BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-305H07
Chromosome2 (Build37)
Map Location 130,578,479 - 130,729,552
singlet/doubletdoublet
Overlap gene4930402H24Rik, LOC100043766, C030014O09Rik, LOC627316
Upstream geneStk35, Tgm3, AU015228, LOC100043438, Tgm6, Snrpb, Tmc2, Nol5a, Idh3b, Ebf4, LOC668899, Cpxm1, LOC100043446, 1700020A23Rik, 4933425O20Rik, A930025D01Rik, Vps16, Ptpra, Mrps26, Oxt, Avp, 1700012O15Rik, Ubox5, Fastkd5, Prosapip1, 2600009E05Rik, Itpa, Slc4a11
Downstream geneAtrn, LOC100043768, Gfra4, Adam33, Siglec1, LOC100043457, Hspa12b, 1700037H04Rik, Spef1, Cenpb, Cdc25b, 2310035K24Rik, D430028G21Rik, Pank2, Rnf24, LOC100043463, Smox, Adra1d
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-305H07.bB6Ng01-305H07.g
ACCGA098741GA098742
length8741,105
definitionB6Ng01-305H07.b B6Ng01-305H07.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(130,728,679 - 130,729,552)(130,578,479 - 130,579,593)
sequence
gaattccacttttctgaaattgccatactagaaggtagctatgctccaac
ctttctaatctacagccactcaagacgtctcacttgagtaccagataatc
aagtagccaagacaaggactccctgccaaacacaagttactagtatatga
gcaaaataagtaagagtacttgtttaagccagtaatgggaatgactggtt
acacaacaaaaaactaacatatcctgtaactcactttcaacaaggacaag
aggtctagtgatgtagacccaattaagaattcatcaagaaagggctggtg
agactactcatggtggtacatgactccagtcccagcactggggaggcaga
ggcaggtggatctttgtgaggccagcctggtctacagagtaagttccagg
acaaatcagagatacataatagacagatcctatttaaaagatttttaata
aaaaaaaaaaaaacaaaaaccagaaagggttggctcagtgggtaaagatg
cttgccgtgtaaagctggcaacttaagttcaacccctgaaacctgtataa
aggtagaaggagagagctgactccacaacattgtcttcagacctccatac
tcatcccataacatgagcacacacagtaataaatttaaaacaaacaaaaa
tactcacctaggggtagtaacacatgctctttcaatcccagcacttggga
ggcaggggtaggtggatctctgagttcaaagccagcctggcatacaaagt
gagttcctggccagtcagggctatgtagaagaagatcctgtctcaaaaga
gagaaagagaaaggaagaaagagagagagggagagagagagagagagaga
gagagagagagagagatagagaga
gaattcctgtctaatgaacaaagcttcaaagtcaagtcagacatcgggtg
tgctggcccacacctttaattctagcattgggaagcagaggcaggggatc
gctgtgagttctaggccggcctggtctcaaaaaccaaaacaaaatagaat
ccccaaacaaacaaaacaaagacacaaccacaacagctcggtggcagggc
ctgatcaagtcaatgattataaccatattctagatgttcaagaatctggg
agaactacattagcttggtatataaagaattaagttttaaaagattcaaa
atgaactcttacagatgaaaaatacagaaataacaacagacaaggttagt
ggcattgtgcaaggcacatgtcagtatgaatcttaggggccacaaagagg
tccaggggaggacagtttctagaacaaaggccgtgtgtgctgttcaagga
gagatactgagtggttaggcactcttgctctgcacacacacacacacaca
cacacacacacacacacacacacgcatgcatgtacactctttctggtcat
tcctctaaccatttcaagctaaaagccatttacacagtgtccacatggga
ttaaattgcctggagcctgcagtacagaggccggctcacagtgcagaagg
tttatgcaaggaccatcccactctatttttggcacttaagcttccttagg
ttctgatgagcacagggttctagaacaatacacaatatggaaaaatggac
agacgtaggatacaagcaagataggatacaagctgggcatggcacatgcc
tacagcccaagcactcgggaggctgcagtgagatcactatccatacaagg
ctagcactgctgcacaatgccttctagtctgaagcctatgccacagggag
agactctgcttcagaatcaatgagatagaccctatgcaacataaatgcta
agaaaaaacattcagaacaacttcactgagcgagagggaatggtagaatt
tcatgaacccacacacacgttaatgggatggaaaaggtagtgtgcacctc
acctgagcaggtttgtgcagttgagcctatccttgggctacacagaaaga
ctcta
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_130728679_130729552
seq2: B6Ng01-305H07.b_45_918 (reverse)

seq1  TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCTCTC  50
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTCTATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCTCTC  50

seq1  TCTCTTTCTTCCTTTCTCTTTCTCTCTTTTGAGACAGGATCTTCTTCTAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTTTCTTCCTTTCTCTTTCTCTCTTTTGAGACAGGATCTTCTTCTAC  100

seq1  ATAGCCCTGACTGGCCAGGAACTCACTTTGTATGCCAGGCTGGCTTTGAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGCCCTGACTGGCCAGGAACTCACTTTGTATGCCAGGCTGGCTTTGAA  150

seq1  CTCAGAGATCCACCTACCCCTGCCTCCCAAGTGCTGGGATTGAAAGAGCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGAGATCCACCTACCCCTGCCTCCCAAGTGCTGGGATTGAAAGAGCA  200

seq1  TGTGTTACTACCCCTAGGTGAGTATTTTTGTTTGTTTTAAATTTATTACT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTTACTACCCCTAGGTGAGTATTTTTGTTTGTTTTAAATTTATTACT  250

seq1  GTGTGTGCTCATGTTATGGGATGAGTATGGAGGTCTGAAGACAATGTTGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGCTCATGTTATGGGATGAGTATGGAGGTCTGAAGACAATGTTGT  300

seq1  GGAGTCAGCTCTCTCCTTCTACCTTTATACAGGTTTCAGGGGTTGAACTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGTCAGCTCTCTCCTTCTACCTTTATACAGGTTTCAGGGGTTGAACTT  350

seq1  AAGTTGCCAGCTTTACACGGCAAGCATCTTTACCCACTGAGCCAACCCTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTGCCAGCTTTACACGGCAAGCATCTTTACCCACTGAGCCAACCCTT  400

seq1  TCTGGTTTTTGTTTTTTTTTTTTTTATTAAAAATCTTTTAAATAGGATCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGTTTTTGTTTTTTTTTTTTTTATTAAAAATCTTTTAAATAGGATCT  450

seq1  GTCTATTATGTATCTCTGATTTGTCCTGGAACTTACTCTGTAGACCAGGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTATTATGTATCTCTGATTTGTCCTGGAACTTACTCTGTAGACCAGGC  500

seq1  TGGCCTCACAAAGATCCACCTGCCTCTGCCTCCCCAGTGCTGGGACTGGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCCTCACAAAGATCCACCTGCCTCTGCCTCCCCAGTGCTGGGACTGGA  550

seq1  GTCATGTACCACCATGAGTAGTCTCACCAGCCCTTTCTTGATGAATTCTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCATGTACCACCATGAGTAGTCTCACCAGCCCTTTCTTGATGAATTCTT  600

seq1  AATTGGGTCTACATCACTAGACCTCTTGTCCTTGTTGAAAGTGAGTTACA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTGGGTCTACATCACTAGACCTCTTGTCCTTGTTGAAAGTGAGTTACA  650

seq1  GGATATGTTAGTTTTTTGTTGTGTAACCAGTCATTCCCATTACTGGCTTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATATGTTAGTTTTTTGTTGTGTAACCAGTCATTCCCATTACTGGCTTA  700

seq1  AACAAGTACTCTTACTTATTTTGCTCATATACTAGTAACTTGTGTTTGGC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAGTACTCTTACTTATTTTGCTCATATACTAGTAACTTGTGTTTGGC  750

seq1  AGGGAGTCCTTGTCTTGGCTACTTGATTATCTGGTACTCAAGTGAGACGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGAGTCCTTGTCTTGGCTACTTGATTATCTGGTACTCAAGTGAGACGT  800

seq1  CTTGAGTGGCTGTAGATTAGAAAGGTTGGAGCATAGCTACCTTCTAGTAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGAGTGGCTGTAGATTAGAAAGGTTGGAGCATAGCTACCTTCTAGTAT  850

seq1  GGCAATTTCAGAAAAGTGGAATTC  874
      ||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAATTTCAGAAAAGTGGAATTC  874

seq1: chr2_130578479_130579593
seq2: B6Ng01-305H07.g_66_1170

seq1  GAATTCCTGTCTAATGAACAAAGCTTCAAAGTCAAGTCAGACATCGGGTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTGTCTAATGAACAAAGCTTCAAAGTCAAGTCAGACATCGGGTG  50

seq1  TGCTGGCCCACACCTTTAATTCTAGCATTGGGAAGCAGAGGCAGGGGATC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGGCCCACACCTTTAATTCTAGCATTGGGAAGCAGAGGCAGGGGATC  100

seq1  GCTGTGAGTTCTAGGCCGGCCTGGTCTCAAAAACCAAAACAAAATAGAAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTGAGTTCTAGGCCGGCCTGGTCTCAAAAACCAAAACAAAATAGAAT  150

