BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-299L10
Chromosome2 (Build37)
Map Location 22,094,114 - 22,245,207
singlet/doubletdoublet
Overlap geneMyo3a
Upstream gene4933434I06Rik, Thnsl1, Gpr158, LOC637235
Downstream geneLOC100041703, Myo3a, Gad2, Apbb1ip, Pdss1, Abi1, 1200016E24Rik, Acbd5, Mastl, Yme1l1, 4931423N10Rik, LOC664835, Nxph2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-299L10.bB6Ng01-299L10.g
ACCGA094478GA094479
length9091,156
definitionB6Ng01-299L10.b B6Ng01-299L10.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(22,094,114 - 22,095,022)(22,244,060 - 22,245,207)
sequence
gaattctttagtagtcacctaaaccaaacctcttggattggaggatcctc
tttttgagatgccaggatattgtgggagagagatgcattgttcaaggtca
tgggttagcctaagaaatggtcttcatttgttgttggtgttggctgtgag
tagatatggaggtctagccctcttattaagtgaggaggttggagagagtt
ctaagggtttattctagctcatggctgttttgggataacacagtagcctg
agtttgtacctcaacctttgttcaattgacattggccacattgagtttag
ctgttccttctgccccaacacttcttcgtctatttcctactcttatttat
cctgaaaacatatttcccaacccttctcattgtttttctcaagaagaact
cctctgggctagagatatggctcaatgattaaaagcagggactgctcttc
cagaggactccagttccattcccagcacctacagagtaactgacaatcat
atgcagctccatttacaagggatccagtgctctcttctgccctccttggg
cactttacatagacatatgtgtaaataaaacactcatacacataaaataa
aattaaaattaaaacaccaaaatgaattcctatgggaaaagagtggatag
agtgtctatggcacaattctttctcaggaatgtgttgaagctgatggcaa
attatgctgcccggtctctgcatgatccactgccaaatgtaagcacaatc
cagtatctttctctatgtcagtgtctctccagtacagagaataatgtaag
agggactactcagtaactattaattcatgagactaactgcaaataatata
caaattaacaggatctctcctctctctctctctctctctctctctctctc
tctctctct
ttcatgcctgtgaagaaaatccatttttgacttagaaacttattgctgat
ctgtgtggaaggtttaggtcttaggggactggaaagctcttctgtgctgt
ttatagtgaatgaaagcttgctagaaaataatcatcacatatttggatct
ttagttttctcttcagtgttaggaaaacaccacatagtaaacttacagtg
actcacaaatgatcaaagggtcatcatttctatatgaaccctccttgagt
aatttgaaatggaaaaggaaggattatcaccaaactcattaaaaatatga
agtatcattgtcagttctatatgtggttgaaactattacaggatattgaa
tttggaactctgaattcacttgggatctgattttttccccctgaggtaat
gttaggccactggtagtagaaatacagtcattttcaaatttttgccaaaa
tacacattacaaacttttagagtacatagaaaactgatttcagttttggt
tccaagtctcccaccccctaacgaagaagctatctgaatctgttatctgc
tagcaaagaaaaaaattgttttctccaatggaatctcacaggatacatta
accacacataggggtaggttctgtggtcagccatagatgaccaacaccaa
acaaactctggtatttttatagattcacaaggttctatgcaagttgctag
aggaagaaaggaatcaatagctctactcattggtaatttccatagtccac
aacaatggcagcacgtcaaggtgtccccttaattgtacaacagtcactta
tatttctgtgataaccaacagttatctaattggatataaaggagaaaaaa
atgtgcatagtttttctacacatttttctgtattaagcaaggcatcatct
ttttatattctgttacacatgaagagattaattttgttttgatatatttt
aaaaatagaaaagaaatcccaattatccattcactgaggagagtctctag
atttgtcatctcttgccccaagtcattaacaataaaacttgcttgaggat
gacagagcagctgataaagagcagaagtggatatttagcctgcctggagg
caagtctggcttttctggtgaagtcaatcctctgttgaatgtggggtttt
ggttct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_22094114_22095022
seq2: B6Ng01-299L10.b_47_955

seq1  GAATTCTTTAGTAGTCACCTAAACCAAACCTCTTGGATTGGAGGATCCTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTAGTAGTCACCTAAACCAAACCTCTTGGATTGGAGGATCCTC  50

seq1  TTTTTGAGATGCCAGGATATTGTGGGAGAGAGATGCATTGTTCAAGGTCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTGAGATGCCAGGATATTGTGGGAGAGAGATGCATTGTTCAAGGTCA  100

seq1  TGGGTTAGCCTAAGAAATGGTCTTCATTTGTTGTTGGTGTTGGCTGTGAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGTTAGCCTAAGAAATGGTCTTCATTTGTTGTTGGTGTTGGCTGTGAG  150

