BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-296K22
Chromosome2 (Build37)
Map Location 150,387,688 - 150,516,972
singlet/doubletdoublet
Overlap geneCst7, 2310001A20Rik, Acss1, Vsx1
Upstream geneEG667048, C530025M09Rik, OTTMUSG00000015750, LOC279056, Zfp120, EG245174, 3300002I08Rik, LOC100043832, OTTMUSG00000015730, LOC668924, OTTMUSG00000015743, LOC545472
Downstream geneEntpd6, LOC100043605, Pygb, Abhd12, Gins1, LOC668925, 4930519N13Rik, LOC668926, Nanp, LOC433486, LOC381390, 4930442J19Rik, LOC100043839, LOC100043840, 4921509C19Rik, Nsfl1c, Fkbp1a, Sdcbp2, Snph, LOC668929, BC052486
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-296K22.bB6Ng01-296K22.g
ACCGA092229GA092230
length1,1511,160
definitionB6Ng01-296K22.b B6Ng01-296K22.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(150,387,688 - 150,388,845)(150,515,784 - 150,516,972)
sequence
gaattcaaatcccagcaaccacttggtagctcacaaccatccataatgag
atctgatgccctcttctggggtgtctgaaaacagctacagtatacttata
tataataaataagtaaatcttaaaaaaaaaaaagaaagaaaatctgagac
taaaattgcatctgtttccttcaccaactccactgcagcagagcagcagc
agtcaccaaattgccttccaaggaagtgcaaggctctgtgttcagatccc
cagcacctgtataaatagccatatgtggtgctgcacagctgtaactaaca
ctgaggagtggaggcagggactgaaagaggcccagaaatcaccagccatc
accatatccgtgatgtcttagtaaaagaccctgtcttaaatggtaacacg
aagggtactagagaaagacagtggaccttggcctccatgcacactcactt
ggtcctgtgcataccctcatatctacatgcacacgtaatgcacattctca
cacttaccccaaaacacaagagagcacttaatacttagaaattcaacaca
catttacccaggaattcatggaatgaaacatgtaccaactgacatataaa
cagaagcacaaacacagaagcaagagcaagatacacatggcagtcataaa
gaatgaaaaattatcagcttcaagaaatggacataagggctggtgagatg
gctcagtgggtaagagcacccgactgctcttccaaaggtccagagttcaa
atcccagcaaccacatggtgcctcacaaccatccttaacgagatctgact
ccctcttctggagtggctgaagacagctacaatgtacttacatataataa
ataaataaatcttaaaaaaaaaaaaagaaatggacataaattgagattac
tgtatttgattaataaatacagtgtaacaaagacaaattatcatgatatc
tcatattattaggaatctttgtgctacagaggtggatttaagttaaggga
gcgtagatgggattggaagatcaaagagggatagatcagtaccagagtag
acaaggttacatgataaaagtgcatgtattgtaaatgtcagtgaaatcct
cactttgtacactattcatacaataaatggaaattaagaaagaggcacag
g
gaattctttgatatcactttcctttgccagaaaggtgcccaaagatccag
ctctcctaccagagttcctgcagacccacaccatcctgccagttgggcag
caggcagcagtggggttgcttctgttcaggaatagcaggatcctgtaacc
cctcagagccctagcccagctctttcctcagcctggctctgcctcactat
tcccatttctctttccttgttccatgagacaagttgacttgtttgagtaa
cctctcatcagtagaacgggtttatttgataagatcttcctcaaggagtt
ggaaacatctgctctggactatccccaggggatgaaatcctacccccaac
cttttggttgctttgtatttctagcatctacttggagtgtggggagtctg
tcatctgggtgaccttccaccctgaggtagaatctaggagagcgcaggac
cttggctacaggcagtggccaggtctctgcagcctcttctgtttgaggtg
atccgggctgagtcacctattctggctacaaaagagtgcactcctagtga
gtatctttcttagctgcaagccgaaatttggatttacgaaggcacacagc
tgctaattggcaagtctctatatttctgatgtcttcccctaaatctagag
gtgaattttgagcaacattcctggcagacctgaaaagatttctccccact
catccacccctctagcgagtgactcaatggacaattatcccgaaggaaag
ttactggcttgctaatccgggagaacagcttggaggggagatttgggtct
tcttttaataatggaaagttaatgcgcagcctcttgttattgtctttctt
agagccccttgttaatcctctggcttagtggtggcgccctcaacagtgaa
gacagcaagggagatgcgctgtgtggggctctgacgggttccaggtggag
gaagcccagccacggctccgtagtccccaaattgcagctcggctatctgt
cgctgatttgagccagcattccagaagcacagcgagcaggctccaagaga
gggtaggcgtctgctggagactgatcagagggcttggtcaggtgtggatg
atttaatgacaatgattgatcgcttgtttatgtaggcttgtgtagagaga
tcagatcccc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_150387688_150388845
seq2: B6Ng01-296K22.b_47_1197