seq1  CCCCAAACAAACAAAACAAAGACACAACCACAACAGCTCGGTGGCAGGGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCAAACAAACAAAACAAAGACACAACCACAACAGCTCGGTGGCAGGGC  200

seq1  CTGATCAAGTCAATGATTATAACCATATTCTAGATGTTCAAGAATCTGGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGATCAAGTCAATGATTATAACCATATTCTAGATGTTCAAGAATCTGGG  250

seq1  AGAACTACATTAGCTTGGTATATAAAGAATTAAGTTTTAAAAGATTCAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAACTACATTAGCTTGGTATATAAAGAATTAAGTTTTAAAAGATTCAAA  300

seq1  ATGAACTCTTACAGATGAAAAATACAGAAATAACAACAGACAAGGTTAGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAACTCTTACAGATGAAAAATACAGAAATAACAACAGACAAGGTTAGT  350

seq1  GGCATTGTGCAAGGCACATGTCAGTATGAATCTTAGGGGCCACAAAGAGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCATTGTGCAAGGCACATGTCAGTATGAATCTTAGGGGCCACAAAGAGG  400

seq1  TCCAGGGGAGGACAGTTTCTAGAACAAAGGCCGTGTGTGCTGTTCAAGGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGGGGAGGACAGTTTCTAGAACAAAGGCCGTGTGTGCTGTTCAAGGA  450

seq1  GAGATACTGAGTGGTTAGGCACTCTTGCTCTGCACACACACACACACACA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATACTGAGTGGTTAGGCACTCTTGCTCTGCACACACACACACACACA  500

seq1  CACACACACACACACACACACACGCATGCATGTACACTCTTTCTGGTCAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACACACACACACACACACACGCATGCATGTACACTCTTTCTGGTCAT  550

seq1  TCCTCTAACCATTTCAAGCTAAAAGCCATTTACACAGTGTCCACATGGGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCTAACCATTTCAAGCTAAAAGCCATTTACACAGTGTCCACATGGGA  600

seq1  TTAAATTGCCTGGAGCCTGCAGTACAGAGGCCGGCTCACAGTGCAGAAGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAATTGCCTGGAGCCTGCAGTACAGAGGCCGGCTCACAGTGCAGAAGG  650

seq1  TTTATGCAAGGACCATCCCACTCTATTTTTGGCACTTAAGCTTCCTTAGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATGCAAGGACCATCCCACTCTATTTTTGGCACTTAAGCTTCCTTAGG  700

seq1  TTCTGATGAGCACAGGGTTCTAGAACAATACACAATATGGAAAAATGGAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGATGAGCACAGGGTTCTAGAACAATACACAATATGGAAAAATGGAC  750

seq1  AGACGTAGGATACAAGCAAGATAGGATACAAGCTGGGCATGGCACATGCC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACGTAGGATACAAGCAAGATAGGATACAAGCTGGGCATGGCACATGCC  800

seq1  TACAGCCCAAGCACTCGGGAGGCTGCAGTGAGATCACTATCCATACAAGG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAGCCCAAGCACTCGGGAGGCTGCAGTGAGATCACTATCCATACAAGG  850

seq1  CTAGCACTGCTGCACAATGCCTTCTAGTCTGAAGCCTATGCCACAGGGAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGCACTGCTGCACAATGCCTTCTAGTCTGAAGCCTATGCCACAGGGAG  900

seq1  AGACTCTGCTTCAAGAATCAATGAGATAGACCCTATGCAACATAAAATGC  950
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  AGACTCTGCTTC-AGAATCAATGAGATAGACCCTATGCAACAT-AAATGC  948

seq1  TAAGAAAAAACATTCAGAACAACTTCACTGAGCGAGAGGGAATGGTAGAA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGAAAAAACATTCAGAACAACTTCACTGAGCGAGAGGGAATGGTAGAA  998

seq1  TTTCAATGAACCCAACACACACGTTAATGGGATGGAAAAGGTTAGTGGTG  1050
      |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||
seq2  TTTC-ATGAACCC-ACACACACGTTAATGGGATGGAAAAGG-TAGT-GTG  1044

seq1  GCACTCACCTGGAGGCCAAGTTTGTGCAAGTTTGAGGCTATCC-TGGGCT  1099
         ||||||| |||  || |||||||||   ||||| |||||| ||||||
seq2  CACCTCACCT-GAG--CAGGTTTGTGCA--GTTGAGCCTATCCTTGGGCT  1089

seq1  ACACAGAAAGACTCTA  1115
      ||||||||||||||||
seq2  ACACAGAAAGACTCTA  1105