BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-284M09
Chromosome2 (Build37)
Map Location 94,952,601 - 95,052,286
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneHsd17b12, E530001K10Rik, Ttc17, Itpa-ps1, Api5, LOC100043259
Downstream geneLOC100042843
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-284M09.bB6Ng01-284M09.g
ACCGA083393GA083394
length7261,017
definitionB6Ng01-284M09.b B6Ng01-284M09.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(95,051,563 - 95,052,286)(94,952,601 - 94,953,640)
sequence
gaattctaaattatttctaagtgcctacttaaagctgagggtaaacatgg
gtgttacccggaagctggaatttgttttgaagacccctgagaattgacac
tccacccctaaaaattctcttcttccttccctttagtttcttctgggaag
catatatgcatgtctcactgttctcttctgaagtcgctccaccaacactt
ttcatacaccaccacctttccctgagcctaccccaaagcccacccccatt
cagtgatctatctcaaagcaaccttccagacaataacagaacatgacatt
ggcctatagaacttctccccagtagcactgacaatgtacctaccagatac
tggatgcagctaatgtttgtgcaggaatgaaagcttcacctgttcatttc
ttcccattgccaacatgaagatgcactgctgttcccatttgacagaagcc
agcattgctccaaaatgagcccatcacctgaagctacattgttacagatg
ctgaatccgtatccaaagcacacgttctttcctctaatccttcacaatta
taaagcaatcccacttcacattgttctatcctcattttaaacaagtatta
gtcacagaaaatttagttcctgatattagaaacagatataaatttcctgt
atttagaaaatataaagctaatccttagcaaaattaagcaactttgtcta
aattcttacagcatatgtagaggagg
gaattcctggttgtcgttcagtctctgtgagcccttatgcgccttgctta
gttgattctgtgagctatgttcttaaggtgactttgactgctctgacttc
cacaattcttcctcttcattttctgtgggattcccagaactcagcctaat
atttagctatgggtctctgcacctacttccaacagttactgggctaagcc
cctctgcttgtacccatcttcacactgttaagatttttttttctagaagg
aaccaattttaaggaattcgcatgcctttttctgaaggtttaccttccca
cttctaattaatgtggtgatattggtcctattgattttacatttttgagt
atagtctgttgaacttgtacagtgtaaaaatacaattgaatcattttcca
tcatgaaacataatgtatttatacgaatatgtgaatatgctaaccatctt
cccaatagagatgtagaggtctacaacccactaagcagtatttttagttt
tgttttgaaaggataattatggccaagagtaggatttcaaacttccttac
ttccacaatgaaacatcatcatgataaaatcttatgacatttccatcttc
attataacttatgacatgtatgggcataattaaagatattacacgttgat
ggataaatctgcttttgatttttttatgatctttaaagtttggttggttt
aaaaaaaaaaagaaaaaaggacagtattggctttcattagtggttctcat
tgccaagactatagggtagaaagtaacactgctctgtcaagtatcattta
ggataacagaaaaatgggtagggaaatatacatacacattgtatgtgtgt
gtttctctctctctctctgtctctgtctctgtctctttctctctctgtgt
gtgtgtaactctttccatatagatactctgcactcatatggacatatgag
ttatcatggggaattgagtggtccatgtgatataatctctctctctctct
ttctctcctctctcctc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_95051563_95052286
seq2: B6Ng01-284M09.b_48_773 (reverse)

seq1  CCTCCTCTACATATGCTGTAAGAATTTAGAC-AAGTTGCTTAATTTTGCT  49
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  CCTCCTCTACATATGCTGTAAGAATTTAGACAAAGTTGCTTAATTTTGCT  50

seq1  AAGGATTAGCTTTCTGTTTTCTAAATACATGGAAATTAATATCTGTTTCT  99
      ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||
seq2  AAGGATTAGCTTTATATTTTCTAAATACA-GGAAATTTATATCTGTTTCT  99

seq1  AATATCTGGAACTAA--TTTCTGTGACTAATACTTGTTTAAAATGAGGAT  147
      |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATCAGGAACTAAATTTTCTGTGACTAATACTTGTTTAAAATGAGGAT  149

seq1  AGAACAATGTGAAGTGGGATTGCTTTATAATTGTGAAGGATTAGAGGAAA  197
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAACAATGTGAAGTGGGATTGCTTTATAATTGTGAAGGATTAGAGGAAA  199

seq1  GAACGTGTGCTTTGGATACGGATTCAGCATCTGTAACAATGTAGCTTCAG  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACGTGTGCTTTGGATACGGATTCAGCATCTGTAACAATGTAGCTTCAG  249

seq1  GTGATGGGCTCATTTTGGAGCAATGCTGGCTTCTGTCAAATGGGAACAGC  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGATGGGCTCATTTTGGAGCAATGCTGGCTTCTGTCAAATGGGAACAGC  299

seq1  AGTGCATCTTCATGTTGGCAATGGGAAGAAATGAACAGGTGAAGCTTTCA  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGCATCTTCATGTTGGCAATGGGAAGAAATGAACAGGTGAAGCTTTCA  349

seq1  TTCCTGCACAAACATTAGCTGCATCCAGTATCTGGTAGGTACATTGTCAG  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTGCACAAACATTAGCTGCATCCAGTATCTGGTAGGTACATTGTCAG  399

seq1  TGCTACTGGGGAGAAGTTCTATAGGCCAATGTCATGTTCTGTTATTGTCT  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTACTGGGGAGAAGTTCTATAGGCCAATGTCATGTTCTGTTATTGTCT  449

seq1  GGAAGGTTGCTTTGAGATAGATCACTGAATGGGGGTGGGCTTTGGGGTAG  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGGTTGCTTTGAGATAGATCACTGAATGGGGGTGGGCTTTGGGGTAG  499

seq1  GCTCAGGGAAAGGTGGTGGTGTATGAAAAGTGTTGGTGGAGCGACTTCAG  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCAGGGAAAGGTGGTGGTGTATGAAAAGTGTTGGTGGAGCGACTTCAG  549

seq1  AAGAGAACAGTGAGACATGCATATATGCTTCCCAGAAGAAACTAAAGGGA  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGAACAGTGAGACATGCATATATGCTTCCCAGAAGAAACTAAAGGGA  599

seq1  AGGAAGAAGAGAATTTTTAGGGGTGGAGTGTCAATTCTCAGGGGTCTTCA  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAGAAGAGAATTTTTAGGGGTGGAGTGTCAATTCTCAGGGGTCTTCA  649

seq1  AAACAAATTCCAGCTTCCGGGTAACACCCATGTTTACCCTCAGCTTTAAG  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAAATTCCAGCTTCCGGGTAACACCCATGTTTACCCTCAGCTTTAAG  699

seq1  TAGGCACTTAGAAATAATTTAGAATTC  724
      |||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGCACTTAGAAATAATTTAGAATTC  726

seq1: chr2_94952601_94953640
seq2: B6Ng01-284M09.g_69_1085

seq1  GAATTCCTGGTTGTCGTTCAGTCTCTGTGAGCCCTTATGCGCCTTGCTTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTGGTTGTCGTTCAGTCTCTGTGAGCCCTTATGCGCCTTGCTTA  50

seq1  GTTGATTCTGTGAGCTATGTTCTTAAGGTGACTTTGACTGCTCTGACTTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGATTCTGTGAGCTATGTTCTTAAGGTGACTTTGACTGCTCTGACTTC  100

seq1  CACAATTCTTCCTCTTCATTTTCTGTGGGATTCCCAGAACTCAGCCTAAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAATTCTTCCTCTTCATTTTCTGTGGGATTCCCAGAACTCAGCCTAAT  150

seq1  ATTTAGCTATGGGTCTCTGCACCTACTTCCAACAGTTACTGGGCTAAGCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTAGCTATGGGTCTCTGCACCTACTTCCAACAGTTACTGGGCTAAGCC  200

seq1  CCTCTGCTTGTACCCATCTTCACACTGTTAAGATTTTTTTTTCTAGAAGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTGCTTGTACCCATCTTCACACTGTTAAGATTTTTTTTTCTAGAAGG  250

seq1  AACCAATTTTAAGGAATTCGCATGCCTTTTTCTGAAGGTTTACCTTCCCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCAATTTTAAGGAATTCGCATGCCTTTTTCTGAAGGTTTACCTTCCCA  300

seq1  CTTCTAATTAATGTGGTGATATTGGTCCTATTGATTTTACATTTTTGAGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTAATTAATGTGGTGATATTGGTCCTATTGATTTTACATTTTTGAGT  350

seq1  ATAGTCTGTTGAACTTGTACAGTGTAAAAATACAATTGAATCATTTTCCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGTCTGTTGAACTTGTACAGTGTAAAAATACAATTGAATCATTTTCCA  400

seq1  TCATGAAACATAATGTATTTATACGAATATGTGAATATGCTAACCATCTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGAAACATAATGTATTTATACGAATATGTGAATATGCTAACCATCTT  450

seq1  CCCAATAGAGATGTAGAGGTCTACAACCCACTAAGCAGTATTTTTAGTTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAATAGAGATGTAGAGGTCTACAACCCACTAAGCAGTATTTTTAGTTT  500

seq1  TGTTTTGAAAGGATAATTATGGCCAAGAGTAGGATTTCAAACTTCCTTAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTTGAAAGGATAATTATGGCCAAGAGTAGGATTTCAAACTTCCTTAC  550

seq1  TTCCACAATGAAACATCATCATGATAAAATCTTATGACATTTCCATCTTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCACAATGAAACATCATCATGATAAAATCTTATGACATTTCCATCTTC  600

seq1  ATTATAACTTATGACATGTATGGGCATAATTAAAGATATTACACGTTGAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATAACTTATGACATGTATGGGCATAATTAAAGATATTACACGTTGAT  650

seq1  GGATAAATCTGCTTTTGATTTTTTTATGATCTTTAAAGTTTGGTTGGTTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATAAATCTGCTTTTGATTTTTTTATGATCTTTAAAGTTTGGTTGGTTT  700

seq1  AAAAAAAAAAAGAAAAAAGGACAGTATTGGCTTTCATTAGTGGTTCTCAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAAAAAAGAAAAAAGGACAGTATTGGCTTTCATTAGTGGTTCTCAT  750

seq1  TGCCAAGACTATAGGGTAGAAAGTAACACTGCTCTGTCAAGTATCATTTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCAAGACTATAGGGTAGAAAGTAACACTGCTCTGTCAAGTATCATTTA  800

seq1  GGATAACAGAAAAATGGGTAGGGAAATATACATACACATTGTATGTGTGT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATAACAGAAAAATGGGTAGGGAAATATACATACACATTGTATGTGTGT  850

seq1  GTTTCTCTCTCTCTCTCTGTCTCTGTCTCTGTCTCTTTCTCTCTCTGTGT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTCTCTCTCTCTCTCTGTCTCTGTCTCTGTCTCTTTCTCTCTCTGTGT  900

seq1  GTGTGTAACTCTTTCCATATAGATACTCTGCACTCATATGGACATATGAG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTAACTCTTTCCATATAGATACTCTGCACTCATATGGACATATGAG  950

seq1  TTATCATGGGGAATTGAGTGGGTTCCATGTGATATAATCTCTCTCTCTCT  1000
      |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATCATGGGGAATTGAGTGG--TCCATGTGATATAATCTCTCTCTCTCT  998

seq1  CTTTCTCT-CTCTCTCCTCTTTCTCCTCTCTCTCTCTCCTC  1040
      |||||||| ||||||||||                      
seq2  CTTTCTCTCCTCTCTCCTC----------------------  1017