BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-289H22
Chromosome2 (Build37)
Map Location 91,203,084 - 91,204,122
singlet/doubletsinglet
Overlap gene1110051M20Rik
Upstream geneLOC668629, GA_x5J8B7W2BV0-3116-4045, Ptprj, 4933423P22Rik, Nup160, Fnbp4, Rpl30-ps3, Agbl2, Mtch2, C1qtnf4, Ndufs3, Kbtbd4, Ptpmt1, Cugbp1, LOC279067, Rapsn, Psmc3, Slc39a13, Sfpi1, Mybpc3, Madd, Nr1h3, Acp2, Ddb2, Pacsin3, Zfp289
Downstream geneLrp4, LOC619941, Ckap5, F2, Zfp408, Arhgap1, D2Ertd391e, LOC100043179, D230010M03Rik, D030051N19Rik, Chrm4, Mdk, Dgkz, Creb3l1, Phf21a
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-289H22.b
ACCGA086880
length1,038
definitionB6Ng01-289H22.b
singlet/doubletsinglet---
BLAST hituniqueno hit data
sequence
gaattcttgagttctggtcagtctagtttacacgatgagatccaaatcag
ccagagctatggacagagaccttgtctcaaacaaacaaaaacacagaaaa
taagctggttttgctgtagggacgatttcataatcccagtgttcagcaga
tgaaggcaggcagagattttgagtttgagaccagtctttgatatatagtg
acaccctgtatcaaaaacgaacaaacgaacaaagagcagcagtaacaaaa
agttaaaattaattgaaaccaaagagtctttcggcagttctcagtctcat
tacatttttaacatttatttattatgtgtatgaccatgttgcctgtgcta
tgtgttctggtgcctataaaggtcaaagagggtgtcttggatcccctgga
actgtaccactgtgtgggtgctggaaactgaaccttattcctctgcaagg
gcagcaagatccaccatctacagcccagttctcaaactctaatgagcatc
acagttgcctgtgaagtgctggaaatgcctgggccccagctcaaaggtct
ctgagtaatctggtgtggggtggggcctgggtgtcagtaatttaaacctc
tccctaagtgatctgaatatataaccatggttgaaaacagttctcagtgt
taggactgaggcaaagaaaacagggagaaagtcacttcatgtcccaaacc
ccagcggtcggtcctgaacactacctgaaacacttgttaaataacaacat
cccaggcccgttgcctgctggctatgatctggtaggtttgagaccagacc
aaggaatctgtctttttaacaacctaagatgtgtaattagagttctaaag
atgggctgtaaattagggtcaggtggtggcagtgggcatgaagaacatgt
tttaatgccaagtaaaataaaactggaaaagattaaattttcaacactat
ttatgatctgcttttatatacttccagcttaaaacccaccaaaaataatc
aaatttgagtatgttataaaattgacaactttcaccta
quality valuesOpen.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_91203084_91204122
seq2: B6Ng01-289H22.b_42_1079

seq1  GAATTCTTGAGTTCATGGTCAGTCTAGTTTACACGATGAGATCCAAATCA  50
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTGAGTTC-TGGTCAGTCTAGTTTACACGATGAGATCCAAATCA  49

seq1  GCCAGAGCTATAGACAGAGACCTTGTCTCAAACAAACAAAAACACAGAAA  100
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAGAGCTATGGACAGAGACCTTGTCTCAAACAAACAAAAACACAGAAA  99

seq1  ATAAGCTGGTTTTGCTGTAGGGACGATTTCATAATCCCAGTGTTCAGCAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGCTGGTTTTGCTGTAGGGACGATTTCATAATCCCAGTGTTCAGCAG  149

seq1  ATGAAGGCAGGCAGAGATTTTGAGTTTGAGACCAGTCTTTGATATAGAGT  200
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  ATGAAGGCAGGCAGAGATTTTGAGTTTGAGACCAGTCTTTGATATATAGT  199

seq1  GACACCCTGTATCAAAAACGAACAAACGAACAAAGAGCAGCAGTAACAAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACACCCTGTATCAAAAACGAACAAACGAACAAAGAGCAGCAGTAACAAA  249

seq1  AAGTTAAAATTAATTGAAACCAAAGAGTCTTTCAGCAGTTCTCAGTCTCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  AAGTTAAAATTAATTGAAACCAAAGAGTCTTTCGGCAGTTCTCAGTCTCA  299

seq1  TTACATTTTTAACATTTATTTATTATGTGTATGACCATGTTGCCTGTGCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACATTTTTAACATTTATTTATTATGTGTATGACCATGTTGCCTGTGCT  349

seq1  ATGTGTTCTGGTGCCTATAGAGGTCAAAGAGGGTGTCTTGGATCCCCTGG  400
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGTTCTGGTGCCTATAAAGGTCAAAGAGGGTGTCTTGGATCCCCTGG  399

seq1  AACTGTACCACTGTGTGGGTGCTGGAAACTGAACCTTAGTCCTCTGCAAG  450
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  AACTGTACCACTGTGTGGGTGCTGGAAACTGAACCTTATTCCTCTGCAAG  449

seq1  GGCAGCAAGATCCACCATCTACAGCCCAGTTCTCAAACTCTAATGAGCAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGCAAGATCCACCATCTACAGCCCAGTTCTCAAACTCTAATGAGCAT  499

seq1  CACAGTTGCCTGTGAAGTGCTGGAAATGCCTGGGCCCCAGCTCAAAGGTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGTTGCCTGTGAAGTGCTGGAAATGCCTGGGCCCCAGCTCAAAGGTC  549

seq1  TCTGAGTAATCTGGTGTGGGGTGGGGCCTGGGTGTCAGTAATTTAAACCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGAGTAATCTGGTGTGGGGTGGGGCCTGGGTGTCAGTAATTTAAACCT  599

seq1  CTCCCTAAGTGATCTGAATATATAACCATGGTTGAAAACAGTTCTCAGTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCTAAGTGATCTGAATATATAACCATGGTTGAAAACAGTTCTCAGTG  649

seq1  TTAGGACTGAGGCAAAGAAAACAGGGAGAAAGTCACTTCATGTCCCAAAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGGACTGAGGCAAAGAAAACAGGGAGAAAGTCACTTCATGTCCCAAAC  699

seq1  CCCAGCGGTCGGTCCTGAACACTACCTGAAACACTTGTTAAATAACAACA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGCGGTCGGTCCTGAACACTACCTGAAACACTTGTTAAATAACAACA  749

seq1  TCCCAGGCCCGTTGCCTGCTGGCTATGATCTGGTAGGTTTGAGACCAGAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCAGGCCCGTTGCCTGCTGGCTATGATCTGGTAGGTTTGAGACCAGAC  799

seq1  CAAGGAATCTGTCTTTTTAACAACCTAAGATGTGTAATTAGAGTTCTAAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGGAATCTGTCTTTTTAACAACCTAAGATGTGTAATTAGAGTTCTAAA  849

seq1  GATGGGCTGTAAATTAGGGTCAGGTGGTGGCAGTGGGCATGAAGAACATG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGGCTGTAAATTAGGGTCAGGTGGTGGCAGTGGGCATGAAGAACATG  899

seq1  TTTTAATGCCAAGTAAAATAAAACTGGAAAAGATTAAATTTTCAACACTA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAATGCCAAGTAAAATAAAACTGGAAAAGATTAAATTTTCAACACTA  949

seq1  TTTAT-ATCTGCTTTTATATACTTCCAGCTTAAAACCCACC-AAAACAAT  998
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||
seq2  TTTATGATCTGCTTTTATATACTTCCAGCTTAAAACCCACCAAAAATAAT  999

seq1  CAAATTTGAGTATGGTTTATTAAATTGACAACTTTAACCTA  1039
      ||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||
seq2  CAAATTTGAGTATG--TTATAAAATTGACAACTTTCACCTA  1038