BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-264B21
Chromosome2 (Build37)
Map Location 7,014,280 - 7,186,105
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100040343, 5430407P10Rik, LOC634939, Echdc3, 1700014B07Rik, Usp6nl, LOC100040387, Cugbp2, LOC100040659
Downstream geneLOC100040648, LOC672230
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-264B21.bB6Ng01-264B21.g
ACCGA068105GA068106
length1,0781,059
definitionB6Ng01-264B21.b B6Ng01-264B21.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(7,014,280 - 7,015,354)(7,185,045 - 7,186,105)
sequence
gaattctgatttcttgctgacaatgtttaaatgaatatgccagtttataa
ttagaaatgcagggagggagaactttttataactgaatatttcacacata
ttaaagttatcacaaatccacacagttctcatcccacttaatctagtgct
cttctacaaggcttattcactcgtagatttgaagttcttttctgaagtgt
tgagttcagtctaaaggcaagtgtttggcccactcctctccggctcactt
tctaatgctttcctttgtgtgtgtctgtgtttccacatggctttgtttta
atgacataattctagttgggggtggtaagcacaggggtaatacgtgtcct
aggccagcctgcattgcacagtgacactctgtctcaaaacagacaaaacc
acattcctactccttaatccttatacgtgaataataattgaagggagtaa
gctgtaaatgttttcttcagaggcatgggggagtgtgtttacatccactg
cactttgatatttttctttttcactatgcttaactccagaatacattttg
ctcttccacctctctagggagatggtagaccacctggtcactatggcaac
atgtttccctgtttctccatccctctccctacttctttagacttcctgta
aataacaagaagccgtttgttttctgttaatttggcttccactcttggag
ttgaatcacgatatgcagaaagctcatataggagtagggagacaacttgg
ttaattatgttcttgcctagtgagcatgaggacctgaattcaagtccaaa
aactgtctaaaaataaaaaacaataaacaagcaaacaaacacattaactt
ccaagtggacatggtggtgtatgctaatcacctcactgctgagcaagcag
aggaaagtagacactgggctcactagctggtctgcttagatttcttggca
agctctaggctagtgtgagaccctgtgttaaaaacaaagaaagaatagat
gggatggtacttggagaaaatgatcctgagttgtcgtcacagggacacat
acttgcacatatcatcttactcacatga

gaattcttgaatggatttcattcaaacggtagatacaggaaaagaagaaa
attctaattgcctctgagacacacaagtcaacagttatttggcatagtaa
acaaggcagagggtcaaatgttagaaagtctcctactttctaggcatgta
tgtttcttctctaagaatctaatagcaagttcaatgcatacactagcagc
aattctgtatagcataaccatacagcaccactgtgagcacattatagaca
gttgctcaagtcaatcgcatactattcaccaagtgctgccataaacagat
gagacagccccatttcactgatgagccaactgaagcacagagatgtggaa
tggcaccccaaagtcatggaggcagtaaaagacagacccagggctggaaa
gcatctataaagatattgaagtagaaatgatggccactcccaggacaaag
aagtagcctgaccaggagaccaaaaaaagaactacatactcccttgatct
atggagccaaaagattggccaatctccttcacacaacctcccttttcatt
tctcacaggcaaatggagacttaatttccctactgatcctacaaaaggta
gtcccagactcttgacagtgtttcaatactcccactgctaaaaagcagtc
cagggggaaatggagggaaatgtgagtggcaagaaagccaaaatcagttc
tgtaatggcagaggaagcagagctgggaccataggcagagagaggagatt
agaagacggtgttaatgacggtgtatcaattgcagcacacatcctgttgg
gattataggatttaaccagggagcatagaagaccttggataattcaaacc
taccctgtgctctaagactatacttgaggagaaaatgaatgttgtgctct
ttcacttgattcacagattcccatagtaaatgaatgatatgcaataagct
acagttgggttcctctcctataacttctcttctgagcttttaatactatt
tataaattttcaagtggtctgtctgtatttgatgcttttaaacaaaaagc
cacacacag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_7014280_7015354
seq2: B6Ng01-264B21.b_47_1124

seq1  GAATTCTGATTTCTTGCTGACAATGTTTAAATGAATATGCCAGTTTATAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGATTTCTTGCTGACAATGTTTAAATGAATATGCCAGTTTATAA  50

seq1  TTAGAAATGCAGGGAGGGAGAACTTTTTATAACTGAATATTTCACACATA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGAAATGCAGGGAGGGAGAACTTTTTATAACTGAATATTTCACACATA  100

seq1  TTAAAGTTATCACAAATCCACACAGTTCTCATCCCACTTAATCTAGTGCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAGTTATCACAAATCCACACAGTTCTCATCCCACTTAATCTAGTGCT  150

