BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-267P24
Chromosome2 (Build37)
Map Location 96,635,134 - 96,790,141
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream genenone
Downstream geneLOC100043267, Lrrc4c, LOC621146
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-267P24.bB6Ng01-267P24.g
ACCGA070977GA070978
length1,0791,077
definitionB6Ng01-267P24.b B6Ng01-267P24.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(96,635,134 - 96,636,204)(96,789,056 - 96,790,141)
sequence
gaattcttgctgttcttctgcttcattcatctttgggggtacaatatact
taccggatattgatgtggtcatgaataacttgacttctcacctttataca
tataataactgaaaaatcgttgagcaattagtgagtcgctaatgccttag
gactttgcagagctcacactactaattacaaactcatgctcaattaagcc
cctgaatcccctcaaccccagtatcacacaaaagtattcttcagagagct
atcaagccctgttttcctcatgcttagggaacatagcgtgaccacattat
ttttttggactttctgactctaaagtggctgaaatgcttaaaatttggaa
aatttcactctgtactataaggaagagatacaacatatcacatttacatg
catagtaacatgcaaatgtatatacacatacacacacatgtagtcatttg
tgatataaactatgtaaaaagatacatataacatttataaaacatgaata
aaactgtaattcataatgatagaaattaattcatagtagagcatccaaaa
ttactgacaattatttttgtacctaaatatttaaattcattcacagtttt
ataaatctggttttagaaacttgatttttttgattaaaaaatccattagt
tttatatgttgcatcatttatcttcataataaataaaaataattggacat
tagctatactaacacatgggaagtactttttacattgtcagatgctgaac
aagttcgtgtctacaaatgatgtgggaccaagagacatactggccacaga
catgacatcaaaatctgaacaacacaacaaaaaatcatggagggtgttat
catttctctaagataaccacagacaatgtctgaaaggacaattcgaaggg
tcacatagagtccatggctatacatacacaaaagtcaagtctgtgtaagc
caaaccagaaaatcatgaaaatgcaaaagacaggtggggtgacagcaagg
aaaaggttgcaaacaactcctttcctaagccaacacatgatgaagactag
gaatactaaacaacaaacaaaccaaaaaa
gaattccaacttaggaacttattgttaattacattttttttttcctctaa
aagttatgttgttggaacagttccattcctgttgagtgtacaatctgtag
gctcagctctttgcccctgcatatgtagcttttgtttgcctccttggaag
aattttgttatatgaaggttggagcataagttggcatacacaagatgcag
acttgcggtacacatctaagcacagcaactgcaaagagcttaatgagtca
ttttccggactacccttgactttgccaagaatgtgttgtgtatgcatatc
aagaaacctgtgaggccatatgctaggggtcagcctttgaccagattcct
ccctccagctgtcacattgaaaaatcatcccacgtatggacattttctat
acacacagggttatgctgacttttcatcaggctggccttgttgaaaagca
gcatgttttatttttctaatttcagagttcagacttggaagctgtgaata
atcttaaatactattcaatatggtctacttttatttccaatgaacacaaa
ttgtaagtatgcaatgcaatctatcacaaaatattttataactataaaat
aagcataaaatgaccatcatcctttcttcttgtcctcctgcccacctttt
ctctttcagatagcaatattagcagtatttttaacgtatgtttatagaaa
ttccacgtgcttactagtttgataagtcgtatttgtaaatcaaaagttta
tttgggtttagaaattttattatatgctaaatatctttggaaaaccaaca
aatatgccccttctttcaatgtttttaagtgcttttaatattatgctttt
tataatccatcttcaatgactgttacaatttttttatcggtattgttcat
tacagcattcaacagtttgttgtttagctttgtcatctagcattaagtat
atatgctacattaatatgatgagagacttcattgttataaatataggagc
tacatgtagtgttaacccattgataataatatgatgataccttagcacca
tatactgctgtaatttattagtgatag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_96635134_96636204
seq2: B6Ng01-267P24.b_42_1120

seq1  GAATTCATGCTGTTCTTCTGCTTCAATTCATCTTTGCATTTACAATATAC  50
      |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||
seq2  GAATTCTTGCTGTTCTTCTGCTTC-ATTCATCTTTGGGGGTACAATATAC  49

seq1  TTACCAGATATTGATGTGGTCATGAATAACTTGACTTCTCACCTTTATAC  100
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACCGGATATTGATGTGGTCATGAATAACTTGACTTCTCACCTTTATAC  99

seq1  ATATAATAACTGAAAAATCATTGAGCAATTAGTGAGTCGCTAATGCCTTA  150
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATAATAACTGAAAAATCGTTGAGCAATTAGTGAGTCGCTAATGCCTTA  149

seq1  GGACTTTGCAGAGCTCACACTACTAATTACAAACTCATGCTCAATTAAGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACTTTGCAGAGCTCACACTACTAATTACAAACTCATGCTCAATTAAGC  199