seq1  GAATTCAAATCCCAGCAACCACTTGGTAGCTCACAACCATCCATAATGAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAATCCCAGCAACCACTTGGTAGCTCACAACCATCCATAATGAG  50

seq1  ATCTGATGCCCTCTTCTGGGGTGTCTGAAAACAGCTACAGTATACTTATA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGATGCCCTCTTCTGGGGTGTCTGAAAACAGCTACAGTATACTTATA  100

seq1  TATAATAAATAAGTAAATCTTAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAATCTGAGAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAATAAATAAGTAAATCTTAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAATCTGAGAC  150

seq1  TAAAATTGCATCTGTTTCCTTCACCAACTCCACTGCAGCAGAGCAGCAGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAATTGCATCTGTTTCCTTCACCAACTCCACTGCAGCAGAGCAGCAGC  200

seq1  AGTCACCAAATTGCCTTCCAAGGAAGTGCAAGGCTCTGTGTTCAGATCCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCACCAAATTGCCTTCCAAGGAAGTGCAAGGCTCTGTGTTCAGATCCC  250

seq1  CAGCACCTGTATAAATAGCCATATGTGGTGCTGCACAGCTGTAACTAACA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCACCTGTATAAATAGCCATATGTGGTGCTGCACAGCTGTAACTAACA  300

seq1  CTGAGGAGTGGAGGCAGGGACTGAAAGAGGCCCAGAAATCACCAGCCATC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGGAGTGGAGGCAGGGACTGAAAGAGGCCCAGAAATCACCAGCCATC  350

seq1  ACCATATCCGTGATGTCTTAGTAAAAGACCCTGTCTTAAATGGTAACACG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCATATCCGTGATGTCTTAGTAAAAGACCCTGTCTTAAATGGTAACACG  400

seq1  AAGGGTACTAGAGAAAGACAGTGGACCTTGGCCTCCATGCACACTCACTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGGTACTAGAGAAAGACAGTGGACCTTGGCCTCCATGCACACTCACTT  450

seq1  GGTCCTGTGCATACCCTCATATCTACATGCACACGTAATGCACATTCTCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCCTGTGCATACCCTCATATCTACATGCACACGTAATGCACATTCTCA  500

seq1  CACTTACCCCAAAACACAAGAGAGCACTTAATACTTAGAAATTCAACACA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTACCCCAAAACACAAGAGAGCACTTAATACTTAGAAATTCAACACA  550

seq1  CATTTACCCAGGAATTCATGGAATGAAACATGTACCAACTGACATATAAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTACCCAGGAATTCATGGAATGAAACATGTACCAACTGACATATAAA  600

seq1  CAGAAGCACAAACACAGAAGCAAGAGCAAGATACACATGGCAGTCATAAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAAGCACAAACACAGAAGCAAGAGCAAGATACACATGGCAGTCATAAA  650

seq1  GAATGAAAAATTATCAGCTTCAAGAAATGGACATAAGGGCTGGTGAGATG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGAAAAATTATCAGCTTCAAGAAATGGACATAAGGGCTGGTGAGATG  700

seq1  GCTCAGTGGGTAAGAGCACCCGACTGCTCTTCCAAAGGTCCAGAGTTCAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCAGTGGGTAAGAGCACCCGACTGCTCTTCCAAAGGTCCAGAGTTCAA  750