seq1  CTTCTACAAGGCTTATTCACTCGTAGATTTGAAGTTCTTTTCTGAAGTGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTACAAGGCTTATTCACTCGTAGATTTGAAGTTCTTTTCTGAAGTGT  200

seq1  TGAGTTCAGTCTAAAGGCAAGTGTTTGGCCCACTCCTCTCCGGCTCACTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTTCAGTCTAAAGGCAAGTGTTTGGCCCACTCCTCTCCGGCTCACTT  250

seq1  TCTAATGCTTTCCTTTGTGTGTGTCTGTGTTTCCACATGGCTTTGTTTTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAATGCTTTCCTTTGTGTGTGTCTGTGTTTCCACATGGCTTTGTTTTA  300

seq1  ATGACATAATTCTAGTTGGGGGTGGTAAGCACAGGGGTAATACGTGTCCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGACATAATTCTAGTTGGGGGTGGTAAGCACAGGGGTAATACGTGTCCT  350

seq1  AGGCCAGCCTGCATTGCACAGTGACACTCTGTCTCAAAACAGACAAAACC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCCAGCCTGCATTGCACAGTGACACTCTGTCTCAAAACAGACAAAACC  400

seq1  ACATTCCTACTCCTTAATCCTTATACGTGAATAATAATTGAAGGGAGTAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTCCTACTCCTTAATCCTTATACGTGAATAATAATTGAAGGGAGTAA  450

seq1  GCTGTAAATGTTTTCTTCAGAGGCATGGGGGAGTGTGTTTACATCCACTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTAAATGTTTTCTTCAGAGGCATGGGGGAGTGTGTTTACATCCACTG  500

seq1  CACTTTGATATTTTTCTTTTTCACTATGCTTAACTCCAGAATACATTTTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTTGATATTTTTCTTTTTCACTATGCTTAACTCCAGAATACATTTTG  550

seq1  CTCTTCCACCTCTCTAGGGAGATGGTAGACCACCTGGTCACTATGGCAAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTCCACCTCTCTAGGGAGATGGTAGACCACCTGGTCACTATGGCAAC  600

seq1  ATGTTTCCCTGTTTCTCCATCCCTCTCCCTACTTCTTTAGACTTCCTGTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTTCCCTGTTTCTCCATCCCTCTCCCTACTTCTTTAGACTTCCTGTA  650

seq1  AATAACAAGAAGCCGTTTGTTTTCTGTTAATTTGGCTTCCACTCTTGGAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAACAAGAAGCCGTTTGTTTTCTGTTAATTTGGCTTCCACTCTTGGAG  700

seq1  TTGAATCACGATATGCAGAAAGCTCATATAGGAGTAGGGAGACAACTTGG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAATCACGATATGCAGAAAGCTCATATAGGAGTAGGGAGACAACTTGG  750

seq1  TTAATTATGTTCTTGCCTAGTGAGCATGAGGACCTGAATTCAAGTCCAAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATTATGTTCTTGCCTAGTGAGCATGAGGACCTGAATTCAAGTCCAAA  800

seq1  AACTGTCTAAAAATAAAAAACAATAAACAAGCAAACAAACACATTAACTT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTGTCTAAAAATAAAAAACAATAAACAAGCAAACAAACACATTAACTT  850

seq1  CCAAGTGGACATGGTGGTGTATGCTAATCACCTCACTGCTGAGCAAGCAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGTGGACATGGTGGTGTATGCTAATCACCTCACTGCTGAGCAAGCAG  900

seq1  AGGAAGGTAGACACTGGGCTCACTAGCTGGTCTGCTTAGATTTCTTGGCA  950
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAAGTAGACACTGGGCTCACTAGCTGGTCTGCTTAGATTTCTTGGCA  950

seq1  AGCTCTAGGCTAGTGTGAGACCCTGTGTTAAAAACAAAGAAAG-ATAGAT  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  AGCTCTAGGCTAGTGTGAGACCCTGTGTTAAAAACAAAGAAAGAATAGAT  1000

seq1  -GGATGGTACTT-GAG-AAATGATCCTTGAGGTTGTCGTTCACAGGGACA  1046
       ||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||
seq2  GGGATGGTACTTGGAGAAAATGATCC-TGA-GTTGTCG-TCACAGGGACA  1047

seq1  CATACCTGCACATA-CATC-TACCCACATGA  1075
      ||||| |||||||| |||| ||| |||||||
seq2  CATACTTGCACATATCATCTTACTCACATGA  1078


seq1: chr2_7185045_7186105
seq2: B6Ng01-264B21.g_67_1125 (reverse)

seq1  CTGTGTGTGGGCTTTTGTTTAAAAAGGCAATCAAATACAGACAGACCACT  50
      ||||||||||  ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGTGTGGCTTTTTGTTTAAAA--GC-ATCAAATACAGACAGACCACT  47