seq1  CCCTGAATCCCCTCAACCCCAGTATCACACAAAAGTATTCTTCAGAGAGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGAATCCCCTCAACCCCAGTATCACACAAAAGTATTCTTCAGAGAGC  249

seq1  TATCAAGCCCTGTTTTCCTCATGCTTAGGGAACATAGCGTAACCACATTA  300
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  TATCAAGCCCTGTTTTCCTCATGCTTAGGGAACATAGCGTGACCACATTA  299

seq1  TTTTTTTGGACTTTCTGACTCTAAAGTGGCTAAAATGCTTAAAATTTGGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTTGGACTTTCTGACTCTAAAGTGGCTGAAATGCTTAAAATTTGGA  349

seq1  AAATTTCACTCTGTACTATAAGGAAGAGATACAACATATCACATTTACAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTTCACTCTGTACTATAAGGAAGAGATACAACATATCACATTTACAT  399

seq1  GCATAGTAACATGCAAATGTATATACACATACACACACATGTAGTCATTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATAGTAACATGCAAATGTATATACACATACACACACATGTAGTCATTT  449

seq1  GTGATATAAACTATGTAAAAAGATACATATAACATTTATAAAACATGAAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGATATAAACTATGTAAAAAGATACATATAACATTTATAAAACATGAAT  499

seq1  AAAACTGTAATTCATAATGATAGAAATTAATTCATAGTAGAGCATCCAAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACTGTAATTCATAATGATAGAAATTAATTCATAGTAGAGCATCCAAA  549

seq1  ATTACTGACAATTATTTTTGTACCTAAATATTTAAATTCATTCACAGTTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTACTGACAATTATTTTTGTACCTAAATATTTAAATTCATTCACAGTTT  599

seq1  TATAAATCTGGTTTTAGAAACTTGATTTTTTTGATTAAAAAATCCATTAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAAATCTGGTTTTAGAAACTTGATTTTTTTGATTAAAAAATCCATTAG  649

seq1  TTTTATATGTTGCATCATTTATCTTCATAATAAATAAAAATAATTGGACA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTATATGTTGCATCATTTATCTTCATAATAAATAAAAATAATTGGACA  699

seq1  TTAGCTATACTAACACATGGGAAGTACTTTTTACATTGTCAGATGCTGAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGCTATACTAACACATGGGAAGTACTTTTTACATTGTCAGATGCTGAA  749

seq1  CAAGTTCGTGTCTACAAATGATGT-GGACCAAGAGACATACTGGCCACAG  799
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTTCGTGTCTACAAATGATGTGGGACCAAGAGACATACTGGCCACAG  799

seq1  ACATGACATCAAAATCTGAACAACAACAACAAAAAATCAT-GAGGGTGTT  848
      |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||
seq2  ACATGACATCAAAATCTGAACAAC-ACAACAAAAAATCATGGAGGGTGTT  848

seq1  ATCATTTCTCTAAGATAACCACAGACAATGTCTG-AAGGACAAATTCGAA  897
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||
seq2  ATCATTTCTCTAAGATAACCACAGACAATGTCTGAAAGGAC-AATTCGAA  897

seq1  GGG-CACATAGAGTCCATGGCTATACATACACAAAAGTC-AGTCTGTGTA  945
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  GGGTCACATAGAGTCCATGGCTATACATACACAAAAGTCAAGTCTGTGTA  947

seq1  AGCCAAACCAGAAAATCATG-AAATGC-AAAGACAGGTGGGGTGACAGCA  993
      |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCAAACCAGAAAATCATGAAAATGCAAAAGACAGGTGGGGTGACAGCA  997

seq1  AGGAAAA-GTTGCAAACAA--CCCTTCCTAAG-CAACACATGATGAAGAC  1039
      ||||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||
seq2  AGGAAAAGGTTGCAAACAACTCCTTTCCTAAGCCAACACATGATGAAGAC  1047

seq1  TA-GAATACTAAAACAAACAAACAAACAAAAAA-  1071
      || ||||||||||   ||||||||||| ||||| 
seq2  TAGGAATACTAAA--CAACAAACAAACCAAAAAA  1079

seq1: chr2_96789056_96790141
seq2: B6Ng01-267P24.g_67_1143 (reverse)

seq1  CTATCACAAATAAATTTTACAACATTATATTGTGCATAAGTTATCATCAT  50
      ||||||| ||||||  ||||| || ||||| |||| |||| |||||||||
seq2  CTATCACTAATAAA--TTACAGCAGTATATGGTGC-TAAGGTATCATCAT  47

seq1  ATTATTATTCAATGTGTTTAACACTGCCATGTAGCTCCTTATATTTAAAA  100
      ||||||| |||||| | ||||||||  ||||||||||| |||||||| ||
seq2  ATTATTA-TCAATG-GGTTAACACT-ACATGTAGCTCC-TATATTTATAA  93

