bB6Ng01-255O03.g
ACCGA061982GA061983
length1,172687
definitionB6Ng01-255O03.b B6Ng01-255O03.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(166,634,642 - 166,635,815)(166,532,946 - 166,533,537)
sequence
gaattcagaaacagcagctagtgcatagatgctatatgacatgaacccac
agccagtttccgatgacaaatagatacatgtttgtttttatactttcatg
atggctgagcatgacagctaacaattacaagaacactttggccctttcat
atgctttgttcatattaaattattaaatggattctctctctctctctctc
tctcacaacacacacacacacacacacacacacacacatacacacacaag
aggatcattaggttgattcagttaaactgtagacaaaatttcccaaattt
aacttaagtctttttattttttcctttttgattaaccttccaaactccat
acaatttaaaaacagaatataaagagacatggagaaagatgggccataat
aaggcaattacaaaaggaaggttttaagattggaattaaactcccaaaca
gagggctggagccgaaagtcaggagatgattaaggcatgtccgggcttca
ttaaagggacaagagcaacagtgtccttggggagaaatactctcccaggc
ccttggtttcccctgcctaggacaccagccctgatttggacagtcatcta
cctatgcaactgatactcagagagatgactcactgagtcactccaatcct
gttctaccctgctcatcgctgctgttacaaaagacaactcctgtcctcac
tgcatttaacagatcagcactgtaaggagcacagccttctgtcacaggat
cttcttctttctttcttttttttttttttagaacagatttatttattttc
gtgagtttgtctacacgtatgtacagcgcatatcatgtgtgtgtctggtg
ctcacagaagccaaaagagggtgttagatgccctggcactggagttacag
actgctgcgaaccacttactatataggtgctcagagtaaaccaaagtctt
ctggaaagggatcagcactaaagctcctatttgccaagcaacttctccag
tcccgtaattactcttatttatataatctacaaacaagcaagatcactaa
gtgactcctgaagactaatagatgctgtggctataatcgaggcagcaagc
atctgcaaagcacctgccttacctcagagttggcacattgcaagatactt
ctttaacagcaagacttgacaa
gaattcccccaacagccaggtatggtggacggagtagcaacaggtacagc
tacatcctcattgccagcttggggggctctgacccaggaagccagcgggt
agctggcgagagcagggcctcatccccacacccctaggccctgagtcggt
ctgagcaaattcagtcaggcccactgagttcatcaggtgtggggaactga
agggaggctctgtgggagaactgcgggatatggaaatggcttcgagagaa
tgactaaagatcacagggagctaatgaagttagcgccccctctccatgct
ttgtaaccaatcttgatctctggaggaagcaattgatgcaaattcatggg
ctcttcccgggctatcttagaccttgcttgtgttacgttttattatctca
gttgtgaacctctgggatgacctgacatctactgagaaaggaccacaaca
gactctcagggctttgcctaggctatgtaacgccacaatttgttatgcca
cgggtggcttgggatgtctccttgtcacctgcaaaaagttcttgttatat
agatgacataaggttgggtgttttgcaactctggaaagccaatgatactt
ctacctaccctgaaaccctgctggggctgggtgatttgaaaaggctgcta
agtgacaaccctagtcccggggtggggagggggatgg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_166634642_166635815
seq2: B6Ng01-255O03.b_45_1216 (reverse)

seq1  TTGTC-AGTGTTGCTGTTAAAATGAAGTTACTTGGCATGTGCAAACTCTT  49
      ||||| ||| |||||||||||  |||||  ||||  |||||| ||||| |
seq2  TTGTCAAGTCTTGCTGTTAAA--GAAGTATCTTGCAATGTGCCAACTC-T  47

seq1  GGGGTAGAGCAGGTGCTCTGCAGATGCTTGCTGCCTCGATTATTAGCACA  99
      | ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||
seq2  GAGGTAAGGCAGGTGCTTTGCAGATGCTTGCTGCCTCGATTATAGCCACA  97

seq1  GCATCTATTAGTCTTTCAGGAGTCACTTAGTGATC-TGCTTGGTTTGTAG  148
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||
seq2  GCATCTATTAGTC-TTCAGGAGTCACTTAGTGATCTTGCTT-GTTTGTAG  145

seq1  ATATAATAAATAAGAGTAATTACGGGACTGGAGAGTTGGCTTGGCAAATA  198
      ||   |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||
seq2  ATTATATAAATAAGAGTAATTACGGGACTGGAGAAGTTGCTTGGCAAATA  195

seq1  GGAGCTTTAGTGCTGATCCC-TTCCAGAAGACTTTGGTTTACTCTGAGCA  247
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGCTTTAGTGCTGATCCCTTTCCAGAAGACTTTGGTTTACTCTGAGCA  245

seq1  CCTATATAGTAAGTGGTTCGCAGCAGTCTGTAACTCCAGTGCCAGGGCAT  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTATATAGTAAGTGGTTCGCAGCAGTCTGTAACTCCAGTGCCAGGGCAT  295

seq1  CTAACACCCTCTTTTGGCTTCTGTGAGCACCAGACACACACATGATATGC  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAACACCCTCTTTTGGCTTCTGTGAGCACCAGACACACACATGATATGC  345

seq1  GCTGTACATACGTGTAGACAAACTCACGAAAATAAATAAATCTGTTCTAA  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTACATACGTGTAGACAAACTCACGAAAATAAATAAATCTGTTCTAA  395

seq1  AAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAGAAGATCCTGTGACAGAAGGCTGTGCT  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAGAAGATCCTGTGACAGAAGGCTGTGCT  445

seq1  CCTTACAGTGCTGATCTGTTAAATGCAGTGAGGACAGGAGTTGTCTTTTG  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTACAGTGCTGATCTGTTAAATGCAGTGAGGACAGGAGTTGTCTTTTG  495

seq1  TAACAGCAGCGATGAGCAGGGTAGAACAGGATTGGAGTGACTCAGTGAGT  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACAGCAGCGATGAGCAGGGTAGAACAGGATTGGAGTGACTCAGTGAGT  545

seq1  CATCTCTCTGAGTATCAGTTGCATAGGTAGATGACTGTCCAAATCAGGGC  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTCTCTGAGTATCAGTTGCATAGGTAGATGACTGTCCAAATCAGGGC  595

seq1  TGGTGTCCTAGGCAGGGGAAACCAAGGGCCTGGGAGAGTATTTCTCCCCA  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTGTCCTAGGCAGGGGAAACCAAGGGCCTGGGAGAGTATTTCTCCCCA  645

seq1  AGGACACTGTTGCTCTTGTCCCTTTAATGAAGCCCGGACATGCCTTAATC  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGACACTGTTGCTCTTGTCCCTTTAATGAAGCCCGGACATGCCTTAATC  695

seq1  ATCTCCTGACTTTCGGCTCCAGCCCTCTGTTTGGGAGTTTAATTCCAATC  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTCCTGACTTTCGGCTCCAGCCCTCTGTTTGGGAGTTTAATTCCAATC  745

seq1  TTAAAACCTTCCTTTTGTAATTGCCTTATTATGGCCCATCTTTCTCCATG  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAACCTTCCTTTTGTAATTGCCTTATTATGGCCCATCTTTCTCCATG  795

seq1  TCTCTTTATATTCTGTTTTTAAATTGTATGGAGTTTGGAAGGTTAATCAA  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTTTATATTCTGTTTTTAAATTGTATGGAGTTTGGAAGGTTAATCAA  845

seq1  AAAGGAAAAAATAAAAAGACTTAAGTTAAATTTGGGAAATTTTGTCTACA  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGAAAAAATAAAAAGACTTAAGTTAAATTTGGGAAATTTTGTCTACA  895

seq1  GTTTAACTGAATCAACCTAATGATCCTCTTGTGTGTGTATGTGTGTGTGT  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTAACTGAATCAACCTAATGATCCTCTTGTGTGTGTATGTGTGTGTGT  945

