BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-293H03
Chromosome2 (Build37)
Map Location 26,817,011 - 26,973,963
singlet/doubletdoublet
Overlap geneRexo4, Adamts13, 5930434B04Rik, Slc2a6, LOC665315, 1110002H13Rik, Adamtsl2, C630035N08Rik
Upstream geneCamsap1, LOC100040100, LOC665199, Ubadc1, Btbd14a, C330006A16Rik, Lhx3, Qscn6l1, C030048H21Rik, 4932418E24Rik, Gpsm1, D2Bwg1335e, Card9, Snapc4, Sdccag3, Pmpca, Inpp5e, AU024582, Notch1, Egfl7, Agpat2, B230317C12Rik, 5730588L14Rik, LOC100039446, Lcn4, LOC669582, Abo, Surf6, Surf5-ps, Surf5, Rpl7a, Surf1, Surf2, Surf4, Gm711
Downstream geneDbh, Sardh, Vav2, D2Bwg1423e, Brd3, Wdr5, Rxra, Col5a1, Fcnb
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-293H03.bB6Ng01-293H03.g
ACCGA089826GA089827
length6821,118
definitionB6Ng01-293H03.b B6Ng01-293H03.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(26,973,282 - 26,973,963)(26,817,011 - 26,818,120)
sequence
gaattccagtcccagccttgcatcaaagcatggcctgagcaagactctcc
ctgacagtgcatgtccatgtctcttccacctgtactcaggccatctgatc
ctcccaagtcaaagtgtaaaacacctcatctagactcgccccacctagac
ctggagagtcagaagcaaaacaccggtctgtccgttactctcatacaccc
ctggaagaggattcctcagtctaaatcccggcaagtctttgggcaggttt
agcagagatttagaaacatgcaccacagggcgtttccttgcatgtttctg
taacagtaaaaggtggataattgtgtctgtagggtccagtggtgtgagct
tgagttcttcagcctaaaggagtatgacctgggcgtgagcatgcagagaa
actccacagtggatccagagggctccctaagaccatcactgcagcatggg
gctagaccccgctgcatgaagcaaaggaaggcgcaacatgtcttaacagc
agcttctttgaaaagagaagaggaaagtgttagtgtgtgcgcatggatgt
gtgtgcttaggacaagactgtggaaggggaaaagcagagctgagacaggt
tgttgcttccagggcagagcagaggatggaaggaaggaaggaaggaagga
aggaaggaaggaaggaaggaaaggaaggaagg
gaattccagacattcagtatctttactcaaaaggttcaactgatgggccg
catgcttcctgctcatttgctttcttcactaggataccctgacacctcct
gccacacacacaaatgctaaagtaaaatgcctgtgtgtctttcctgctta
tatcagccttaggagggaggggccttgtagtctctccaatccagcctgct
tatataactcagcagaagcagttaaactcacgtccctttacccttcagca
gctgaatcttgtagcctgtcatgggctcacttagcttgatctgacacaac
tctcataaacacacttcccataccagttcccaaagaaatgttctccttcc
cctttgcccgcaccctccactgtataatcccagaccaaggttttctttag
gtttaagggaaggcaggaaaatcctaggcagcaggaagccaacctgcctt
ataagcatatcccatccaggctaggtgttatcacagtgctcattaagcag
gcaaaagacactaagcaacacatagtgcacttcagtccccctaactgtac
agatgaccacactgaggataaaaggatgcaagaaagccatcaattggcaa
aaaggcaggactgggtttcacaggagtccttctgggtccagcacacacta
tgaaaaagtttttgttggctcttaccttgtgccaagctctacactggggc
ccaaagacacagtattatctgtataatagggtctgcctttagcagcccac
actctaggagaaacaagggacgaacaaacaaatatcacagggtttgggta
gaagactgtaccagggccgaacggtggtggtgaagacagtggatcacctg
tttctgtggatgttccaggcaccacagcagagttgatacttactcagtgg
gcgtgggctgattcaagataacagctgcctccgtagctttccacttaggc
ttgagagcccctttgatgagaagagatgtcactatatgtcctcttcttgg
cttcttttcttctgctctgtttccagagtatcttgtgggaggtactagta
ttctttcctgttcggtaggtgcagatgttacagatcccctagtgcttctt
tggacttttctgtctctg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_26973282_26973963
seq2: B6Ng01-293H03.b_46_727 (reverse)

seq1  CCTTCCTTCCTTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCCTTCCTTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTC  50

seq1  CTTCCATCCTCTGCTCTGCCCTGGAAGCAACAACCTGTCTCAGCTCTGCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCATCCTCTGCTCTGCCCTGGAAGCAACAACCTGTCTCAGCTCTGCT  100

seq1  TTTCCCCTTCCACAGTCTTGTCCTAAGCACACACATCCATGCGCACACAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCCCTTCCACAGTCTTGTCCTAAGCACACACATCCATGCGCACACAC  150

seq1  TAACACTTTCCTCTTCTCTTTTCAAAGAAGCTGCTGTTAAGACATGTTGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACACTTTCCTCTTCTCTTTTCAAAGAAGCTGCTGTTAAGACATGTTGC  200

seq1  GCCTTCCTTTGCTTCATGCAGCGGGGTCTAGCCCCATGCTGCAGTGATGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTTCCTTTGCTTCATGCAGCGGGGTCTAGCCCCATGCTGCAGTGATGG  250

seq1  TCTTAGGGAGCCCTCTGGATCCACTGTGGAGTTTCTCTGCATGCTCACGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTAGGGAGCCCTCTGGATCCACTGTGGAGTTTCTCTGCATGCTCACGC  300

seq1  CCAGGTCATACTCCTTTAGGCTGAAGAACTCAAGCTCACACCACTGGACC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGTCATACTCCTTTAGGCTGAAGAACTCAAGCTCACACCACTGGACC  350

seq1  CTACAGACACAATTATCCACCTTTTACTGTTACAGAAACATGCAAGGAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACAGACACAATTATCCACCTTTTACTGTTACAGAAACATGCAAGGAAA  400

seq1  CGCCCTGTGGTGCATGTTTCTAAATCTCTGCTAAACCTGCCCAAAGACTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCCCTGTGGTGCATGTTTCTAAATCTCTGCTAAACCTGCCCAAAGACTT  450

seq1  GCCGGGATTTAGACTGAGGAATCCTCTTCCAGGGGTGTATGAGAGTAACG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCGGGATTTAGACTGAGGAATCCTCTTCCAGGGGTGTATGAGAGTAACG  500

seq1  GACAGACCGGTGTTTTGCTTCTGACTCTCCAGGTCTAGGTGGGGCGAGTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGACCGGTGTTTTGCTTCTGACTCTCCAGGTCTAGGTGGGGCGAGTC  550

seq1  TAGATGAGGTGTTTTACACTTTGACTTGGGAGGATCAGATGGCCTGAGTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATGAGGTGTTTTACACTTTGACTTGGGAGGATCAGATGGCCTGAGTA  600

seq1  CAGGTGGAAGAGACATGGACATGCACTGTCAGGGAGAGTCTTGCTCAGGC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTGGAAGAGACATGGACATGCACTGTCAGGGAGAGTCTTGCTCAGGC  650

seq1  CATGCTTTGATGCAAGGCTGGGACTGGAATTC  682
      ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCTTTGATGCAAGGCTGGGACTGGAATTC  682

seq1: chr2_26817011_26818120
seq2: B6Ng01-293H03.g_67_1184

seq1  GAATTCCAGACATTCAGTATCTTTACTCAAAAGGTTCAACTGATGGGCCG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGACATTCAGTATCTTTACTCAAAAGGTTCAACTGATGGGCCG  50

seq1  CATGCTTCCTGCTCATTTGCTTTCTTCACTAGGATACCCTGACACCTCCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCTTCCTGCTCATTTGCTTTCTTCACTAGGATACCCTGACACCTCCT  100

seq1  GCCACACACACAAATGCTAAAGTAAAATGCCTGTGTGTCTTTCCTGCTTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCACACACACAAATGCTAAAGTAAAATGCCTGTGTGTCTTTCCTGCTTA  150

seq1  TATCAGCCTTAGGAGGGAGGGGCCTTGTAGTCTCTCCAATCCAGCCTGCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCAGCCTTAGGAGGGAGGGGCCTTGTAGTCTCTCCAATCCAGCCTGCT  200

seq1  TATATAACTCAGCAGAAGCAGTTAAACTCACGTCCCTTTACCCTTCAGCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATAACTCAGCAGAAGCAGTTAAACTCACGTCCCTTTACCCTTCAGCA  250

seq1  GCTGAATCTTGTAGCCTGTCATGGGCTCACTTAGCTTGATCTGACACAAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGAATCTTGTAGCCTGTCATGGGCTCACTTAGCTTGATCTGACACAAC  300

seq1  TCTCATAAACACACTTCCCATACCAGTTCCCAAAGAAATGTTCTCCTTCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCATAAACACACTTCCCATACCAGTTCCCAAAGAAATGTTCTCCTTCC  350

seq1  CCTTTGCCCGCACCCTCCACTGTATAATCCCAGACCAAGGTTTTCTTTAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTGCCCGCACCCTCCACTGTATAATCCCAGACCAAGGTTTTCTTTAG  400

seq1  GTTTAAGGGAAGGCAGGAAAATCCTAGGCAGCAGGAAGCCAACCTGCCTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTAAGGGAAGGCAGGAAAATCCTAGGCAGCAGGAAGCCAACCTGCCTT  450

seq1  ATAAGCATATCCCATCCAGGCTAGGTGTTATCACAGTGCTCATTAAGCAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGCATATCCCATCCAGGCTAGGTGTTATCACAGTGCTCATTAAGCAG  500

seq1  GCAAAAGACACTAAGCAACACATAGTGCACTTCAGTCCCCCTAACTGTAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAAAGACACTAAGCAACACATAGTGCACTTCAGTCCCCCTAACTGTAC  550

seq1  AGATGACCACACTGAGGATAAAAGGATGCAAGAAAGCCATCAATTGGCAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGACCACACTGAGGATAAAAGGATGCAAGAAAGCCATCAATTGGCAA  600

seq1  AAAGGCAGGACTGGGTTTCACAGGAGTCCTTCTGGGTCCAGCACACACTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGCAGGACTGGGTTTCACAGGAGTCCTTCTGGGTCCAGCACACACTA  650

seq1  TGAAAAAGTTTTTGTTGGCTCTTACCTTGTGCCAAGCTCTACACTGGGGC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAAAAGTTTTTGTTGGCTCTTACCTTGTGCCAAGCTCTACACTGGGGC  700

seq1  CCAAAGACACAGTATTATCTGTATAATAGGGTCTGCCTTTAGCAGCCCAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAAGACACAGTATTATCTGTATAATAGGGTCTGCCTTTAGCAGCCCAC  750

seq1  ACTCTAGGAGAAACAAGGGACGAACAAACAAATATCACAGGG-TTGGGTA  799
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  ACTCTAGGAGAAACAAGGGACGAACAAACAAATATCACAGGGTTTGGGTA  800

seq1  GAAGACTGTACCAGGGCCGAACGGTGGTGGTGAAGACAGTGGATCACCTG  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGACTGTACCAGGGCCGAACGGTGGTGGTGAAGACAGTGGATCACCTG  850

seq1  TTTCTGTGGATGTTCCAGGCACCACAGCAGAGTTGATACTTACTCAGTGG  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTGTGGATGTTCCAGGCACCACAGCAGAGTTGATACTTACTCAGTGG  900

seq1  GCGTGGGCTGATTCAAGATAACAGCTGCCTCCGTAGCTTTCCACTTAGGC  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCGTGGGCTGATTCAAGATAACAGCTGCCTCCGTAGCTTTCCACTTAGGC  950

seq1  TTGAGAGCCCC-TTGATGAGAAGAGATGTCACTATATGTCCTCTTCTTGG  998
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGAGCCCCTTTGATGAGAAGAGATGTCACTATATGTCCTCTTCTTGG  1000

seq1  C-TCCTTTCTTCTGCTCTG-TTCCAGAGGTATC-TGTGGGAGGTACTAGT  1045
      | || |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||
seq2  CTTCTTTTCTTCTGCTCTGTTTCCAGA-GTATCTTGTGGGAGGTACTAGT  1049

seq1  AT--CTTCCTG-TCCGTAGGTGCAGATGTAACAGAACCCCTAGTGCT--C  1090
      ||   |||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||   
seq2  ATTCTTTCCTGTTCGGTAGGTGCAGATGTTACAGATCCCCTAGTGCTTCT  1099

seq1  TTGGCCTTTTCTGTCCTCTG  1110
      |||| ||||||||| |||||
seq2  TTGGACTTTTCTGT-CTCTG  1118