seq1  CAAATGAAGTCTCTCCTTCATATTAATGTAGCATATATACTTAATGCAAG  150
      | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  C-AATGAAGTCTCT-CATCATATTAATGTAGCATATATACTTAATGCTAG  141

seq1  ATGACAAAGGTAAACAAACAAACTGTTGAATGCTTGTAATGAACAATACC  200
      ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  ATGACAAAGCTAAAC-AACAAACTGTTGAATGC-TGTAATGAACAATACC  189

seq1  GAT-AAAAAATTGTAACAGTCATTGAAGATGGATTATAAAAAGCATAATA  249
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAAAAAAATTGTAACAGTCATTGAAGATGGATTATAAAAAGCATAATA  239

seq1  TTAAAAGCACTTAAAAACATTGAAAGAA-GGGCATATTTGTTGG-TTTCC  297
      |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||
seq2  TTAAAAGCACTTAAAAACATTGAAAGAAGGGGCATATTTGTTGGTTTTCC  289

seq1  AAAGATATTTAGCATATAATAAAATTTCTAAACCCAAATAAACTTTTGAT  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGATATTTAGCATATAATAAAATTTCTAAACCCAAATAAACTTTTGAT  339

seq1  TTACAAATACGACTTATCAAACTAGTAAGCACGTGGAATTTCTATAAACA  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACAAATACGACTTATCAAACTAGTAAGCACGTGGAATTTCTATAAACA  389

seq1  TACGTTAAAAATACTGCTAATATTGCTAACTGAAAGAGAAAAGGTGGGCA  447
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  TACGTTAAAAATACTGCTAATATTGCTATCTGAAAGAGAAAAGGTGGGCA  439

seq1  GGAGGAAAAGAAGAAAGGATGATGGTCATTTTATGCTTATTTTATAGTTA  497
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGGACAAGAAGAAAGGATGATGGTCATTTTATGCTTATTTTATAGTTA  489

seq1  TAAAATATTTTGTGATAGATTGCATTGCATACTTACAATTTGTGTTCATT  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAATATTTTGTGATAGATTGCATTGCATACTTACAATTTGTGTTCATT  539

seq1  GGAAATAAAAGTAGACCATATTGAATAGTATTTAAGATTATTCACAGCTT  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAATAAAAGTAGACCATATTGAATAGTATTTAAGATTATTCACAGCTT  589

seq1  CCAAGTCTGAACTTTGAAATTAGAAAAATAAAACATGCTGCTTTTCAACA  647
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGTCTGAACTCTGAAATTAGAAAAATAAAACATGCTGCTTTTCAACA  639

seq1  AGGCCAGCCTGATGAAAAGTCAGCATAACCCTGTGTGTATAGAAAATGTA  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  AGGCCAGCCTGATGAAAAGTCAGCATAACCCTGTGTGTATAGAAAATGTC  689

seq1  CATACGTGGGATGATTTTTCAATGTGACAGCTGGAGGGAGGAATCTGGTC  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATACGTGGGATGATTTTTCAATGTGACAGCTGGAGGGAGGAATCTGGTC  739

seq1  AAAGGCTGACCCCTAGCATATGGCCTCACAGGTTTCTTGATATGCATACA  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGCTGACCCCTAGCATATGGCCTCACAGGTTTCTTGATATGCATACA  789

seq1  CAACACATTCTTGGCAAAGTCAAGGGTAGACCGGAAAATGACTCATTAAG  847
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  CAACACATTCTTGGCAAAGTCAAGGGTAGTCCGGAAAATGACTCATTAAG  839

seq1  CTCTTTGCAGTTGCTGTGCTTAGATGTGTACCGCAAGTCTGCATCTTGTG  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTTGCAGTTGCTGTGCTTAGATGTGTACCGCAAGTCTGCATCTTGTG  889

seq1  TATGCCAACTTATGCTCCAACCTTCATATAACAAAATTCTTCCAAGGAGG  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCCAACTTATGCTCCAACCTTCATATAACAAAATTCTTCCAAGGAGG  939

seq1  CAAACAAAAGCTACATATGCAGGGGCAAAGAGCTGAGCCTACAGATTGTA  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACAAAAGCTACATATGCAGGGGCAAAGAGCTGAGCCTACAGATTGTA  989

seq1  CACTCAACAGGAATGGAACTGTTCCAACAACATAACTTTTAGAGGAAAAA  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTCAACAGGAATGGAACTGTTCCAACAACATAACTTTTAGAGGAAAAA  1039

seq1  AAAAATGTAATTAACAATAATATTCCTAAGTTGGAATTC  1086
      ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||
seq2  AAAAATGTAATTAACAATAA-GTTCCTAAGTTGGAATTC  1077