BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-264A04
Chromosome2 (Build37)
Map Location 70,277,799 - 70,427,038
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100040021, Sp5, 4933404M02Rik, LOC100040068, Gad1
Upstream geneLrp2, Bbs5, Kbtbd10, Fastkd1, Ppig, 4930578N16Rik, Phospho2, LOC433432, Klhl23, Ssb, Mettl5, 4930550G17Rik, Zfp650, Myo3b
Downstream geneLOC100039766, Gorasp2, Tlk1, Mettl8, 4833418A01Rik, Cybrd1, Dync1i2, Slc25a12, LOC667528, Hat1, LOC100040177, Metapl1, LOC100040207, Dlx1, Dlx1as, Dlx2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-264A04.bB6Ng01-264A04.g
ACCGA068030GA068031
length9401,131
definitionB6Ng01-264A04.b B6Ng01-264A04.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(70,277,799 - 70,278,516)(70,425,906 - 70,427,038)
sequence
gaattcatccctgaggatttacagtaggtggtctcataccttgtgcaagg
gtatctgtagagtctgggtttttttaatcacttaggactaatactctgac
acctgggctctgggtggacgaggggccagatgattctgtgtaccaagttt
gatcccggagccactgttctttggtcattcgttatgatggtgaagacata
cagataaagactccaaaagattatgggatggatccctgggtatggcagtc
tctagatggtccatcttttcgtctcagctccaaactttgtctctgtaact
ccttccatgggtgttttgttcccaattctaagaagggacaaaatgtccac
actttggtctttgttcttgagtttcatgtgttttgcaaattgtatctagt
atcttgggtattctaagtttctgggctaatatccacttatcagtgagtac
atatcacgcgagttcttttgtgattgggttacctcactcaggatgatgcc
ctccaggtccatccatttgcctaggaatttcataaattcattctttttaa
tagctgagtagtactccattatgtaaatgtaccacattttctgtatccat
tcctctgttgagggaatctgggttctttccagcttctggctattataaat
aaggctgctatgcctccaaacgctgacaccattgcatataccagcaagat
tttgctgaaaggaccctgatatagctgtctcttgtgaggctatgccagtg
cttggcaaacacagaagtggatgctcacagtcagctattggatggaacac
agggctcccaatggaggagctagagaaagtacccaaggagctaaaggggt
ctgcaaccctataggtgaaacaacaatatgaactaaccagtactcccaga
gctcgtgtctctagctgcatatgtatcaaaagatggccta
gaattcacagttaaaaagccaagcaggtttatgcatgcttgtaatctcag
aactgggactaggtaaatggagacaggtgggtccttgaggcttgctgttc
agcctacctaacctgccttgtgagtttcaggccagggagagaccttgtct
caaataaatgatgcagtgcctatgtctgacttctacacacctgcaccaca
cacacacacacacacacacacacctgcacacacacacacaccttcacata
cacacctgcacacacataaacatgtacacccccataataatagtaggtct
ataactgggaaggctgaaacactaattcatcttaagatgttgtcacagaa
aagagggaagcaaggaaatgaataaaaggacctagggcaagttgggggag
ccctatgagtctcaaggagtttaagagctcatcccttagccagtaaaact
ccatccaccttagtctcagcaaacagccacaaccaaaaaagaaggcacga
gaaggtaactaaacaacagtgtggtggtaatggtggcagctacatggcgg
ggccgtggggcccatctgttctatggaattgcttcgtgtagcagagttcg
ttgagttggatttgccaagtactaagccatctgctggggcacagaagtgc
tttgctaaacagagtccctcgataaaatgggacttatgaagactagacta
tatctaacaagaaacaaagttcaatgggtgaggagatggagtcaccacat
gtcctgcaggttgggtgagtgtcacagatgcatcctgtgagtggctaccc
acgagtgctctggtcaccctcactcaaagcattcatctactcacttaagc
tggaccaaactaataatcgaggtagttctagagtggacccttcttagcac
ggcaaaacacaaaatggacaaaaatcaacaggaaaggtaaatttgggctt
gttgaggtgcttagtactgtgagtggataaaggacttttgccactaagtc
tcataactgagtttaaatccctaagaatgcattccgtagaaagacaactc
tatcttctgactctcttctttacacaacacacacaccatatcacatcaca
ccactgacagtatgactggtagactcagctt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_70277799_70278516
seq2: B6Ng01-264A04.b_47_764

seq1  GAATTCATCCCTGAGGATTTACAGTAGGTGGTCTCATACCTTGTGCAAGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATCCCTGAGGATTTACAGTAGGTGGTCTCATACCTTGTGCAAGG  50

seq1  GTATCTGTAGAGTCTGGGTTTTTTTAATCACTTAGGACTAATACTCTGAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATCTGTAGAGTCTGGGTTTTTTTAATCACTTAGGACTAATACTCTGAC  100

seq1  ACCTGGGCTCTGGGTGGACGAGGGGCCAGATGATTCTGTGTACCAAGTTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTGGGCTCTGGGTGGACGAGGGGCCAGATGATTCTGTGTACCAAGTTT  150

seq1  GATCCCGGAGCCACTGTTCTTTGGTCATTCGTTATGATGGTGAAGACATA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCCCGGAGCCACTGTTCTTTGGTCATTCGTTATGATGGTGAAGACATA  200

seq1  CAGATAAAGACTCCAAAAGATTATGGGATGGATCCCTGGGTATGGCAGTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATAAAGACTCCAAAAGATTATGGGATGGATCCCTGGGTATGGCAGTC  250

seq1  TCTAGATGGTCCATCTTTTCGTCTCAGCTCCAAACTTTGTCTCTGTAACT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAGATGGTCCATCTTTTCGTCTCAGCTCCAAACTTTGTCTCTGTAACT  300

seq1  CCTTCCATGGGTGTTTTGTTCCCAATTCTAAGAAGGGACAAAATGTCCAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCCATGGGTGTTTTGTTCCCAATTCTAAGAAGGGACAAAATGTCCAC  350

seq1  ACTTTGGTCTTTGTTCTTGAGTTTCATGTGTTTTGCAAATTGTATCTAGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTGGTCTTTGTTCTTGAGTTTCATGTGTTTTGCAAATTGTATCTAGT  400

seq1  ATCTTGGGTATTCTAAGTTTCTGGGCTAATATCCACTTATCAGTGAGTAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTGGGTATTCTAAGTTTCTGGGCTAATATCCACTTATCAGTGAGTAC  450

seq1  ATATCACGCGAGTTCTTTTGTGATTGGGTTACCTCACTCAGGATGATGCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATCACGCGAGTTCTTTTGTGATTGGGTTACCTCACTCAGGATGATGCC  500

seq1  CTCCAGGTCCATCCATTTGCCTAGGAATTTCATAAATTCATTCTTTTTAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCAGGTCCATCCATTTGCCTAGGAATTTCATAAATTCATTCTTTTTAA  550

seq1  TAGCTGAGTAGTACTCCATTATGTAAATGTACCACATTTTCTGTATCCAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCTGAGTAGTACTCCATTATGTAAATGTACCACATTTTCTGTATCCAT  600

seq1  TCCTCTGTTGAGGGAATCTGGGTTCTTTCCAGCTTCTGGCTATTATAAAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCTGTTGAGGGAATCTGGGTTCTTTCCAGCTTCTGGCTATTATAAAT  650

seq1  AAGGCTGCTATGCCTCCAAACGCTGACACCATTGCATATACCAGCAAGAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCTGCTATGCCTCCAAACGCTGACACCATTGCATATACCAGCAAGAT  700

seq1  TTTGCTGAAAGGACCCTG  718
      ||||||||||||||||||
seq2  TTTGCTGAAAGGACCCTG  718

seq1: chr2_70425906_70427038
seq2: B6Ng01-264A04.g_68_1198 (reverse)

seq1  AAGCTGAGTCTACAAGTCATACTGTTTGTGTGTGTG-TGTGTGTGTGTGT  49
      ||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||| ||||  | || ||
seq2  AAGCTGAGTCTACCAGTCATACTGTCAGTG-GTGTGATGTG-ATATG-GT  47

seq1  GTGTGTGTGTGTGTGTAAGAGAGAGTCAGAGGATAGGAGTTGGTTCTTTC  99
      |||||||| |||||  |  ||||||||||| |||| ||||||  ||||| 
seq2  GTGTGTGT-TGTGTAAAGAAGAGAGTCAGAAGATA-GAGTTG--TCTTT-  92

seq1  CTACCGAATGCATTCTAAGG--ATTAAACTCAGTTATGAGACTTAGTGGC  147
      |||| ||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACGGAATGCATTCTTAGGGATTTAAACTCAGTTATGAGACTTAGTGGC  142

seq1  -AAAGTCCTTTATCCACTCACAGTACTAAGCCACCTCAACA--GCCAAAT  194
       ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||
seq2  AAAAGTCCTTTATCCACTCACAGTACTAAG-CACCTCAACAAGCCCAAAT  191