seq1  TG-AAATTTATAAATAGTATTTAAAAGCTCAG-AGAGAAGTTATAGGAGA  98
      || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  TGAAAATTTATAAATAGTA-TTAAAAGCTCAGAAGAGAAGTTATAGGAGA  96

seq1  GGAA-CCAACTGTAGCTTATTGCATATCATTTCATTTACTATGGGAATCT  147
      |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  GGAACCCAACTGTAGCTTATTGCATATCA-TTCATTTACTATGGGAATCT  145

seq1  GTGAATCAAGTGAAAGAGCACAACATTCATTTTCTCCTCAAGTATAGTCT  197
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAATCAAGTGAAAGAGCACAACATTCATTTTCTCCTCAAGTATAGTCT  195

seq1  TAGAGCACAGGGTAGGTTTGAATTATCCAAGGTCTTCTATGCTCCCTGGT  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGCACAGGGTAGGTTTGAATTATCCAAGGTCTTCTATGCTCCCTGGT  245

seq1  TAAATCCTATAATCCCAACAGGATGTGTGCTGCAATTGATACACCGTCAT  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATCCTATAATCCCAACAGGATGTGTGCTGCAATTGATACACCGTCAT  295

seq1  TAACACCGTCTTCTAATCTCCTCTCTCTGCCTATGGTCCCAGCTCTGCTT  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACACCGTCTTCTAATCTCCTCTCTCTGCCTATGGTCCCAGCTCTGCTT  345

seq1  CCTCTGCCATTACAGAACTGATTTTGGCTTTCTTGCCACTCACATTTCCC  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTGCCATTACAGAACTGATTTTGGCTTTCTTGCCACTCACATTTCCC  395

seq1  TCCATTTCCCCCTGGACTGCTTTTTAGCAGTGGGAGTATTGAAACACTGT  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATTTCCCCCTGGACTGCTTTTTAGCAGTGGGAGTATTGAAACACTGT  445

seq1  CAAGAGTCTGGGACTACCTTTTGTAGGATCAGTAGGGAAATTAAGTCTCC  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGAGTCTGGGACTACCTTTTGTAGGATCAGTAGGGAAATTAAGTCTCC  495

seq1  ATTTGCCTGTGAGAAATGAAAAGGGAGGTTGTGTGAAGGAGATTGGCCAA  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGCCTGTGAGAAATGAAAAGGGAGGTTGTGTGAAGGAGATTGGCCAA  545

seq1  TCTTTTGGCTCCATAGATCAAGGGAGTATGTAGTTCTTTTTTTGGTCTCC  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTTGGCTCCATAGATCAAGGGAGTATGTAGTTCTTTTTTTGGTCTCC  595

seq1  TGGTCAGGCTACTTCTTTGTCCTGGGAGTGGCCATCATTTCTACTTCAAT  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTCAGGCTACTTCTTTGTCCTGGGAGTGGCCATCATTTCTACTTCAAT  645

seq1  ATCTTTATAGATGCTTTCCAGCCCTGGGTCTGTCTTTTACTGCCTCCATG  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTTATAGATGCTTTCCAGCCCTGGGTCTGTCTTTTACTGCCTCCATG  695

seq1  ACTTTGGGGTGCCATTCCACATCTCTGTGCTTCAGTTGGCTCATCAGTGA  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTGGGGTGCCATTCCACATCTCTGTGCTTCAGTTGGCTCATCAGTGA  745

seq1  AATGGGGCTGTCTCATCTGTTTATGGCAGCACTTGGTGAATAGTATGCGA  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGGGCTGTCTCATCTGTTTATGGCAGCACTTGGTGAATAGTATGCGA  795

seq1  TTGACTTGAGCAACTGTCTATAATGTGCTCACAGTGGTGCTGTATGGTTA  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGACTTGAGCAACTGTCTATAATGTGCTCACAGTGGTGCTGTATGGTTA  845

seq1  TGCTATACAGAATTGCTGCTAGTGTATGCATTGAACTTGCTATTAGATTC  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTATACAGAATTGCTGCTAGTGTATGCATTGAACTTGCTATTAGATTC  895

seq1  TTAGAGAAGAAACATACATGCCTAGAAAGTAGGAGACTTTCTAACATTTG  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGAGAAGAAACATACATGCCTAGAAAGTAGGAGACTTTCTAACATTTG  945

seq1  ACCCTCTGCCTTGTTTACTATGCCAAATAACTGTTGACTTGTGTGTCTCA  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCTCTGCCTTGTTTACTATGCCAAATAACTGTTGACTTGTGTGTCTCA  995

seq1  GAGGCAATTAGAATTTTCTTCTTTTCCTGTATCTACCGTTTGAATGAAAT  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGCAATTAGAATTTTCTTCTTTTCCTGTATCTACCGTTTGAATGAAAT  1045

seq1  CCATTCAAGAATTC  1061
      ||||||||||||||
seq2  CCATTCAAGAATTC  1059


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |