BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-274B15
Chromosome2 (Build37)
Map Location 82,012,829 - 82,143,312
singlet/doubletdoublet
Overlap geneZfp804a
Upstream geneLOC100040704
Downstream geneLOC100041308, A130030D18Rik, EG624362, LOC433550, LOC269292, LOC433440, Fsip2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-274B15.bB6Ng01-274B15.g
ACCGA075494GA075495
length1,135857
definitionB6Ng01-274B15.b B6Ng01-274B15.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(82,012,829 - 82,013,959)(82,142,457 - 82,143,312)
sequence
gaattctttaaaacagaaaagtttatgcttcaccatttagcccttaggaa
gtggtacatctgcaacatacatgtaacactattacatatgtaaaaataac
cttaaatgctatgaattttttaaaacctcaaatcatgtcttctgctttaa
tatttctcaaactgtatgtcaactcacatggttgtaatatacattctttt
gaatccaattttcacatgcaaatctgtggaaatcatcattctaaatacac
tagagtgtaacaaatcagtatgtgttgtctcaaaactagagagaaaattg
cacgtctaagttggtcaaattgtttgatcaagtaaaatcaccacaaataa
gagcttattgcatttcattatttttttcatctaggttaatgtcattttag
actaaaaaatgtaaaaaacttaagaactcactatttcaaaatttaaataa
ttaaatctatttgtagagttataaccatttactttacaatcatatttgaa
ctgtgtacagttatacattaaataaaacactacagacaagtttttttaaa
ctgagtaatttgtaagatgcaaagctaaaatccagcatctatactgcatt
aaataactgtaaagtgtctgaaaagaaatgcaagtgcagtgctagtcttg
acacttgcttggatttaaacttgggttgttaaagtctatggcttctttca
atgtacacttgattgttaatgacaaaaagatgccctacctgagttcccaa
atggactcagcatttcctttgactattgttttagtttgtttgttttattt
tctctcaggtaaaacccccttccaaaatattactgccacgatttccccct
ttcatactccagtcaagtcctcatgaattagacaggatcagccagaactt
gaacttcaaagggtattaatttaatctcctttaatatctaaaagcaagtt
cttcctcagtgactttactgctttattatttttatgtttcttttgatagt
gaacatcttagattatacatatttacaactgactccatgaaaaatgtctt
catactactaatgtctagctagctccagttcatgtatcagtgcttagttg
gtgtggtcttgggggaggggcgctgcagtttactc

gaattctgctcttttctgaaggtaaacagagaaacattgaatccaggggt
gaggggctgggggactaagcattgagaggataggaaaaaggagaaattac
agctgggacgtaatttttgagagaagaataaaaaaataaattttggaaaa
gaggataaaaaagaattgaatgcagtaataggcataattatgagaacaga
tataaagatgattgttttctagttctaattctgtcaggaatatttttgtc
attttttgttaagtgcataaaaatgctatacaatatgagcttccattaca
atatctattctaactgtacagaagttcacgacattgtataagcatgactt
gatttctgtttaatttttctgagtggtgttttatatgtttataagacttt
taataataaagtttataaaatttttaaaatgtatataagtttaagaaaat
aattccccaaaatctttaatgttattctaaagtagtggaaatgtggactg
ggtgtagatggaagatggcttagcattcatagcatgcaagaattagggaa
tgaaggagttgaagggatttgccaccccataggaagaacaacgtcagcca
accagacccagctcccagcgaataaaccaccaaccaaagactacacatgg
aatgacccaaggttccagctgcttatgaagtagaggatggccttgttggg
catcagtgggaggagaggcaaaggctggctagccaagagaccttactgga
aaaattagttaatgatatccagctgtacttgtagacaggagcctgtaaaa
actcaatgccccaatgtaggggaatgccagggcagggaggtgggagtggg
gtgggtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_82012829_82013959
seq2: B6Ng01-274B15.b_45_1179

seq1  GAATTCTTTAAAACAGAAAAGTTTATGCTTCACCATTTAGCCCTTAGGAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTAAAACAGAAAAGTTTATGCTTCACCATTTAGCCCTTAGGAA  50

seq1  GTGGTACATCTGCAACATACATGTAACACTATTACATATGTAAAAATAAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGTACATCTGCAACATACATGTAACACTATTACATATGTAAAAATAAC  100

seq1  CTTAAATGCTATGAATTTTTTAAAACCTCAAATCATGTCTTCTGCTTTAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAAATGCTATGAATTTTTTAAAACCTCAAATCATGTCTTCTGCTTTAA  150

