BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-269D08
Chromosome2 (Build37)
Map Location 128,489,324 - 128,542,928
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAnapc1, Mertk
Upstream geneLOC668892, Mall, Nphp1, 1500011K16Rik, Bub1, Acoxl, Bcl2l11, LOC100043424, LOC100043729, LOC383791, LOC100043730, Gm355
Downstream geneTmem87b, 1600015H20Rik, Zc3h8, LOC100043735, LOC100043736, Zc3h6, LOC668894, Ttl, LOC100043738, Rpo1-2, Chchd5, LOC545461, LOC100043431, Slc20a1, A730036I17Rik, LOC671466, Ckap2l, Il1a, Il1b, OTTMUSG00000015529, LOC668896, F830045P16Rik, Sirpa, Pdyn
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-269D08.bB6Ng01-269D08.g
ACCGA071867GA071868
length1,1081,179
definitionB6Ng01-269D08.b B6Ng01-269D08.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(128,541,817 - 128,542,928)(128,489,324 - 128,490,519)
sequence
gaattcactctatagaccaggctgacctcaaattcataaaaatcttcctg
cttctgcctcccaagtgctggctgggattaaaggcctgcaccaccacagc
ctagctaccacaacaactcttataaaagaaaacatttcattgaggctggc
tacagttcagaggcttagtccattttcatcatggccagatgcatggcagt
gtgcaggcagacatagtgttggaggggctgagagtgctacttactgatgg
tcaggcagcagcaggacattgccacactaggtgtagtttgagcatctgag
acctcaaagcctatctccacagtgacgcacttcctccaacaaggccacac
ttacttgagccaggccacacacctcctaatattttggctccctatgggcc
aagctttcaaacacttgagtctatgggaaccattcctattcagaccacca
tagaggacaatgatgggactgttgctgtgcctccagaacaggcttctgtc
acccgcacatctgcagtggctcagacactcagggactttgtgaaggctca
agattggccttgaatttccatgccagcataatgaactaatgcaactcaca
attaagtccaaggatgttcagtgagcacagtgtgtgaggactagcatgca
gggatgctcaatggttagctagcagttctattctcagaggtgaagcctac
ctcctctgctactactgccttgacatttatgatgtctctaacttctctga
tacccagaggaaaagcggaccatggagaccagacttggcatacactctcc
tcatcctacctgaggtaggctcattggccttcctctgaactctggcctgg
tggtcttctgaagtagcaatttctgatgccttgagaaaacaagctttggc
actcactggggacagtgcgaagtactgacagccatgaatcccagggaaag
taccctttgagctcttggctcttgggatctttgtctctcctgggttggcc
tttacatgacttttctaacagaacctcatttttaattcctcttggaagct
cagtgaccatagtcccagtaagaaaaagagctgacactgagcctgggcag
tgggtagg
gaattcaagaccagcctgggctacgtacacagcaagaccttgactttaaa
aaagacaaaaagaaaagaaaaaaaggtaaattgtgcttaaacagattttt
aaataaagactcaaaacctactaagtatttgattcatgctatataggaca
acaggccttagtattatcccgacatattctaaggcttacctattattaag
tttgtcaggttctctcagttatatagccagttatacaagcactgcatttc
taacaggataatgaagaaaacaactgtagttacttacacttcgggtccat
gctaagcggtctgtgttataacccatcatgttcaagagacaaatcacaaa
taaactccactctgagtgacagctgggtcctcctggagcactgtgcacat
tgtaccacttgacgagcacctgaatggctacttcttttggcaggatgaac
ttaattgcttgcagacacgtttgtactattaaaagcaaatactgatttta
gtatgtactgcctgcctcctttcaaatgggaaggttcaaattgctaccat
gtccaggccagccaggaaaaacagaaactatcactaaggacactgggcac
aaacattacctcaacattatcaatcacgttaaactaactactgaattcaa
cagggctcacagaaaatctgaagattagctgtcagatccctaattcggga
ctagaaataaagtgagcatatagcccagttcaccagaaataaccactgct
ccaggaaataactgttcccttttcactctcaaaactgtcctactttgaac
aatcaagcttacttcataaaaaatatctaatttcaaaaaaaaaaaaaaag
aaaagaaaacaaagccgggcgtggtggcgcacgcctttaatcccagcaca
gaggcagaggcaggcagatttctgagttcgaggccagcctggtctgtaga
gtgacttccaggacagccagggctacacagagaaaccctgtctcgaaaaa
ccaaaaactacacacaacacaaaaatctatttctacacaaataatttata
ataaatgtgattaattctcagttagatcacatgcagcacagcactactac
agattgcttaaggatgctacagctatttctcatgactgcacattcgttca
cttacactgccactcggtaatttctatac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_128541817_128542928
seq2: B6Ng01-269D08.b_47_1154 (reverse)

seq1  CCTACCCACTGCCCCAGGGCCTTCAGTGTCAGCTTCCTTTTTCTACCTTG  50
      ||||||||||| ||||||    ||||||||||||  ||||||||  || |
seq2  CCTACCCACTG-CCCAGG---CTCAGTGTCAGCT--CTTTTTCTTACTGG  44

seq1  GACTATGGTCACTGAGCTT-CAAGA-GAATT-AAAATGAGGTTCCTGTTA  97
      ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||
seq2  GACTATGGTCACTGAGCTTCCAAGAGGAATTAAAAATGAGGTT-CTGTTA  93

seq1  GAAAAGTCATGTAAAGGCCAACCCAGGAGAGACAAAGATCCCAAGAGCCA  147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAAGTCATGTAAAGGCCAACCCAGGAGAGACAAAGATCCCAAGAGCCA  143

seq1  AGAGCTCAAAGGGTACTTTCCCTGGGATTCATGGCTGTCAGTACTTCGCA  197
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCTCAAAGGGTACTTTCCCTGGGATTCATGGCTGTCAGTACTTCGCA  193

seq1  CTGTCCCCAGTGAGTGCCAAAGCTTGTTTTCTCAAGGCATCAGAAATTGC  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCCCCAGTGAGTGCCAAAGCTTGTTTTCTCAAGGCATCAGAAATTGC  243

seq1  TACTTCAGAAGACCACCAGGCCAGAGTTCAGAGGAAGGCCAATGAGCCTA  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTCAGAAGACCACCAGGCCAGAGTTCAGAGGAAGGCCAATGAGCCTA  293

seq1  CCTCAGGTAGGATGAGGAGAGTGTATGCCAAGTCTGGTCTCCATGGTCCG  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCAGGTAGGATGAGGAGAGTGTATGCCAAGTCTGGTCTCCATGGTCCG  343

seq1  CTTTTCCTCTGGGTATCAGAGAAGTTAGAGACATCATAAATGTCAAGGCA  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTCCTCTGGGTATCAGAGAAGTTAGAGACATCATAAATGTCAAGGCA  393

seq1  GTAGTAGCAGAGGAGGTAGGCTTCACCTCTGAGAATAGAACTGCTAGCTA  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGTAGCAGAGGAGGTAGGCTTCACCTCTGAGAATAGAACTGCTAGCTA  443

seq1  ACCATTGAGCATCCCTGCATGCTAGTCCTCACACACTGTGCTCACTGAAC  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCATTGAGCATCCCTGCATGCTAGTCCTCACACACTGTGCTCACTGAAC  493

seq1  ATCCTTGGACTTAATTGTGAGTTGCATTAGTTCATTATGCTGGCATGGAA  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTTGGACTTAATTGTGAGTTGCATTAGTTCATTATGCTGGCATGGAA  543

seq1  ATTCAAGGCCAATCTTGAGCCTTCACAAAGTCCCTGAGTGTCTGAGCCAC  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCAAGGCCAATCTTGAGCCTTCACAAAGTCCCTGAGTGTCTGAGCCAC  593

seq1  TGCAGATGTGCGGGTGACAGAAGCCTGTTCTGGAGGCACAGCAACAGTCC  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAGATGTGCGGGTGACAGAAGCCTGTTCTGGAGGCACAGCAACAGTCC  643

