BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-272H06
Chromosome2 (Build37)
Map Location 70,099,401 - 70,241,763
singlet/doubletdoublet
Overlap geneMyo3b
Upstream geneAbcb11, Dhrs9, Lrp2, Bbs5, Kbtbd10, Fastkd1, Ppig, 4930578N16Rik, Phospho2, LOC433432, Klhl23, Ssb, Mettl5, 4930550G17Rik, Zfp650
Downstream geneLOC100040021, Sp5, 4933404M02Rik, LOC100040068, Gad1, LOC100039766, Gorasp2, Tlk1, Mettl8, 4833418A01Rik, Cybrd1, Dync1i2, Slc25a12, LOC667528, Hat1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-272H06.bB6Ng01-272H06.g
ACCGA074275GA074276
length1,2121,098
definitionB6Ng01-272H06.b B6Ng01-272H06.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(70,099,401 - 70,100,611)(70,240,659 - 70,241,763)
sequence
gaattccttccagctaagttccggtttcatgggagctagaaactgtcttt
tacttcccaagtcaggcatcagcgtgccctagactggctttcttaccctt
tcaagggagcctcttctctgggcgacctggaaagtaacactcccttaatt
agtggctatagaaaagatgtgttgtctgagttccttattacggtcaaaaa
gatcaacacttgactgtgtataactttgatagctttccatgactttaaca
aatacccagcgataaccaattcacaaagagaaaagttttacttctcacag
tgttaggcgttacagcgcatggtcaattgtttctgctggcttggtactgg
ggtagcacctagtggcaggtttgcctggtggagcaaaaccgtctttgtct
tgagagaaagaaaatggccaggtttccatcactgcctttagggagacact
tccaccaatctgaagagctctcactagttcctgcctcttagaggcttgca
tctcctcccagtagtaccagggctggagactgtgccttgacacatgggtc
ttggggggagactttccacaaccaagttaccatggtaactgccatgtgac
atcagagatagtaatcacccagcatttcccccaatgcttcctttgacttt
cctgttctcactgactatgaaagagactgaacatgcagagtgaaataaag
ccccagggcgccaggagacagggccactcctgtgttgtctagcagcagct
aagtctggtgagaaagatagcggtgctagagggtgctctcatcccaaggt
tctcatcccaaggttcgcagtcagcactggataaacagaggcagccacag
tcagcatggattctcttccttttggcctgttgccctgaccatgctttggc
ctgcagtggactattcaggactagtaagtgttattgcacgggctccctca
caccacaatggacaaccagatctatgcggtaaacatgttggtctacctcg
cagtgcttattctgccttgtggtggtcatgctgtgtgcctctctgctaac
actgagctgcatgagaatataagacagagctttctgtccaacacatgtgt
ggagcatatatccagcactcaaatgctcccacgccaatccctccccacaa
tacgcttacttcaacctcccctgccctccagttagtcctccaaaattcca
acccgccagttt
gaattcagagtaaatggtcaagaatggcttccaagggccagtaaggtggc
gtaagtgggtaaggggtttactgccaagcctgatgacccgagtttgatcc
ccagaacccacacagtagacagagagataaaattaccacagggtgtcctc
tgacctccaaatgtgtgctgtggcatgtgtctgccctctaagcccatata
cacataaaataattaaattacttttttttaaaaaggaattaactcccaga
tttctaccttatcttgagtgtctgtgaatatcattttgtgaaacagagaa
ggccaaggtggtcagtgagtattctgggatggtgaggtcaagagttcagc
tcttgatcacgggcctgttgtgaaacatcctgtagaattgttcgatgggt
agctctgtgtgcatctggaatggagggggaacacagtaggctgctcgctt
gcactgcagaggcagcagcttatcattgggatttcaggagggaaggtcct
cggctatccggaggatgcgtaccctgggcggggctggggaggcggctgcc
taggaacagggcatagccatgaggttaccgatcaaggaaaacgtacttaa
ggagatcacatgctggcggcaggtggaaactgatccacctgtccaccagt
ccagagaagttcctccagatcttgcaaggtcttaggtttcctaacagtgt
attcctggggagtggcaacctaaggagatcctgtagggcacaatccaggc
aacagatgctgccaaaatgccttaaaatgtgactaagaaggggtgaggga
agggtgagcagggagccacagtttattaaagaggacatgtaaaaacaccc
tggaggtgtctgagctgacatgcagtctatccggtgagatggggactggg
taccagtgtatgtgccttgtcctggaagatcatcttctccattcttgctg
tctccgtggcctcccgagtgtctctaattaagccagtatctccttgtttc
ctaagttctgctcgagataacgcttcactgatgagtgttccatgtaaagc
gatcactagctaccaactgctaagtgctgatggatggctttctatgtc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_70099401_70100611
seq2: B6Ng01-272H06.b_48_1259