seq1  GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAATCCA  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAATCCA  995

seq1  TTTAATAATTTAATATGAACAAAGCATATGAAAGGGCCAAAGTGTTCTTG  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAATAATTTAATATGAACAAAGCATATGAAAGGGCCAAAGTGTTCTTG  1045

seq1  TAATTGTTAGCTGTCATGCTCAGCCATCATGAAAGTATAAAAACAAACAT  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTGTTAGCTGTCATGCTCAGCCATCATGAAAGTATAAAAACAAACAT  1095

seq1  GTATCTATTTGTCATCGGAAACTGGCTGTGGGTTCATGTCATATAGCATC  1147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATCTATTTGTCATCGGAAACTGGCTGTGGGTTCATGTCATATAGCATC  1145

seq1  TATGCACTAGCTGCTGTTTCTGAATTC  1174
      |||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCACTAGCTGCTGTTTCTGAATTC  1172

seq1: chr2_166532946_166533537
seq2: B6Ng01-255O03.g_162_753

seq1  CGGGTAGCTGGCGAGAGCAGGGCCTCATCCCCACACCCCTAGGCCCTGAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGGTAGCTGGCGAGAGCAGGGCCTCATCCCCACACCCCTAGGCCCTGAG  50

seq1  TCGGTCTGAGCAAATTCAGTCAGGCCCACTGAGTTCATCAGGTGTGGGGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGGTCTGAGCAAATTCAGTCAGGCCCACTGAGTTCATCAGGTGTGGGGA  100

seq1  ACTGAAGGGAGGCTCTGTGGGAGAACTGCGGGATATGGAAATGGCTTCGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGAAGGGAGGCTCTGTGGGAGAACTGCGGGATATGGAAATGGCTTCGA  150

seq1  GAGAATGACTAAAGATCACAGGGAGCTAATGAAGTTAGCGCCCCCTCTCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAATGACTAAAGATCACAGGGAGCTAATGAAGTTAGCGCCCCCTCTCC  200

seq1  ATGCTTTGTAACCAATCTTGATCTCTGGAGGAAGCAATTGATGCAAATTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTTTGTAACCAATCTTGATCTCTGGAGGAAGCAATTGATGCAAATTC  250

seq1  ATGGGCTCTTCCCGGGCTATCTTAGACCTTGCTTGTGTTACGTTTTATTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGGCTCTTCCCGGGCTATCTTAGACCTTGCTTGTGTTACGTTTTATTA  300

seq1  TCTCAGTTGTGAACCTCTGGGATGACCTGACATCTACTGAGAAAGGACCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCAGTTGTGAACCTCTGGGATGACCTGACATCTACTGAGAAAGGACCA  350

seq1  CAACAGACTCTCAGGGCTTTGCCTAGGCTATGTAACGCCACAATTTGTTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACAGACTCTCAGGGCTTTGCCTAGGCTATGTAACGCCACAATTTGTTA  400

seq1  TGCCACGGGTGGCTTGGGATGTCTCCTTGTCACCTGCAAAAAGTTCTTGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCACGGGTGGCTTGGGATGTCTCCTTGTCACCTGCAAAAAGTTCTTGT  450

seq1  TATATAGATGACATAAGGTTGGGTGTTTTGCAACTCTGGAAAGCCAATGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATAGATGACATAAGGTTGGGTGTTTTGCAACTCTGGAAAGCCAATGA  500

seq1  TACTTCTACCTACCCTGAAACCCTGCTGGGGCTGGGTGATTTGAAAAGGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTCTACCTACCCTGAAACCCTGCTGGGGCTGGGTGATTTGAAAAGGC  550

seq1  TGCTAAGTGACAACCCTAGTCCCGGGGTGGGGAGGGGGATGG  592
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTAAGTGACAACCCTAGTCCCGGGGTGGGGAGGGGGATGG  592