seq1  TAGATATGGAGGTCTAGCCCTCTTATTAAGTGAGGAGGTTGGAGAGAGTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATATGGAGGTCTAGCCCTCTTATTAAGTGAGGAGGTTGGAGAGAGTT  200

seq1  CTAAGGGTTTATTCTAGCTCATGGCTGTTTTGGGATAACACAGTAGCCTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAGGGTTTATTCTAGCTCATGGCTGTTTTGGGATAACACAGTAGCCTG  250

seq1  AGTTTGTACCTCAACCTTTGTTCAATTGACATTGGCCACATTGAGTTTAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTGTACCTCAACCTTTGTTCAATTGACATTGGCCACATTGAGTTTAG  300

seq1  CTGTTCCTTCTGCCCCAACACTTCTTCGTCTATTTCCTACTCTTATTTAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTCCTTCTGCCCCAACACTTCTTCGTCTATTTCCTACTCTTATTTAT  350

seq1  CCTGAAAACATATTTCCCAACCCTTCTCATTGTTTTTCTCAAGAAGAACT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGAAAACATATTTCCCAACCCTTCTCATTGTTTTTCTCAAGAAGAACT  400

seq1  CCTCTGGGCTAGAGATATGGCTCAATGATTAAAAGCAGGGACTGCTCTTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTGGGCTAGAGATATGGCTCAATGATTAAAAGCAGGGACTGCTCTTC  450

seq1  CAGAGGACTCCAGTTCCATTCCCAGCACCTACAGAGTAACTGACAATCAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGGACTCCAGTTCCATTCCCAGCACCTACAGAGTAACTGACAATCAT  500

seq1  ATGCAGCTCCATTTACAAGGGATCCAGTGCTCTCTTCTGCCCTCCTTGGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCAGCTCCATTTACAAGGGATCCAGTGCTCTCTTCTGCCCTCCTTGGG  550

seq1  CACTTTACATAGACATATGTGTAAATAAAACACTCATACACATAAAATAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTTACATAGACATATGTGTAAATAAAACACTCATACACATAAAATAA  600

seq1  AATTAAAATTAAAACACCAAAATGAATTCCTATGGGAAAAGAGTGGATAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTAAAATTAAAACACCAAAATGAATTCCTATGGGAAAAGAGTGGATAG  650

seq1  AGTGTCTATGGCACAATTCTTTCTCAGGAATGTGTTGAAGCTGATGGCAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTCTATGGCACAATTCTTTCTCAGGAATGTGTTGAAGCTGATGGCAA  700

seq1  ATTATGCTGCCCGGTCTCTGCATGATCCACTGCCAAATGTAAGCACAATC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATGCTGCCCGGTCTCTGCATGATCCACTGCCAAATGTAAGCACAATC  750

seq1  CAGTATCTTTCTCTATGTCAGTGTCTCTCCAGTACAGAGAATAATGTAAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTATCTTTCTCTATGTCAGTGTCTCTCCAGTACAGAGAATAATGTAAG  800

seq1  AGGGACTACTCAGTAACTATTAATTCATGAGACTAACTGCAAATAATATA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGACTACTCAGTAACTATTAATTCATGAGACTAACTGCAAATAATATA  850

seq1  CAAATTAACAGGATCTCTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATTAACAGGATCTCTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC  900

seq1  TCTCTCTCT  909
      |||||||||
seq2  TCTCTCTCT  909

seq1: chr2_22244060_22245207
seq2: B6Ng01-299L10.g_74_1229 (reverse)

seq1  AGAACCAAAAC----CAT--CACAGAGGA-TGACTTCA-CAGAAAAG-CA  41
      |||||||||||    |||   |||||||| |||||||| |||||||| ||
seq2  AGAACCAAAACCCCACATTCAACAGAGGATTGACTTCACCAGAAAAGCCA  50

seq1  GACTGGGCCTCAGCCA-GCTAAATATCAACTTTCTGCTCTTTATCAGCTG  90
      |||| | |  ||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||
seq2  GACTTGCCTCCAGGCAGGCTAAATATCCAC-TTCTGCTCTTTATCAGCTG  99

seq1  CTCCTTGTCATCCTTCAGCAAGTTTTTATGTTAATGGACTTGGGGCAAGA  140
      |||  |||||||||  ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||
seq2  CTC--TGTCATCCTCAAGCAAGTTTTATTGTTAAT-GACTTGGGGCAAGA  146

seq1  GATGACAAATCTAGAGACTCTCCTCAGTTGAATGGATAATT-GGATTTCT  189
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| 
seq2  GATGACAAATCTAGAGACTCTCCTCAG-TGAATGGATAATTGGGATTTC-  194