seq1  GAATTCCTTCCAGCTAAGTTCCGGTTTCATGGGAGCTAGAAACTGTCTTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTTCCAGCTAAGTTCCGGTTTCATGGGAGCTAGAAACTGTCTTT  50

seq1  TACTTCCCAAGTCAGGCATCAGCGTGCCCTAGACTGGCTTTCTTACCCTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTCCCAAGTCAGGCATCAGCGTGCCCTAGACTGGCTTTCTTACCCTT  100

seq1  TCAAGGGAGCCTCTTCTCTGGGCGACCTGGAAAGTAACACTCCCTTAATT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAGGGAGCCTCTTCTCTGGGCGACCTGGAAAGTAACACTCCCTTAATT  150

seq1  AGTGGCTATAGAAAAGATGTGTTGTCTGAGTTCCTTATTACGGTCAAAAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGCTATAGAAAAGATGTGTTGTCTGAGTTCCTTATTACGGTCAAAAA  200

seq1  GATCAACACTTGACTGTGTATAACTTTGATAGCTTTCCATGACTTTAACA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCAACACTTGACTGTGTATAACTTTGATAGCTTTCCATGACTTTAACA  250

seq1  AATACCCAGCGATAACCAATTCACAAAGAGAAAAGTTTTACTTCTCACAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATACCCAGCGATAACCAATTCACAAAGAGAAAAGTTTTACTTCTCACAG  300

seq1  TGTTAGGCGTTACAGCGCATGGTCAATTGTTTCTGCTGGCTTGGTACTGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTAGGCGTTACAGCGCATGGTCAATTGTTTCTGCTGGCTTGGTACTGG  350

seq1  GGTAGCACCTAGTGGCAGGTTTGCCTGGTGGAGCAAAACCGTCTTTGTCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAGCACCTAGTGGCAGGTTTGCCTGGTGGAGCAAAACCGTCTTTGTCT  400

seq1  TGAGAGAAAGAAAATGGCCAGGTTTCCATCACTGCCTTTAGGGAGACACT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGAGAAAGAAAATGGCCAGGTTTCCATCACTGCCTTTAGGGAGACACT  450

seq1  TCCACCAATCTGAAGAGCTCTCACTAGTTCCTGCCTCTTAGAGGCTTGCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCACCAATCTGAAGAGCTCTCACTAGTTCCTGCCTCTTAGAGGCTTGCA  500

seq1  TCTCCTCCCAGTAGTACCAGGGCTGGAGACTGTGCCTTGACACATGGGTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCTCCCAGTAGTACCAGGGCTGGAGACTGTGCCTTGACACATGGGTC  550

seq1  TTGGGGGGAGACTTTCCACAACCAAGTTACCATGGTAACTGCCATGTGAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGGGGAGACTTTCCACAACCAAGTTACCATGGTAACTGCCATGTGAC  600

seq1  ATCAGAGATAGTAATCACCCAGCATTTCCCCCAATGCTTCCTTTGACTTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAGAGATAGTAATCACCCAGCATTTCCCCCAATGCTTCCTTTGACTTT  650

seq1  CCTGTTCTCACTGACTATGAAAGAGACTGAACATGCAGAGTGAAATAAAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTTCTCACTGACTATGAAAGAGACTGAACATGCAGAGTGAAATAAAG  700