seq1  TATTTCTCAAACTGTATGTCAACTCACATGGTTGTAATATACATTCTTTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTCTCAAACTGTATGTCAACTCACATGGTTGTAATATACATTCTTTT  200

seq1  GAATCCAATTTTCACATGCAAATCTGTGGAAATCATCATTCTAAATACAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATCCAATTTTCACATGCAAATCTGTGGAAATCATCATTCTAAATACAC  250

seq1  TAGAGTGTAACAAATCAGTATGTGTTGTCTCAAAACTAGAGAGAAAATTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGTGTAACAAATCAGTATGTGTTGTCTCAAAACTAGAGAGAAAATTG  300

seq1  CACGTCTAAGTTGGTCAAATTGTTTGATCAAGTAAAATCACCACAAATAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACGTCTAAGTTGGTCAAATTGTTTGATCAAGTAAAATCACCACAAATAA  350

seq1  GAGCTTATTGCATTTCATTATTTTTTTCATCTAGGTTAATGTCATTTTAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTTATTGCATTTCATTATTTTTTTCATCTAGGTTAATGTCATTTTAG  400

seq1  ACTAAAAAATGTAAAAAACTTAAGAACTCACTATTTCAAAATTTAAATAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAAAAAATGTAAAAAACTTAAGAACTCACTATTTCAAAATTTAAATAA  450

seq1  TTAAATCTATTTGTAGAGTTATAACCATTTACTTTACAATCATATTTGAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAATCTATTTGTAGAGTTATAACCATTTACTTTACAATCATATTTGAA  500

seq1  CTGTGTACAGTTATACATTAAATAAAACACTACAGACAAGTTTTTTTAAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGTACAGTTATACATTAAATAAAACACTACAGACAAGTTTTTTTAAA  550

seq1  CTGAGTAATTTGTAAGATGCAAAGCTAAAATCCAGCATCTATACTGCATT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGTAATTTGTAAGATGCAAAGCTAAAATCCAGCATCTATACTGCATT  600

seq1  AAATAACTGTAAAGTGTCTGAAAAGAAATGCAAGTGCAGTGCTAGTCTTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAACTGTAAAGTGTCTGAAAAGAAATGCAAGTGCAGTGCTAGTCTTG  650

seq1  ACACTTGCTTGGATTTAAACTTGGGTTGTTAAAGTCTATGGCTTCTTTCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACTTGCTTGGATTTAAACTTGGGTTGTTAAAGTCTATGGCTTCTTTCA  700

seq1  ATGTACACTTGATTGTTAATGACAAAAAGATGCCCTACCTGAGTTCCCAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTACACTTGATTGTTAATGACAAAAAGATGCCCTACCTGAGTTCCCAA  750

seq1  ATGGACTCAGCATTTCCTTTGACTATTGTTTTAGTTTGTTTGTTTTATTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGACTCAGCATTTCCTTTGACTATTGTTTTAGTTTGTTTGTTTTATTT  800

seq1  TCTCTCAGGTAAAACCCCCTTCCAAAATATTACTGCCACGATTTCCCCC-  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  TCTCTCAGGTAAAACCCCCTTCCAAAATATTACTGCCACGATTTCCCCCT  850

seq1  TTCATACTCCAGTCAAGTCCTCATGAATTAGACAGGATCAGCCAGAACTT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATACTCCAGTCAAGTCCTCATGAATTAGACAGGATCAGCCAGAACTT  900

seq1  GAACTTCAAAGGTTATTAA-TTAATCTCCTTTAATATCTAAAAGCAAGTT  948
      |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACTTCAAAGGGTATTAATTTAATCTCCTTTAATATCTAAAAGCAAGTT  950

seq1  C-TCCTCAGTGACTTTACTGCTTTATTATTTTTATGTTTCTTTTGATAGT  997
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCTCAGTGACTTTACTGCTTTATTATTTTTATGTTTCTTTTGATAGT  1000

seq1  GAACATCTTTAGATTATACATATTTACAAACTGACTCCATGAAAAATGTC  1047
      ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  GAACATC-TTAGATTATACATATTTAC-AACTGACTCCATGAAAAATGTC  1048

seq1  TTCATTACTACTAATGTCTAGCTAGCTCCAGTTCATGTAATCAGTGCTTC  1097
      |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| 
seq2  TTCA-TACTACTAATGTCTAGCTAGCTCCAGTTCATGT-ATCAGTGCTTA  1096

seq1  GT--GTGT-GTC-TGGGGAAGGGGCGCTGCAG-TTACTC  1131
      ||  |||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||
seq2  GTTGGTGTGGTCTTGGGGGAGGGGCGCTGCAGTTTACTC  1135


seq1: chr2_82142457_82143312
seq2: B6Ng01-274B15.g_67_923 (reverse)

seq1  CACCCA-CCCACTCCCACCTCCCTGCCCTGGCATTCCCCTACATTGGGGC  49
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCCACCCCACTCCCACCTCCCTGCCCTGGCATTCCCCTACATTGGGGC  50

seq1  ATTGAGTTTTTACAGGCTCCTGTCTACAAGTACAGCTGGATATCATTAAC  99
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGAGTTTTTACAGGCTCCTGTCTACAAGTACAGCTGGATATCATTAAC  100

seq1  TAATTTTTCCAGTAAGGTCTCTTGGCTAGCCAGCCTTTGCCTCTCCTCCC  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTTTTCCAGTAAGGTCTCTTGGCTAGCCAGCCTTTGCCTCTCCTCCC  150

seq1  ACTGATGCCCAACAAGGCCATCCTCTACTTCATAAGCAGCTGGAACCTTG  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGATGCCCAACAAGGCCATCCTCTACTTCATAAGCAGCTGGAACCTTG  200

seq1  GGTCATTCCATGTGTAGTCTTTGGTTGGTGGTTTATTCGCTGGGAGCTGG  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCATTCCATGTGTAGTCTTTGGTTGGTGGTTTATTCGCTGGGAGCTGG  250

seq1  GTCTGGTTGGCTGACGTTGTTCTTCCTATGGGGTGGCAAATCCCTTCAAC  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTGGTTGGCTGACGTTGTTCTTCCTATGGGGTGGCAAATCCCTTCAAC  300

seq1  TCCTTCATTCCCTAATTCTTGCATGCTATGAATGCTAAGCCATCTTCCAT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTCATTCCCTAATTCTTGCATGCTATGAATGCTAAGCCATCTTCCAT  350

seq1  CTACACCCAGTCCACATTTCCACTACTTTAGAATAACATTAAAGATTTTG  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACACCCAGTCCACATTTCCACTACTTTAGAATAACATTAAAGATTTTG  400

seq1  GGGAATTATTTTCTTAAACTTATATACATTTTAAAAATTTTATAAACTTT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAATTATTTTCTTAAACTTATATACATTTTAAAAATTTTATAAACTTT  450

seq1  ATTATTAAAAGTCTTATAAACATATAAAACACCACTCAGAAAAATTAAAC  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATTAAAAGTCTTATAAACATATAAAACACCACTCAGAAAAATTAAAC  500

seq1  AGAAATCAAGTCATGCTTATACAATGTCGTGAACTTCTGTACAGTTAGAA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAATCAAGTCATGCTTATACAATGTCGTGAACTTCTGTACAGTTAGAA  550

seq1  TAGATATTGTAATGGAAGCTCATATTGTATAGCATTTTTATGCACTTAAC  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATATTGTAATGGAAGCTCATATTGTATAGCATTTTTATGCACTTAAC  600

seq1  AAAAAATGACAAAAATATTCCTGACAGAATTAGAACTAGAAAACAATCAT  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAATGACAAAAATATTCCTGACAGAATTAGAACTAGAAAACAATCAT  650

seq1  CTTTATATCTGTTCTCATAATTATGCCTATTACTGCATTCAATTCTTTTT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTATATCTGTTCTCATAATTATGCCTATTACTGCATTCAATTCTTTTT  700

seq1  TATCCTCTTTTCCAAAATTTATTTTTTTATTCTTCTCTCAAAAATTACGT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCCTCTTTTCCAAAATTTATTTTTTTATTCTTCTCTCAAAAATTACGT  750

seq1  CCCAGCTGTAATTTCTCCTTTTTCCTATCCTCTCAATGCTTAGTCCCCCA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGCTGTAATTTCTCCTTTTTCCTATCCTCTCAATGCTTAGTCCCCCA  800

seq1  GCCCCTCACCCCTGGATTCAATGTTTCTCTGTTTACCTTCAGAAAAGAGC  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCCTCACCCCTGGATTCAATGTTTCTCTGTTTACCTTCAGAAAAGAGC  850

seq1  AGAATTC  856
      |||||||
seq2  AGAATTC  857


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |