BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-284G07
Chromosome2 (Build37)
Map Location 3,110,804 - 3,273,969
singlet/doubletdoublet
Overlap gene9630050M13Rik, Nmt2, Rpp38, Acbd7, Olah
Upstream genenone
Downstream geneMeig1, Dclre1c, Suv39h2, Hspa14, Armetl1, LOC100040219, LOC666495, 3110001A13Rik, LOC100040257, LOC100040163, LOC666944, 1700080N15Rik, Frmd4a, EG634452
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-284G07.bB6Ng01-284G07.g
ACCGA083108GA083109
length1,1731,083
definitionB6Ng01-284G07.b B6Ng01-284G07.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(3,272,798 - 3,273,969)(3,110,804 - 3,111,887)
sequence
gaattcactatgtagaccaggatggcctcaaactccttgagattcatgtg
cctctaccaggccggcaattatctctatcttcttaagatcttgacatgta
taattcagtcaactgtcctaagagacagctgaatgtcctaagagcgagcc
ataaattcttgctgcaatcttggacttttaatttatgactgtttacagtg
ctatgcaattttgtactcttgctctgtgaaagttgccaacactcctggct
gtttgttctagcaaaagtagatctcagagttaggcagactgctgagttag
agtgcttgccttgcaagcagaggacctgtgtcttatccccagaacataca
taaaaatgccagtgcacactggtaatcccggtgctgaggcagaagaagta
tggggacccctgaggtcaacagcaagtctaggctaattgctcagctccag
gtcaatgagagcctgtctcagaggaggtaagccacattactgaggataac
attagaaattgtcctctggcctacatgcactcacatgaacacatccacct
gtgcatgcatgctcacacgcacgcgcacacacgcacacacacacacacac
acacacacacacacacacacgcatgcgcacagagacacccatgcatacgc
acatgcatgcacaattctgcattgtattaaaccactgatgcagcataaat
agaggaggaaactggacttcccacagactcacgtacttccctccttctga
gtaagtcctcatgtcctcagctgctcatctgtgtgcagctgcataattca
tcctgtgtttcctttttaaaaaaatacatgttgatctactacacactttt
tttcttcctaagtaacttacttttcacattgtcatacaagtttattttgt
atgtcatgcatattcttttttatatcctcgatccttctttttctgccctc
attggtcacttctgtcctggttggcaattttacttctgctttctagtcat
gtatatatgactttatgtatctgtataaaacaaaagttagcttcattcat
ttattatgattatctctagttatttccatttttcaacctaatgaactcct
cctttaatggctggaaatgtttccattgggcgtggaaggaaacacgttga
ttatctcgttcgttggtgaacac
gaattccttcttctcaatgtgtttgtttataagttctgaggcattgagtt
acatctctcaggttttaagatatgagtagtagtttgagtctttcttgatc
tacttcattttaatgttgtctgtcatcatgtatttgctaagtggtggaga
ctgatgtctcctgagccaggaaatcacatggtcagaatggcatctctgag
cagtcagtgtccatagctgaaatagaggttaagtttgaagcagagggctg
gctgggagactgttgaggcaaaaggtggttcataggtctgtagtgtgggg
tcagaagggaggaaatgttgacgaaggagcaatagccagccgtggtactt
gaatgactctgtcagatgttagaaagggaaagtgatgttggtctggagca
aaactgggcactggagagaatatgggctcattagaggagagagggtgcat
gctggtcttagaaactgggtaaagctatctagaagacaggggaaatgcca
gtgtggaactcaagcaagatgctagactggaaatgactgtgggtataaag
agagatctctaagacgagcagagagaggctgcagagatgatggatagctg
tctttgggagctgtctcatctaggggcagaaggagagagaagggatctgc
atgagaggcagagtctggagagaaccagagaccaaggatgaatgccaaga
aagagaggactcatgcgtgaggatgccggacactgcagtccgttgtgaag
aggtcagggggtgaaggctgaaaggaggtggtcatgtggctgcagattat
acggtggatcttggcatcgtgtgttttgggtgaccgccatgtcactgggg
ctgaatgggaagaagacaggcgttcatatatggtgaggaaaaagtgactt
ttccctacttagggaagatataagtgtgctttattgctgaaaggaggaaa
catcaatcagacaaagaactttgttgaccaaggcacggacagttggtaag
gttcacaacagccataccacagaagcagactgagagagggctgattgacc
tggatgaaaacaatagaatggggggggggaata
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_3272798_3273969
seq2: B6Ng01-284G07.b_50_1222 (reverse)

seq1  GTGTTCACCAAACGAAC-AGATAATCAAACGTGGTCTCTT-CACGCC--A  46
      ||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |  ||| ||||||  |
seq2  GTGTTCACC-AACGAACGAGATAATC-AACGTGTTTCCTTCCACGCCCAA  48

seq1  TGGAAACATTTTCAGCCA-TAAAGGAGGAAGTCATAGTGTTTGGAAAAAT  95
      ||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||   |||  |||||||
seq2  TGGAAACATTTCCAGCCATTAAAGGAGGAGTTCATTAGGTT--GAAAAAT  96

seq1  GGATATAACTAGAGATAATCATATTAAATGAATGAAGCTAACCTTTGTTT  145
      ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||
seq2  GGAAATAACTAGAGATAATCATAATAAATGAATGAAGCTAACTTTTGTTT  146

seq1  TATACAGATACATAAAGTCATATATACATGACTAGAAAGCAGAAGTAAAA  195
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATACAGATACATAAAGTCATATATACATGACTAGAAAGCAGAAGTAAAA  196

seq1  TTGCCAACCAGGACAGAAGTGACCAATGAGGGCAGAAAAAGAAGGATCGA  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCCAACCAGGACAGAAGTGACCAATGAGGGCAGAAAAAGAAGGATCGA  246

seq1  GGATATAAAAAAGAATATGCATGACATACAAAATAAACTTGTATGACAAT  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATATAAAAAAGAATATGCATGACATACAAAATAAACTTGTATGACAAT  296

seq1  GTGAAAAGTAAGTTACTTAGGAAG-AAAAAAGTGTGTAGTAGATCAACAT  344
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAAAAGTAAGTTACTTAGGAAGAAAAAAAGTGTGTAGTAGATCAACAT  346

seq1  GTATTTTTTTAAAAAGGAAACACAGGATGAATTATGCAGCTGCACACAGA  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATTTTTTTAAAAAGGAAACACAGGATGAATTATGCAGCTGCACACAGA  396

seq1  TGAGCAGCTGAGGACATGAGGACTTACTCAGAAGGAGGGGAAGTACGTGA  444
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  TGAGCAGCTGAGGACATGAGGACTTACTCAGAAGGA-GGGAAGTACGTGA  445

seq1  GTCTGTGGGAAGTCCAGTTTCCTCCTCTATTTATGCTGCATCAGTGGTTT  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTGTGGGAAGTCCAGTTTCCTCCTCTATTTATGCTGCATCAGTGGTTT  495

seq1  AATACAATGCAGAATTGTGCATGCATGTGCGTATGCATGGGTGTCTCTGT  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATACAATGCAGAATTGTGCATGCATGTGCGTATGCATGGGTGTCTCTGT  545

seq1  GCGCATGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGT  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCGCATGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGT  595

seq1  GTGCGCGTGCGTGTGAGCATGCATGCACAGGTGGATGTGTTCATGTGAGT  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCGCGTGCGTGTGAGCATGCATGCACAGGTGGATGTGTTCATGTGAGT  645

seq1  GCATGTAGGCCAGAGGACAATTTCTAATGTTATCCTCAGTAATGTGGCTT  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGTAGGCCAGAGGACAATTTCTAATGTTATCCTCAGTAATGTGGCTT  695

seq1  ACCTCCTCTGAGACAGGCTCTCATTGACCTGGAGCTGAGCAATTAGCCTA  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTCCTCTGAGACAGGCTCTCATTGACCTGGAGCTGAGCAATTAGCCTA  745

seq1  GACTTGCTGTTGACCTCAGGGGTCCCCATACTTCTTCTGCCTCAGCACCG  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTTGCTGTTGACCTCAGGGGTCCCCATACTTCTTCTGCCTCAGCACCG  795

seq1  GGATTACCAGTGTGCACTGGCATTTTTATGTATGTTCTGGGGATAAGACA  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATTACCAGTGTGCACTGGCATTTTTATGTATGTTCTGGGGATAAGACA  845

seq1  CAGGTCCTCTGCTTGCAAGGCAAGCACTCTAACTCAGCAGTCTGCCTAAC  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTCCTCTGCTTGCAAGGCAAGCACTCTAACTCAGCAGTCTGCCTAAC  895

seq1  TCTGAGATCTACTTTTGCTAGAACAAACAGCCAGGAGTGTTGGCAACTTT  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGAGATCTACTTTTGCTAGAACAAACAGCCAGGAGTGTTGGCAACTTT  945

seq1  CACAGAGCAAGAGTACAAAATTGCATAGCACTGTAAACAGTCATAAATTA  994
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGAGCAAGAGTACAAAATTGCATAGCACTGTAAACAGTCATAAATTA  995

seq1  AAAGTCCAAGATTGCAGCAAGAATTTATGGCTCGCTCTTAGGACATTCAG  1044
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTCCAAGATTGCAGCAAGAATTTATGGCTCGCTCTTAGGACATTCAG  1045

seq1  CTGTCTCTTAGGACAGTTGACTGAATTATACATGTCAAGATCTTAAGAAG  1094
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCTCTTAGGACAGTTGACTGAATTATACATGTCAAGATCTTAAGAAG  1095

seq1  ATAGAGATAATTGCCGGCCTGGTAGAGGCACATGAATCTCAAGGAGTTTG  1144
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGAGATAATTGCCGGCCTGGTAGAGGCACATGAATCTCAAGGAGTTTG  1145

seq1  AGGCCATCCTGGTCTACATAGTGAATTC  1172
      ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCCATCCTGGTCTACATAGTGAATTC  1173

seq1: chr2_3110804_3111887
seq2: B6Ng01-284G07.g_67_1149

seq1  GAATTCCTTCTTCTCAATGTGTTTGTTTATAAGTTCTGAGGCATTGAGTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTTCTTCTCAATGTGTTTGTTTATAAGTTCTGAGGCATTGAGTT  50

seq1  ACATCTCTCAGGTTTTAAGATATGAGTAGTAGTTTGAGTCTTTCTTGATC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATCTCTCAGGTTTTAAGATATGAGTAGTAGTTTGAGTCTTTCTTGATC  100

seq1  TACTTCATTTTAATGTTGTCTGTCATCATGTATTTGCTAAGTGGTGGAGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTCATTTTAATGTTGTCTGTCATCATGTATTTGCTAAGTGGTGGAGA  150

seq1  CTGATGTCTCCTGAGCCAGGAAATCACATGGTCAGAATGGCATCTCTGAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGATGTCTCCTGAGCCAGGAAATCACATGGTCAGAATGGCATCTCTGAG  200

seq1  CAGTCAGTGTCCATAGCTGAAATAGAGGTTAAGTTTGAAGCAGAGGGCTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCAGTGTCCATAGCTGAAATAGAGGTTAAGTTTGAAGCAGAGGGCTG  250

seq1  GCTGGGAGACTGTTGAGGCAAAAGGTGGTTCATAGGTCTGTAGTGTGGGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGGAGACTGTTGAGGCAAAAGGTGGTTCATAGGTCTGTAGTGTGGGG  300

seq1  TCAGAAGGGAGGAAATGTTGACGAAGGAGCAATAGCCAGCCGTGGTACTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGAAGGGAGGAAATGTTGACGAAGGAGCAATAGCCAGCCGTGGTACTT  350

seq1  GAATGACTCTGTCAGATGTTAGAAAGGGAAAGTGATGTTGGTCTGGAGCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGACTCTGTCAGATGTTAGAAAGGGAAAGTGATGTTGGTCTGGAGCA  400

seq1  AAACTGGGCACTGGAGAGAATATGGGCTCATTAGAGGAGAGAGGGTGCAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTGGGCACTGGAGAGAATATGGGCTCATTAGAGGAGAGAGGGTGCAT  450

seq1  GCTGGTCTTAGAAACTGGGTAAAGCTATCTAGAAGACAGGGGAAATGCCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGTCTTAGAAACTGGGTAAAGCTATCTAGAAGACAGGGGAAATGCCA  500

seq1  GTGTGGAACTCAAGCAAGATGCTAGACTGGAAATGACTGTGGGTATAAAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGGAACTCAAGCAAGATGCTAGACTGGAAATGACTGTGGGTATAAAG  550

seq1  AGAGATCTCTAAGACGAGCAGAGAGAGGCTGCAGAGATGATGGATAGCTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGATCTCTAAGACGAGCAGAGAGAGGCTGCAGAGATGATGGATAGCTG  600

seq1  TCTTTGGGAGCTGTCTCATCTAGGGGCAGAAGGAGAGAGAAGGGATCTGC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTGGGAGCTGTCTCATCTAGGGGCAGAAGGAGAGAGAAGGGATCTGC  650

seq1  ATGAGAGGCAGAGTCTGGAGAGAACCAGAGACCAAGGATGAATGCCAAGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGAGGCAGAGTCTGGAGAGAACCAGAGACCAAGGATGAATGCCAAGA  700

seq1  AAGAGAGGACTCATGCGTGAGGATGCCGGACACTGCAGTCCGTTGTGAAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGAGGACTCATGCGTGAGGATGCCGGACACTGCAGTCCGTTGTGAAG  750

seq1  AGGTCAGGGGGTGAAGGCTGAAAGGAGGTGGTCATGTGGCTGCAGATTAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTCAGGGGGTGAAGGCTGAAAGGAGGTGGTCATGTGGCTGCAGATTAT  800

seq1  ACGGTGGATCTTGGCATCGTGTGTTTTGGGTGACCGCCATGTCACTGGGG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGGTGGATCTTGGCATCGTGTGTTTTGGGTGACCGCCATGTCACTGGGG  850

seq1  CTGAAT-GGAAGAAGACAGGCGTTCATATATGGTGAGGAAAAAGTGACTT  899
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAATGGGAAGAAGACAGGCGTTCATATATGGTGAGGAAAAAGTGACTT  900

seq1  TTCCCTACTTAGGGAAGATATAAGTGTGC-TTATTGCTG-AAGGAGGAAA  947
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||
seq2  TTCCCTACTTAGGGAAGATATAAGTGTGCTTTATTGCTGAAAGGAGGAAA  950

seq1  CACCAA-CAGACAAAG-ACATTGTTGACCAAGGCACGAACAGTTGGTAAA  995
      || ||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||
seq2  CATCAATCAGACAAAGAACTTTGTTGACCAAGGCACGGACAGTTGGT-AA  999

seq1  GGTTCACCACAG-CATA-CACAGGAAAGCAGAACTGAGGAGAGGGGCTTG  1043
      ||||||| |||| |||| |||||  |||||| ||||| |||| |||||  
seq2  GGTTCACAACAGCCATACCACAG--AAGCAG-ACTGA-GAGA-GGGCT--  1042

seq1  GTTTGACCTGGGATGAAAACAATAGAAT-GGGGGGGGGAATA  1084
      | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  GATTGACCT-GGATGAAAACAATAGAATGGGGGGGGGGAATA  1083