seq1  CCCCAGGGCGCCAGGAGACAGGGCCACTCCTGTGTTGTCTAGCAGCAGCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCAGGGCGCCAGGAGACAGGGCCACTCCTGTGTTGTCTAGCAGCAGCT  750

seq1  AAGTCTGGTGAGAAAGATAGCGGTGCTAGAGGGTGCTCTCATCCCAAGGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTCTGGTGAGAAAGATAGCGGTGCTAGAGGGTGCTCTCATCCCAAGGT  800

seq1  TCTCATCCCAAGGTTCGCAGTCAGCACTGGATAAACAGAGGCAGCCACAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCATCCCAAGGTTCGCAGTCAGCACTGGATAAACAGAGGCAGCCACAG  850

seq1  TCAGCATGGATTCTCTTCCTTTTGGCCTGTTGCCCTGACCATGCTTTGGC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCATGGATTCTCTTCCTTTTGGCCTGTTGCCCTGACCATGCTTTGGC  900

seq1  CTGCAGGTGGACTATTTCAGGACTAGTAAGTGTTATTGCACGGGGCTCCT  950
      ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||
seq2  CTGCA-GTGGACTA-TTCAGGACTAGTAAGTGTTATTGCACGGGCTCCCT  948

seq1  CACACCACAATGGACAACCAGATCTATGCGGTAAACATGTTGGTCTACCT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACCACAATGGACAACCAGATCTATGCGGTAAACATGTTGGTCTACCT  998

seq1  CGCAGTGC-TATTCTGCCTTGT-GTGGTCATGCTGTGTGCCTCTCTGCTA  1048
      |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCAGTGCTTATTCTGCCTTGTGGTGGTCATGCTGTGTGCCTCTCTGCTA  1048

seq1  ACACTGAGCTGCATGAG-ATATAAGACAGAGCTTTCTGTTCCACACATGT  1097
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||
seq2  ACACTGAGCTGCATGAGAATATAAGACAGAGCTTTCTGTCCAACACATGT  1098

seq1  GTGGAGCATATATCCAGCACTCCAATGCTCCCCACGCC-ATCCCTCCCCA  1146
      |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||
seq2  GTGGAGCATATATCCAGCACTCAAATGCT-CCCACGCCAATCCCTCCCCA  1147

seq1  CCATACCTTCTTTCCTTCCACCTCCCCTGCCTCCCAGTTAGTCCTTCAAA  1196
      | ||||     || |||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||
seq2  CAATAC---GCTTACTTCAACCTCCCCTGCCCTCCAGTTAGTCCTCCAAA  1194

seq1  ATT-CAACC--CCAGTTT  1211
      ||| |||||  |||||||
seq2  ATTCCAACCCGCCAGTTT  1212

seq1: chr2_70240659_70241763
seq2: B6Ng01-272H06.g_65_1162 (reverse)

seq1  GACATAGAAACCAATTCTACCAGCACTTAGCAGTTGTGTAGCCTAGTGAA  50
      |||||||||| | | || | |||||||||||||||| |||| ||||||| 
seq2  GACATAGAAAGCCA-TCCATCAGCACTTAGCAGTTG-GTAG-CTAGTGA-  46

seq1  TCCGCCTTACATGGAACACTCATCAGTG-AGCG-TATCTCGAGCAGAACT  98
        ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||
seq2  -TCGCTTTACATGGAACACTCATCAGTGAAGCGTTATCTCGAGCAGAACT  95

seq1  TAAGAAACAAGGAGATACTGGCTTAATTAGAGACACTCGGGGAGCCACCG  148
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||
seq2  TAGGAAACAAGGAGATACTGGCTTAATTAGAGACACTCGGGAGGCCA-CG  144

seq1  GAGACAGCAAGAATGGGAGAAGATGATCTTCCAGGACAAGGGCACATACA  198
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  GAGACAGCAAGAAT-GGAGAAGATGATCTTCCAGGACAA-GGCACATACA  192

seq1  CTGGTACCCAGTCCCCATTCTCACCGGATAGACTGCATGTCAGCTCAGAC  248
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTACCCAGTCCCCA-TCTCACCGGATAGACTGCATGTCAGCTCAGAC  241