seq1  ATCCCAGCAACCACATGGTGCCTCACAACCATCCTTAACGAGATCTGACT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCCAGCAACCACATGGTGCCTCACAACCATCCTTAACGAGATCTGACT  800

seq1  CCCTCTTCTGGAGTGGCTGAAGACAGCTACAATGTACTTACATATAATAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCTTCTGGAGTGGCTGAAGACAGCTACAATGTACTTACATATAATAA  850

seq1  ATAAATAAATCTT-AAAAAAAAAAAAGAAATGGACATAAATTGAGATTAC  899
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAATAAATCTTAAAAAAAAAAAAAGAAATGGACATAAATTGAGATTAC  900

seq1  TGTATTTGATTAATAAATACAGTGTAACAAAGACAAATTATCATGATATC  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATTTGATTAATAAATACAGTGTAACAAAGACAAATTATCATGATATC  950

seq1  TCATA-TATTAGGAATCTTTGTGCTACAGAGGTGGATTTAAGTTAAGGGA  998
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATATTATTAGGAATCTTTGTGCTACAGAGGTGGATTTAAGTTAAGGGA  1000

seq1  GGCGTAGGATGGGATTGGAAGATCAAAGAGGGGATAGA-CAGTACCAGAG  1047
       ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||
seq2  -GCGTA-GATGGGATTGGAAGATCAAAGA-GGGATAGATCAGTACCAGAG  1047

seq1  TAGACCAAGTTTACATGATAAAAGTGCATGTA-TGTAAATGTCAGTGAAA  1096
      |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  TAGA-CAAGGTTACATGATAAAAGTGCATGTATTGTAAATGTCAGTGAAA  1096

seq1  TTCCTCACTTTGTACAACTAATTCATACCAATAAAAATTGAAAATAAGAA  1146
       |||||||||||||| ||| ||||||| ||||  |||| |||| ||||||
seq2  -TCCTCACTTTGTAC-ACT-ATTCATA-CAAT--AAATGGAAATTAAGAA  1140

seq1  AGAAGGCACAGG  1158
      || |||||||||
seq2  AG-AGGCACAGG  1151

seq1: chr2_150515784_150516972
seq2: B6Ng01-296K22.g_69_1228 (reverse)

seq1  GGGGATCTGACCCCCTCACACAGACCTACATAAAAACAAACAAACAAAAA  50
      |||||||||| | |   |||||  |||||||      |||||| | |  |
seq2  GGGGATCTGATCTCTCTACACAAGCCTACAT------AAACAAGCGATCA  44

seq1  ATCATTG-CATATAAACAAACAAACAACTCTGGGCCAGCCCTTCTGACTC  99
      ||||||| |||  || ||  || ||    |||  | ||||| ||||| ||
seq2  ATCATTGTCATTAAATCATCCACAC----CTGACCAAGCCC-TCTGA-TC  88

seq1  AGTCTCCAGCCCAGACGCCTACCCTCTCTTGGGGCCCCTGCTCGCTTGTG  149
      |||||||||  ||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||
seq2  AGTCTCCAG--CAGACGCCTACCCTCTCTTGGAG--CCTGCTCGC-TGTG  133

seq1  CTTCTGGAAATTGCCTGGCTTCCAAATCAGGCGGACAGATAGCCGAGCTG  199
      |||||||||  || ||||||  ||||||||   |||||||||||||||||
seq2  CTTCTGGAA--TG-CTGGCT--CAAATCAG--CGACAGATAGCCGAGCTG  176

seq1  CAATTTTGGGGGACCTACGGAGCCGTGGCTGGGCTTCCTCCACCTGGAAC  249
      ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  CAATTT--GGGGA-CTACGGAGCCGTGGCTGGGCTTCCTCCACCTGGAA-  222

seq1  CCCGTCAGAGCCCCACACAGCGCATCTCCCTTGCTGTCTTCACTGTTTGA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  CCCGTCAGAGCCCCACACAGCGCATCTCCCTTGCTGTCTTCACTG-TTGA  271

seq1  GGGCGCCACCACTAAGCCAGAGGATTAAACAAGGGGCTCTAAGAAAGACA  349
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCGCCACCACTAAGCCAGAGGATT-AACAAGGGGCTCTAAGAAAGACA  320

seq1  ATAACAAGAGGCTGCGCATTAACTTTCCATTATTAAAAGAAGACCCAAAT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAACAAGAGGCTGCGCATTAACTTTCCATTATTAAAAGAAGACCCAAAT  370

seq1  CTCCCCTCCAAGCTGTTCTCCCGGATTAGCAAGCCAGTAACTTTCCTTCG  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCCTCCAAGCTGTTCTCCCGGATTAGCAAGCCAGTAACTTTCCTTCG  420

seq1  GGATAATTGTCCATTGAGTCACTCGCTAGAGGGGTGGATGAGTGGGGAGA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATAATTGTCCATTGAGTCACTCGCTAGAGGGGTGGATGAGTGGGGAGA  470

seq1  AATCTTTTCAGGTCTGCCAGGAATGTTGCTCAAAATTCACCTCTAGATTT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCTTTTCAGGTCTGCCAGGAATGTTGCTCAAAATTCACCTCTAGATTT  520

seq1  AGGGGAAGACATCAGAAATATAGAGACTTGCCAATTAGCAGCTGTGTGCC  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGGAAGACATCAGAAATATAGAGACTTGCCAATTAGCAGCTGTGTGCC  570

seq1  TTCGTAAATCCAAATTTCGGCTTGCAGCTAAGAAAGATACTCACTAGGAG  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCGTAAATCCAAATTTCGGCTTGCAGCTAAGAAAGATACTCACTAGGAG  620

seq1  TGCACTCTTTTGTAGCCAGAATAGGTGACTCAGCCCGGATCACCTCAAAC  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCACTCTTTTGTAGCCAGAATAGGTGACTCAGCCCGGATCACCTCAAAC  670

seq1  AGAAGAGGCTGCAGAGACCTGGCCACTGCCTGTAGCCAAGGTCCTGCGCT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGAGGCTGCAGAGACCTGGCCACTGCCTGTAGCCAAGGTCCTGCGCT  720

seq1  CTCCTAGATTCTACCTCAGGGTGGAAGGTCACCCAGATGACAGACTCCCC  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTAGATTCTACCTCAGGGTGGAAGGTCACCCAGATGACAGACTCCCC  770

seq1  ACACTCCAAGTAGATGCTAGAAATACAAAGCAACCAAAAGGTTGGGGGTA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACTCCAAGTAGATGCTAGAAATACAAAGCAACCAAAAGGTTGGGGGTA  820

seq1  GGATTTCATCCCCTGGGGATAGTCCAGAGCAGATGTTTCCAACTCCTTGA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATTTCATCCCCTGGGGATAGTCCAGAGCAGATGTTTCCAACTCCTTGA  870

seq1  GGAAGATCTTATCAAATAAACCCGTTCTACTGATGAGAGGTTACTCAAAC  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGATCTTATCAAATAAACCCGTTCTACTGATGAGAGGTTACTCAAAC  920

seq1  AAGTCAACTTGTCTCATGGAACAAGGAAAGAGAAATGGGAATAGTGAGGC  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTCAACTTGTCTCATGGAACAAGGAAAGAGAAATGGGAATAGTGAGGC  970

seq1  AGAGCCAGGCTGAGGAAAGAGCTGGGCTAGGGCTCTGAGGGGTTACAGGA  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCCAGGCTGAGGAAAGAGCTGGGCTAGGGCTCTGAGGGGTTACAGGA  1020

seq1  TCCTGCTATTCCTGAACAGAAGCAACCCCACTGCTGCCTGCTGCCCAACT  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGCTATTCCTGAACAGAAGCAACCCCACTGCTGCCTGCTGCCCAACT  1070

seq1  GGCAGGATGGTGTGGGTCTGCAGGAACTCTGGTAGGAGAGCTGGATCTTT  1149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGGATGGTGTGGGTCTGCAGGAACTCTGGTAGGAGAGCTGGATCTTT  1120

seq1  GGGCACCTTTCTGGCAAAGGAAAGTGATATCAAAGAATTC  1189
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCACCTTTCTGGCAAAGGAAAGTGATATCAAAGAATTC  1160