seq1  TTACCTTCCCTGTTGATTTTTGTCCATTTTGTGTTTTGCCCGTGCTAAG-  243
      ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| 
seq2  TTACCTTTCCTGTTGATTTTTGTCCATTTTGTGTTTTG-CCGTGCTAAGA  240

seq1  AGGGTCCACTCTAGAACTACCTCGATTATTAGTTTGGTCCAGCTT-AGTG  292
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  AGGGTCCACTCTAGAACTACCTCGATTATTAGTTTGGTCCAGCTTAAGTG  290

seq1  AGTAGATGAATGCTTTGAGTGAGGGTGACCAGAGCACTCGTGGGTAGCCA  342
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAGATGAATGCTTTGAGTGAGGGTGACCAGAGCACTCGTGGGTAGCCA  340

seq1  CTCACAGGATGCATCTGTGACACTCACCCAACCTGCAGGACATGTGGTGA  392
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACAGGATGCATCTGTGACACTCACCCAACCTGCAGGACATGTGGTGA  390

seq1  CTCCATCTCCTCACCCATTGAACTTTGTTTCTTGTTAGATATAGTCTAGT  442
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCATCTCCTCACCCATTGAACTTTGTTTCTTGTTAGATATAGTCTAGT  440

seq1  CTTCATAAGTCCCATTTTATCGAGGGACTCTGTTTAGCAAAGCACTTCTG  492
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCATAAGTCCCATTTTATCGAGGGACTCTGTTTAGCAAAGCACTTCTG  490

seq1  TGCCCCAGCAGATGGCTTAGTACTTGGCAAATCCAACTCAACGAACTCTG  542
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCCCAGCAGATGGCTTAGTACTTGGCAAATCCAACTCAACGAACTCTG  540

seq1  CTACACGAAGCAATTCCATAGAACAGATGGGCCCCACGGCCCCGCCATGT  592
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACACGAAGCAATTCCATAGAACAGATGGGCCCCACGGCCCCGCCATGT  590

seq1  AGCTGCCACCATTACCACCACACTGTTGTTTAGTTACCTTCTCGTGCCTT  642
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGCCACCATTACCACCACACTGTTGTTTAGTTACCTTCTCGTGCCTT  640

seq1  CTTTTTTGGTTGTGGCTGTTTGCTGAGACTAAGGTGGATGGAGTTTTACT  692
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTTTGGTTGTGGCTGTTTGCTGAGACTAAGGTGGATGGAGTTTTACT  690

seq1  GGCTAAGGGATGAGCTCTTAAACTCCTTGAGACTCATAGGGCTCCCCCAA  742
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTAAGGGATGAGCTCTTAAACTCCTTGAGACTCATAGGGCTCCCCCAA  740

seq1  CTTGCCCTAGGTCCTTTTATTCATTTCCTTGCTTCCCTCTTTTCTGTGAC  792
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGCCCTAGGTCCTTTTATTCATTTCCTTGCTTCCCTCTTTTCTGTGAC  790

seq1  AACATCTTAAGATGAATTAGTGTTTCAGCCTTCCCAGTTATAGACCTACT  842
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATCTTAAGATGAATTAGTGTTTCAGCCTTCCCAGTTATAGACCTACT  840

seq1  ATTATTATGGGGGTGTACATGTTTATGTGTGTGCAGGTGTGTATGTGAAG  892
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATTATGGGGGTGTACATGTTTATGTGTGTGCAGGTGTGTATGTGAAG  890

seq1  GTGTGTGTGTGTGTGCAGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGTGCA  942
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTGTGTGTGCAGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGTGCA  940

seq1  GGTGTGTAGAAGTCAGACATAGGCACTGCATCATTTATTTGAGACAAGGT  992
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGTGTAGAAGTCAGACATAGGCACTGCATCATTTATTTGAGACAAGGT  990

seq1  CTCTCCCTGGCCTGAAACTCACAAGGCAGGTTAGGTAGGCTGAACAGCAA  1042
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCCCTGGCCTGAAACTCACAAGGCAGGTTAGGTAGGCTGAACAGCAA  1040

seq1  GCCTCAAGGACCCACCTGTCTCCATTTACCTAGTCCCAGTTCTGAGATTA  1092
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTCAAGGACCCACCTGTCTCCATTTACCTAGTCCCAGTTCTGAGATTA  1090

seq1  CAAGCATGCATAAACCTGCTTGGCTTTTTAACTGTGAATTC  1133
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGCATGCATAAACCTGCTTGGCTTTTTAACTGTGAATTC  1131