seq1  ACCTCCAGGGTGTTTTTACATGTCCTCTTTAATAAACTGTGGCTCCCTGC  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTCCAGGGTGTTTTTACATGTCCTCTTTAATAAACTGTGGCTCCCTGC  291

seq1  TCACCCTTCCCTCACCCCTTCTTAGTCACATTTTAAGGCATTTTGGCAGC  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCCTTCCCTCACCCCTTCTTAGTCACATTTTAAGGCATTTTGGCAGC  341

seq1  ATCTGTTGCCTGGATTGTGCCCTACAGGATCTCCTTAGGTTGCCACTCCC  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGTTGCCTGGATTGTGCCCTACAGGATCTCCTTAGGTTGCCACTCCC  391

seq1  CAGGAATACACTGTTAGGAAACCTAAGACCTTGCAAGATCTGGAGGAACT  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGAATACACTGTTAGGAAACCTAAGACCTTGCAAGATCTGGAGGAACT  441

seq1  TCTCTGGACTGGTGGACAGGTGGATCAGTTTCCACCTGCCGCCAGCATGT  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTGGACTGGTGGACAGGTGGATCAGTTTCCACCTGCCGCCAGCATGT  491

seq1  GATCTCCTTAAGTACGTTTTCCTTGATCGGTAACCTCATGGCTATGCCCT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCTCCTTAAGTACGTTTTCCTTGATCGGTAACCTCATGGCTATGCCCT  541

seq1  GTTCCTAGGCAGCCGCCTCCCCAGCCCCGCCCAGGGTACGCATCCTCCGG  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCCTAGGCAGCCGCCTCCCCAGCCCCGCCCAGGGTACGCATCCTCCGG  591

seq1  ATAGCCGAGGACCTTCCCTCCTGAAATCCCAATGATAAGCTGCTGCCTCT  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGCCGAGGACCTTCCCTCCTGAAATCCCAATGATAAGCTGCTGCCTCT  641

seq1  GCAGTGCAAGCGAGCAGCCTACTGTGTTCCCCCTCCATTCCAGATGCACA  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGTGCAAGCGAGCAGCCTACTGTGTTCCCCCTCCATTCCAGATGCACA  691

seq1  CAGAGCTACCCATCGAACAATTCTACAGGATGTTTCACAACAGGCCCGTG  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGCTACCCATCGAACAATTCTACAGGATGTTTCACAACAGGCCCGTG  741

seq1  ATCAAGAGCTGAACTCTTGACCTCACCATCCCAGAATACTCACTGACCAC  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAAGAGCTGAACTCTTGACCTCACCATCCCAGAATACTCACTGACCAC  791

seq1  CTTGGCCTTCTCTGTTTCACAAAATGATATTCACAGACACTCAAGATAAG  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGGCCTTCTCTGTTTCACAAAATGATATTCACAGACACTCAAGATAAG  841

seq1  GTAGAAATCTGGGAGTTAATTCCTTTTTAAAAAAAAGTAATTTAATTATT  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGAAATCTGGGAGTTAATTCCTTTTTAAAAAAAAGTAATTTAATTATT  891

seq1  TTATGTGTATATGGGCTTAGAGGGCAGACACATGCCACAGCACACATTTG  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATGTGTATATGGGCTTAGAGGGCAGACACATGCCACAGCACACATTTG  941

seq1  GAGGTCAGAGGACACCCTGTGGTAATTTTATCTCTCTGTCTACTGTGTGG  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGTCAGAGGACACCCTGTGGTAATTTTATCTCTCTGTCTACTGTGTGG  991

seq1  GTTCTGGGGATCAAACTCGGGTCATCAGGCTTGGCAGTAAACCCCTTACC  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCTGGGGATCAAACTCGGGTCATCAGGCTTGGCAGTAAACCCCTTACC  1041

seq1  CACTTACGCCACCTTACTGGCCCTTGGAAGCCATTCTTGACCATTTACTC  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTACGCCACCTTACTGGCCCTTGGAAGCCATTCTTGACCATTTACTC  1091

seq1  TGAATTC  1105
      |||||||
seq2  TGAATTC  1098