seq1  TTTTCTATTTTTTAAAATATATCAAAAC-AAATTAATCTCTTCATGTGTA  238
      ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCTA-TTTTTAAAATATATCAAAACAAAATTAATCTCTTCATGTGTA  243

seq1  ACAGAATATAAAAAGATGATGCC-TGCTTAATACAG-AAAATGTGTAGAA  286
      ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||
seq2  ACAGAATATAAAAAGATGATGCCTTGCTTAATACAGAAAAATGTGTAGAA  293

seq1  AAACTATGCACATTTTTTTCTCC-TTATATCCAATTAGATAACTGTTGGT  335
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTATGCACATTTTTTTCTCCTTTATATCCAATTAGATAACTGTTGGT  343

seq1  TATCACAGAAATATAAGTGACTGTTGTACAATTAAGGGGACACCTTGACC  385
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  TATCACAGAAATATAAGTGACTGTTGTACAATTAAGGGGACACCTTGACG  393

seq1  TGCTGCCATTGTTGTGGACTATGGAAATTACCAATGAGTAGAGCTATTGA  435
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGCCATTGTTGTGGACTATGGAAATTACCAATGAGTAGAGCTATTGA  443

seq1  TTCCTTTCTTCCTCTAGCAACTTGCATAGAACCTTGTGAATCTATAAAAA  485
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTTTCTTCCTCTAGCAACTTGCATAGAACCTTGTGAATCTATAAAAA  493

seq1  TACCAGAGTTTGTTTGGTGTTGGTCATCTATGGCTGACCACAGAACCTAC  535
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCAGAGTTTGTTTGGTGTTGGTCATCTATGGCTGACCACAGAACCTAC  543

seq1  CCCTATGTGTGGTTAATGTATCCTGTGAGATTCCATTGGAGAAAACAATT  585
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTATGTGTGGTTAATGTATCCTGTGAGATTCCATTGGAGAAAACAATT  593

seq1  TTTTTCTTTGCTAGCAGATAACAGATTCAGATAGCTTCTTCGTTAGGGGG  635
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTCTTTGCTAGCAGATAACAGATTCAGATAGCTTCTTCGTTAGGGGG  643

seq1  TGGGAGACTTGGAACCAAAACTGAAATCAGTTTTCTATGTACTCTAAAAG  685
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGAGACTTGGAACCAAAACTGAAATCAGTTTTCTATGTACTCTAAAAG  693

seq1  TTTGTAATGTGTATTTTGGCAAAAATTTGAAAATGACTGTATTTCTACTA  735
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTAATGTGTATTTTGGCAAAAATTTGAAAATGACTGTATTTCTACTA  743

seq1  CCAGTGGCCTAACATTACCTCAGGGGGAAAAAATCAGATCCCAAGTGAAT  785
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGTGGCCTAACATTACCTCAGGGGGAAAAAATCAGATCCCAAGTGAAT  793

seq1  TCAGAGTTCCAAATTCAATATCCTGTAATAGTTTCAACCACATATAGAAC  835
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGAGTTCCAAATTCAATATCCTGTAATAGTTTCAACCACATATAGAAC  843

seq1  TGACAATGATACTTCATATTTTTAATGAGTTTGGTGATAATCCTTCCTTT  885
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACAATGATACTTCATATTTTTAATGAGTTTGGTGATAATCCTTCCTTT  893

seq1  TCCATTTCAAATTACTCAAGGAGGGTTCATATAGAAATGATGACCCTTTG  935
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATTTCAAATTACTCAAGGAGGGTTCATATAGAAATGATGACCCTTTG  943

seq1  ATCATTTGTGAGTCACTGTAAGTTTACTATGTGGTGTTTTCCTAACACTG  985
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATTTGTGAGTCACTGTAAGTTTACTATGTGGTGTTTTCCTAACACTG  993

seq1  AAGAGAAAACTAAAGATCCAAATATGTGATGATTATTTTCTAGCAAGCTT  1035
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGAAAACTAAAGATCCAAATATGTGATGATTATTTTCTAGCAAGCTT  1043

seq1  TCATTCACTATAAACAGCACAGAAGAGCTTTCCAGTCCCCTAAGACCTAA  1085
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTCACTATAAACAGCACAGAAGAGCTTTCCAGTCCCCTAAGACCTAA  1093

seq1  ACCTTCCACACAGATCAGCAATAAGTTTCTAAGTCAAAAATGGATTTTCT  1135
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTTCCACACAGATCAGCAATAAGTTTCTAAGTCAAAAATGGATTTTCT  1143

seq1  TCACAGGCATGAA  1148
      |||||||||||||
seq2  TCACAGGCATGAA  1156