seq1  CATCATTGTCCTCTATGGTGGTCTGAATAGGAATGGTTCCCATAGACTCA  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCATTGTCCTCTATGGTGGTCTGAATAGGAATGGTTCCCATAGACTCA  693

seq1  AGTGTTTGAAAGCTTGGCCCATAGGGAGCCAAAATATTAGGAGGTGTGTG  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTTTGAAAGCTTGGCCCATAGGGAGCCAAAATATTAGGAGGTGTGTG  743

seq1  GCCTGGCTCAAGTAAGTGTGGCCTTGTTGGAGGAAGTGCGTCACTGTGGA  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGGCTCAAGTAAGTGTGGCCTTGTTGGAGGAAGTGCGTCACTGTGGA  793

seq1  GATAGGCTTTGAGGTCTCAGATGCTCAAACTACACCTAGTGTGGCAATGT  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAGGCTTTGAGGTCTCAGATGCTCAAACTACACCTAGTGTGGCAATGT  843

seq1  CCTGCTGCTGCCTGACCATCAGTAAGTAGCACTCTCAGCCCCTCCAACAC  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGCTGCTGCCTGACCATCAGTAAGTAGCACTCTCAGCCCCTCCAACAC  893

seq1  TATGTCTGCCTGCACACTGCCATGCATCTGGCCATGATGAAAATGGACTA  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTCTGCCTGCACACTGCCATGCATCTGGCCATGATGAAAATGGACTA  943

seq1  AGCCTCTGAACTGTAGCCAGCCTCAATGAAATGTTTTCTTTTATAAGAGT  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTCTGAACTGTAGCCAGCCTCAATGAAATGTTTTCTTTTATAAGAGT  993

seq1  TGTTGTGGTAGCTAGGCTGTGGTGGTGCAGGCCTTTAATCCCAGCCAGCA  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGTGGTAGCTAGGCTGTGGTGGTGCAGGCCTTTAATCCCAGCCAGCA  1043

seq1  CTTGGGAGGCAGAAGCAGGAAGATTTTTATGAATTTGAGGTCAGCCTGGT  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGGGAGGCAGAAGCAGGAAGATTTTTATGAATTTGAGGTCAGCCTGGT  1093

seq1  CTATAGAGTGAATTC  1112
      |||||||||||||||
seq2  CTATAGAGTGAATTC  1108

seq1: chr2_128489324_128490519
seq2: B6Ng01-269D08.g_64_1242

seq1  GAATTCAAGACCAGCCTGGGCTACGTACACAGCAAGACCTTGACTTTAAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAGACCAGCCTGGGCTACGTACACAGCAAGACCTTGACTTTAAA  50

seq1  AAAGACAAAAAGAAAAGAAAAAAAGGTAAATTGTGCTTAAACAGATTTTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGACAAAAAGAAAAGAAAAAAAGGTAAATTGTGCTTAAACAGATTTTT  100

seq1  AAATAAAGACTCAAAACCTACTAAGTATTTGATTCATGCTATATAGGACA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAAAGACTCAAAACCTACTAAGTATTTGATTCATGCTATATAGGACA  150

seq1  ACAGGCCTTAGTATTATCCCGACATATTCTAAGGCTTACCTATTATTAAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGCCTTAGTATTATCCCGACATATTCTAAGGCTTACCTATTATTAAG  200

seq1  TTTGTCAGGTTCTCTCAGTTATATAGCCAGTTATACAAGCACTGCATTTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTCAGGTTCTCTCAGTTATATAGCCAGTTATACAAGCACTGCATTTC  250

seq1  TAACAGGATAATGAAGAAAACAACTGTAGTTACTTACACTTCGGGTCCAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACAGGATAATGAAGAAAACAACTGTAGTTACTTACACTTCGGGTCCAT  300

seq1  GCTAAGCGGTCTGTGTTATAACCCATCATGTTCAAGAGACAAATCACAAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAAGCGGTCTGTGTTATAACCCATCATGTTCAAGAGACAAATCACAAA  350

seq1  TAAACTCCACTCTGAGTGACAGCTGGGTCCTCCTGGAGCACTGTGCACAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAACTCCACTCTGAGTGACAGCTGGGTCCTCCTGGAGCACTGTGCACAT  400

seq1  TGTACCACTTGACGAGCACCTGAATGGCTACTTCTTTTGGCAGGATGAAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTACCACTTGACGAGCACCTGAATGGCTACTTCTTTTGGCAGGATGAAC  450

seq1  TTAATTGCTTGCAGACACGTTTGTACTATTAAAAGCAAATACTGATTTTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATTGCTTGCAGACACGTTTGTACTATTAAAAGCAAATACTGATTTTA  500

seq1  GTATGTACTGCCTGCCTCCTTTCAAATGGGAAGGTTCAAATTGCTACCAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATGTACTGCCTGCCTCCTTTCAAATGGGAAGGTTCAAATTGCTACCAT  550

seq1  GTCCAGGCCAGCCAGGAAAAACAGAAACTATCACTAAGGACACTGGGCAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCAGGCCAGCCAGGAAAAACAGAAACTATCACTAAGGACACTGGGCAC  600

seq1  AAACATTACCTCAACATTATCAATCACGTTAAACTAACTACTGAATTCAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACATTACCTCAACATTATCAATCACGTTAAACTAACTACTGAATTCAA  650

seq1  CAGGGCTCACAGAAAATCTGAAGATTAGCTGTCAGATCCCTAATTCGGGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGGCTCACAGAAAATCTGAAGATTAGCTGTCAGATCCCTAATTCGGGA  700

seq1  CTAGAAATAAAGTGAGCATATAGCCCAGTTCACCAGAAATAACCACTGCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGAAATAAAGTGAGCATATAGCCCAGTTCACCAGAAATAACCACTGCT  750

seq1  CCAGGAAATAACTGTTCCCTTTTCACTCTCAAAACTGTCCTACTTTGAAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGAAATAACTGTTCCCTTTTCACTCTCAAAACTGTCCTACTTTGAAC  800

seq1  AATCAAGCTTACTTCATAAAAAATATCTAATTTC-AAAAAAAAAAAAAAG  849
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  AATCAAGCTTACTTCATAAAAAATATCTAATTTCAAAAAAAAAAAAAAAG  850

seq1  AAAAGAAAACAAAGCCGGGCGTGGTGGCGCACGCCTTTAATCCCAGCACA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGAAAACAAAGCCGGGCGTGGTGGCGCACGCCTTTAATCCCAGCACA  900

seq1  GAGGCAGAGGCAGGCAGATTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCTGTAGA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGCAGAGGCAGGCAGATTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCTGTAGA  950

seq1  GTGACTTCCAGGACAGCCAGGGCTACACAGAGAAACCCTGTCTCGAAAAA  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGACTTCCAGGACAGCCAGGGCTACACAGAGAAACCCTGTCTCGAAAAA  1000

seq1  ACCAAAAAACTAACAACAACAACAACAAAAATCTAATTTCTACACAAATA  1049
        | ||||||||   |||||    |||||||||| |||||||||||||| 
seq2  --CCAAAAACTACACACAAC----ACAAAAATCT-ATTTCTACACAAAT-  1042

seq1  AATTTATATAAAATGTGGATTAAATCCTTCAG-TAGATTCAACATGCAGC  1098
      ||||||||  |||||| |||||| ||  |||| |||||   |||||||||
seq2  AATTTATAATAAATGT-GATTAATTC--TCAGTTAGAT--CACATGCAGC  1087

seq1  ACAGGCACCTACTAACAGGAATGCTTAGGGATGCTACAAGCTA-TTCTCA  1147
      ||| ||| ||||| ||| || |||||| ||||||||| ||||| ||||| 
seq2  ACA-GCA-CTACT-ACA-GATTGCTTAAGGATGCTAC-AGCTATTTCTC-  1131

seq1  ATGAGTGAACATTCCTGTCAACTAACACTGCAACTC-GTAATTTCTACAC  1196
      |||| || ||||||  ||  ||| ||||||| |||| |||||||||| ||
seq2  ATGACTGCACATTC--GTTCACTTACACTGCCACTCGGTAATTTCTATAC  1179